2023
Journal articles
- titre
- Exploring the impact of dexamethasone on gene regulation in myeloma cells
- auteur
- Victor Bessonneau-Gaborit, Jonathan Cruard, Catherine Guerin-Charbonnel, Jennifer Derrien, Jean-Baptiste Alberge, Elise Douillard, Magali Devic, Sophie Deshayes, Loïc Campion, Frank Westermann, Phillipe Moreau, Carl Herrmann, Jérémie Bourdon, Florence Magrangeas, Stéphane Minvielle
- article
- Life Science Alliance, 2023, 6 (9), pp.e202302195. ⟨10.26508/lsa.202302195⟩
- Resume_court
- Among glucocorticoids (GCs), dexamethasone (Dex) is widely used in treatment of multiple myelomas. H .....
- DOI
- DOI : 10.26508/lsa.202302195
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Inferring Boolean Networks from Single-Cell Human Embryo Datasets
- auteur
- Mathieu Bolteau, Jérémie Bourdon, Laurent David, Carito Guziolowski
- article
- 2023
- Resume_court
- This study aims to understand human embryonic development and cell fate determination, specifically .....
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-
- titre
- Predicting weighted unobserved nodes in a regulatory network using Answer Set Programming
- auteur
- Sophie Le Bars, Mathieu Bolteau, Jérémie Bourdon, Carito Guziolowski
- article
- 2023
- Resume_court
- The impact of a perturbation, over-expression, or repression of a key node on an organism, can be mo .....
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-
2022
Conference papers
- titre
- Contributions des entrées sur les sorties pour les réseaux métaboliques sur génomes entiers: performances et utilisation pour des études en nutrition humaine
- auteur
- Oumarou Abdou Arbi, Anne Siegel, Jérémie Bourdon
- article
- CARI 2022 - Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Oct 2022, Yaoundé, Cameroun. pp.1-12
- Resume_court
- Metabolic networks are composed by all the biochemical reactions that can take place within an organ .....
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-
2021
Journal articles
- titre
- Integrated pseudotime analysis of human pre-implantation embryo single-cell transcriptomes reveals the dynamics of lineage specification
- auteur
- Dimitri Meistermann, Alexandre Bruneau, Sophie Loubersac, Arnaud Reignier, Julie Firmin, Valentin François-Campion, Stéphanie Kilens, Yohann Lelièvre, Jenna Lammers, Magalie Feyeux, Phillipe Hulin, Steven Nedellec, Betty Bretin, Gaël Castel, Nicolas Allègre, Simon Covin, Audrey Bihouée, Magali Soumillon, Tarjei Mikkelsen, Paul Barrière, Claire Chazaud, Joel Chappell, Vincent Pasque, Jérémie Bourdon, Thomas Fréour, Laurent David
- article
- Cell Stem Cell, 2021, 28 (9), pp.1625-1640.e6. ⟨10.1016/j.stem.2021.04.027⟩
- Resume_court
- Understanding lineage specification during human pre-implantation development is a gateway to improv .....
- DOI
- DOI : 10.1016/j.stem.2021.04.027
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-
- titre
- Large-scale regulatory and signaling network assembly through linked open data
- auteur
- Marie Lefebvre, Alban Gaignard, Maxime Folschette, Jérémie Bourdon, Carito Guziolowski
- article
- Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2021, 2021, pp.baaa113. ⟨10.1093/database/baaa113⟩
- Resume_court
- Huge efforts are currently underway to address the organization of biological knowledge through link .....
- DOI
- DOI : 10.1093/database/baaa113
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Chromatin accessibility combined with enhancer clusters activation mediates heterogeneous response to dexamethasone in myeloma cells
- auteur
- Victor Gaborit, Jonathan Cruard, Catherine Guérin-Charbonnel, Jennifer Derrien, Jean-Baptiste Alberge, Elise Douillard, Nathalie Roi, Magali Devic, Loïc Campion, Frank Westermann, Philippe Moreau, Carl Herrmann, Jérémie Bourdon, Florence Magrangeas, Stephane Minvielle
- article
- 2021
- Resume_court
- Glucocorticoids (GC) effects occur through binding to the GC receptor (GR) which, once translocated .....
- DOI
- DOI : 10.1101/2021.09.06.459068
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-
2020
Journal articles
- titre
- Induction of human trophoblast stem cells from somatic cells and pluripotent stem cells
- auteur
- Gaël Castel, Dimitri Meistermann, Betty Bretin, Julie Firmin, Justine Blin, Sophie Loubersac, Alexandre Bruneau, Simon Chevolleau, Stéphanie Kilens, Caroline Chariau, Anne Gaignerie, Quentin Francheteau, Harunobu Kagawa, Eric Charpentier, Léa Flippe, Valentin François--Campion, Sandra Haider, Bianca Dietrich, Martin Knöfler, Takahiro Arima, Jérémie Bourdon, Nicolas Rivron, Damien Masson, Thierry Fournier, Hiroaki Okae, Thomas Fréour, Laurent David
- article
- Cell Reports, 2020, 33, pp.108419 -. ⟨10.1016/j.celrep.2020.108419⟩
- Resume_court
- Human trophoblast stem cells (hTSCs) derived from blastocysts and first-trimester cytotrophoblasts o .....
- DOI
- DOI : 10.1016/j.celrep.2020.108419
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-
- titre
- Bayesian Integrative Modeling of Genome-Scale Metabolic and Regulatory Networks
- auteur
- Hanen Mhamdi, Jérémie Bourdon, Abdelhalim Larhlimi, Mourad Elloumi
- article
- Informatics, 2020, 7 (1), pp.1. ⟨10.3390/informatics7010001⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/informatics7010001
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-
2019
Journal articles
- titre
- Probabilistic Modeling of Microbial Metabolic Networks for Integrating Partial Quantitative Knowledge Within the Nitrogen Cycle
- auteur
- Damien Eveillard, Nicholas Bouskill, Damien Vintache, Julien Gras, Bess Ward, Jérémie Bourdon
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 9, pp.1-9. ⟨10.3389/fmicb.2018.03298⟩
- Resume_court
- Understanding the interactions between microbial communities and their environment sufficiently to p .....
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2018.03298
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-
Book sections
- titre
- Logic and Linear Programs to Understand Cancer Response
- auteur
- Misbah Razzaq, Lokmane Chebouba, Pierre Le Jeune, Hanen Mhamdi, Carito Guziolowski, Jérémie Bourdon
- article
- Liò P., Zuliani P. (eds) Automated Reasoning for Systems Biology and Medicine. Computational Biology, vol 30. Springer, Cham, pp.191-213, 2019, ⟨10.1007/978-3-030-17297-8_7⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-17297-8_7
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-
Poster communications
- titre
- The limit of cell specification concept: a lesson from scRNA-Seq on early human development
- auteur
- Dimitri Meistermann, Sophie Loubersac, Arnaud Reignier, Valentin François-Campion, Thomas Fréour, Jérémie Bourdon, Laurent David
- article
- JOBIM 2019, Jul 2019, Nantes, France
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-
2018
Journal articles
- titre
- Parallel derivation of isogenic human primed and naive induced pluripotent stem cells
- auteur
- Stéphanie Kilens, Dimitri Meistermann, Diego Moreno, Caroline Chariau, Anne Gaignerie, Arnaud Reignier, Yohann Lelièvre, Miguel Casanova, Céline Vallot, Steven Nedellec, Léa Flippe, Julie Firmin, Juan Song, Eric Charpentier, Jenna Lammers, Audrey Donnart, Nadège Marec, Wallid Deb, Audrey Bihouée, Cédric Le Caignec, Claire Pecqueur, Richard Redon, Paul Barriere, Jérémie Bourdon, Vincent Pasque, Magali Soumillon, Tarjei Mikkelsen, Claire Rougeulle, Thomas Freour, Laurent David, Milieu Intérieur Consortium
- article
- Nature Communications, 2018, 9 (1), pp.302 - 314. ⟨10.1038/s41467-017-02107-w⟩
- Resume_court
- Induced pluripotent stem cells (iPSCs) have considerably impacted human developmental biology and re .....
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-017-02107-w
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-
- titre
- Computational Discovery of Dynamic Cell Line Specific Boolean Networks from Multiplex Time-Course Data
- auteur
- Misbah Razzaq, Loïc Paulevé, Anne Siegel, Julio Saez-Rodriguez, Jérémie Bourdon, Carito Guziolowski
- article
- PLoS Computational Biology, 2018, 14, pp.1-23. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006538⟩
- Resume_court
- Protein signaling networks are static views of dynamic processes where proteins go through many bioc .....
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pcbi.1006538
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-
Books
- titre
- Computing Diverse Boolean Networks from Phosphoproteomic Time Series Data
- auteur
- Misbah Razzaq, Roland Kaminski, Javier J Romero, Torsten Schaub, Jérémie Bourdon, Carito Guziolowski
- article
- pp.59-74, 2018
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Logic and Linear programs to understand cancer response
- auteur
- Misbah Razzaq, Lokmane Chebouba, Pierre Le Jeune, Hanen Mhamdi, Carito Guziolowski, Jérémie Bourdon
- article
- 2018
- Resume_court
- Understanding which are the key components of a system that distinguish a normal from a cancerous ce .....
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-
2017
Journal articles
- titre
- A Logic for Checking the Probabilistic Steady-State Properties of Reaction Networks
- auteur
- Vincent Picard, Anne Siegel, Jérémie Bourdon
- article
- Journal of Computational Biology, 2017, 24 (8), pp.1--12. ⟨10.1089/cmb.2017.0099⟩
- Resume_court
- Designing probabilistic reaction models and determining their stochastic kinetic parameters are majo .....
- DOI
- DOI : 10.1089/cmb.2017.0099
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-
- titre
- A multi-objective constraint-based approach for modeling genome-scale microbial ecosystems.
- auteur
- Marko Budinich, Jérémie Bourdon, Abdelhalim Larhlimi, Damien Eveillard
- article
- PLoS ONE, 2017, 12 (2), pp.e0171744
- Resume_court
- Interplay within microbial communities impacts ecosystems on several scales, and elucidation of the .....
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-
- titre
- Meneco, a Topology-Based Gap-Filling Tool Applicable to Degraded Genome-Wide Metabolic Networks
- auteur
- Sylvain Prigent, Clémence Frioux, Simon M Dittami, Sven Thiele, Abdelhalim Larhlimi, Guillaume Collet, Gutknecht Fabien, Jeanne Got, Damien Eveillard, Jérémie Bourdon, Frédéric Plewniak, Thierry Tonon, Anne Siegel
- article
- PLoS Computational Biology, 2017, 13 (1), pp.32. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005276⟩
- Resume_court
- Increasing amounts of sequence data are becoming available for a wide range of non-model organisms. .....
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pcbi.1005276
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-
Conference papers
- titre
- Regulation and signalization graph assembly through Linked Open Data
- auteur
- Marie Lefebvre, Jérémie Bourdon, Carito Guziolowski, Alban Gaignard
- article
- JOBIM 2017, Jul 2017, Lille, France
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-
2016
Journal articles
- titre
- Model of the delayed translation of cyclin B maternal mRNA after sea urchin fertilization
- auteur
- Vincent Picard, Odile Mulner-Lorillon, Jérémie Bourdon, Julia Morales, Patrick Cormier, Anne Siegel, Robert Bellé
- article
- Molecular Reproduction and Development, 2016, ⟨10.1002/mrd.22746⟩
- Resume_court
- Sea urchin eggs exhibit a cap-dependent increase in protein synthesis within minutes after fertiliza .....
- DOI
- DOI : 10.1002/mrd.22746
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-
- titre
- A combinatorial approach to products of Pisot substitutions
- auteur
- Valérie Berthé, Jérémie Bourdon, Timo Jolivet, Anne Siegel
- article
- Ergodic Theory and Dynamical Systems, 2016, 36 (6), pp.1757-1794. ⟨10.1017/etds.2014.141⟩
- Resume_court
- We define a generic algorithmic framework to prove a pure discrete spectrum for the substitutive sym .....
- DOI
- DOI : 10.1017/etds.2014.141
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-
Book sections
- titre
- Modélisation et prédiction du fonctionnement et de la dynamique des écosystèmes
- auteur
- Damien Eveillard, Xavier Raynaud, Jérémie Bourdon, Alain Franc, Frederic Plewniak
- article
- La génomique environnemetale : la révolution du séquençage à haut débit, 2016
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modeling and predicting behaviors and dynamics of ecosystems
- auteur
- Damien Eveillard, Xavier Raynaud, Jérémie Bourdon, Alain Franc, Frédéric Plewniak
- article
- Insight on environmental genomics, the high-throughput sequencing revolution, 2016
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-
Special issue
- titre
- Selected papers from the Computational Methods in Systems Biology 2015 conference
- auteur
- Jérémie Bourdon, Olivier Roux
- article
- BioSystems, 149, pp.1-2, 2016, ⟨10.1016/j.biosystems.2016.10.006⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.biosystems.2016.10.006
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-
2015
Journal articles
- titre
- Multivariate Normal Approximation for the Stochastic Simulation Algorithm: Limit Theorem and Applications
- auteur
- Vincent Picard, Anne Siegel, Jérémie Bourdon
- article
- Electronic Notes in Theoretical Computer Science, 2015, 316C, pp.67-82. ⟨10.1016/j.entcs.2015.06.011⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.entcs.2015.06.011
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-
Conference papers
- titre
- OPINION PAPER Evolutionary Constraint-Based Formulation Requires New Bi-level Solving Techniques
- auteur
- Marko Budinich, Jérémie Bourdon, Abdelhalim Larhlimi, Damien Eveillard
- article
- 13th International Conference on Computational Methods in Systems Biology CMSB 2015, Sep 2015, Nantes, France. pp.279-281, ⟨10.1007/978-3-319-23401-4_23⟩
- Resume_court
- Constraint Based Methods had been successfully used to simulate genome-scale metabolic behaviors ove .....
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-23401-4_23
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-
- titre
- A Logic for Checking the Probabilistic Steady-State Properties of Reaction Networks
- auteur
- Vincent Picard, Anne Siegel, Jérémie Bourdon
- article
- IJCAI workshop BAI: Bioinformatics and Artificial Intelligence, 2015, Buenos Aeres, Argentina
- Resume_court
- Designing probabilistic reaction models and determining their stochastic kinetic parameters are majo .....
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-
Books
- titre
- Computational Methods in Systems Biology - 13th International Conference, CMSB 2015, Nantes, France, September 16-18, 2015, Proceedings
- auteur
- Olivier F. Roux, Jérémie Bourdon
- article
- Olivier F. Roux and Jérémie Bourdon. Springer, 9308, 2015, Lecture Notes in Computer Science, 978-3-319-23400-7. ⟨10.1007/978-3-319-23401-4⟩
- Resume_court
- no abstract
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-23401-4
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Impact of the species compartment definition on quantitative modeling of microbial communities
- auteur
- Marko Budinich, Jérémie Bourdon, Damien Eveillard
- article
- 2015
- Resume_court
- Recent advances in genome-scale metabolic network reconstruction paved the way to the use of quantit .....
- DOI
- DOI : 10.1101/018010
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-
2014
Journal articles
- titre
- Modelization of the regulation of protein synthesis following fertilization in sea urchin shows requirement of two processes: a destabilization of eIF4E:4E-BP complex and a great stimulation of the 4E-BP-degradation mechanism, both rapamycin-sensitive
- auteur
- Sébastien Laurent, Adrien Richard, Odile Mulner-Lorillon, Julia Morales, Didier Flament, Virginie Glippa, Jérémie Bourdon, Pauline Gosselin, Anne Siegel, Patrick Cormier, Robert Bellé
- article
- Frontiers in Genetics, 2014, 5, pp.117. ⟨10.3389/fgene.2014.00117⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fgene.2014.00117
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-
- titre
- Exploring metabolism flexibility in complex organisms through quantitative study of precursor sets for system outputs
- auteur
- Oumarou Abdou-Arbi, Sophie Lemosquet, Jaap J. van Milgen, Anne Siegel, Jérémie Bourdon
- article
- BMC Systems Biology, 2014, 8 (1), pp.8. ⟨10.1186/1752-0509-8-8⟩
- Resume_court
- Background When studying metabolism at the organ level, a major challenge is to understand the matte .....
- DOI
- DOI : 10.1186/1752-0509-8-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Multivariate Normal Approximation for the Stochastic Simulation Algorithm: limit theorem and applications
- auteur
- Vincent Picard, Anne Siegel, Jérémie Bourdon
- article
- SASB - 5th International Workshop on Static Analysis and Systems Biology, 2014, Munchen, Germany
- Resume_court
- Stochastic approaches in systems biology are being used increasingly to model the heterogeneity and .....
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2013
Journal articles
- titre
- Large deviation properties for patterns
- auteur
- Mireille Regnier, Jérémie Bourdon
- article
- Journal of Discrete Algorithms, 2013, ⟨10.1016/j.jda.2013.09.004⟩
- Resume_court
- Deciding whether a given pattern is over- or under-represented according to a given background model .....
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jda.2013.09.004
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Generating discrete planes with substitutions
- auteur
- Valerie Berthe, Jérémie Bourdon, Timo Jolivet, Anne Siegel
- article
- WORDS - 9th International Conference on Words - 2013, Sep 2013, Turku, Finland
- Resume_court
- Given a finite set S of unimodular Pisot substitutions, we provide a method for characterizing the i .....
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- XII Des données haut-débit à la modélisation des écosystèmes
- auteur
- Damien Eveillard, Xavier Raynaud, Jérémie Bourdon, Alain Franc, Frederic Plewniak
- article
- Prospective Génomique Environnementale, , pp.83-89, 2013
- Accès au bibtex
-
Reports
- titre
- MeDUSA: a sage-based tool for computing the stoichiometric capacitance of a metabolic network
- auteur
- Marko Budinich, Damien Eveillard, Jérémie Bourdon, Abdelhalim Larhlimi
- article
- 2013
- Resume_court
- Optimization-based analysis of metabolic networks have been used to design metabolic engineering str .....
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2012
Conference papers
- titre
- Systems biology approaches at cellular level in the model organism Ectocarpus siliculosus to better understand brown algal physiology
- auteur
- Thierry Tonon, Patricia Bonin, Sylvain Prigent, Z. Shao, Agnès Groisillier, Sylvie Rousvoal, Sophie Goulitquer, Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Catherine Boyen, Anne Siegel
- article
- Esil 2012: algal post-genomics, Apr 2012, Roscoff, France
- Resume_court
- Application of systems biology approaches for benchmark model organisms has helped to get insights o .....
- Accès au bibtex
-
- titre
- Large deviation properties for patterns
- auteur
- Jérémie Bourdon, Mireille Regnier
- article
- LSD&LAW 2012, Simon J. Puglisi and Golnaz Badkobeh, Feb 2012, Londres, United Kingdom
- Resume_court
- Deciding whether a given pattern is overrepresented or under-represented according to a given backgr .....
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Sources Probabilistes: des séquences aux systèmes
- auteur
- Jérémie Bourdon
- article
- Bio-informatique [q-bio.QM]. Université de Nantes, 2012
- Resume_court
- Ce mémoire est un recueil et une synthèse de plusieurs études en analyse en moyenne d'algorithmes .....
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-
2011
Journal articles
- titre
- Toward systems biology in brown algae to explore acclimation and adaptation to the shore environment.
- auteur
- Thierry Tonon, Damien Eveillard, Sylvain Prigent, Jérémie Bourdon, Philippe Potin, Catherine Boyen, Anne Siegel
- article
- OMICS, 2011, 15 (12), pp.883-892. ⟨10.1089/omi.2011.0089⟩
- Resume_court
- Brown algae belong to a phylogenetic lineage distantly related to land plants and animals. They are .....
- DOI
- DOI : 10.1089/omi.2011.0089
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Integrating quantitative knowledge into a qualitative gene regulatory network.
- auteur
- Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Anne Siegel
- article
- PLoS Computational Biology, 2011, 7 (9), pp.e1002157. ⟨10.1371/journal.pcbi.1002157⟩
- Resume_court
- Despite recent improvements in molecular techniques, biological knowledge remains incomplete. Any th .....
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pcbi.1002157
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-
Conference papers
- titre
- Average-case analysis methods dedicated to the study of Biological Networks
- auteur
- Jérémie Bourdon
- article
- Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB) 2011, Jul 2011, Moscou, Russia
- Resume_court
- Despite recent improvements in molecular techniques, biological knowledge remains incomplete. Any th .....
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Probabilistic Approaches for Investigating Biological Networks
- auteur
- Jérémie Bourdon, Damien Eveillard
- article
- Mourad Elloumi, Albert Y. Zomaya. Algorithms in Computational Molecular Biology: Techniques, Approaches and Applications, Wiley, pp.1066, 2011
- Accès au bibtex
-
2010
Journal articles
- titre
- Statistical Properties of Factor Oracles
- auteur
- Jérémie Bourdon, Irena Rusu
- article
- Journal of Discrete Algorithms, 2010, LNCS, 9 (2011), pp.59-66. ⟨10.1007/978-3-642-02441-2⟩
- Resume_court
- Factor and suffix oracles provide an economic and efficient solution for storing all the factors and .....
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-02441-2
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A parallel scheme for comparing transcription factor binding sites matrices
- auteur
- Solenne Carat, Rémi Houlgatte, Jérémie Bourdon
- article
- Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2010, 8 (3), pp.18
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Complex update strategies for Probabilistic Boolean Networks
- auteur
- Théo Merle, Jérémie Bourdon
- article
- 7th Workshop on Computational Systems Biology, Jun 2010, Luxembourg, France. pp.4
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- A generic stoichiometric model to analyse the metabolic flexibility of the mammary gland in lactating dairy cows
- auteur
- Sophie Lemosquet, Oumarou Abdou-Arbi, Anne Siegel, Jocelyne Guinard-Flament, Jaap J. van Milgen, Jérémie Bourdon
- article
- D. Sauvant, J. Van Milgen, P. Faverdin and N. Friggens. Modelling nutrient digestion and utilization in farm animals, Wageningen Academic Publishers, 2010, 978-90-8686-156-9
- Accès au bibtex
-
2009
Journal articles
- titre
- Temporal constraints of a gene regulatory network: refining a qualitative simulation
- auteur
- Jamil Ahmad, Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Jonathan Fromentin, Olivier Roux, Christine Sinoquet
- article
- BioSystems, 2009, pp.10.1016/j.biosystems.2009.05.002. ⟨10.1016/j.biosystems.2009.05.002⟩
- Resume_court
- The modelling of gene regulatory networks (GRNs) has classically been addressed through very differe .....
- DOI
- DOI : 10.1016/j.biosystems.2009.05.002
- Accès au bibtex
-
- titre
- Temporal constraints of a gene regulatory network: Refining a qualitative simulation.
- auteur
- Jamil Ahmad, Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Jonathan Fromentin, Olivier Roux, Christine Sinoquet
- article
- BioSystems, 2009, 98 (3), pp.149-159. ⟨10.1016/j.biosystems.2009.05.002⟩
- Resume_court
- The modelling of gene regulatory networks (GRNs) has classically been addressed through very differe .....
- DOI
- DOI : 10.1016/j.biosystems.2009.05.002
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- A statistical method for PWM clustering
- auteur
- Solenne Carat, Rémi Houlgatte, Jérémie Bourdon
- article
- Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Jul 2009, Moscou, Russia. pp.59-60
- Accès au bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Qualitative modelling and analysis of gene regulatory networks: application to the adaptation of Escherichia coli bacterium to carbon availability
- auteur
- Jamil Ahmad, Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Jonathan Fromentin, Olivier Roux, Christine Sinoquet
- article
- 2009
- Resume_court
- Attempts to model Gene Regulatory Networks (GRNs) have yielded very different approaches. Among othe .....
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2007
Journal articles
- titre
- Combinations of cytochrome P450 gene polymorphisms enhancing the risk for sporadic colorectal cancer related to red meat consumption.
- auteur
- Sébastien Küry, Bruno Buecher, Sébastien Robiou-Du-Pont, Catherine Scoul, Véronique Sébille, Hélène Colman, Claire Le Houérou, Tanguy Le Neel, Jérémie Bourdon, Roger Faroux, Jean Ollivry, Bernard Lafraise, Louis-Dominique Chupin, Stéphane Bézieau
- article
- Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention, 2007, 16 (7), pp.1460-7. ⟨10.1158/1055-9965.EPI-07-0236⟩
- Resume_court
- Susceptibility to sporadic colorectal cancers (CRC) is generally thought to be the sum of complex in .....
- DOI
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2002
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- Dynamical Analysis of alpha-Euclidean Algorithms
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- Journal of Algorithms in Cognition, Informatics and Logic, 2002, 1 (44), pp.246--285
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2001
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