Publications HAL de Mathieu, Giraud

2024

auteur
Francesco Maccarini, Maël Oudin, Mathieu Giraud, Florence Levé
titre
Co-creative orchestration of Angeles with layer scores and orchestration plans
article
International Conference on Artificial Intelligence in Music, Sound, Art and Design (EvoMUSART 2024), 2024, Aberystwyth, United Kingdom
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2023

auteur
Aurélien Bertiaux, François Gabrielli, Mathieu Giraud, Florence Levé
titre
Associations between music training and the dynamics of writing music by hand
article
Musicae Scientiae, 2023, 27 (1), ⟨10.1177/1029864920972145⟩
DOI
DOI : 10.1177/1029864920972145
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https://hal.science/hal-02979816/file/writing-by-hand.pdf BibTex
auteur
Cyprien Borée, Mathieu Giraud, Mikaël Salson
titre
Alignment-free detection and seed-based identification of multi-loci V(D)J recombinations in Vidjil-algo
article
2023
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https://hal.science/hal-04361907/file/vidjil-algo.pdf BibTex
auteur
Vanessa Nina Borsan, Mathieu Giraud, Richard Groult
titre
The Games We Play: Exploring The Impact of ISMIR on Musicology
article
International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2023), Nov 2023, Milano, Italy. pp.474-481, ⟨10.5281/zenodo.10265344⟩
DOI
DOI : 10.5281/zenodo.10265344
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https://hal.science/hal-04142194/file/2023-ismir-impact-musicology.pdf BibTex
auteur
Vanessa Nina Borsan, Mathieu Giraud, Richard Groult, Thierry Lecroq
titre
Adding descriptors to melodies improves pattern matching: a study on Slovenian folk songs
article
International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2023), 2023, Milan, Italy. pp.474-481, ⟨10.5281/zenodo.10265328⟩
DOI
DOI : 10.5281/zenodo.10265328
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https://hal.science/hal-04142315/file/2023-ismir-descriptors-pattern-matching.pdf BibTex
auteur
Isabelle Catala, Roberto Di Cosmo, Mathieu Giraud, Daniel Le Berre, Violaine Louvet, Sophie Renaudin
titre
Establishing a national research software award
article
2023
DOI
DOI : 10.12688/openreseurope.16069.1
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https://hal.science/hal-04258977/file/2023-Blanc--National-Software-Award--v1.pdf BibTex
auteur
Mark Gotham, Johannes Hentschel, Louis Couturier, Nathan Dykeaylen, Martin Rohrmeier, Mathieu Giraud
titre
The ‘Measure Map’: an inter-operable standard for aligning symbolic music
article
International Conference on Digital Libraries for Musicology (DLfM 2023), Nov 2023, Milano, Italy. ⟨10.1145/3625135.3625136⟩
DOI
DOI : 10.1145/3625135.3625136
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https://hal.science/hal-04197400/file/2023-dlfm-measure-map.pdf BibTex
auteur
Emmanuel Leguy, Mathieu Giraud, Lou Garczynski, Charles Ballester
titre
Dezrann
article
2023, ⟨swh:1:dir:a3d32658da7e6a97daa74fcd42f21b93b5c94f91⟩
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BibTex
auteur
Patrice Thibaud, Mathieu Giraud
titre
Analyse et essai de reconstruction de structures arborescentes des grilles de jazz
article
Journées d'Informatique Musicale (JIM 2023), May 2023, Paris, France. pp.62-67
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https://hal.science/hal-04196644/file/2023-jim-thibaud-giraud.pdf BibTex

2022

auteur
Ken Déguernel, Mathieu Giraud, Richard Groult, Sebastien Gulluni
titre
Personalizing AI for Co-Creative Music Composition from Melody to Structure
article
Sound and Music Computing (SMC 2022), 2022, Saint-Étienne, France. pp.314-321, ⟨10.5281/zenodo.6573287⟩
DOI
DOI : 10.5281/zenodo.6573287
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https://hal.science/hal-03618015/file/2022-smc-personalizing-ai.pdf BibTex
auteur
Louis Garczynski, Mathieu Giraud, Emmanuel Leguy, Philippe Rigaux
titre
Modeling and Editing Cross-Modal Synchronization on a Label Web Canvas
article
Music Encoding Conference (MEC 2022), 2022, Halifax, Canada
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https://hal.science/hal-03583179/file/2022-mec-cross-modal-sychronization.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Florent Jacquemard
titre
Weighted Automata Computation of Edit Distances with Consolidations and Fragmentations
article
Information and Computation, 2022, 282, pp.104652. ⟨10.1016/j.ic.2020.104652⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ic.2020.104652
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https://inria.hal.science/hal-01857267/file/ms-automata.pdf BibTex
auteur
Anne Langlois de Septenville, Myriam Boudjoghra, Clotilde Bravetti, Marine Armand, Mikaël Salson, Mathieu Giraud, Frederic Davi
titre
Immunoglobulin Gene Mutational Status Assessment by Next Generation Sequencing in Chronic Lymphocytic Leukemia
article
Anton W. Langerak. Immunogenetics, 2453, Springer, pp.153-167, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-2115-8. ⟨10.1007/978-1-0716-2115-8_10⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-1-0716-2115-8_10
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https://hal.science/hal-03684717/file/2022-Septenville-protocol-mutational-status-CLL.pdf BibTex
auteur
Dinh-Viet-Toan Le, Mathieu Giraud, Florence Levé, Francesco Maccarini
titre
A Corpus Describing Orchestral Texture in First Movements of Classical and Early-Romantic Symphonies
article
Digital Libraries for Musicology (DLfM 2022), 2022, Prague, Czech Republic. pp.22-35
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https://hal.science/hal-03663112/file/2022-dlfm-corpus-orchestral-texture.pdf BibTex
auteur
Alice Sauda, Mathieu Giraud, Emmanuel Leguy
titre
Soutenir en classe l'écoute active, l'autonomie et l'échange en analyse musicale avec la plateforme web Dezrann
article
Journées d'Informatique Musicale (JIM 2022) / Sound and Music Computing (SMC 2022), 2022, Saint-Étienne, France. pp.617-623, ⟨10.5281/zenodo.6800855⟩
DOI
DOI : 10.5281/zenodo.6800855
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https://hal.science/hal-03618017/file/2022-jim-dezrann-ecoute-active.pdf BibTex
auteur
Perrine Vantalon, Mathieu Giraud, Richard Groult, Thierry Lecroq
titre
Towards modeling alternating patterns through inter-notes relations
article
23rd International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2022), Late-Breaking Demo Session, Dec 2022, Bangalore, India. , pp.LV10
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https://hal.science/hal-03951420/file/2022-ismir-lbd-alternating-patterns.pdf BibTex
auteur
Patrick Villarese, Chrystelle Abdo, Matthieu Bertrand, Florian Thonier, Mathieu Giraud, Mikaël Salson, Elizabeth Macintyre
titre
One-Step Next-Generation Sequencing of Immunoglobulin and T-Cell Receptor Gene Recombinations for MRD Marker Identification in Acute Lymphoblastic Leukemia
article
Anton W. Langerak. Immunogenetics. Methods and Protocols, 2453, Springer, pp.43-59, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-2115-8. ⟨10.1007/978-1-0716-2115-8_3⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-1-0716-2115-8_3
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https://hal.science/hal-03684695/file/2022-Villarese-protocol-marker-identification-ALL.pdf BibTex

2021

auteur
Louis Bigo, Mathieu Giraud, Florence Levé
titre
From local markers to global form: Computational modeling of musical structure
article
2021
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BibTex
auteur
Jules Cournut, Louis Bigo, Mathieu Giraud, Nicolas Martin, David Régnier
titre
What are the most used guitar positions?
article
International Conference on Digital Libraries for Musicology (DLfM 2021), 2021, Online, United Kingdom. pp.84-92, ⟨10.1145/3469013.3469024⟩
DOI
DOI : 10.1145/3469013.3469024
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https://hal.science/hal-03279863/file/2021-dlfm-guitar-positions.pdf BibTex
auteur
Gianluca Micchi, Louis Bigo, Mathieu Giraud, Richard Groult, Florence Levé
titre
I Keep Counting : An Experiment in Human/AI Co-creative Songwriting
article
Transactions of the International Society for Music Information Retrieval (TISMIR), 2021, 4 (1), pp.263-275. ⟨10.5334/tismir.93⟩
DOI
DOI : 10.5334/tismir.93
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https://hal.science/hal-03399076/file/ikc-tismir.pdf BibTex
auteur
Louis Soum-Fontez, Mathieu Giraud, Nicolas Guiomard-Kagan, Florence Levé
titre
Symbolic Textural Features and Melody/Accompaniment Detection in String Quartets
article
International Symposium on Computer Music Multidisciplinary Research (CMMR 2021), Nov 2021, Online, Japan. pp.175-184
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https://hal.science/hal-03322543/file/2021-cmmr-melody-texture.pdf BibTex

2020

auteur
Rony Abecidan, Mathieu Giraud, Gianluca Micchi
titre
Towards Custom Dilated Convolutions on Pitch Spaces
article
International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2020), Late-Breaking Demo Session, 2020, Montréal, Canada. Extended Abstracts for the Late-Breaking Demo Session of the 21st Int. Society for Music Information Retrieval Conference
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https://hal.science/hal-02959676/file/ISMIR2020-LBD-436-poster.pdf BibTex
auteur
Jules Cournut, Louis Bigo, Mathieu Giraud, Nicolas Martin
titre
Encodages de tablatures pour l'analyse de musique pour guitare
article
Journées d'Informatique Musicale (JIM 2020), 2020, Strasbourg (en ligne), France
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https://hal.science/hal-02934382/file/COURNUT_J._BIGO_L._GIRAUD_M._MARTIN_N._Encodages_de_tablatures_pour_l_analyse_de_musique_pour_guitare_1.pdf BibTex
auteur
Laurent Feisthauer, Louis Bigo, Mathieu Giraud, Florence Levé
titre
Estimating keys and modulations in musical pieces
article
Sound and Music Computing Conference (SMC 2020), Simone Spagnol; Andrea Valle, Jun 2020, Torino, Italy
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https://hal.science/hal-02886399/file/2020-smc-modulations.pdf BibTex
auteur
Gianluca Micchi, Mark Gotham, Mathieu Giraud
titre
Not All Roads Lead to Rome: Pitch Representation and Model Architecture for Automatic Harmonic Analysis
article
Transactions of the International Society for Music Information Retrieval (TISMIR), 2020, 3 (1), pp.42-54. ⟨10.5334/tismir.45⟩
DOI
DOI : 10.5334/tismir.45
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https://hal.science/hal-02934374/file/2020-tismir-rome.pdf BibTex

2019

auteur
Pierre Allegraud, Véronique Béland, Quentin Denimal, Mathieu Giraud, Richard Groult, Emmanuel Leguy, Guillaume Libersat
titre
As We Are Blind
article
Œuvres et Recherches, 2019, pp.2019:01
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https://hal.science/hal-02379772/file/2019-01-As-We-Are-Blind.pdf BibTex
auteur
Pierre Allegraud, Louis Bigo, Laurent Feisthauer, Mathieu Giraud, Richard Groult, Emmanuel Leguy, Florence Levé
titre
Learning Sonata Form Structure on Mozart's String Quartets
article
Transactions of the International Society for Music Information Retrieval (TISMIR), 2019, 2 (1), pp.82-96. ⟨10.5334/tismir.27⟩
DOI
DOI : 10.5334/tismir.27
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https://hal.science/hal-02366640/file/2019-tismir-sonata-form.pdf BibTex
auteur
Moreno Andreatta, Gérard Assayag, Myriam Desainte-Catherine, Jean-Louis Giavitto, Mathieu Giraud, Yann Orlarey, Anne Sèdes
titre
L'informatique musicale : informatique et musique en interdisciplinarité
article
Journées d'Informatique Musicale (JIM 2019), May 2019, Bayonne, France
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https://hal.science/hal-02348292/file/AndreattaAssayagDesainteCatherineGiavittoGiraudOrlareySedes.pdf BibTex
auteur
Henry Boisgibault, Mathieu Giraud, Florent Jacquemard
titre
What does the Mongeau-Sankoff algorithm compute?
article
2019
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https://inria.hal.science/hal-02340896/file/ms-music.pdf BibTex
auteur
Monika Brüggemann, Michaela Kotrova, Henrik Knecht, Jack Bartram, Myriam Boudjogrha, Vojtech Bystry, Grazia Fazio, Eva Froňková, Mathieu Giraud, Andrea Grioni, Jeremy Hancock, Dietrich Herrmann, Cristina Jimenez, Adam Krejci, John Moppett, Tomas Reigl, Mikaël Salson, Blanca Scheijen, Martin Schwarz, Simona Songia, Michael Svaton, Jacques J. M. van Dongen, Patrick Villarese, Stephanie Wakeman, Gary Wright, Giovanni Cazzaniga, Frédéric Davi, Ramón García-Sanz, David Davi, Patricia Groenen, Michael Hummel, Elizabeth Macintyre, Kostas C Stamatopoulos, Christiane Pott, Jan Trka, Nikos Darzentas, Anton Langerak, David Gonzalez
titre
Standardized next-generation sequencing of immunoglobulin and T-cell receptor gene recombinations for MRD marker identification in acute lymphoblastic leukaemia; a EuroClonality-NGS validation study
article
Leukemia, 2019, ⟨10.1038/s41375-019-0496-7⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41375-019-0496-7
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https://hal.science/hal-02169053/file/s41375-019-0496-7.pdf BibTex
auteur
Bryan Deliencourt, Mathieu Giraud, Julien Miranda, Stanislas Larnier, Ariane Herbulot, Michel Devy
titre
Génération photo-réaliste de défauts sur des images de surfaces extérieures d'avions acquises par un drone autonome
article
ORASIS, journées francophones des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, May 2019, Saint-Dié-des-Vosges, France
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https://hal.science/hal-02164953/file/MIRANDA_ORASIS2019.pdf BibTex
auteur
Laurent Feisthauer, Louis Bigo, Mathieu Giraud, Florence Levé
titre
Modelling Keys and Modulation with Scales and Harmonic Progressions
article
Digital Music Research Network Workshop (DMRN+14), 2019, London, France
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BibTex
auteur
Laurent Feisthauer, Louis Bigo, Mathieu Giraud
titre
Modeling and learning structural breaks in sonata forms
article
International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2019), 2019, Delft, Netherlands. ⟨10.5281/zenodo.3527828⟩
DOI
DOI : 10.5281/zenodo.3527828
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https://hal.science/hal-02162936/file/2019-ismir-medial-caesura.pdf BibTex
auteur
Laurent Feisthauer, Louis Bigo, Mathieu Giraud, Florence Levé
titre
Vers une recherche automatisée du parcours tonal
article
Les sciences de la musique, 2019, Paris, France.
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BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Valkiri Valkiri
titre
Algo-Rythme
article
Œuvres et Recherches, 2019, pp.2019:05
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BibTex
auteur
Ling Ma, Mathieu Giraud, Emmanuel Leguy
titre
Realtime collaborative annotation of music scores with Dezrann
article
International Symposium on Computer Music Modeling and Retrieval (CMMR 2019), 2019, Marseille, France
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BibTex

2018

auteur
Aurélien Béliard, Marc Duez, Mathieu Giraud, Ryan Herbert, Tatiana Rocher, Mikaël Salson, Florian Thonier
titre
Vidjil
article
2018, ⟨swh:1:dir:919b1f80b59a0d7139e816a8acd45b5139032f55;origin=https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil;visit=swh:1:snp:291e56d00815773ebeae2102804ef8be5eb62b86;anchor=swh:1:rev:5d5ebe597a7271b8c4296da422de1ad81bee0804⟩
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BibTex
auteur
Louis Bigo, Mathieu Giraud, Richard Groult, Florence Levé
titre
Actes des Journées d'Informatique Musicale (JIM 2018), Amiens
article
Journées d'Informatique Musicale (JIM 2018), May 2018, Amiens, France. , 2018
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https://hal.science/hal-01790928/file/jim2018-amiens-actes.pdf BibTex
auteur
Louis Bigo, Laurent Feisthauer, Mathieu Giraud, Florence Levé
titre
Relevance of musical features for cadence detection
article
International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2018), 2018, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01801060/file/2018-ismir-cadences.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud
titre
Using Dezrann in Musicology and MIR Research
article
Digital Libraries for Musicology (DLfM 2018), 2018, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01871713/file/2018-dlfm-dezrann.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Richard Groult, Emmanuel Leguy
titre
Dezrann, a Web Framework to Share Music Analysis
article
International Conference on Technologies for Music Notation and Representation (TENOR 2018), May 2018, Montréal, Canada. pp.104-110
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https://hal.science/hal-01796787/file/2018-dezrann-tenor.pdf BibTex
auteur
Yoel Greenberg, Beate Kutschke, Mathieu Giraud, David Huron
titre
Fixing the Horse before the Cart: Reconstructing the Genesis of Classical Forms through Big Data and Computational Methods
article
2018
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BibTex
auteur
Tatiana Rocher, Mathieu Giraud, Mikaël Salson
titre
Indexing labeled sequences
article
PeerJ Computer Science, 2018, 4, pp.1-14. ⟨10.7717/peerj-cs.148⟩
DOI
DOI : 10.7717/peerj-cs.148
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https://hal.science/hal-01743104/file/2018-Rocher-indexing-labeled-sequences.pdf BibTex

2017

auteur
Louis Bigo, Mathieu Giraud, Richard Groult, Nicolas Guiomard-Kagan, Florence Levé
titre
Sketching Sonata Form Structure in Selected Classical String Quartets
article
ISMIR 2017 - International Society for Music Information Retrieval Conference, 2017, Suzhou, China
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https://hal.science/hal-01568703/file/2017-ismir-sonata.pdf BibTex
auteur
Julien Debove, David Durand, Marion Giraud, Mathieu Giraud, Richard Groult, Nicolas Guiomard-Kagan, Ophélie Hérouart, Emmanuel Leguy, Florence Levé, Nathan Marécaux, Hervé Midavaine
titre
Les pierres musicales, un dispositif pédagogique interactif
article
Journées d'Informatique Musicale (JIM 2017), 2017, Paris, France
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https://hal.science/hal-01517519/file/2017-jim-pierres-musicales.pdf BibTex
auteur
Anton W Langerak, Monika Brüggemann, Frederic Davi, Nikos Darzentas, Jacques J. M. van Dongen, David Gonzalez, Gianni Cazzaniga, Véronique Giudicelli, Marie-Paule Lefranc, Mathieu Giraud, Elizabeth Macintyre, Michael Hummel, Christiane Pott, Patricia Jta Groenen, Kostas Stamatopoulos
titre
High-Throughput Immunogenetics for Clinical and Research Applications in Immunohematology: Potential and Challenges.
article
Journal of Immunology, 2017, 198 (10), pp.3765-3774. ⟨10.4049/jimmunol.1602050⟩
DOI
DOI : 10.4049/jimmunol.1602050
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BibTex
auteur
Emmanuel Leguy, Richard Groult, Mathieu Giraud
titre
Une application web interactive pour l'analyse musicale
article
European Music Analysis Conference (EuroMAC 2017), 2017, Strasbourg, France. 2017
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https://hal.science/hal-01517517/file/2017-euromac-application-web.pdf BibTex
auteur
Mikael Salson, Mathieu Giraud, Aurélie Caillault, Nathalie Grardel, Nicolas Duployez, Yann Ferret, Marc Duez, Ryan Herbert, Tatiana Rocher, Shéhérazade Sebda, Sabine Quief, Céline Villenet, Martin Figeac, Claude Preudhomme
titre
High-throughput sequencing in acute lymphoblastic leukemia: Follow-up of minimal residual disease and emergence of new clones
article
Leukemia Research, 2017, 53, pp.1-7. ⟨10.1016/j.leukres.2016.11.009⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.leukres.2016.11.009
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https://hal.science/hal-01404817/file/2017-SalsonGiraudCaillaultGrardel-mrd-hal.pdf BibTex

2016

auteur
Marc Duez, Mathieu Giraud, Ryan Herbert, Tatiana Rocher, Mikael Salson, Florian Thonier
titre
Vidjil: A Web Platform for Analysis of High-Throughput Repertoire Sequencing
article
PLoS ONE, 2016, 11 (11), ⟨10.1371/journal.pone.0166126⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0166126
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https://hal.science/hal-01397079/file/journal.pone.0166126.PDF BibTex
auteur
Yann Ferret, Aurélie Caillault, Shéhérazade Sebda, Marc Duez, Nathalie Grardel, Nicolas Duployez, Céline Villenet, Martin Figeac, Claude Preudhomme, Mikaël Salson, Mathieu Giraud
titre
Multi-loci diagnosis of acute lymphoblastic leukaemia with high-throughput sequencing and bioinformatics analysis
article
British Journal of Haematology, 2016, 173 (3), pp.413-420. ⟨10.1111/bjh.13981⟩
DOI
DOI : 10.1111/bjh.13981
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https://hal.science/hal-01279160/file/2016-FerretCaillault-multi-loci-diagnosis-hal.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Richard Groult, Florence Levé
titre
Computational Analysis of Musical Form
article
David Meredith. Computational Music Analysis, Springer, pp.113-136, 2016, 978-3-319-25929-1. ⟨10.1007/978-3-319-25931-4_5⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-25931-4_5
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BibTex
auteur
Mathieu Giraud
titre
Compter les globules blancs, analyser les partitions
article
Informatique [cs]. Université de Lille 1 – Sciences et Technologies, 2016
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https://theses.hal.science/tel-01577763/file/2016-hdr-giraud.pdf BibTex
auteur
Nicolas Guiomard-Kagan, Mathieu Giraud, Richard Groult, Florence Levé
titre
Improving voice separation by better connecting contigs
article
International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2016), Aug 2016, New York, United States
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https://hal.science/hal-01331551/file/2016-ismir-connecting-contigs%20%281%29.pdf BibTex
auteur
Tatiana Rocher, Mathieu Giraud, Mikael Salson
titre
Indexer un ensemble de séquences ADN annotées
article
JOBIM, Jun 2016, Lyon, France
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https://hal.science/hal-01576319/file/2016-Rocher-jobim-indexer-sequences-annotees.pdf BibTex
auteur
Mikael Salson, Aurélie Caillault, Marc Duez, Yann Ferret, Alice Fievet, Michaela Kotrova, Florian Thonier, Patrick Villarese, Stephanie Wakeman, Gary Wright, Mathieu Giraud
titre
A dataset of sequences with manually curated V(D)J designations
article
2016
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BibTex

2015

auteur
Guillaume Bagan, Mathieu Giraud, Richard Groult, Emmanuel Leguy
titre
Modélisation et visualisation de schémas d'analyse musicale avec music21
article
Journées d'Informatique Musicale (JIM 2015), 2015, Montréal, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01135118/file/2015-jim-schema.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Sławek Staworko
titre
Modeling Musical Structure with Parametric Grammars
article
Mathematics and Computation in Music (MCM 2015), Jun 2015, London, United Kingdom. pp.85-96, ⟨10.1007/978-3-319-20603-5_8⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-20603-5_8
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https://inria.hal.science/hal-01205422/file/staworko-mcm15.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Richard Groult, Emmanuel Leguy, Florence Levé
titre
Computational Fugue Analysis
article
Computer Music Journal, 2015, 39 (2), pp.77-96. ⟨10.1162/COMJ_a_00300⟩
DOI
DOI : 10.1162/COMJ_a_00300
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https://hal.science/hal-01113520/file/2015-cmj-fugues.pdf BibTex
auteur
Nicolas Guiomard-Kagan, Mathieu Giraud, Richard Groult, Florence Levé
titre
Comparing Voice and Stream Segmentation Algorithms
article
International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2015), Oct 2015, Malaga, Spain. pp.493-499
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https://hal.science/hal-01246693/file/2015-ismir-voices-streams.pdf BibTex
auteur
Michaela Kotrova, Katerina Muzikova, Ester Mejstrikova, Michaela Novakova, Violeta Bakardjieva-Mihaylova, Karel Fiser, Jan Stuchly, Mathieu Giraud, Mikael Salson, Christiane Pott, Monika Brüggemann, Marc Füllgrabe, Jan Stary, Jan Trka, Eva Fronkova
titre
The predictive strength of next-generation sequencing MRD detection for relapse compared with current methods in childhood ALL.
article
Blood, 2015, 126 (8), pp.1045-7. ⟨10.1182/blood-2015-07-655159⟩
DOI
DOI : 10.1182/blood-2015-07-655159
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auteur
Lucile Lefèvre, Hanin Omeiri, Ludivine Drougat, Constanze Hantel, Mathieu Giraud, Pierre Val, S Rodriguez, K Perlemoine, Corinne Blugeon, Felix Beuschlein, Aurélien de Reyniès, Marthe Rizk-Rabin, Jérôme Bertherat, Bruno Ragazzon
titre
Combined transcriptome studies identify AFF3 as a mediator of the oncogenic effects of β-catenin in adrenocortical carcinoma
article
Oncogenesis, 2015, 4 (7), pp.e161. ⟨10.1038/oncsis.2015.20⟩
DOI
DOI : 10.1038/oncsis.2015.20
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https://inserm.hal.science/inserm-01182372/file/oncsis201520a.pdf BibTex
auteur
Azadeh Saffarian, Mathieu Giraud, Hélène Touzet
titre
Modeling alternate RNA structures in genomic sequences.
article
Journal of Computational Biology, 2015, 22 (3), pp.190-204
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auteur
Tuan Tu Tran, Mathieu Giraud, Jean-Stéphane Varré
titre
Perfect Hashing Structures for Parallel Similarity Searches
article
International Workshop on High Performance Computational Biology (HiCOMB 2015) / International Parallel and Distributed Processing Symposium (IPDPS 2015), 2015, Hyderabad, India. pp.332-341, ⟨10.1109/IPDPSW.2015.105⟩
DOI
DOI : 10.1109/IPDPSW.2015.105
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2014

auteur
Laurent David, Mathieu Giraud, Richard Groult, Florence Levé, Corentin Louboutin
titre
Vers une analyse automatique des formes sonates
article
Journées d'Informatique Musicale (JIM 2014), 2014, Bourges, France. pp.113-118
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https://hal.science/hal-01009166/file/2014-jim-sonata.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Marc Rigaudière
titre
Algorithmes pour l’analyse de la musique tonale
article
Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série TSI : Technique et Science Informatiques, 2014, Informatique musicale, 33 (7-8), pp.567-586. ⟨10.3166/tsi.33.567-586⟩
DOI
DOI : 10.3166/tsi.33.567-586
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https://hal.science/hal-01107721/file/2014-tsi-analyse.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Florence Levé, Florent Mercier, Marc Rigaudière, Donatien Thorez
titre
Towards Modeling Texture in Symbolic Data
article
International Society for Music Information Retrieval Conference - ISMIR, 2014, Taipei, Taiwan. pp.59-64
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https://hal.science/hal-01057017/file/2014-ismir-texture%20%281%29.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Mikaël Salson, Marc Duez, Céline Villenet, Sabine Quief, Aurélie Caillault, Nathalie Grardel, Christophe Roumier, Claude Preudhomme, Martin Figeac
titre
Fast multiclonal clusterization of V(D)J recombinations from high-throughput sequencing
article
BMC Genomics, 2014, 15 (1), pp.409. ⟨10.1186/1471-2164-15-409⟩
DOI
DOI : 10.1186/1471-2164-15-409
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https://hal.science/hal-01009173/file/1471-2164-15-409.pdf BibTex
auteur
Nathalie Grardel, Mikaël Salson, Aurélie Caillault, Marc Duez, Céline Villenet, Sabine Quief, Shéhérazade Sebda, Christophe Roumier, Martin Figeac, Claude Preudhomme, Mathieu Giraud
titre
Diagnostic et suivi des leucémies aiguës lymphoblastiques (LAL) par séquençage haut-débit (HTS)
article
Congrès de la Société Française d'Hématologie (SFH), 2014, Paris, France
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BibTex
auteur
Nathalie Grardel, Mathieu Giraud, Mikaël Salson, Marc Duez
titre
Multiclonal Diagnosis and MRD Follow-up in ALL with HTS Coupled with a Bioinformatic Analysis
article
American Society of Hematology Annual Meeting, 2014, San Francisco, France. , 2014
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BibTex
auteur
Azadeh Saffarian, Mathieu Giraud, Hélène Touzet
titre
Searching for alternate RNA structures in genomic sequences
article
Computational Methods for Structural RNAs, CMSR'14, Sep 2014, Strasbourg, France. pp.13-24, ⟨10.15455/CMSR.2014.0002⟩
DOI
DOI : 10.15455/CMSR.2014.0002
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https://hal.science/hal-01084319/file/CMSR14-Article-Touzet.pdf BibTex

2013

auteur
Christina Anagnostopoulou, Mathieu Giraud, Nick Poulakis
titre
Melodic contour representations in the analysis of children's songs
article
3rd International Workshop on Folk Music Analysis, Jun 2013, Amsterdam, Netherlands. pp.40-43
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https://hal.science/hal-00826427/file/melodic-contour-fma-2013.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Mikaël Salson, Marc Duez, Jean-Stéphane Varré, Céline Villenet, Sabine Quief, Aurélie Caillault, Nathalie Grardel, Christophe Roumier, Claude Preudhomme, Martin Figeac
titre
Suivi de la leucémie résiduelle par séquençage haut-débit
article
JOBIM, Jul 2013, Toulouse, France
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BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Ken Déguernel, Emilios Cambouropoulos
titre
Fragmentations with pitch, rhythm and parallelism constraints for variation matching
article
International Symposium on Computer Music Multidisciplinary Research (CMMR), Oct 2013, Marseille, France. pp.298-312, ⟨10.1007/978-3-319-12976-1_19⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-12976-1_19
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https://hal.science/hal-00906462/file/variations-cmmr-2013-lncs.pdf BibTex
auteur
Antoine Rousseau, Aurélie Darnaud, Brice Goglin, Céline Acharian, Christine Leininger, Christophe Godin, Clarisse Holik, Claude Kirchner, Diane Rives, Elodie Darquie, Erwan Kerrien, Fabrice Neyret, Florent Masseglia, Florian Dufour, Gérard Berry, Gilles Dowek, Hélène Robak, Hélène Xypas, Irina Illina, Isabelle Gnaedig, Joanna Jongwane, Jocelyne Ehrel, Laurent Viennot, Laure Guion, Lisette Calderan, Lola Kovacic, Marie Collin, Marie-Agnès Enard, Marie-Hélène Comte, Martin Quinson, Martine Olivi, Mathieu Giraud, Mathilde Dorémus, Mia Ogouchi, Muriel Droin, Nathalie Lacaux, Nicolas P. Rougier, Nicolas Roussel, Pascal Guitton, Pierre Peterlongo, Rose-Marie Cornus, Simon Vandermeersch, Sophie Maheo, Sylvain Lefebvre, Sylvie Boldo, Thierry Viéville, Véronique Poirel, Aline Chabreuil, Arnaud Fischer, Claude Farge, Claude Vadel, Isabelle Astic, Jean-Pierre Dumont, Loic Féjoz, Patrick Rambert, Pierre Paradinas, Sophie de Quatrebarbes, Stéphane Laurent
titre
Médiation Scientifique : une facette de nos métiers de la recherche
article
[Interne] Inria. 2013, pp.34
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https://inria.hal.science/hal-00804915/file/Mediation-scientifique-v0.2.pdf BibTex

2012

auteur
Mathieu Giraud, Richard Groult, Florence Levé
titre
Detecting Episodes with Harmonic Sequences for Fugue Analysis
article
ISMIR - International Society for Music Information Retrieval Conference - 2012, 2012, Porto, Portugal
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https://inria.hal.science/hal-00712565/file/harmonic-sequences-episodes-ismir-2012-ggl.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Richard Groult, Florence Levé
titre
Subject and counter-subject detection for analysis of the Well-Tempered Clavier fugues
article
International Symposium on Computer Music Modelling and Retrieval (CMMR 2012), 2012, United Kingdom. pp.661-673
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https://hal.science/hal-00712554/file/fugues-cmmr-2012-ggl.pdf BibTex
auteur
Azadeh Saffarian, Mathieu Giraud, Antoine de Monte, Hélène Touzet
titre
RNA Locally Optimal Secondary Structures
article
Journal of Computational Biology, 2012, 19 (10), pp.1120-1133. ⟨10.1089/cmb.2010.0178⟩
DOI
DOI : 10.1089/cmb.2010.0178
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https://inria.hal.science/hal-00756249/file/saffarian-2012-locally-optimal.pdf BibTex

2011

auteur
Jean-Frédéric Berthelot, Charles Deltel, Mathieu Giraud, Stéphane Janot, Laetitia Jourdan, Dominique Lavenier, Helene Touzet, Jean-Stéphane Varré
titre
biomanycores.org: a repository of interoperable open-source code for many-core bioinformatics
article
JOBIM 2011, Jul 2011, Paris, France
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BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Stéphane Janot, Jean-Frédéric Berthelot, Charles Deltel, Laetitia Jourdan, Dominique Lavenier, Helene Touzet, Jean-Stéphane Varré
titre
Biomanycores, open-source parallel code for many-core bioinformatics
article
Bioinformatics Open Source Conference (BOSC 2011), 2011, Vienne, Austria
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https://inria.hal.science/inria-00623390/file/bosc11.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Mikaël Salson
titre
Les séquenceurs à haut débit
article
Interstices, 2011
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BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Jean-Stéphane Varré
titre
Parallel Position Weight Matrices Algorithms
article
Parallel Computing, 2011, 37, pp.466-478. ⟨10.1016/j.parco.2010.10.001⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.parco.2010.10.001
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https://hal.science/hal-00623404/file/parallelcomputing.pdf BibTex
auteur
Florence Levé, Richard Groult, Guillaume Arnaud, Cyril Séguin, Rémi Gaymay, Mathieu Giraud
titre
Rhythm extraction from polyphonic symbolic music
article
12th International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2011), Oct 2011, United States. pp.375-380
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https://hal.science/hal-00636058/file/rhythm-leve.pdf BibTex
auteur
Tuan Tu Tran, Mathieu Giraud, Jean-Stéphane Varré
titre
Bit-Parallel Multiple Pattern Matching
article
Parallel Processing and Applied Mathematics / Parallel Biocomputing Conference (PPAM / PBC 11), 2011, Torun, Poland
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00637227/file/pbc11-tran.pdf BibTex
auteur
Jean-Stéphane Varré, Bertil Schmidt, Stéphane Janot, Mathieu Giraud
titre
Manycore high-performance computing in bioinformatics
article
Laura Elnitski, Helen Piontkivska, Lonnie R Welch. Advances in Genomic Sequence Analysis and Pattern Discovery, World Scientific, chapter 8, 2011
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https://hal.science/hal-00563408/file/varre-manycore-bioinformatics.pdf BibTex

2010

auteur
Hideo Bannai, Mathieu Giraud, Kazuhiko Kusano, Wataru Matsubara, Ayumi Shinohara, Jamie Simpson
titre
The Number of Runs in a Ternary Word
article
Prague Stringology Conference 2010, Aug 2010, France. pp.178-181
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https://hal.science/hal-00533202/file/PSC2010_article16.pdf BibTex
auteur
Nadia Pisanti, Mathieu Giraud, Pierre Peterlongo
titre
Filters and seeds approaches for fast homology searches in large datasets
article
Algorithms in computational molecular biology, 2010, ⟨10.1002/9780470892107.ch15⟩
DOI
DOI : 10.1002/9780470892107.ch15
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https://inria.hal.science/inria-00425370/file/Elloumi2010.pdf BibTex

2009

auteur
Mathieu Giraud
titre
Asymptotic behavior of the numbers of runs and microruns
article
Information and Computation, 2009, 207 (11), pp.1221-1228. ⟨10.1016/j.ic.2009.02.007⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ic.2009.02.007
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https://hal.science/hal-00438214/file/ic.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Jean-Stéphane Varré
titre
Parallel Position Weight Matrices Algorithms
article
International Symposium on Parallel and Distributed Computing (ISPDC 2009), Jul 2009, Lisboa, Portugal. pp.65-69, ⟨10.1109/ISPDC.2009.31⟩
DOI
DOI : 10.1109/ISPDC.2009.31
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https://inria.hal.science/inria-00438215/file/ispdc09-final.pdf BibTex
auteur
Peter Steffen, Robert Giegerich, Mathieu Giraud
titre
GPU Parallelization of Algebraic Dynamic Programming
article
Parallel Processing and Applied Mathematics / Parallel Biocomputing Conference (PPAM / PBC 09), Sep 2009, Wroclaw, Poland
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00438219/file/CP54.pdf BibTex
auteur
Jean-Stéphane Varré, Stéphane Janot, Mathieu Giraud
titre
Biomanycores, a repository of interoperable open-source code for many-cores bioinformatics
article
Bioinformatics Open Source Conference (BOSC), Jun 2009, Stockholm, Sweden
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BibTex

2008

auteur
Mathieu Giraud
titre
Not so many runs in strings
article
2nd International Conference on Language and Automata Theory and Applications (LATA 2008), Mar 2008, Tarragona, Spain
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https://inria.hal.science/inria-00271630/file/giraud-lata-08.pdf BibTex
auteur
Pierre Peterlongo, Laurent Noé, Dominique Lavenier, van Hoa Nguyen, Gregory Kucherov, Mathieu Giraud
titre
Optimal neighborhood indexing for protein similarity search
article
BMC Bioinformatics, 2008, 9 (534), ⟨10.1186/1471-2105-9-534⟩
DOI
DOI : 10.1186/1471-2105-9-534
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https://inria.hal.science/inria-00340510/file/journal2.pdf BibTex

2007

auteur
Jean-Eudes Duchesne, Mathieu Giraud, Nadia El-Mabrouk
titre
Seed-Based Exclusion Method for Non-coding RNA Gene Search
article
13th Annual International Computing and Combinatorics Conference (COCOON 2007), Jul 2007, Banff, Canada. pp.27-39, ⟨10.1007/978-3-540-73545-8_6⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-540-73545-8_6
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00271642/file/dgem-cocoon-07-lncs.pdf BibTex
auteur
Mathieu Giraud, Philippe Veber, Dominique Lavenier
titre
Path-equivalent developments in acyclic weighted automata
article
International Journal of Foundations of Computer Science, 2007, 18 (4), pp.799-812. ⟨10.1142/S012905410700498X⟩
DOI
DOI : 10.1142/S012905410700498X
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00271646/file/gvl-ijfcs-07-preprint.pdf BibTex
auteur
Pierre Peterlongo, Laurent Noé, Dominique Lavenier, Gilles Georges, Julien Jacques, Gregory Kucherov, Mathieu Giraud
titre
Protein similarity search with subset seeds on a dedicated reconfigurable hardware
article
Parallel Bio-Computing, Sep 2007, Gdansk,, Poland
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00178325/file/Lav07cb.pdf BibTex

2006

auteur
Nicolas Deroche, Mathieu Giraud
titre
Symbiologik : jouez avec les gènes
article
Interstices, 2006
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BibTex
auteur
Dominique Lavenier, Philippe Veber, Mathieu Giraud
titre
Path-Equivalent Removal of Epsilon-Transitions
article
2006, pp.23--33, ⟨10.1007/11812128_4⟩
DOI
DOI : 10.1007/11812128_4
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BibTex
auteur
Sandrine Pawlicki, Anne-Sophie Valin, Mathieu Giraud, Gilles Georges, Christian Delamarche, Grégory Ranchy
titre
Découverte et analyse de signatures à grande échelle dans les protéines amyloïdes.
article
Regard sur la biochimie, 2006, pp.1-12
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https://hal.science/hal-00456604/file/pawlicki-et-al-2006-1.pdf BibTex
auteur
Sébastien Tempel, Mathieu Giraud, Dominique Lavenier, Israël-César C. Lerman, Anne-Sophie Valin, Ivan Couée, Abdelhak El Amrani, Jacques Nicolas
titre
Domain organization within repeated DNA sequences: application to the study of a family of transposable elements.
article
Bioinformatics, 2006, 22(16), pp.1948-1954
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BibTex

2005

auteur
Mathieu Giraud, Laurent Noé, Gregory Kucherov, Dominique Lavenier
titre
Recherches de motifs et de similarités en bioinformatique : modélisations, solutions logicielles et matérielles
article
MajecSTIC 2005 : Manifestation des Jeunes Chercheurs francophones dans les domaines des STIC, IRISA – IETR – LTSI, Nov 2005, Rennes/France, pp.18--37
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00001036/file/120.pdf BibTex
auteur
Dominique Lavenier, Mathieu Giraud
titre
Bioinformatics Applications
article
Gokhale, Maya B., Graham, Paul S. Reconfigurable Computing. Accelerating Computation with Field-Programmable Gate Arrays, Springer, 2005, Foundation of computing, 0-387-26105-2
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BibTex
auteur
Pascale Quignon, Mathieu Giraud, Maud Rimbault, Patricia Lavigne, Sandrine Tacher, Emmanuelle Morin, Elodie Retout, Anne-Sophie Valin, Kerstin Lindblad-Toh, Jacques Nicolas, Francis Galibert
titre
The dog and rat olfactory receptor repertoires
article
Genome Biology, 2005, 6 (10), pp.R83. ⟨10.1186/gb-2005-6-10-r83⟩
DOI
DOI : 10.1186/gb-2005-6-10-r83
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BibTex
auteur
Sébastien Tempel, Mathieu Giraud, Israël-César C. Lerman, Ivan Couée, Abdelhak El Amrani, Jacques Nicolas
titre
Organisation modulaire des séquences d'ADN répétées: application à l'étude des hélitrons non-autonomes dans le génome d'Arabidopsis thaliana
article
XIIIe colloque Eléments Transposables, 2005, Orsay, France
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BibTex

2002

auteur
Ghizlane Bana, Roman Kolpakov, Mathieu Giraud, Ralph Rabbat, Gregory Kucherov
titre
mreps: a program for exhaustive search for tandem repeats in DNA sequences
article
Sixth Annual International Conference on Research in Computational Biology - RECOMB 2002, Apr 2002, Washington, DC, US
Accès au bibtex
BibTex

2000

auteur
Mathieu Giraud, Gregory Kucherov
titre
Maximal Repetitions and Application to DNA sequences
article
Journées Ouvertes : Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM'2000, 2000, Montpellier/France, pp.165--172
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00107854/file/A00-R-165.pdf BibTex