2023
Book sections
- titre
- Norine: Bioinformatics Methods and Tools for the Characterization of Newly Discovered Nonribosomal Peptides
- auteur
- Areski Flissi, Matthieu Duban, Philippe Jacques, Valérie Leclère, Maude Pupin
- article
- Non-Ribosomal Peptide Biosynthesis and Engineering, 2670, Springer US, pp.303-318, 2023, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-3214-7. ⟨10.1007/978-1-0716-3214-7_16⟩
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-
2022
Poster communications
- titre
- TnSeek : analysing Tn-seq data for multiple conditions and multiple species
- auteur
- Loïc Couderc, Erwan Gueguen, Maxime Brunin, Areski Flissi, Guillemette Marot, Guy Condemine, Hélène Touzet
- article
- Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2022), Jul 2022, Rennes, France
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-
- titre
- Tn-phyto: essential genomes of nine bacterial phytopathogens
- auteur
- Julie Baltenneck, Ben Moussa, Loïc Couderc, Areski Flissi, Jacques Pédron, Cindy E. Morris, Marie-Anne Barny, Odile Berge, Hélène Touzet, Erwan Gueguen, Guy Condemine
- article
- 4. International Ewinia workshop (IEW), Jul 2022, Assise, Italy
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-
Software
- titre
- TnSeek
- auteur
- Hélène Touzet, Areski Flissi, Loïc Couderc
- article
- 2022, ⟨swh:1:dir:5a4d461bfa0edddb5f36eda76bbc1eb93b32f26e;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-04441970;visit=swh:1:snp:dccee2e5c5a988bcc927a55dd922c7ba6eca4a46;anchor=swh:1:rel:a832b435ac7524297ea6f2105444ca86e82f22db;path=/⟩
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-
2020
Journal articles
- titre
- Uremic Toxins and Vascular Dysfunction
- auteur
- I. Six, Nadia Flissi, Gaëlle Lenglet, Loïc Louvet, Saïd Kamel, Marlène Gallet, Ziad Massy, Sophie Liabeuf
- article
- Toxins, 2020, 12 (6), pp.404. ⟨10.3390/toxins12060404⟩
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-
Poster communications
- titre
- Genome mining for screening and characterization of new lipopeptides with biocontrol applications.
- auteur
- Matthieu Duban, Maude Pupin, Areski Flissi, L. Couderc, Hélène Touzet, Louis Meunier, Denis Baurain, Olumide Owolabi Omoboye, Monica Höfte, Alexandre Bricout, Alice Rochex, Mickaël Chevalier, Christophe Flahaut, Quassim Esmaël, Essaid Ait Barka, Philippe Jacques, Valérie Leclère
- article
- 14emes rencontres plantes-bactéries, Jan 2020, Aussois, France
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-
2019
Journal articles
- titre
- rBAN: retro-biosynthetic analysis of nonribosomal peptides
- auteur
- Emma Ricart, Valérie Leclère, Areski Flissi, Markus Mueller, Maude Pupin, Frederique Lisacek
- article
- Journal of Cheminformatics, 2019, 11 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/s13321-019-0335-x⟩
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-
- titre
- Norine: update of the nonribosomal peptide resource
- auteur
- Areski Flissi, Emma Ricart, Clémentine Campart, Mickael Chevalier, Yoann Dufresne, Juraj Michalik, Philippe Jacques, Christophe Flahaut, Frederique Lisacek, Valérie Leclère, Maude Pupin
- article
- Nucleic Acids Research, 2019, ⟨10.1093/nar/gkz1000⟩
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-
Conference papers
- titre
- Genome mining for screening and characterization of new lipopeptides with biocontrol applications
- auteur
- Matthieu Duban, Maude Pupin, Areski Flissi, Loïc Couderc, Loïc Meunier, Denis Baurain, Olumide Omoboye, Monica Höfte, Alexandre Bricout, Alice Rochex, Mickael Chevalier, Christophe Flahaut, Qassim Esmaeel, Essaid Aitb, Philippe Jacques, Valérie Leclère
- article
- PlantBioProtech, Nov 2019, Marrackech, Morocco
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-
2018
Journal articles
- titre
- Bioinformatics tools for the discovery of new lipopeptides with biocontrol applications
- auteur
- Maude Pupin, Areski Flissi, Philippe Jacques, Valérie Leclère
- article
- European Journal of Plant Pathology, 2018, ⟨10.1007/s10658-018-1544-2⟩
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-
- titre
- Bioinformatics tools for the discovery of new lipopeptides with biocontrol applications
- auteur
- M. Pupin, A. Flissi, P. Jacques, Valérie Leclère
- article
- European Journal of Plant Pathology, 2018, 152 (4), pp.9. ⟨10.1007/s10658-018-1544-2⟩
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-
2017
Poster communications
- titre
- Norine, Florine, s2m : powerful bioinformatics resource and tools for the discovery of novel nonribosomal peptides, natural metabolites with versatile activities
- auteur
- Qassim Esmaeel, Yoann Dufresne, Areski Flissi, Maude Pupin, Philippe Jacques, Valérie Leclère
- article
- FEMS 2017 - 7th congress of Federation of European Microbiology societies, Jul 2017, Valencia, Spain
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-
- titre
- Data updates on Norine, the reference Non-Ribosomal Peptide knowledge base
- auteur
- Yoann Dufresne, Juraj Michalik, Areski Flissi, Valérie Leclère, Maude Pupin
- article
- JOBIM 2017 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2017, Lille, France
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-
2015
Journal articles
- titre
- Norine: a powerful resource for novel nonribosomal peptide discovery
- auteur
- Maude Pupin, Qassim Esmaeel, Areski Flissi, Yoann Dufresne, Philippe Jacques, Valérie Leclère
- article
- Synthetic and Systems Biotechnology, 2015, ⟨10.1016/j.synbio.2015.11.001⟩
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-
- titre
- Norine, the knowledgebase dedicated to non-ribosomal peptides, is now open to crowdsourcing
- auteur
- Areski Flissi, Yoann Dufresne, Juraj Michalik, Laurie Tonon, Stéphane Janot, Laurent Noé, Philippe Jacques, Valérie Leclère, Maude Pupin
- article
- Nucleic Acids Research, 2015, ⟨10.1093/nar/gkv1143⟩
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-
2013
Conference papers
- titre
- CIAO: A Component Model and its OSGi Framework for Dynamically Adaptable Telephony Applications
- auteur
- Gilles Vanwormhoudt, Areski Flissi
- article
- The 16th International ACM Sigsoft Symposium on Component-Based Software Engineering (CBSE'2013), Jun 2013, Vancouver, Canada. pp.10
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-
- titre
- CIAO : modèle de composants et framework OSGi pour des applications télécoms adaptables dynamiquement
- auteur
- Areski Flissi, Gilles Vanwormhoudt
- article
- GDR GPL 2013, Apr 2013, Nancy, France. pp.216-217
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-
2012
Conference papers
- titre
- Programmation orientée domaine pour les services télécoms : concepts, DSL et outillage
- auteur
- Areski Flissi, Gilles Vanwormhoudt
- article
- Conférence en Ingénierie du Logiciel (CIEL 2012), Jun 2012, Rennes, France. pp.1-6
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-
2011
Conference papers
- titre
- Conception de services télécoms : Une approche IDM à base d'acteurs, sessions et rôles.
- auteur
- Areski Flissi, Gilles Vanwormhoudt
- article
- IDM 2011, Jun 2011, Lille, France. pp.47-50
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-
- titre
- Session-Based Role Programming for the Design of Advanced Telephony Applications
- auteur
- Gilles Vanwormhoudt, Areski Flissi
- article
- 11th Distributed Applications and Interoperable Systems (DAIS), Jun 2011, Reykjavik, Iceland. pp.77-91, ⟨10.1007/978-3-642-21387-8_7⟩
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-
2009
Conference papers
- titre
- Conception de systèmes par applications de modèles paramétrés
- auteur
- Olivier Caron, Bernard Carré, Areski Flissi, Alexis Muller, Gilles Vanwormhoudt
- article
- Journées nationales du GDR CNRS GPL (Génie de la Programmation et du Logiciel), Jan 2009, Toulouse, France
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-
Other publications
- titre
- Infrastructure ubiquitaire à base de composants logiciels pour des services de transports.
- auteur
- Christophe Gransart, Areski Flissi
- article
- 2009, pp.21-26
- Accès au bibtex
-
- titre
- EMFScript : Scripting méta-réflexif de modèles dans l'environnement EMF
- auteur
- Gilles Vanwormhoudt, Areski Flissi
- article
- 2009
- Accès au bibtex
-
2008
Journal articles
- titre
- Une démarche orientée modèle pour déployer des systèmes logiciels répartis
- auteur
- Jérémy Dubus, Areski Flissi, Nicolas Dolet, Philippe Merle
- article
- Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série L'Objet : logiciel, bases de données, réseaux, 2008, 14 (1-2), pp.35-39. ⟨10.3166/obj.14.1-2.35-59⟩
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-
Conference papers
- titre
- Deploying on the Grid with DeployWare
- auteur
- Areski Flissi, Jérémy Dubus, Nicolas Dolet, Philippe Merle
- article
- Eighth IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid, May 2008, France. pp.177-184, ⟨10.1109/CCGRID.2008.59⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2006
Conference papers
- titre
- A Generic Deployment Framework for Grid Computing and Distributed Applications
- auteur
- Areski Flissi, Philippe Merle
- article
- OTM Confederated International Conferences, Grid computing, high performAnce and Distributed Applications (GADA 2006), 2006, Montpellier, France. pp.1402-1411, ⟨10.1007/11914952_26⟩
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-
2005
Conference papers
- titre
- A service discovery and automatic deployment component-based software infrastructure for Ubiquitous Computing
- auteur
- Areski Flissi, Christophe Gransart, Philippe Merle
- article
- The 17th Conference on Advanced Information Systems Engineering - CAiSE'05 Workshop, Jun 2005, Porto, Portugal. pp.601-615
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-
- titre
- Une démarche dirigée par les modèles pour construire les machines de déploiement des intergiciels à composants
- auteur
- Areski Flissi, Philippe Merle
- article
- Langages et Modèles à Objets (LM0'05), 2005, Bern, Suisse. pp.79-94
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Une Infrastructure à Composants pour des Applications Ubiquitaires
- auteur
- Areski Flissi, Christophe Gransart, Philippe Merle
- article
- UbiMob 2005, 2005, Grenoble, France. pp.45-48
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Component-based Software Infrastructure for Contextual Transportation Applications
- auteur
- Areski Flissi, Christophe Gransart, Philippe Merle
- article
- The 5th International Conference on ITS Telecommunications, 2005, Brest, France. pp.307-310
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Component-based Software Infrastructure for Ubiquitous Computing
- auteur
- Areski Flissi, Christophe Gransart, Philippe Merle
- article
- Fourth International Symposium on Parallel and Distributed Computing, 2005, Lille, France. pp.183-190
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2004
Conference papers
- titre
- Vers un environnement multi personnalités pour la configuration et le déploiement d'applications à base de composants logiciels
- auteur
- Areski Flissi, Philippe Merle
- article
- 2004, pp.3-14
- Accès au texte intégral et bibtex
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