2022

Journal articles

titre

Embryo-scale epithelial buckling forms a propagating furrow that initiates gastrulation

auteur

Julien Fierling, Alphy John, Barthélémy Delorme, Alexandre Torzynski, Guy B Blanchard, Claire M Lye, Anna Popkova, Grégoire Malandain, Bénédicte Sanson, Jocelyn Etienne, Philippe Marmottant, Catherine Quilliet, Matteo Rauzi

article

Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.3348. ⟨10.1038/s41467-022-30493-3⟩

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Conference papers

titre

Robust Plant Cell Tracking in Fluorescence Microscopy 3D+T Series

auteur

Manuel Petit, Guillaume Cerutti, Christophe Godin, Grégoire Malandain

article

ISBI 2022 - IEEE 19th International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India. pp.1-4, ⟨10.1109/ISBI52829.2022.9761521⟩

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2021

Journal articles

titre

A multiscale analysis of early flower development in Arabidopsis provides an integrated view of molecular regulation and growth control

auteur

Yassin Refahi, Argyris Zardilis, Gaël Michelin, Raymond Wightman, Bruno Leggio, Jonathan Legrand, Emmanuel Faure, Laetitia Vachez, Alessia Armezzani, Anne-Evodie Risson, Feng Zhao, Pradeep Das, Nathanaël Prunet, Elliot Meyerowitz, Christophe Godin, Grégoire Malandain, Henrik Jönsson, Jan Traas

article

Developmental Cell, 2021, 56 (4), pp.540-556.e8. ⟨10.1016/j.devcel.2021.01.019⟩

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2020

Journal articles

titre

Contact area-dependent cell communication and the morphological invariance of ascidian embryogenesis

auteur

Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Bruno Leggio, Julien Laussu, Emmanuel Faure, Gaël Michelin, Kilian Biasuz, Lars Hufnagel, Grégoire Malandain, Christophe Godin, Patrick Lemaire

article

Science, 2020, 369 (6500), pp.158. ⟨10.1126/science.aar5663⟩

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2019

Conference papers

titre

3D Coronary Vessel Tree Tracking in X-Ray Projections

auteur

Emmanuelle Poulain, Grégoire Malandain, Régis Vaillant

article

FIMH 2019 - 10th Functional Imaging and Modeling of the Heart, Jun 2019, Bordeaux, France. pp.388-396, ⟨10.1007/978-3-030-21949-9_42⟩

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2018

Journal articles

titre

A stochastic framework to model axon interactions within growing neuronal populations

auteur

Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes

article

PLoS Computational Biology, 2018, 14 (12), pp.e1006627. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006627⟩

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titre

A stochastic framework to model axon interactions within growing neuronal populations

auteur

Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes

article

PLoS Computational Biology, 2018, 14 (12), pp.e1006627

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titre

In Toto Imaging and Reconstruction of Post-Implantation Mouse Development at the Single-Cell Level

auteur

Katie Mcdole, Léo Guignard, Fernando Amat, Andrew Berger, Grégoire Malandain, Loïc Royer, Srinivas Turaga, Kristin Branson, Philipp Keller

article

Cell, 2018, 175 (3), pp.859 - 876.e33. ⟨10.1016/j.cell.2018.09.031⟩

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Conference papers

titre

Intensity-based matching and registration for 3D correlative microscopy with large discrepancies

auteur

Bertha Mayela Toledo Acosta, Xavier Heiligenstein, Grégoire Malandain, Patrick Bouthemy

article

ISBI 2018 - IEEE 15th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington, United States. pp.493-496, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363623⟩

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2017

Journal articles

titre

Planar cell polarity genes frizzled4 and frizzled6 exert patterning influence on arterial vessel morphogenesis

auteur

Rene Markovič, Julien Peltan, Marko Gosak, Denis Horvat, Borut Žalik, Benjamin Séguy, Rémi Chauvel, Grégoire Malandain, Thierry Couffinhal, Cécile Duplàa, Marko Marhl, Etienne Roux

article

PLoS ONE, 2017, 12 (3), pp.e0171033. ⟨10.1371/journal.pone.0171033⟩

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Conference papers

titre

Suivi temporel 3D de vaisseaux coronaires dans les projections rayons X

auteur

Emmanuelle Poulain, Grégoire Malandain, Régis Vaillant

article

GRETSI, Sep 2017, Juan-Les-Pins, France

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titre

3D Coronary vessel tracking in x-ray projections

auteur

Emmanuelle Poulain, Grégoire Malandain, Régis Vaillant

article

International Conference on Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH), Jun 2017, Toronto, Canada. pp.204-215, ⟨10.1007/978-3-319-59448-4_20⟩

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titre

Modelling collective axon growth from in vivo data reveals the importance of physical axon-axon interactions

auteur

Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes

article

Rencontre C@UCA 2017, Jun 2017, Fréjus, France

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titre

Modeling collective axon growth from in vivo data reveals the importance of physical axon-axon interactions

auteur

Agustina Razetti, Caroline Medioni, Grégoire Malandain, Florence Besse, Xavier Descombes

article

Cell biology of the neuron: Polarity, plasticity and regeneration, EMBO, May 2017, Heraklion, Greece

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titre

Coherent temporal extrapolation of labeled images

auteur

Grégoire Malandain, Gaël Michelin

article

ISBI 2017 - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2017, Melbourne, Australia. pp.433 - 436, ⟨10.1109/ISBI.2017.7950554⟩

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Other publications

titre

Contact-dependent cell communications drive morphological invariance during ascidian embryogenesis

auteur

Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Bruno Leggio, Emmanuel Faure, Julien Laussu, Lars Hufnagel, Grégoire Malandain, Christophe Godin, Patrick Lemaire

article

2017, ⟨10.1101/238741⟩

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2016

Journal articles

titre

Temporal epilepsy lesions may be detected by the voxel-based quantitative analysis of brain FDG-PET images using an original block-matching normalization software

auteur

Antoine Verger, Yalcin Yagdigul, Axel van Der Gucht, Sylvain Poussier, Eric Guedj, Louis Maillard, Grégoire Malandain, Gabriela Hossu, Renaud Fay, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie

article

Annals of Nuclear Medicine, 2016, 30 (4), pp.272-278. ⟨10.1007/s12149-016-1060-4⟩

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Conference papers

titre

Spatio-temporal registration of 3D microscopy image sequences of Arabidopsis floral meristems

auteur

Gaël Michelin, Yassin Refahi, Raymond Wightman, Henrik Jönsson, Jan J. Traas, Christophe Godin, Grégoire Malandain

article

ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2016, Prague, Czech Republic. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2015.7163872⟩

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2015

Journal articles

titre

Age-related changes in FDG brain uptake are more accurately assessed when applying an adaptive template to the SPM method of voxel-based quantitative analysis

auteur

Axel van Der Gucht, Antoine Verger, Eric Guedj, Grégoire Malandain, Gabriela Hossu, Yalcin Yagdigul, Véronique Roch, Sylvain Poussier, Louis Maillard, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie

article

Annals of Nuclear Medicine, 2015, 29 (10), pp.921-928. ⟨10.1007/s12149-015-1022-2⟩

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titre

A tree-topology preserving pairing for 3D/2D registration

auteur

Thomas Benseghir, Grégoire Malandain, Régis Vaillant

article

International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2015, 10 (6), pp.913-923. ⟨10.1007/s11548-015-1207-0⟩

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Conference papers

titre

A framework for creating population specific multimodal brain atlas using clinical T1 and diffusion tensor images

auteur

Vikash Gupta, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec

article

MICCAI 2015 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'15), Oct 2015, Munich, Germany. pp.99-108, ⟨10.1007/978-3-319-28588-7_9⟩

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titre

Motion compensation in two-photon microscopy temporal series

auteur

Caroline Medioni, Florence Besse, Xavier Descombes, Grégoire Malandain

article

International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, Brooklyn, United States. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2015.7164182⟩

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titre

Quantitative comparison of micro-vasculatures

auteur

Manon Linder, Cecile Duplaa, Thierry Couffinhal, Grégoire Malandain

article

ISBI 2015 - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, Brooklyn, United States

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titre

Cell Pairings for Ascidian Embryo Registration

auteur

Gaël Michelin, Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Patrick Lemaire, Christophe Godin, Grégoire Malandain

article

ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE). USA., Apr 2015, New York, United States. ⟨10.1109/ISBI.2015.7163872⟩

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Reports

titre

From extraction of physiological features with dynamic µ-SPECT imaging to modelling of iodide biodistribution in stomach

auteur

Marine Breuilly, Kaouthar Chatti, Jacques Darcourt, Philippe Franken, Julien Guglielmi, Grégoire Malandain, Thierry Pourcher

article

[Research Report] Inria Sophia Antipolis. 2015

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2014

Journal articles

titre

Assessing the ability of the 2D Fisher-KPP equation to model cell-sheet wound closure

auteur

Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain

article

Mathematical Biosciences, 2014, 252, pp.45-59

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Conference papers

titre

Spatio-temporal registration of embryo images

auteur

Léo Guignard, Christophe Godin, Ulla-Maj Fiuza, Lars Hufnagel, Patrick Lemaire, Grégoire Malandain

article

ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Pekin, China

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titre

Embryo Cell Membranes Reconstruction by Tensor Voting

auteur

Gaël Michelin, Léo Guignard, Ulla-Maj Fiuza, Grégoire Malandain

article

ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. ⟨10.1109/ISBI.2014.6868105⟩

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titre

Head Tracking and Flagellum Tracing for Sperm Motility Analysis

auteur

Huei-Fang Yang, Xavier Descombes, Sylvain Prigent, Grégoire Malandain, Xavier Druart, Franck Plouraboué

article

ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, Beijing, China. ⟨10.1109/ISBI.2014.6867871⟩

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titre

A Recursive Approach For Multiclass Support Vector Machine: Application to Automatic Classification of Endomicroscopic Videos

auteur

Alexis Zubiolo, Barbara André, Eric Debreuve, Grégoire Malandain

article

VISAPP - International Conference on Computer Vision Theory and Applications, Jan 2014, Lisbon, Portugal

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2013

Journal articles

titre

Amplitude-based data selection for optimal retrospective reconstruction in micro-SPECT

auteur

Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Julien Guglielmi, Robert Marsault, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken, Jacques Darcourt

article

Physics in Medicine and Biology, 2013, 58 (8), pp.2657-2674. ⟨10.1088/0031-9155/58/8/2657⟩

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Conference papers

titre

Mechanical properties of the plasma membrane of micropatterned cells incubated with mono or polyunsaturated fatty acids

auteur

Hélène Barelli, M. Pinot, Thierry Ferreira, Grégoire Malandain, Xavier Descombes, Bruno Goud, Bruno Antonny

article

American Society for Cell Biology (ASCB) Annual Meeting, Dec 2013, New Orleans, United States

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titre

Iterative Closest Curve: a Framework for Curvilinear Structure Registration Application to 2D/3D Coronary Arteries Registration

auteur

Thomas Benseghir, Grégoire Malandain, Régis Vaillant

article

MICCAI - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.179-186, ⟨10.1007/978-3-642-40811-3_23⟩

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titre

Modeling cell sheet wound closure

auteur

Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain

article

Applied Mathematics, Modeling and Computational Science (AMMCS), Wilfrid Laurier University with AIMS and SIAM, Aug 2013, Waterloo, Ontario, Canada

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titre

Image-based motion detection in 4D images and application to respiratory motion suppression

auteur

Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Julien Guglielmi, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken, Jacques Darcourt

article

ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.792-795, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556597⟩

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titre

Automatic dendrite spines detection from X-ray tomography volumes

auteur

Xavier Descombes, Grégoire Malandain, Caroline Fonta, Lazlo Negyessy, Rajmund Mosko

article

ISBI - International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San fancisco, United States. ⟨10.1109/ISBI.2013.6556505⟩

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2012

Journal articles

titre

Voxel-based quantitative analysis of brain images from F-18 Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography with a Block-Matching algorithm for spatial normalization

auteur

Christophe Person, Valérie Louis-Dorr, Sylvain Poussier, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Louis Maillard, Didier Wolf, Nicolas Gilet, Véronique Roch, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie

article

Clinical Nuclear Medicine, 2012, 37 (3), pp.268-273. ⟨10.1097/RLU.0b013e3182443b2d⟩

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titre

Radiotherapy and radiology: joint efforts for modern radiation planning and practice

auteur

Juliette Thariat, Pierre-Yves Marcy, A. Lacout, Liliane Ramus, T. Girinsky, Y. Pointreau, Grégoire Malandain

article

Diagnostic and Interventional Imaging, 2012, 93 (5), pp.342-350. ⟨10.1016/j.diii.2012.02.004⟩

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Conference papers

titre

Modeling Cell-Sheets Wound Closure

auteur

Abderrahmane Habbal, Hélène Barelli, Grégoire Malandain

article

3rd International Conference of the Moroccan Society of Applied Mathematics (SM2A), Sep 2012, Marrakesh, Morocco

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titre

Prise en compte du mouvement respiratoire du petit animal pour la reconstruction 3D TEMP synchronisée : application aux métastases péritonéales

auteur

Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken

article

50ème Colloque de Médecine Nucléaire de Langue Française, Apr 2012, Montpellier, France. pp.188-189, ⟨10.1016/j.mednuc.2012.02.108⟩

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titre

Simulated breath-hold reconstruction in micro-SPECT: application to peritoneal metastases expressing NIS as reporter gene

auteur

Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken

article

MIBO - second Molecular Imaging in Biology and Oncology workshop - 2012, Jan 2012, Nice, France

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2011

Journal articles

titre

Evaluation of registration methods on thoracic CT: the EMPIRE10 challenge.

auteur

Keelin Murphy, Bram van Ginneken, Joseph M. Reinhardt, Sven Kabus, Kai Ding, Xiang Deng, Kunlin Cao, Kaifang Du, Gary E. Christensen, Vincent Garcia, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Ben Glocker, Nikolaos Paragios, Nassir Navab, Vladlena Gorbunova, Jon Sporring, Marleen de Bruijne, Xiao Han, Mattias P. Heinrich, Julia A. Schnabel, Mark Jenkinson, Cristian Lorenz, Marc Modat, Jamie R. Mcclelland, Sébastien Ourselin, Sacha Ea Muenzing, Max A. Viergever, Dante de Nigris, Louis D. Collins, Tal Arbel, Marta Peroni, Rui Li, Gregory C. Sharp, Alexander Schmidt-Richberg, Jan Ehrhardt, René Werner, Dirk Smeets, Dirk Loeckx, Gang Song, Nicholas Tustison, Brian Avants, James C. Gee, Marius Staring, Stefan Klein, Berend C. Stoel, Martin Urschler, Manuel Werlberger, Jef Vandemeulebroucke, Simon Rit, David Sarrut, Josien Pw Pluim

article

IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30 (11), pp.1901-20. ⟨10.1109/TMI.2011.2158349⟩

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titre

Vers un patient numérique personnalisé pour le diagnostic et la thérapie guidés par l'image [Towards a personalized digital patient for diagnosis and therapy guided by image].

auteur

Nicholas Ayache, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Maxime Sermesant

article

Médecine/Sciences, 2011, 27 (2), pp.208-13. ⟨10.1051/medsci/2011272208⟩

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titre

DENTALMAPS: Automatic Dental Delineation for Radiotherapy Planning in Head and Neck Cancer

auteur

Juliette Thariat, Liliane Ramus, Philippe Maingon, Guillaume Odin, Vincent Grégoire, Vincent Darcourt, Pierre-Yves Marcy, Nicolas Guevara, Marie-Helene Orlanducci, Serge Marcie, Gilles Poissonnet, Alex Bozec, Olivier Dassonville, François Demard, Laurent Castillo, José Santini, Grégoire Malandain

article

International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics, 2011, 82 (5), pp.1858-1865

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Conference papers

titre

A federated system for sharing and reuse of images and image processing tools in neuroimaging

auteur

Bernard Gibaud, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Franck Michel, Bacem Wali, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Pascal Girard, Alban Gaignard, Diane Lingrand, Johan Montagnat, Javier Rojas Balderrama, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, David Godard, Gilles Kassel, Mélanie Pélégrini-Issac

article

Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS'11), Jun 2011, Berlin, Germany

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titre

NeuroLOG: A framework for the sharing and reuse of distributed tools and data in neuroimaging

auteur

Michel Dojat, Mélanie Pélégrini-Issac, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Alban Gaignard, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Franck Michel, Johan Montagnat, Xavier Pennec, Javier Balderrama, Bacem Wali

article

Organization for Human Brain Mapping (HBM'11), Jun 2011, Quebec, Canada

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2010

Journal articles

titre

Les mathématiques cachées de la médecine

auteur

Grégoire Malandain

article

Interstices, 2010

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titre

Outils de contourage, utilisation et construction d'atlas anatomiques : exemples des cancers de la tete et du cou

auteur

Liliane Ramus, Juliette Thariat, Pierre-Yves Marcy, Yoann Pointreau, Guillaume Bera, Olivier Commowick, Grégoire Malandain

article

Cancer/Radiothérapie, 2010, 14 (3), pp.206-12

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titre

Imaging plant growth in 4D : robust tissue reconstruction and lineaging at cell resolution.

auteur

R. Fernandez, Pradeep Das, V. Mirabet, E. Moscardi, Jan Traas, J.-L. Verdeil, Grégoire Malandain, Christophe Godin

article

Nature Methods, 2010, 7, pp.547-553. ⟨10.1038/NMETH.1472⟩

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titre

[Longitudinal study of health related quality of life in multiple sclerosis: correlation with MRI parameters]

auteur

M. Cohen, C. Lebrun, D Aufauvre, S. Chanalet, C Filleau-Bertogliatti, W Camu, P Thomas, Grégoire Malandain, P Clavelou

article

Revue Neurologique, 2010, 166 (11), pp.894-900

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Conference papers

titre

Design and use of patient-specific atlases for radiotherapy planning of the head and neck region

auteur

Liliane Ramus, Souha Aouadi, Yoann Pointreau, Guillaume Bera, Yungan Tao, Anne Beaudré, Vincent Grégoire, Grégoire Malandain

article

ESTRO - 29th European Society for Therapeutic Radiology and Oncology, Sep 2010, Barcelona, Spain

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titre

Construction of patient specific atlases from locally most similar anatomical pieces.

auteur

Liliane Ramus, Olivier Commowick, Grégoire Malandain

article

Med Image Comput Comput Assist Interv (MICCAI), Sep 2010, China. pp.155-162

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titre

Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.

auteur

Franck Michel, Alban Gaignard, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, Michel Dojat, Bernard Gibaud, Pascal Girard, David Godard, Gilles Kassel, Diane Lingrand, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Mélanie Pélégrini-Issac, Xavier Pennec, Javier Rojas Balderrama, Bacem Wali

article

HealthGrid'10, Jun 2010, Paris, France. pp.112-123, ⟨10.3233/978-1-60750-583-9-112⟩

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titre

Diffeomorphic demons and the EMPIRE10 challenge

auteur

Vincent Garcia, Tom Vercauteren, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China

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titre

Assessing Selection Methods in the Context of Multi-atlas Based Segmentation

auteur

Liliane Ramus, Grégoire Malandain

article

Proceedings of the Seventh IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2010 (ISBI'10), 2010, Rotterdam, The Netherlands, Netherlands

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titre

Multi-atlas based segmentation: Application to the head and neck region for radiotherapy planning

auteur

Liliane Ramus, Grégoire Malandain

article

MICCAI Workshop Medical Image Analysis for the Clinic - A Grand Challenge, 2010, Beijing, China, China

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titre

A Robust and Efficient Block Matching Framework for Non Linear Registration of Thoracic CT Images

auteur

Vincent Garcia, Olivier Commowick, Grégoire Malandain

article

Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China. pp.1-10

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Other publications

titre

Longitudinal MRI assessment of quality of life and disability in early treated relapsing remitting multiple sclerosis

auteur

Mikael Cohen, Christine Lebrun, Dominique Aufauvre, Stéphane Chanalet, Christelle Filleau, William Camu, Pierre Thomas, Grégoire Malandain, Pierre Clavelou

article

2010

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titre

Construction of a dental atlas for automatic teeth segmentation to improve post-irradiation dental care management

auteur

Juliette Thariat, Liliane Ramus, Philippe Maingon, Vincent Grégoire, Serge Marcie, Grégoire Malandain

article

2010

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titre

Atlas de contourage automatique des dents pour l'optimisation des soins dentaires

auteur

Juliette Thariat, Liliane Ramus, Philippe Maingon, Vincent Grégoire, Vincent Darcourt, Serge Marcie, Grégoire Malandain

article

2010

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Documents associated with scientific events

titre

Definition of motionless phases for monitoring gated reconstruction of SPECT images in alive mice

auteur

Marine Breuilly, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt, Thierry Pourcher, Philippe R. Franken

article

ICVSS - International Computer Vision Summer School, Jul 2010, Punta Sampieri, 97010 Scicli, Sicile, Italy. 2010

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2009

Journal articles

titre

A pre-clinical assessment of an atlas-based automatic segmentation tool for the head and neck

auteur

Richard Sims, Aurélie Isambert, Vincent Grégoire, François Bidault, Lydia Fresco, John Sage, John Mills, Jean Bourhis, Dimitri Lefkopoulos, Olivier Commowick, Mehdi Benkebil, Grégoire Malandain

article

Radiotherapy & Oncology, 2009, 93 (3), pp.474-8

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titre

A three-dimensional histological atlas of the human basal ganglia. II. Atlas deformation strategy and evaluation in deep brain stimulation for Parkinson disease.

auteur

Eric Bardinet, Manik Bhattacharjee, Didier Dormont, Bernard Pidoux, Grégoire Malandain, Michael Schupbach, Nicholas Ayache, Philippe Cornu, Yves Agid, Jérôme Yelnik

article

Journal of Neurosurgery, 2009, 110 (2), pp.208-19

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titre

Revue des approches de segmentation des lésions de sclérose en plaques dans les séquences conventionnelles IRM

auteur

Jean-Christophe Souplet, Christine Lebrun, Stéphane Chanalet, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain

article

Revue Neurologique, 2009, 165 (1), pp.7--14

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Conference papers

titre

Using consensus measures for atlas construction

auteur

Liliane Ramus, Grégoire Malandain

article

Proceedings of the Sixth IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2009 (ISBI'09), 2009, Boston, MA, United States

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titre

Using Frankenstein's Creature Paradigm to Build a Patient Specific Atlas

auteur

Olivier Commowick, Simon K. K. Warfield, Grégoire Malandain

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part II, 2009, London, UK, United States. pp.993--1000, ⟨10.1007/978-3-642-04271-3_120⟩

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Book sections

titre

Asclepios: a Research Project-Team at INRIA for the Analysis and Simulation of Biomedical Images

auteur

Nicholas Ayache, Olivier Clatz, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Maxime Sermesant

article

Bertot, Y. and Huet, G. and Lévy, J.-J. and Plotkin, G. From semantics to computer science: essays in honor of Gilles Kahn, Cambridge University Press, pp.415-436, 2009, ⟨10.1017/CBO9780511770524.019⟩

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2008

Journal articles

titre

A phantom study of the accuracy of CT, MR and PET image registrations with a block matching-based algorithm

auteur

Aurélie Isambert, Guillaume Bonniaud, F. Lavielle, Grégoire Malandain, Dimitri Lefkopoulos

article

Cancer/Radiothérapie, 2008, 12 (8), pp.800-8. ⟨10.1016/j.canrad.2008.04.009⟩

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titre

An efficient locally affine framework for the smooth registration of anatomical structures

auteur

Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Aurélie Isambert, Jimena Costa, Frédéric Dhermain, F. Bidault, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain

article

Medical Image Analysis, 2008, 12 (4), pp.427-41. ⟨10.1016/j.media.2008.01.002⟩

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titre

Atlas-Based Delineation of Lymph Node Levels in Head and Neck Computed Tomography Images

auteur

Olivier Commowick, Vincent Grégoire, Grégoire Malandain

article

Radiotherapy & Oncology, 2008, 87 (2), pp.281-289

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titre

Evaluation of an atlas-based automatic segmentation software for the delineation of brain organs at risk in a radiation therapy clinical context

auteur

Aurélie Isambert, Frédéric Dhermain, F. Bidault, Olivier Commowick, Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Dimitri Lefkopoulos

article

Radiotherapy & Oncology, 2008, 87 (1), pp.93-9. ⟨10.1016/j.radonc.2007.11.030⟩

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Conference papers

titre

Computational models of flow in cerebral aneurisms

auteur

Marc Thiriet, Serge Piperno, Grégoire Malandain, Pascal Frey, Jacques Bittoun, A. Gaston

article

11th Conference of the European Society of Biomechanics, Aug 2008, Toulouse, France. pp.273-282, ⟨10.1145/1400751.1400788⟩

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titre

A New Evaluation Of The Brain Parenchymal Fraction: Application In Multiple Sclerosis Longitudinal Studies

auteur

Jean-Christophe Souplet, Christine Lebrun, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain

article

Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'08), 2008, Paris, France, France. pp.65-68

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titre

An Automatic Segmentation of T2-FLAIR Multiple Sclerosis Lesions

auteur

Jean-Christophe Souplet, Christine Lebrun, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain

article

MICCAI-Multiple Sclerosis Lesion Segmentation Challenge Workshop, 2008, New York, NY, USA, United States

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Book sections

titre

Processing of In Vivo Fibered Confocal Microscopy Video Sequences

auteur

Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Nicolas Savoire, Grégoire Malandain, Aymeric Perchant

article

Rittscher, Jens and Machiraju, Raghu and Wong, Stephen T.C. Microscopic Image Analysis for Life Science Applications, Artech House, pp.441--463, 2008

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2007

Journal articles

titre

Model-based respiratory motion compensation for emission tomography image reconstruction

auteur

Mauricio Antonio Reyes Aguirre, Grégoire Malandain, Pierre Malick Koulibaly, Miguel Ángel González Ballester, Jacques Darcourt

article

Physics in Medicine and Biology, 2007, 52 (12), pp.3579-600

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titre

A three-dimensional, histological and deformable atlas of the human basal ganglia. I. Atlas construction based on immunohistochemical and MRI data

auteur

Jérôme Yelnik, Eric Bardinet, Didier Dormont, Grégoire Malandain, Sébastien Ourselin, Dominique Tandé, Carine Karachi, Nicholas Ayache, Philippe Cornu, Yves Agid

article

NeuroImage, 2007, 34 (2), pp.618-38

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Conference papers

titre

Efficient Selection of the Most Similar Image in a Database for Critical Structures Segmentation

auteur

Olivier Commowick, Grégoire Malandain

article

Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Part II, 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.203--210

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Book sections

titre

Applications de la géométrie discrète en imagerie médicale

auteur

Grégoire Malandain

article

Coeurjolly, David and Montanvert, Annick and Chassery, Jean-Marc. Géométrie discrète et images numériques, Hermès, pp.371--379, 2007, Traités IC2

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Patents

titre

Robust Mosaicing Method with Correction of Motion Distorsions and Tissue Deformations for In Vivo Fibered Microscopy

auteur

Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain

article

United States, Patent n° : US Patent US20090041314. 2007

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2006

Journal articles

titre

A low temperature embedding and section registration strategy for 3D image reconstruction of the rat brain from autoradiographic sections.

auteur

Arjan W. Simonetti, Vedat A. Elezi, Régine Farion, Grégoire Malandain, Christoph Segebarth, Chantal Rémy, Emmanuel L. Barbier

article

Journal of Neuroscience Methods, 2006, 158 (2), pp.242-50. ⟨10.1016/j.jneumeth.2006.06.004⟩

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titre

Blockwise processing applied to brain microvascular network study

auteur

Céline Fouard, Grégoire Malandain, Steffen Prohaska, Malte Westerhoff

article

IEEE Transactions on Medical Imaging, 2006, 25 (10), pp.1319 - 1328. ⟨10.1109/TMI.2006.880670⟩

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titre

Piecewise Affine Registration of Biological Images for Volume Reconstruction

auteur

Alain Pitiot, Eric Bardinet, Paul Thompson, Grégoire Malandain

article

Medical Image Analysis, 2006, 10 (3), pp.465--483

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titre

Reconstruction of Coronary Arteries from a Single Rotational X-Ray Projection Sequence

auteur

Christophe Blondel, Grégoire Malandain, Régis Vaillant, Nicholas Ayache

article

IEEE Transactions on Medical Imaging, 2006, 25 (5), pp.653--663. ⟨10.1109/TMI.2006.873224⟩

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titre

Robust Mosaicing with Correction of Motion Distortions and Tissue Deformation for In Vivo Fibered Microscopy

auteur

Tom Vercauteren, Aymeric Perchant, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Nicholas Ayache

article

Medical Image Analysis, 2006, 10 (5), pp.673--692. ⟨10.1016/j.media.2006.06.006⟩

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titre

Early detection of cognitive impairment in relapsing-remitting multiple sclerosis: functional-anatomical correlations and longitudinal follow-up

auteur

Caroline Bensa, Christelle Bertogliati, Stéphane Chanalet, Grégoire Malandain, P. Bedoucha, Christine Lebrun

article

Revue Neurologique, 2006, 162 (12), pp.1221

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Conference papers

titre

Evaluation of Atlas Construction Strategies in the Context of Radiotherapy Planning

auteur

Olivier Commowick, Grégoire Malandain

article

Proceedings of the SA2PM Workshop (From Statistical Atlases to Personalized Models), 2006, Copenhagen, Denmark

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titre

Processing and Mosaicing of Fibered Confocal Images

auteur

Nicholas Ayache, Tom Vercauteren, Grégoire Malandain, Fabien Oberrietter, Nicolas Savoire, Aymeric Perchant

article

MICCAI Workshop on Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB'06), 2006, no address, Denmark

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titre

An Efficient Locally Affine Framework for the Registration of Anatomical Structures

auteur

Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Jimena Costa, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain

article

Proceedings of the Third IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.478-481

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2005

Journal articles

titre

Atlas-based automatic segmentation of MR images: validation study on the brainstem in radiotherapy context

auteur

Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Stéphane Chanalet, Pierre-Yves Marcy, Jean-Louis Habrand, François Fauchon, Philippe Paquis, Adel Courdi, Olivier Commowick, Isabelle Rutten, Nicholas Ayache

article

International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics, 2005, 61 (1), pp.289-98. ⟨10.1016/j.ijrobp.2004.08.055⟩

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titre

Realistic Simulation of the 3D Growth of Brain Tumors in MR Images Coupling Diffusion with Mass Effect

auteur

Olivier Clatz, Maxime Sermesant, Pierre-Yves Bondiau, Hervé Delingette, Simon K. K. Warfield, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

IEEE Transactions on Medical Imaging, 2005, 24 (10), pp.1334-1346

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titre

La tomographie en mouvement

auteur

Grégoire Malandain, Mauricio Antonio Reyes Aguirre

article

Pour la science, 2005, 338, pp.132--137

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titre

From arteriographies to computational flow in saccular aneurisms: the INRIA experience

auteur

Marc Thiriet, J.-D. Boissonnat, R. Chaine, P. Frey, Grégoire Malandain, Stéphanie Salmon, E. Saltel

article

Medical Image Analysis, 2005, 9 (2), pp.133-143

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Conference papers

titre

Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.

auteur

Olivier Commowick, Radu Stefanescu, Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.927-34, ⟨10.1007/11566489_114⟩

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titre

Tree Matching Applied to Vascular System

auteur

Arnaud Charnoz, Vincent Agnus, Grégoire Malandain, Luc Soler, Mohamed Tajine

article

Graph-Based Representations in Pattern Recognition, 2005, no address, France. pp.183--192, ⟨10.1007/b107037⟩

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titre

Vascular system matching validated on the liver

auteur

Arnaud Charnoz, Vincent Agnus, Grégoire Malandain, Luc Soler, Mohamed Tajine

article

Information Processing in Medical Imaging 2005 (IPMI'05), 2005, Glenwood springs, Colorado, USA, United States. pp.443--455, ⟨10.1007/11505730_37⟩

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titre

Retrospective cross-evaluation of an histological and deformable 3D atlas of the basal ganglia on series of Parkinsonian patients treated by deep brain stimulation (DBS)

auteur

Eric Bardinet, Didier Dormont, Grégoire Malandain, Manik Bhattacharjee, Bernard Pidoux, Christian Saleh, Philippe Cornu, Nicholas Ayache, Yves Agid, Jérôme Yelnik

article

Proceedings of MICCAI'05, 2005, Palm Springs, California, United States. pp.385--393, ⟨10.1007/11566489₄8⟩

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titre

Respiratory Motion Correction in Emission Tomography Image Reconstruction

auteur

Mauricio Antonio Reyes Aguirre, Grégoire Malandain, Pierre Malick Koulibaly, Miguel Ángel González Ballester, Jacques Darcourt

article

Proceedings of MICCAI'05, Part II, 2005, Palm Springs, California, United States. pp.369--376, ⟨10.1007/11566489₄6⟩

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titre

Respiratory Motion Correction in Emission Tomography Imaging

auteur

Mauricio Antonio Reyes Aguirre, Grégoire Malandain, Jacques Darcourt, Pierre Malick Koulibaly

article

Fully Three-Dimensional Image Reconstruction Meeting in Radiology and Nuclear Medicine, 2005, Salt Lake City, Utah, USA, United States

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titre

Liver registration for the follow-up of hepatic tumors

auteur

Arnaud Charnoz, Vincent Agnus, Grégoire Malandain, Clément Forest, Mohamed Tajine, Luc Soler

article

Proceedings of MICCAI'05, 2005, Palm Springs, California, United States. pp.155--162, ⟨10.1007/11566489₂0⟩

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titre

Non-Linear 2D and 3D Registration Using Block-Matching and B-Splines

auteur

Heike Hufnagel, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Hans Handels, Nicholas Ayache

article

Bildverarbeitung fuer die Medizin 2005, Deutsches Krebsforschungszentrum, 2005, Heidelberg, Germany, Germany. pp.325-329, ⟨10.1007/3-540-26431-0_67⟩

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Other publications

titre

Neurobase: gestion de données et de connaissances distribuées en neuroimagerie

auteur

Christian Barillot, Laurent Amsaleg, Florent Aubry, Jean Pierre Bazin, Yann Cointepas, Isabelle Corouge, Michel Dojat, Catherine Garbay, Bernard Gibaud, Patrick Gros, Serge Kinkingnéhun, Grégoire Malandain, Jean-Pierre Matsumoto, Dimitri Papadopoulos-Orfanos, M. Pélégrini, Nathalie Richard, Eric Simon, Habib Benali, Olivier Dameron

article

2005

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Reports

titre

Blockwise processing applied to brain micro-vascular network study

auteur

Céline Fouard, Grégoire Malandain, Steffen Prohaska, Malte Westerhoff

article

[Research Report] RR-5581, INRIA. 2005, pp.27

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titre

On optimal chamfer masks and coefficients

auteur

Grégoire Malandain, Céline Fouard

article

[Research Report] RR-5566, INRIA. 2005, pp.36

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2004

Journal articles

titre

3-D chamfer distances and norms in anisotropic grids

auteur

Céline Fouard, Grégoire Malandain

article

Image and Vision Computing, 2004, 23 (2), pp.143-158. ⟨10.1016/j.imavis.2004.06.009⟩

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titre

Traitement des images et radiothérapie

auteur

Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Stéphane Chanalet, Pierre-Yves Marcy, C. Foa, Nicholas Ayache

article

Cancer/Radiothérapie, 2004, 8 (2), pp.120--129

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titre

Fusion of autoradiographs with an MR volume using 2-D and 3-D linear transformations

auteur

Grégoire Malandain, Eric Bardinet, Koen Nelissen, Wim Vanduffel

article

NeuroImage, 2004, 23 (1), pp.111--127. ⟨10.1016/j.neuroimage.2004.04.038⟩

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titre

3-D tomographic reconstruction of coronary arteries using a precomputed 4-D motion field

auteur

Christophe Blondel, Régis Vaillant, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

Physics in Medicine and Biology, 2004, 49 (11), pp.2197--2208. ⟨10.1088/0031-9155/49/11/006⟩

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titre

The use of superresolution techniques to reduce slice thickness in functional MRI

auteur

R.R. Peeters, Pierre Kornprobst, M. Nikolova, S. Sunaert, Thierry Viéville, Grégoire Malandain, Rachid Deriche, Olivier Faugeras, M. Ng, P. van Hecke

article

International Journal of Imaging Systems and Technology, 2004, 14 (3), pp.131--138. ⟨10.1002/ima.20016⟩

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titre

The contribution of automatic anatomical matching of sequential brain MRI scans in the monitoring of multiple sclerosis lesions

auteur

Christine Lebrun, David Rey, Stéphane Chanalet, Véronique Bourg, Caroline Bensa, Marcel Chatel, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain

article

Revue Neurologique, 2004, 160 (8-9), pp.805-10

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Conference papers

titre

Non-Rigid Atlas to Subject Registration with Pathologies for Conformal Brain Radiotherapy

auteur

Radu Stefanescu, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Xavier Pennec

article

MICCAI 2004 - 7th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2004, Saint-Malo, France. pp.704-711, ⟨10.1007/978-3-540-30135-6_86⟩

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titre

In Silico Tumor Growth: Application to Glioblastomas

auteur

Olivier Clatz, Pierre Yves Bondiau, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Maxime Sermesant, Simon K. K. Warfield, Nicholas Ayache

article

Proc. of the 7th Int. Conf on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2004 (2), 2004, Saint-Malo, France, France. pp.337--345

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titre

Hierarchical Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions in Multi-Sequence MRI

auteur

Guillaume Dugas-Phocion, Miguel Ángel González Ballester, Christine Lebrun, Stéphane Chanalet, Caroline Bensa, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'04), IEEE, 2004, Arlington, VA, USA, United States

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titre

Squelettisation par blocs pour des grands volumes de données 3D: application à la microcirculation cérébrale

auteur

Céline Fouard, Grégoire Malandain, Stefen Prohaska, Malte Westerhoff, Francis Cassot, Christophe Mazel, Didier Asselot, Jean-Pierre Marc-Vergnes

article

Proc. of RFIA'04, 2004, Toulouse, France, France

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titre

Automatic Classification of SPECT Images of Alzheimer's Disease Patients and Control Subjects

auteur

Jonathan Stoeckel, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain, Pierre Malick Koulibaly, Klaus P. Ebmeier, Jacques Darcourt

article

Proc. of MICCAI'04, 2004, Saint-Malo, France, France. pp.654--662

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titre

Skeletonization by blocks for large datasets: application to brain microcirculation

auteur

Céline Fouard, Grégoire Malandain, Stefen Prohaska, Malte Westerhoff, Francis Cassot, Christophe Mazel, Didier Asselot, Jean-Pierre Marc-Vergnes

article

International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'04), IEEE, 2004, Arlington, VA, USA, United States

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titre

Measuring Blood Cells Velocity In Microvessels From a Single Image: Application To In Vivo and In Situ Confocal Microscopy

auteur

Nicolas Savoire, Georges Le Goualher, Aymeric Perchant, François Lacombe, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

Proc. ISBI'04, 2004, Arlington (USA), United States. pp.456--459

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Reports

titre

Respiratory Movement Correction in Emission Tomography

auteur

Mauricio Reyes Aguirre, Grégoire Malandain, Jacques Darcourt

article

RR-5279, INRIA. 2004, pp.47

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titre

Brain Tumor Growth Simulation

auteur

Olivier Clatz, Pierre-Yves Bondiau, Hervé Delingette, Maxime Sermesant, Simon K. Warfield, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

[Research Report] RR-5187, INRIA. 2004

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titre

Reconstruction of Coronary Arteries from One Rotational X-Ray Projection Sequence

auteur

Christophe Blondel, Grégoire Malandain, Régis Vaillant, Nicholas Ayache

article

[Research Report] RR-5214, INRIA. 2004, pp.43

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2003

Journal articles

titre

Retrospective evaluation of intersubject brain registration

auteur

Pierre Hellier, Christian Barillot, Isabelle Corouge, Bernard Gibaud, G. Le Goualher, D. Louis Collins, Allan Evans, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, G. E. Christensen, H.J. Johnson

article

IEEE Transactions on Medical Imaging, 2003, 22 (9), pp.1120 - 1130. ⟨10.1109/TMI.2003.816961⟩

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titre

Anisotropic Filtering for Model Based Segmentation of 4D Cylindrical Echocardiographic Images

auteur

Johan Montagnat, Maxime Sermesant, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

Pattern Recognition Letters, 2003, 24 (4-5), pp.815-828. ⟨10.1016/S0167-8655(02)00184-8⟩

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titre

Automatic three-dimensional model for protontherapy of the eye: Preliminary results

auteur

Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Pierre Chauvel, Frédérique Peyrade, Adel Courdi, Nicole Iborra, Jean-Pierre Caujolle, Pierre Gastaud

article

Medical Physics, 2003, 30 (6), pp.1013-1020

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Conference papers

titre

4-D Tomographic Representation of Coronary Arteries from One Rotational X-Ray Sequence

auteur

Christophe Blondel, Grégoire Malandain, Régis Vaillant, Frédéric Devernay, Ève Coste-Manière, Nicholas Ayache

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Nov 2003, Montreal, Canada. ⟨10.1007/978-3-540-39899-8_52⟩

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titre

Fusion of autoradiographies with an MR volume using 2-D and 3-D linear transformations

auteur

Grégoire Malandain, Eric Bardinet

article

Proceedings of Information Processing in Medical Imaging (IPMI'03), 2003, no address, United Kingdom. pp.487--498

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titre

Systematized calculation of optimal coefficients of 3-D chamfer norms

auteur

Céline Fouard, Grégoire Malandain

article

Discrete Geometry for Computer Imagery, 2003, Napoli, Italy. pp.214--223, ⟨10.1007/b94107⟩

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titre

Delineation of the basal ganglia in MR images of patients by automatic registration of a multimodal atlas based on histological and MR data

auteur

Jérôme Yelnik, Eric Bardinet, Didier Dormont, Chantal François, Dominique Tandé, Karine Parain, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Etienne C. Hirsch, Yves Agid

article

NeuroImage (HBM'03), 2003, New York, USA, United States

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titre

Intensity compensation within series of images

auteur

Grégoire Malandain, Eric Bardinet

article

Medical image computing and computer-assisted intervention (MICCAI 2003), 2003, Montreal, Canada, Canada. pp.41--49

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titre

Piecewise Affine Registration of Biological Images

auteur

Alain Pitiot, Grégoire Malandain, Eric Bardinet, Paul Thompson

article

Second International Workshop on Biomedical Image Registration WBIR'03, 2003, Philadelphia, PA, USA, United States. pp.91--101

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titre

4D deformation field of coronary arteries from monoplane rotational X-ray angiography

auteur

Christophe Blondel, Grégoire Malandain, Régis Vaillant, Nicholas Ayache

article

Computer Assisted Radiology and Surgery 2003 Proceedings, 2003, Londres, United Kingdom, United Kingdom. ⟨10.1016/S0531-5131(03)00256-5⟩

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titre

3D tomographic reconstruction of coronary arteries using a precomputed 4D motion field

auteur

Christophe Blondel, Régis Vaillant, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

Proceedings of the VIIth International Conference on Fully 3D Reconstruction In Radiology and Nuclear Medicine, 2003, Saint-Malo, France, France

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titre

2D to 3D Refinement of Post Mortem Optical and MRI Co-Registration

auteur

C. Kenwright, Eric Bardinet, S.A. Hojjat, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Alan Colchester

article

Medical image computing and computer-assisted intervention (MICCAI 2003), 2003, Montreal, Canada, Canada. pp.935--944

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Patents

titre

Electronic device for automatic registration of images

auteur

Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec

article

United States, Patent n° : US patent No US 6,539,127 B1, Mars 25, 2003. 2003

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Reports

titre

Automated Piecewise Affine Registration of Biological Images

auteur

Alain Pitiot, Éric Bardinet, Paul M. Thompson, Grégoire Malandain

article

RR-4866, INRIA. 2003

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titre

Fusion of autoradiographies with an MR volume using 2-D and 3-D linear transformations

auteur

Éric Bardinet, Grégoire Malandain

article

RR-4791, INRIA. 2003

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titre

Automatic calculation of chamfer mask coefficients for large masks and anisotropic images

auteur

Céline Fouard, Grégoire Malandain

article

RR-4792, INRIA. 2003

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2002

Journal articles

titre

Computing the Diameter of a Point Set

auteur

Grégoire Malandain, Jean-Daniel Boissonnat

article

International Journal of Computational Geometry and Applications, 2002, 12 (6), pp.489--510

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Conference papers

titre

Elaboration of a three-dimensional, functional and registrable atlas of the human basal ganglia

auteur

Jérôme Yelnik, Eric Bardinet, Didier Dormont, Chantal François, Dominique Tandé, Karine Parain, Sébastien Ourselin, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Etienne C. Hirsch

article

3rd Forum of European Neuroscience, The Federation of European Neuroscience Societies (FENS), 2002, Paris, France

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titre

Computing the Diameter of a Point Set

auteur

Grégoire Malandain, Jean-Daniel Boissonnat

article

Discrete Geometry for Computer Imagery (DGCI 2002), 2002, Bordeaux, France, France

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titre

Three dimensional functional cartography of the human basal ganglia by registration of optical and histological serial sections

auteur

Eric Bardinet, Sébastien Ourselin, Grégoire Malandain, Dominique Tandé, Karine Parain, Nicholas Ayache, Jérôme Yelnik

article

IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2002, Washington, USA, United States. pp.329--332

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titre

From medical images to computational meshes

auteur

Jean-Daniel Boissonnat, Raphaelle Chaine, P. Frey, Grégoire Malandain, F. Nicoud, Stéphanie Salmon, E. Saltel, Marc Thiriet

article

Conference on Modelling and Simulation for Computer-aided Medicine and Surgery (MS4CMS'02), 2002, no address, France. pp.1--7

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titre

Improved Detection Sensitivity in Functional MRI Data using a Brain Parcelling Technique

auteur

Guillaume Flandin, Ferath Kherif, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jean-Baptiste Poline

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'02), 2002, Tokyo, Japan. pp.467--474, ⟨10.1007/3-540-45786-0_58⟩

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titre

Automatic trinocular 3D reconstruction of coronary artery centerlines from rotational X-ray angiography

auteur

Christophe Blondel, Régis Vaillant, Frédéric Devernay, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

Computer Assisted Radiology Surgery, 2002, Paris, France

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titre

Co-registration of histological, optical and MR data of the human brain

auteur

Eric Bardinet, Sébastien Ourselin, Didier Dormont, Grégoire Malandain, Dominique Tandé, Karine Parain, Nicholas Ayache, Jérôme Yelnik

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'02), 2002, Tokyo, Japan. pp.548--555

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Reports

titre

Superresolution in MRI and its influence in statistical analysis

auteur

Pierre Kornprobst, Grégoire Malandain, Olivier Faugeras, R. Peeters, Thierry Viéville, S. Mierisova, S. Sunaert, P. van Hecke

article

[Research Report] RR-4513, INRIA. 2002

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2001

Journal articles

titre

Rigid registration of 3-D ultrasound with MR images: a new approach combining intensity and gradient information.

auteur

Alexis Roche, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

IEEE Transactions on Medical Imaging, 2001, 20 (10), pp.1038-49. ⟨10.1109/42.959301⟩

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titre

Fully automatic anatomical, pathological, and functional segmentation from CT scans for hepatic surgery

auteur

Luc Soler, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Nicholas Ayache, Christophe Koehl, Olivier Dourthe, B. Malassagne, M. Smith, Didier Mutter, Jacques Marescaux

article

Computer Aided Surgery, 2001, 6 (3), pp.131-42

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titre

Perfusion brain SPECT and Statistical Parametric Mapping analysis indicate that apathy is a cingulate syndrome: a study in Alzheimer's disease and non-demented patients

auteur

Octave Migneco, M. Benoit, Pierre Malick Koulibaly, I. Dygai, Christelle Bertogliati, P. Desvignes, Philippe Robert, Grégoire Malandain, F. Bussière, Jacques Darcourt

article

NeuroImage, 2001, 13 (5), pp.896--902. ⟨10.1006/nimg.2000.0741⟩

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Conference papers

titre

3D+t Modeling of Coronary Artery Tree from Standard Non Simultaneous Angiograms

auteur

Fabien Mourgues, Frédéric Devernay, Grégoire Malandain, Ève Coste-Manière

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2001, Oct 2001, Utrecht, Netherlands. pp.1320-1322, ⟨10.1007/3-540-45468-3_213⟩

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titre

Classification of SPECT Images of Normal Subjects versus Images of Alzheimer's Disease Patients

auteur

Jonathan Stoeckel, Grégoire Malandain, Octave Migneco, Pierre Malick Koulibaly, Philippe Robert, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt

article

4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.666--674

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titre

Smoothness and degrees of freedom restrictions when using SPM 99

auteur

Jonathan Stoeckel, Jean-Baptiste Poline, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt

article

Human Brain Mapping HBM'01, 2001, Brighton, United Kingdom

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titre

A Spatio-temporal Model-based Statistical Approach to Detect Evolving Multiple Sclerosis Lesions

auteur

David Rey, Jonathan Stoeckel, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

IEEE Workshop on Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis, MMBIA'01, 2001, Kauia, Hawai, USA, United States

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titre

Fusion of histological sections and MR images: towards the construction of an atlas of the human basal ganglia

auteur

Sébastien Ourselin, Eric Bardinet, Didier Dormont, Grégoire Malandain, Alexis Roche, Nicholas Ayache, D. Tandé, Karine Parain, Jérôme Yelnik

article

4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.743--751

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titre

Evaluation of an automatic classifier for SPECT Alzheimer's disease diagnosis

auteur

Octave Migneco, Grégoire Malandain, Pierre Malick Koulibaly, Philippe Robert, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt

article

European Association of Nuclear Medicine Meeting, 2001, Napoli, Italy, Italy

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titre

Modélisation 3D+t de l'arbre coronaire à partir de séquences angiographiques

auteur

Fabien Mourgues, Frédéric Devernay, Grégoire Malandain, Ève Coste-Manière

article

Journées ORASIS - 2001, 2001, Obernai, France

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titre

Using SPM to Detect Evolving MS Lesions

auteur

David Rey, Jonathan Stoeckel, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.1232--1234

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titre

Retrospective Evaluation of Inter-subject Brain registration

auteur

Pierre Hellier, Christian Barillot, Isabelle Corouge, B. Giraud, Georges Le Goualher, L. Collins, A. Evans, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

4th Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'01), 2001, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.258--265

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Reports

titre

Robust Registration of Multi-Modal Medical Images: Towards Real-Time Clinical Applications

auteur

Sébastien Ourselin, Xavier Pennec, Radu Stefanescu, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

RR-4333, INRIA. 2001

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titre

Computing the Diameter of a Point Set

auteur

Grégoire Malandain, Jean-Daniel Boissonnat

article

RR-4233, INRIA. 2001

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2000

Journal articles

titre

Unifying maximum likelihood approaches in medical image registration

auteur

Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

International Journal of Imaging Systems and Technology, 2000, 11 (1), pp.71-80

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titre

An automatic virtual patient reconstruction from CT-scans for hepatic surgical planning

auteur

Luc Soler, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Christophe Koehl, Jean-Marie Clément, Olivier Dourthe, Jacques Marescaux

article

Studies in Health Technology and Informatics, 2000, 70, pp.316-22

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titre

Model-Based Detection of Tubular Structures in 3D Images

auteur

Karl Krissian, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Régis Vaillant, Yves Trousset

article

Computer Vision and Image Understanding, 2000, 80 (2), pp.130--171

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Conference papers

titre

Generalized Correlation Ratio for Rigid Registration of 3D Ultrasound with MR Images

auteur

Alexis Roche, Xavier Pennec, M. Rudolph, D.P. Auer, Grégoire Malandain, Sébastien Ourselin, L.M. Auer, Nicholas Ayache

article

Proc. of the 3rd Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'00), 2000, Pittsburgh, Pennsylvanie, USA, United States. pp.567--577, ⟨10.1007/978-3-540-40899-4_58⟩

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titre

Absolute calibration of HMPAO SPECT using Xenon-133

auteur

Octave Migneco, Grégoire Malandain, Alexis Roche, I. Dygai, F. Bussière, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt

article

European Association of Nuclear Medicine Meeting, 2000, Paris, France, France

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titre

A Fully Automatic Anatomical, Pathological and Fonctionnal Segmentation from CT-scans for Hepatic Surgery

auteur

Luc Soler, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Nicholas Ayache, Jean-Marie Clément, Christophe Koehl, Olivier Dourthe, Didier Mutter, Jacques Marescaux

article

Medical Imaging 2000, SPIE, 2000, San Diego, United States. pp.246--255

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titre

SPM Analysis Applied to MIBI-SPECT for the Diagnosis of Recurrent Oligodendrogliomas

auteur

I. Dygai, Jonathan Stoeckel, Octave Migneco, P. Desvignes, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Marcel Chatel, François Fauchon, Marc Frenay, Jacques Darcourt, F. Bussière

article

European Association of Nuclear Medicine Meeting, 2000, Paris, France, France

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titre

Object Representation and Comparison Inferred from Its Medial Axis

auteur

Eric Bardinet, Grégoire Malandain, S. Damas, N. Perez de La Blanca Capilla

article

International Conference on Pattern Recognition (ICPR 2000), 2000, Barcelone, Espagne, Spain. pp.1712--1715

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titre

A new 3D segmentation of liver neoplasm, portal venous system and parenchymal contours

auteur

Luc Soler, Olivier Dourthe, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Hervé Delingette, Nicholas Ayache

article

European Congress of Radiology, 2000, Vienne (Autriche), Austria

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titre

An Automatic Virtual Patient Reconstruction from CT-Scans for Hepatic Surgical Planning

auteur

Luc Soler, Jean-Marie Clément, Christophe Koehl, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Olivier Dourthe, Jacques Marescaux

article

Medicine Meets Virtual Reality (MMVR'2000), 2000, Los Angeles, United States

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titre

Planification Chirurgicale Hépatique Assistée par Ordinateur

auteur

Luc Soler, Christophe Koehl, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Didier Mutter, J. Leroy, B. Malassagne, Jacques Marescaux

article

11ème Journées de printemps de l'ACHBT, 2000, Paris (France), France

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titre

Structural Object Matching

auteur

Eric Bardinet, Sara Fernández-Vidal, S. Damas, Grégoire Malandain, N. Perez de La Blanca Capilla

article

Advanced Concepts for Intelligent Vision Systems (ACIVS 2000), 2000, Baden-Baden, Allemagne, Germany

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Reports

titre

Generalized Correlation Ratio for Rigid Registration of 3D Ultrasound with MR Images

auteur

Alexis Roche, Xavier Pennec, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Sébastien Ourselin

article

[Research Report] RR-3980, INRIA. 2000, pp.24

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1999

Conference papers

titre

Cylindrical Echocardiographic Image Segmentation Based on 3D Deformable Models

auteur

Johan Montagnat, Hervé Delingette, Grégoire Malandain

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI'99, Sep 1999, Cambridge, United Kingdom. pp.168-175, ⟨10.1007/10704282_18⟩

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titre

Fusion Scanner / IRM entièrement automatique : perspective d'utilisation pour la radiothérapie

auteur

Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Karen Bénézery, Alexis Roche, R. Ferrand, D. Pontvert, Jean-Louis Habrand, J.N. Bruneton

article

Proc. du XIX Forum de Cancérologie, 1999, Paris, France

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titre

Towards a Better Comprehension of Similarity Measures used in Medical Image Registration

auteur

Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Sylvain Prima

article

Proc. of 2nd Int. Conf. on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'99), 1999, Cambridge, UK, United Kingdom. pp.555-566

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titre

Planification Chirurgicale Hépatique Assistée par Ordinateur

auteur

Luc Soler, Jean-Marie Clément, Christophe Koehl, Hervé Delingette, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Olivier Dourthe, Didier Mutter, Jacques Marescaux

article

Journées de la société française de Chirurgie Digestive, 1999, Paris, France

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Patents

titre

Dispositif électronique de recalage automatique d'images

auteur

Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec

article

France, Patent n° : Brevet numéro No FR 98 09649. European extension EP0977148. 1999

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Reports

titre

Analyse statistique d'images médicales : étude et utilisation du logiciel SPM

auteur

Marie-Laure Tabary, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt, Grégoire Malandain

article

RR-3802, INRIA. 1999

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titre

Model Based Detection of Tubular Structures in 3D Images

auteur

Karl Krissian, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Régis Vaillant, Yves Trousset

article

RR-3736, INRIA. 1999

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titre

Unifying Maximum Likelihood Approaches in Medical Image Registration

auteur

Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

RR-3741, INRIA. 1999

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1998

Journal articles

titre

Fast Binary Image Processing Using Binary Decision Diagrams

auteur

Luc Robert, Grégoire Malandain

article

Computer Vision and Image Understanding, 1998, 72 (1), pp.1--9

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titre

Euclidean Skeletons

auteur

Grégoire Malandain, Sara Fernández-Vidal

article

Image and Vision Computing, 1998, 16 (5), pp.317--327

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titre

Segmentation automatique : application aux angioscanners 3D du foie

auteur

Luc Soler, Grégoire Malandain, Hervé Delingette

article

Traitement du Signal, 1998, 15 (5), pp.411-431

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Conference papers

titre

Model-Based Multiscale Detection of 3D Vessels

auteur

Karl Krissian, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Régis Vaillant, Yves Trousset

article

Proc. of Worshop on Biomedical Image Analysis WBIA'98, 1998, Santa Barbara, United States. pp.202-208

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titre

The Correlation Ratio as a New Similarity Measure for Multimodal Image Registration

auteur

Alexis Roche, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Nicholas Ayache

article

Medical Image Computing and Computer-Assisted Interventation, 1998, France. pp.1115-1124, ⟨10.1007/BFb0056181⟩

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titre

Model-Based Multiscale Detection of 3D Vessels

auteur

Karl Krissian, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Régis Vaillant, Yves Trousset

article

Proc. of the IEEE Conf. on Computer Vision and Pattern Recognition, CVPR'98, 1998, Santa Barbara, United States. pp.722-727

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titre

Modélisation numérique de l'écoulement dans les anévrismes cérébraux

auteur

Marc Thiriet, Grégoire Malandain

article

XXIIIème congrès de la société de Biomécanique, 1998, Lyon, France, France

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Reports

titre

Segmentation automatique : application aux angioscanners 3D du foie

auteur

Luc Soler, Grégoire Malandain, Hervé Delingette

article

RR-3496, INRIA. 1998

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titre

Multimodal Image Registration by Maximization of the Correlation Ratio

auteur

Alexis Roche, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Xavier Pennec

article

RR-3378, INRIA. 1998

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titre

Model Based Multiscale Detection and Reconstruction of 3D Vessels

auteur

Karl Krissian, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

RR-3442, INRIA. 1998

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1997

Journal articles

titre

Comparison and evaluation of retrospective intermodality brain image registration techniques

auteur

J. West, J.M. Fitzpatrick, M.Y. Wang, B.M. Dawant, C.R. Maurer, R.M. Kessler, R.J. Maciunas, Christian Barillot, Didier Lemoine, A. Collignon, F. Maes, P. Suetens, D. Vandermeulen, P.A. van den Elsen, S. Napel, T.S. Sumanaweera, B. Harkness, P.F. Hemler, Derek Hill, David J. Hawkes, C. Studholme, J.B.A. Maintz, M.A. Viergever, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, M.E. Noz, G.Q. Maguire, M. Pollack, C.A. Pelizzari, R.A. Robb, D. Hanson, R.P. Woods

article

Journal of Computer Assisted Tomography, 1997, 21 (4), pp.554-566

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titre

Clinical and technical requirements for proton treatment planning of ocular diseases. The SERAG (South Europe Radiotherapy Group)

auteur

Pierre Chauvel, W. Sauerwein, N. Bornfeld, W. Friedrichs, N. Brassart, Adel Courdi, J. Herault, J.P. Pignol, Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain

article

Frontiers of Radiation Therapy and Oncology, 1997, 30, pp.133-42

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titre

Extension of the ICP Algorithm to Nonrigid Intensity-Based Registration of 3D Volumes

auteur

Jacques Feldmar, Jérôme Declerck, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

Computer Vision and Image Understanding, 1997, 66 (2), pp.193--206. ⟨10.1006/cviu.1997.0606⟩

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titre

X-ray angiography in stereotactic conditions: techniques and interest for interventional neuroradiology

auteur

L. Picard, Eric Maurincomme, M. Soderman, Jacques Feldmar, René Anxionnat, L. Launay, K. Ericson, Grégoire Malandain, S. Bracard, Erwan Kerrien, O. Flodmark, Nicholas Ayache

article

Stereotactic and Functional Neurosurgery, 1997, 68 (1-4 Pt 1), pp.117-20. ⟨10.1159/000099912⟩

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Conference papers

titre

Matching 3D MR Angiography Data and 2D X-ray Angiograms

auteur

Jacques Feldmar, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, Sara Fernández-Vidal, Eric Maurincomme, Yves Trousset

article

First Joint Conference Computer Vision, Virtual Reality and Robotics in Medicine and Medical Robotics and Computer-Assisted Surgery - CVRMed-MRCAS'97, Mar 1997, Grenoble, France. pp.129--138, ⟨10.1007/BFb0029232⟩

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titre

L'oeil virtuel

auteur

Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache, C. Zur, Pierre Chauvel, P. Gastaud

article

103ème Congrès de la société française d'ophtalmologie, 1997, Paris, France, France

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titre

Automatic eye reconstruction for radiotherapy

auteur

Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Pierre Chauvel, Frédérique Peyrade, J.N. Bruneton

article

1st Joint Annual Conference of the International Society for Computer Aided Surgery, 1997, Berlin, Germany, Germany

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titre

Activation mnésique en TEMP

auteur

Octave Migneco, Jacques Darcourt, M. Benoit, Grégoire Malandain, Jean-Philippe Thirion, Philippe Robert, Roland Vidal, P. Desvignes, J. Benoliel, Nicholas Ayache, F. Bussière

article

36eme Colloque de médecine nucléaire 1997, 1997, Rennes, France, France

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titre

Segmentation automatique : application aux angioscanners 3D du foie

auteur

Luc Soler, Grégoire Malandain, Hervé Delingette

article

Proceedings of Sixth Orasis conference (ORASIS'97), 1997, La Colle-sur-Loup, France, France

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titre

SPECT memory activation studies thanks to non-rigid automated 3D image registration

auteur

Octave Migneco, Jean-Philippe Thirion, M. Benoit, Grégoire Malandain, Philippe Robert, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt

article

CVRMed-MRCAS'97, 1997, Grenoble, France, France. pp.487--490

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titre

SPECT memory activation thanks to non-rigid coregistration

auteur

Octave Migneco, M. Benoit, Grégoire Malandain, Jean-Philippe Thirion, Philippe Robert, Nicholas Ayache, F. Bussière, Jacques Darcourt

article

European Association of Nuclear Medecine Meeting, 1997, Glasgow, Scotland, United Kingdom

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titre

Automatic Segmentation of Portal Vein in CT-Scans of the Liver

auteur

Luc Soler, Grégoire Malandain, Johan Montagnat, Hervé Delingette, Nicholas Ayache, Jean-Marie Clément, C. Roy, Y. Russier, V. Tassetti, Jacques Marescaux

article

Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, 1997, Nice, France, France. pp.788

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titre

Directional Anisotropic Diffusion Applied to Segmentation of Vessels in 3D Images

auteur

Karl Krissian, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

Scale-Space Theory in Computer Vision (Scale-Space'97), 1997, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.345--348

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titre

Fast Binary Image Processing Using Binary Decision Diagrams

auteur

Luc Robert, Grégoire Malandain

article

Computer Vision and Pattern Recognition, IEEE, 1997, Puerto Rico, Puerto Rico. pp.97--102

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titre

Eye Reconstruction and CT-Retinography Fusion for Proton Treatment Planning of Ocular Diseases

auteur

Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain

article

CVRMed-MRCAS'97, 1997, Grenoble, France, France. pp.705--714

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1996

Conference papers

titre

Comparison and evaluation of retrospective intermodality image registration techniques

auteur

Jay B. West, Michael J. Fitzpatrick, Matthew Y. Wang, Benoit M. Dawant, Calvin R. Maurer, Robert M. Kessler, Robert J. Maciunas, Christian Barillot, Didier Lemoine, Andre M.F. Collignon, Frederik Maes, Paul Suetens, Dirk Vandermeulen, Petra A. van den Elsen, Paul F. Hemler, Sandy Napel, Thilaka S. Sumanaweera, Beth A. Harkness, Derek L. Hill, Colin Studholme, Grégoire Malandain, Xavier Pennec, Marylin E. Noz, Derald Q. Maguire, Michael Pollack, Charles A. Pelizzari, Richard A. Robb, Dennis P. Hanson, Roger P. Woods

article

Medical Imaging 1996: Image Processing, Apr 1996, Newport Beach, California, USA, United States. ⟨10.1117/12.237936⟩

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titre

Clinical and Technical Requirements for Proton Treatment Planning of Ocular Diseases

auteur

Pierre Chauvel, W. Sauerwein, N. Bornfeld, W. Friedrichs, N. Brassart, Adel Courdi, J. Hérault, J.-P. Pignol, Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain

article

First International Symposium on Special Aspects of Radiotherapy, 1996, Berlin (Germany), Germany

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titre

Squelettes euclidiens d'objets n-dimensionnels

auteur

Sara Fernández-Vidal, Grégoire Malandain

article

10ème Congrès Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle (RFIA'96), AFCET - AFIA, 1996, Rennes, France, France

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titre

Une étude TEMP d'activation mnésique réalisée grâce à des recalages d'images 3D

auteur

Octave Migneco, Jean-Philippe Thirion, M. Benoit, Grégoire Malandain, Philippe Robert, Nicholas Ayache, Jacques Darcourt

article

Actes du congrès sur la Méthodologie en imagerie fonctionnelle cérébrale, 1996, Lyon, France, France

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titre

Extension of the ICP Algorithm to Non-Rigid Intensity-Based Registration of 3D Volumes

auteur

Jacques Feldmar, Grégoire Malandain, Jérôme Declerck, Nicholas Ayache

article

Mathematical Methods in Biomedical Image Analysis, 1996, San Francisco, California, USA, United States

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titre

Projet de reconstruction tridimensionnelle de l'oeil à partir des images scanneurs, IRM et de fundographie. Utilisation pour la protonthérapie des tumeurs oculaires

auteur

Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Pierre Chauvel

article

35eme Congrès de la société française des physiciens d'hôpital, 1996, Toulouse, France, France

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Reports

titre

Directional Anisotropic Diffusion Applied to Segmentation of Vessels in 3D Images

auteur

Karl Krissian, Grégoire Malandain, Nicholas Ayache

article

RR-3064, INRIA. 1996

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titre

Fast Binary Image Processing Using Binary Decision Diagrams

auteur

Luc Robert, Grégoire Malandain

article

RR-3001, INRIA. 1996

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titre

Squelettes euclidiens d'objets discrets n-dimensionnels

auteur

Sara Fernández-Vidal, Grégoire Malandain

article

RR-2771, INRIA. 1996

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1995

Journal articles

titre

A note on ''Building skeleton models via 3D medial surface-axis thinning algorithms

auteur

Gilles Bertrand, Grégoire Malandain

article

Graphical Models and Image Processing, 1995, 57 (6), pp.537--538

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titre

A note on "Building skeleton models via 3-D medial surface/axis thinning algorithms

auteur

Gilles Bertrand, Grégoire Malandain

article

Graphical Models and Image Processing, 1995, 57 (6), pp.537-538

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Conference papers

titre

Recalage sans cadre stéréotaxique d'images volumiques et projectives en radiologie interventionnelle

auteur

Nicholas Ayache, Jacques Feldmar, Grégoire Malandain, Eric Maurincomme, C. Picard, Yves Trousset

article

Mini colloque INSERM de radiologie interventionnelle, 1995, Paris, France

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titre

Digital Euclidean skeleton in n-D

auteur

Sara Fernández-Vidal, Grégoire Malandain

article

9th Scandinavian Conference on Image Analysis (SCIA'95), IAPR, 1995, Uppsala, Sweden, Sweden. pp.517--524

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titre

Topologically correct skeleton in n-D

auteur

Grégoire Malandain, Sara Fernández-Vidal

article

5th Discrete Geometry for Computer Imagery (DGCI'95), 1995, Clermont-Ferrand, France, France. pp.199--208

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titre

Automatic registration of Myocardial Perfusion study using a Potential Based Rigid Transformation

auteur

M.L. Goris, Grégoire Malandain, I. Marque

article

2nd International Conference of Nuclear Cardiology, 1995, Cannes France, France

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1994

Journal articles

titre

Mise en correspondance d'objets 3D par une approche mécanique : application aux images médicales multimodales

auteur

Grégoire Malandain, Sara Fernández-Vidal, Jean-Marie Rocchisani

article

Traitement du Signal, 1994, 11 (6), pp.541--558

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titre

A new characterization of three-dimensional simple points

auteur

Gilles Bertrand, Grégoire Malandain

article

Pattern Recognition Letters, 1994, 15 (2), pp.169--175

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Conference papers

titre

Improving Registration of 3-D Medical Images Using a Mechanical Based Method

auteur

Grégoire Malandain, Sara Fernández-Vidal, Jean-Marie Rocchisani

article

3rd European Conference on Computer Vision (ECCV'94), 1994, Stockholm, Sweden, Sweden. pp.131--136

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titre

Rigid Registration of 3-D Objects by Motion Analysis

auteur

Grégoire Malandain, Sara Fernández-Vidal, Jean-Marie Rocchisani

article

12th International Conference on Pattern Recognition (ICPR'94), IAPR, 1994, Jérusalem, Israël, Israel. pp.579--581

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Reports

titre

Physically Based Rigid Registration of 3-D Free-Form Objects : application to Medical Imaging

auteur

Grégoire Malandain, Sara Fernandez-Vidal, Jean-Marie Rocchisani

article

[Research Report] RR-2453, INRIA. 1994

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1993

Journal articles

titre

Topological segmentation of discrete surfaces

auteur

Grégoire Malandain, Gilles Bertrand, Nicholas Ayache

article

International Journal of Computer Vision, 1993, 10 2 (1), pp.183-197

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titre

Topological segmentation of discrete surfaces

auteur

Grégoire Malandain, Gilles Bertrand, Nicholas Ayache

article

International Journal of Computer Vision, 1993, 10 (2), pp.183-197. ⟨10.1007/BF01420736⟩

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Reports

titre

On topology in multidimensional discrete

auteur

Grégoire Malandain

article

RR-2098, INRIA. 1993

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titre

Matching of 3D medical images with a potential based method

auteur

Grégoire Malandain, Jean-Marie Rocchisani

article

[Research Report] RR-1890, INRIA. 1993

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1992

Conference papers

titre

Fast characterization of 3D simple points

auteur

Grégoire Malandain, Gilles Bertrand

article

IAPR 11th International Conference on Pattern Recognition, 1992, The Hague, The Netherlands, Netherlands

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titre

Registration of 3D medical images using a mechanical based method

auteur

Grégoire Malandain, Jean-Marie Rocchisani

article

IEEE EMBS satellite symposium on 3D advanced image processing in medicine, 1992, Rennes, France, France

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titre

3D superimposition of CT and SPECT images of the brain by a mechanical based method

auteur

Grégoire Malandain, Jean-Marie Rocchisani

article

European Association of Nuclear Medicine Congress, 1992, Lisbon, Portugal, Portugal

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titre

A new topological segmentation of discrete surfaces

auteur

Gilles Bertrand, Grégoire Malandain

article

2nd European Conference on Computer Vision (ECCV 92), 1992, no address, Italy. pp.710--71

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1991

Journal articles

titre

Recursive filtering and edge tracking: two primary tools for 3-D edge detection

auteur

Olivier Monga, Rachid Deriche, Grégoire Malandain, Jean-Pierre Cocquerez

article

Image and Vision Computing, 1991, 9 (4), pp.203--214. ⟨10.1016/0262-8856(91)90025-K⟩

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Conference papers

titre

Topological classification in digital space

auteur

Grégoire Malandain, Gilles Bertrand, Nicholas Ayache

article

XIIth international conference on Information Processing in Medical Imaging (IPMI), 1991, Wye, Kent, England, United Kingdom. pp.300--313

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titre

Topological segmentation of discrete surfaces

auteur

Grégoire Malandain, Gilles Bertrand, Nicholas Ayache

article

Proceedings of the conference on Computer Vision and Pattern Recognition, IEEE, 1991, Lahaina, Maui, Hawaii, United States. pp.444--449

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1990

Journal articles

titre

Automatic multidimensional segmentation of nuclear medicine images using fast recursive filters

auteur

Jean-Marie Rocchisani, Olivier Monga, Rachid Deriche, Grégoire Malandain

article

European Journal of Nuclear Medicine, 1990, 16, pp.419

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Conference papers

titre

3-D edge detection by recursive filtering and edge tracking

auteur

Olivier Monga, Rachid Deriche, Grégoire Malandain, Jean-Pierre Cocquerez

article

10th International Conference on Pattern Recognition, 1990, Atlantic City, USA, United States

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titre

Recursive filtering and edge closing: two primary tools for 3-D edge detection

auteur

Olivier Monga, Rachid Deriche, Grégoire Malandain, Jean-Pierre Cocquerez

article

1st European Conference on Computer Vision (ECCV'90), 1990, Nice, France, France

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Reports

titre

Segmentation topologique des surfaces discretes

auteur

Grégoire Malandain, Gilles Bertrand, Nicholas Ayache

article

[Rapport de recherche] RR-1357, INRIA. 1990

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1989

Reports

titre

Recursive filtering and edge closing : two primary tools for 3d edge detection

auteur

Olivier Monga, Rachid Deriche, Grégoire Malandain, J.P. Cocquerez

article

RR-1103, INRIA. 1989

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