2024
Article dans une revue
- titre
- Modelling biofilm development: the importance of considering the link between EPS distribution, detachment mechanisms and physical properties
- auteur
- Y. Pechaud, N. Derlon, Isabelle Queinnec, Y. Bessiere, E. Paul
- article
- Water Research, 2024, 250, pp.120985. ⟨10.1016/j.watres.2023.120985⟩
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-
Pré-publication, Document de travail
- titre
- The genome of the simultaneously hermaphroditic snail Lymnaea stagnalis reveals an evolutionary expansion of FMRFamide-like receptors
- auteur
- Joris M Koene, Daniel J. Jackson, Yumi Nakadera, Nicolas Cerveau, Mohammed‐amin Madoui, Benjamin Noel, Véronique Jamilloux, Julie Poulain, Karine Labadie, Corinne Da Silva, Angus Davison, Zhong-Ping Feng, Coen M Adema, Christophe C. Klopp, Jean-Marc Aury, Patrick Wincker, Marie-Agnès Coutellec
- article
- 2024
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-
2023
Article dans une revue
- titre
- Influence of feed salinity on ammonia recovery from high-strength effluents in transmembrane chemical absorption process
- auteur
- Irene Gonzalez-Salgado, Mansour Bounouba, Simon Dubos, Evrard Mengelle, Christelle Guigui, Mathieu Sperandio
- article
- Journal of Membrane Science, 2023, 687, pp.122086. ⟨10.1016/j.memsci.2023.122086⟩
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-
- titre
- Contrasting Evolutionary Patterns Between Sexual and Asexual Lineages in a Genomic Region Linked to Reproductive Mode Variation in the pea aphid
- auteur
- Maud Rimbault, Fabrice Legeai, Jean Peccoud, Lucie Mieuzet, Elsa Call, Pierre Nouhaud, Hélène Defendini, Frédérique Mahéo, William Marande, Nicolas Théron, Denis Tagu, Gaël Le Trionnaire, Jean-Christophe Simon, Julie Jaquiéry
- article
- Genome Biology and Evolution, 2023, 15 (9), pp.1-18. ⟨10.1093/gbe/evad168⟩
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-
- titre
- Water temperature explains part of the variation in basal plasma cortisol level within and between fish species
- auteur
- Sébastien Alfonso, Camille Houdelet, Eduardo Bessa, Benjamin Geffroy, Bastien Sadoul
- article
- Journal of Fish Biology, 2023, ⟨10.1111/jfb.15342⟩
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-
- titre
- Distribution of Wolbachia infection in butterflies (Lepidoptera): First systematic report from Thailand
- auteur
- Panukorn Boonsit, Itsanun Wiwatanaratanabutr, Perran Ross, Frederic Grandjean, Chris Austin, Somsak Kramchote
- article
- Oriental Insects, 2023, pp.1-15. ⟨10.1080/00305316.2023.2167883⟩
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-
- titre
- Seasonality and growth in tropical freshwater ectotherm vertebrates: Results from 1‐year experimentation in the African gray bichir, giraffe catfish, and the West African mud turtle
- auteur
- Axelle Gardin, Olga Otero, Elodie Réveillac, Alexandra Lafitte, Xavier Valentin, Florian Lapalus, Didier Bouchon, Géraldine Garcia
- article
- Ecology and Evolution, 2023, 13 (3), pp.e9936. ⟨10.1002/ece3.9936⟩
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-
- titre
- Online data sharing with virtual social interactions favor scientific and educational successes in a biodiversity citizen science project
- auteur
- Ana-Cristina Torres, Baptiste Bedessem, Nicolas Deguines, Colin Fontaine
- article
- Journal of Responsible Innovation, 2023, 10 (1), pp.2019970. ⟨10.1080/23299460.2021.2019970⟩
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-
- titre
- Influence of distance from source population and seasonality in eDNA detection of white‐clawed crayfish, through qPCR and ddPCR assays
- auteur
- Thomas Baudry, Maud Laffitte, Charlotte Noizat, Carine Delaunay, Grégoire Ricou, Valentin Vasselon, Frédéric Grandjean
- article
- Environmental DNA, 2023, 5 (4), pp.733-749. ⟨10.1002/edn3.435⟩
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-
- titre
- Phospha-cyanines in Their Ideal Polymethine State: Synthesis and Structure–Property Relationships
- auteur
- Alexandre Chemin, Iryna Knysh, Denis Ari, Marie Cordier, Thierry Roisnel, Boris Le Guennic, Muriel Hissler, Denis Jacquemin, Pierre-Antoine Bouit
- article
- Journal of Physical Chemistry A, 2023, 127 (49), pp.10457-10463. ⟨10.1021/acs.jpca.3c07039⟩
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-
- titre
- Investigating Wolbachia symbiont-mediated host protection against a bacterial pathogen using a natural Wolbachia nuclear insert
- auteur
- Cybèle Prigot-Maurice, Baptiste Lheraud, Samuel Guéritault, Sophie Beltran-Bech, Richard Cordaux, Jean Peccoud, Christine Braquart-Varnier
- article
- Journal of Invertebrate Pathology, 2023, 197, pp.107893. ⟨10.1016/j.jip.2023.107893⟩
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-
- titre
- Honeybee queen exposure to a widely used fungicide disrupts reproduction and colony dynamic
- auteur
- Maxime Pineaux, Stéphane Grateau, Tiffany Lirand, Pierrick Aupinel, Freddie-Jeanne Richard
- article
- Environmental Pollution, 2023, 322, pp.121131. ⟨10.1016/j.envpol.2023.121131⟩
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-
2022
Article dans une revue
- titre
- Severe conservation risks of roads on apex predators
- auteur
- Itxaso Quintana, Edgar Cifuentes, Jeffrey Dunnink, María Ariza, Daniela Martínez-Medina, Felipe Fantacini, Bibek Shrestha, Freddie-Jeanne Richard
- article
- Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.2902. ⟨10.1038/s41598-022-05294-9⟩
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-
- titre
- Science learning in biodiversity citizen science: Inputs from the analysis of online social interactions within a contributory project for pollinators' monitoring
- auteur
- Baptiste Bedessem, Ana-Cristina Torres, Colin Fontaine, Nicolas Deguines
- article
- Biological Conservation, 2022, 276, pp.109807. ⟨10.1016/j.biocon.2022.109807⟩
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-
- titre
- A new set of microsatellite markers for Phoxinus lumaireul senso lato , Phoxinus marsilii and Phoxinus krkae for population and molecular taxonomic studies
- auteur
- Matej Vucić, Mišel Jelić, Göran Klobučar, Dušan Jelić, Han Ming Gan, Chris Austin, Daniel Guyonnet, Isabelle Giraud, Thomas Becking, Frederic Grandjean
- article
- Journal of Fish Biology, 2022, 101 (5), pp.1225-1234. ⟨10.1111/jfb.15194⟩
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-
- titre
- Modelling the response of urban lichens to broad-scale changes in air pollution and climate
- auteur
- Bernardo Rocha, Paula Matos, Paolo Giordani, Lõhmus Piret, Cristina Branquinho, Joan Casanelles-Abella, Cristiana Aleixo, Nicolas Deguines, Tiit Hallikma, Lauri Laanisto, Marco Moretti, Marta Alós Ortí, Roeland Samson, Piotr Tryjanowski, Pedro Pinho
- article
- Environmental Pollution, 2022, 315, pp.120330. ⟨10.1016/j.envpol.2022.120330⟩
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-
- titre
- Hybrid swarm as a result of hybridization between two alien and two native water frog species (genus Pelophylax) in Central Croatia: Crna Mlaka fishpond acting as a species melting pot?
- auteur
- Mišel Jelić, Damjan Franjević, Domagoj Đikić, Petra Korlević, Matej Vucić, Dušan Jelić, Thomas Becking, Frédéric Grandjean, Göran Klobučar
- article
- Biological Invasions, 2022, 24 (10), pp.3291-3304. ⟨10.1007/s10530-022-02846-y⟩
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-
- titre
- La biodiversité du sol au cœur d’un projet pédagogique sur le campus de l’Université de Poitiers, France : entre formation, gestion et conservation
- auteur
- Julia Clause, Donovan Leblanc, Nicolas Deguines
- article
- Étude et Gestion des Sols, 2022, 29, pp.223-238
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-
- titre
- The development of early monitoring tools to detect aquatic invasive species: eDNA assay development and the case of the armored catfish Hypostomus robinii
- auteur
- Thomas Dubreuil, Thomas Baudry, Quentin Mauvisseau, Alexandre Arqué, Clarisse Courty, Carine Delaunay, Michael Sweet, Frédéric Grandjean
- article
- Environmental DNA, 2022, 4 (2), pp.349-362. ⟨10.1002/edn3.260⟩
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-
- titre
- Iguana insularis (Iguanidae) from the southern Lesser Antilles: An endemic lineage endangered by hybridization
- auteur
- Michel Breuil, David Schikorski, Barbara Vuillaume, Ulrike Krauss, Jennifer Daltry, Glenroy Gaymes, Joanne Gaymes, Olivier Lepais, Nicolas Bech, Mišel Jelić, Thomas Becking, Frédéric Grandjean
- article
- Zookeys, 2022, 1086, pp.137 - 161. ⟨10.3897/zookeys.1086.76079⟩
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-
- titre
- How wild bees find a way in European cities: Pollen metabarcoding unravels multiple feeding strategies and their effects on distribution patterns in four wild bee species
- auteur
- Joan Casanelles‐abella, Stefanie Müller, Alexander Keller, Cristiana Aleixo, Marta Alós Orti, François Chiron, Nicolas Deguines, Tiit Hallikma, Lauri Laanisto, Pedro Pinho, Roeland Samson, Piotr Tryjanowski, Anskje van Mensel, Loïc Pellissier, Marco Moretti
- article
- Journal of Applied Ecology, 2022, UN Decade on Ecosystem Restoration, 59 (2), pp.457-470. ⟨10.1111/1365-2664.14063⟩
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-
- titre
- The NGS Magic Pudding: A Nanopore-Led Long-Read Genome Assembly for the Commercial Australian Freshwater Crayfish, Cherax destructor
- auteur
- Christopher Austin, Laurence Croft, Frédéric Grandjean, Han Ming Gan
- article
- Frontiers in Genetics, 2022, 12, pp.695763. ⟨10.3389/fgene.2021.695763⟩
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-
- titre
- Growth and root-knot nematode infection of tomato are influenced by mycorrhizal fungi and earthworms in an intercropping cultivation system with leeks
- auteur
- Jeremy Detrey, Valentin Cognard, Caroline Djian-Caporalino, Nathalie Marteu, Joan Doidy, Nathalie Pourtau, Cecile Vriet, Laurence Maurousset, Didier Bouchon, Julia Clause
- article
- Applied Soil Ecology, 2022, 169, pp.104181. ⟨10.1016/j.apsoil.2021.104181⟩
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-
- titre
- The promising combination of a remote sensing approach and landscape connectivity modelling at a fine scale in urban planning
- auteur
- Elie Morin, Pierre-Alexis Herrault, Yvonnick Guinard, Frédéric Grandjean, Nicolas Bech
- article
- Ecological Indicators, 2022, 139, pp.108930. ⟨10.1016/j.ecolind.2022.108930⟩
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-
- titre
- Determinants of haemosporidian single- and co-infection risks in western palearctic birds.
- auteur
- Romain Pigeault, Mathieu Chevalier, Camille-Sophie Cozzarolo, Molly Baur, Mathilde Arlettaz, Alice Cibois, André Keiser, Antoine Guisan, Philippe Christe, Olivier Glaizot
- article
- International Journal for Parasitology, 2022, 52 (9), pp.617-627. ⟨10.1016/j.ijpara.2022.05.002⟩
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-
- titre
- Experiment in semi-natural conditions did not confirm the influence of malaria infection on bird attractiveness to mosquitoes.
- auteur
- Camille-Sophie Cozzarolo, Romain Pigeault, Julie Isaïa, Jérôme Wassef, Molly Baur, Olivier Glaizot, Philippe Christe
- article
- Parasites & Vectors, 2022, 15 (1), pp.187. ⟨10.1186/s13071-022-05292-w⟩
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-
- titre
- Negative relationship between woody species density and size of urban green spaces in seven European cities
- auteur
- Marta Alós Ortí, Joan Casanelles-Abella, François Chiron, Nicolas Deguines, Tiit Hallikma, Piia Jaksi, Patrycja K Kwiatkowska, Marco Moretti, Babette Muyshondt, Ülo Niinemets, Pedro Pinho, Manuel João Pinto, Peedu Saar, Roeland Samson, Piotr Tryjanowski, Anskje van Mensel, Lauri Laanisto
- article
- Urban Forestry and Urban Greening, 2022, 74, pp.127650. ⟨10.1016/j.ufug.2022.127650⟩
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-
- titre
- Masculinization of the X-chromosome in aphid soma and gonads
- auteur
- Julie Jaquiéry, Jean-Christophe Simon, Stéphanie Robin, Gautier Richard, Jean Peccoud, Hélène Boulain, Fabrice Legeai, Sylvie Tanguy, Nathalie Prunier Leterme, Gaël Le Trionnaire
- article
- Peer Community Journal, 2022, 2, pp.e53. ⟨10.24072/pcjournal.166⟩
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-
- titre
- Climate change would prevail over land use change in shaping the future distribution of Triturus marmoratus in France
- auteur
- Clémentine Préau, Romain Bertrand, Yann Sellier, Frédéric Grandjean, Francis Isselin‐nondedeu
- article
- Animal Conservation, 2022, 25 (2), pp.221-232. ⟨10.1111/acv.12733⟩
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-
- titre
- The invasive crayfish Cherax quadricarinatus facing chlordecone in Martinique: Bioaccumulation and depuration study
- auteur
- Thomas Baudry, Eric Gismondi, Jean-Pierre Goût, Alexandre Arqué, Juliette Smith-Ravin, Frédéric Grandjean
- article
- Chemosphere, 2022, 286, Part 3, pp.131926. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.131926⟩
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-
- titre
- Towards Ecological Management and Sustainable Urban Planning in Seoul, South Korea: Mapping Wild Pollinator Habitat Preferences and Corridors Using Citizen Science Data
- auteur
- Hortense Serret, Desiree Andersen, Nicolas Deguines, Céline Clauzel, Wan-Hyeok Park, Yikweon Jang
- article
- Animals, 2022, 12 (11), pp.1469. ⟨10.3390/ani12111469⟩
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-
- titre
- Interactions between hydrated cement pastes and aggressive ammonium: experimental batches characterization
- auteur
- Marie Giroudon, Cédric Roosz, Mehdi Bista, Matthieu Peyre Lavigne, Laurie Lacarrière, Alexandra Bertron
- article
- MATEC Web of Conferences, 2022, 364, pp.05010. ⟨10.1051/matecconf/202236405010⟩
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-
Communication dans un congrès
- titre
- THE TROPHIC ROLE OF THE NECROMASS OF POSIDONIA OCEANICA (L) DELILE IN THE SURF ZONE OF SANDY SHORES
- auteur
- Rossi F, Gilbers Romero, Alexis Pey, Patricia Ventura, Loques Françoise, B. Derijard, J.M Cottalorda, Eugenio Di Franco, P Guidetti, Simona Bussotti
- article
- 7th Mediterranean Symposium on Marine Vegetation, Sep 2022, Gene, Italy
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-
Rapport
- titre
- Avis de l'Anses relatif à l'interdiction de vente en libre-service de certaines catégories de produits biocides
- auteur
- Georges de Sousa, Olivier Adam, Alain Aymard, Jean-Christophe Cahuzac, James Devillers, Pierre Greve, Philippe Hartemann, Claire Hellio, Dominique Hurtaud-Pessel, Vincent Richard, Christophe Soumet, Catherine Gourlay-Francé, Isabelle Attig, Matthias Brizard, Patrice Carpentier, Farida Ouadi, Rachel Pagès
- article
- Saisine n° 2020-SA-0008, Anses. 2022, 46 p
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-
2021
Article dans une revue
- titre
- A genus-wide analysis of genetic variation to guide population management, hybrid identification, and monitoring of invasions and illegal trade in Iguana (Reptilia: Iguanidae)
- auteur
- Matthijs van den Burg, Frédéric Grandjean, David Schikorski, Michel Breuil, Catherine Malone
- article
- Conservation Genetics Resources, 2021, 13 (4), pp.435-445. ⟨10.1007/s12686-021-01216-5⟩
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-
- titre
- Surveillance Studies Reveal Diverse and Potentially Pathogenic-Incriminated Vector Mosquito Species across Major Botswana Touristic Hotspots
- auteur
- Mmabaledi Buxton, Casper Nyamukondiwa, Ryan Wasserman, Victor Othenin-Girard, Romain Pigeault, Philippe Christe, Olivier Glaizot
- article
- Insects, 2021, 12 (10), pp.913. ⟨10.3390/insects12100913⟩
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-
- titre
- Early Response to Dehydration Six-Like Transporter Family: Early Origin in Streptophytes and Evolution in Land Plants
- auteur
- Lucie Slawinski, Abir Israel, Caroline Paillot, Florence Thibault, Richard Cordaux, Rossitza Atanassova, Fabienne Dédaldéchamp, Maryse Laloi
- article
- Frontiers in Plant Science, 2021, 12, ⟨10.3389/fpls.2021.681929⟩
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-
- titre
- Monitoring Insect Transposable Elements in Large Double-Stranded DNA Viruses Reveals Host-to-Virus and Virus-to-Virus Transposition
- auteur
- Vincent Loiseau, Jean Peccoud, Clémence Bouzar, Sandra Guillier, Jiangbin Fan, Gianpiero Gueli Alletti, Carine Meignin, Elisabeth Herniou, Brian Federici, Jörg Wennmann, Johannes Jehle, Richard Cordaux, Clément Gilbert
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2021, 38 (9), pp.3512-3530. ⟨10.1093/molbev/msab198⟩
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-
- titre
- Characterization of a Sex-Determining Region and Its Genomic Context via Statistical Estimates of Haplotype Frequencies in Daughters and Sons Sequenced in Pools
- auteur
- Richard Cordaux, Mohamed Amine Chebbi, Isabelle Giraud, David R.J. Pleydell, Jean Peccoud
- article
- Genome Biology and Evolution, 2021, 13 (8), ⟨10.1093/gbe/evab121⟩
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-
- titre
- A dataset of the flowering plants (Angiospermae) in urban green areas in five European cities
- auteur
- Joan Casanelles-Abella, David Frey, Stefanie Müller, Cristiana Aleixo, Marta Alós Ortí, Nicolas Deguines, Tiit Hallikma, Lauri Laanisto, Ülo Niinemets, Pedro Pinho, Roeland Samson, Lucía Villarroya-Villalba, Marco Moretti
- article
- Data in Brief, 2021, ⟨10.1016/j.dib.2021.107243⟩
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-
- titre
- Feminising Wolbachia disrupt Armadillidium vulgare insulin‐like signalling pathway
- auteur
- Benjamin Herran, Camille Houdelet, Maryline Raimond, Carine Delaunay, Nicolas Cerveau, Catherine Debenest, Pierre Grève, Joanne Bertaux
- article
- Cellular Microbiology, 2021, ⟨10.1111/cmi.13381⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- More from less: Genome skimming for nuclear markers for animal phylogenomics, a case study using decapod crustaceans
- auteur
- Mun Hua Tan, Han Ming Gan, Heather Bracken-Grissom, Tin-Yam Chan, Frédéric Grandjean, Christopher Austin
- article
- Journal of Crustacean Biology, 2021, 41 (2), ⟨10.1093/jcbiol/ruab009⟩
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-
- titre
- Research agenda on biodiversity and ecosystem functions and services in European cities
- auteur
- Pedro Pinho, Joan Casanelles-Abella, Ana Catarina Luz, Anna Maria Kubicka, Cristina Branquinho, Lauri Laanisto, Lena Neuenkamp, Marta Alós Ortí, Martin K Obrist, Nicolas Deguines, Piotr Tryjanowski, Roeland Samson, Ülo Niinemets, Marco Moretti
- article
- Basic and Applied Ecology, 2021, 53, pp.124-133. ⟨10.1016/j.baae.2021.02.014⟩
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-
- titre
- Effect of Neonicotinoid Exposure on the Life History Traits and Susceptibility to Plasmodium Infection on the Major Avian Malaria Vector Culex pipiens (Diptera: Culicidae)
- auteur
- Romain Pigeault, Danaé Bataillard, Olivier Glaizot, Philippe Christe
- article
- Parasitologia, 2021, 1 (1), pp.20-33. ⟨10.3390/parasitologia1010003⟩
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-
- titre
- A precise and rapid isotopomic analysis of small quantities of cholesterol at natural abundance by optimized 1H-13C 2D NMR
- auteur
- Lenny Haddad, Sophie Renou, Gérald Remaud, Toufic Rizk, Joseph Bejjani, Serge Akoka
- article
- Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, 413 (6), pp.1521-1532. ⟨10.1007/s00216-020-03135-0⟩
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-
- titre
- Effects of Dysbiosis and Dietary Manipulation on the Digestive Microbiota of a Detritivorous Arthropod
- auteur
- Marius Bredon, Elisabeth Depuydt, Lucas Brisson, Laurent Moulin, Ciriac Charles, Sophie Haenn, Bouziane Moumen, Didier Bouchon
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (1), pp.148. ⟨10.3390/microorganisms9010148⟩
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-
- titre
- Mapping a super-invader in a biodiversity hotspot, an eDNA-based success story
- auteur
- Thomas Baudry, Quentin Mauvisseau, Jean-Pierre Goût, Alexandre Arqué, Carine Delaunay, Juliette Smith-Ravin, Michael Sweet, Frédéric Grandjean
- article
- Ecological Indicators, 2021, 126, pp.107637. ⟨10.1016/j.ecolind.2021.107637⟩
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-
- titre
- Insights into the local interaction mechanisms between fermenting broken maize and various binder materials for anaerobic digester structures
- auteur
- Marie Giroudon, Cédric Perez, Matthieu Peyre Lavigne, Benjamin Erable, Christine Lors, Cédric Patapy, Alexandra Bertron
- article
- Journal of Environmental Management, 2021, 300, ⟨10.1016/j.jenvman.2021.113735⟩
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-
- titre
- Development and validation of QuEChERS-based extraction for quantification of nine micropollutants in wastewater treatment plant
- auteur
- L. Cavaillé, C. Kim, M. Bounouba, H. Zind, C. Claparols, D. Riboul, E. Pinelli, Claire Albasi, Y. Bessiere
- article
- Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, 413, pp.0. ⟨10.1007/s00216-021-03489-z⟩
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-
- titre
- Laboratory assessment of the contribution of aggressive to concrete chemical compounds to the degradation of Portland cement-based materials during anaerobic digestion
- auteur
- Marie Giroudon, Matthieu Peyre Lavigne, Cédric Patapy, Alexandra Bertron
- article
- Materials and structures, 2021, 54 (6), ⟨10.1617/s11527-021-01810-x⟩
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-
- titre
- Experimental evidence of Wolbachia introgressive acquisition between terrestrial isopod subspecies
- auteur
- Nicolas Bech, Sophie Beltran-Bech, Cassandre Chupeau, Jean Peccoud, Magali Thierry, Roland Raimond, Yves Caubet, Mathieu Sicard, Pierre Grève
- article
- Current zoology, 2021, 67 (4), pp.455 - 464. ⟨10.1093/cz/zoaa078⟩
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-
- titre
- First record of a marbled crayfish Procambarus virginalis (Lyko, 2017) population in France
- auteur
- Frédéric Grandjean, Marc Collas, Magali Uriarte, Marion Rousset
- article
- BioInvasions Records, 2021, 10 (2), pp.341-347. ⟨10.3391/bir.2021.10.2.12⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2020
Article dans une revue
- titre
- Isopod holobionts as promising models for lignocellulose degradation
- auteur
- Marius Bredon, Benjamin Herran, Joanne Bertaux, Pierre Grève, Bouziane Moumen, Didier Bouchon
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2020, 13 (1), ⟨10.1186/s13068-020-01683-2⟩
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-
- titre
- Stress response in terrestrial isopods: A comparative study on glycaemia
- auteur
- Jonathan A.C. Roques, Camille Houdelet, Freddie-Jeanne Richard
- article
- Applied Soil Ecology, 2020, 156, pp.103708. ⟨10.1016/j.apsoil.2020.103708⟩
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-
- titre
- Using X-ray microtomography to characterize the burrowing behaviour of earthworms in heterogeneously polluted soils
- auteur
- Maria Balseiro-Romero, Arnaud Mazurier, Dmytro Monoshyn, Philippe C. Baveye, Julia Clause
- article
- Pedobiologia, 2020, 83, pp.150671. ⟨10.1016/j.pedobi.2020.150671⟩
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-
- titre
- Characterization of a new case of XMLV (Bxv1) contamination in the human cell line Hep2 (clone 2B)
- auteur
- Vincent Loiseau, Richard Cordaux, Isabelle Giraud, Agnès Beby-Defaux, Nicolas Lévêque, Clement Gilbert
- article
- Scientific Reports, 2020, 10, ⟨10.1038/s41598-020-73169-y⟩
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-
- titre
- Enhanced Attraction of Arthropod Vectors to Infected Vertebrates: A Review of Empirical Evidence
- auteur
- Camille-Sophie Cozzarolo, Olivier Glaizot, Philippe Christe, Romain Pigeault
- article
- Frontiers in Ecology and Evolution, 2020, 8, ⟨10.3389/fevo.2020.568140⟩
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-
- titre
- Chemical and physical properties of alginate-like exopolymers of aerobic granules and flocs produced from different wastewaters
- auteur
- Cássio Moraes Schambeck, Rejane Helena Ribeiro da Costa, Cássio Moraes Schambeck, Elisabeth Girbal-Neuhauser, Lukas Böni, Peter Fischer, Yolaine Bessiere, Etienne Paul, Rejane Helena Ribeiro da Costa, Nicolas Derlon
- article
- Bioresource Technology, 2020, 312, pp.123632. ⟨10.1016/j.biortech.2020.123632⟩
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-
- titre
- Combining thermophilic aerobic reactor (TAR) with mesophilic anaerobic digestion (MAD) improves the degradation of pharmaceutical compounds
- auteur
- I. Gonzalez-Salgado, L. Cavaillé, S. Dubos, E. Mengelle, C. Kim, M. Bounouba, Sébastien Pommier, E. Paul, Y. Bessiere
- article
- Water Research, 2020, 182, ⟨10.1016/j.watres.2020.116033⟩
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- titre
- Metabisotopomics of triacylglycerols from animal origin: A simultaneous metabolomic and isotopic profiling using 13C INEPT
- auteur
- Ghina Hajjar, Toufic Rizk, Joseph Bejjani, Serge Akoka
- article
- Food Chemistry, 2020, 315, pp.126325. ⟨10.1016/j.foodchem.2020.126325⟩
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- titre
- Dataset for sequencing and de novo assembly of the European endangered white-clawed crayfish (Austropotamobius pallipes) abdominal muscle transcriptome.
- auteur
- Frederic Grandjean, Han Ming Gan, Bouziane Moumen, Isabelle Giraud, Skander Hatira, Richard Cordaux, Christopher Austin
- article
- Data in Brief, 2020, 29, pp.105166. ⟨10.1016/j.dib.2020.105166⟩
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-
- titre
- Physiological and histopathological responses of Porcellio laevis (Isopoda, Crustacea) as indicators of metal trace element contamination
- auteur
- Chedliya Ghemari, Raja Jelassi, Hajer Khemaissia, Christophe Waterlot, Maryline Raimond, Catherine Souty‐grosset, Francis Douay, Karima Nasri‐ammar
- article
- Microscopy Research and Technique, 2020, 83 (4), pp.402-409. ⟨10.1002/jemt.23428⟩
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-
- titre
- A Giant Genome for a Giant Crayfish (Cherax quadricarinatus) With Insights Into cox1 Pseudogenes in Decapod Genomes
- auteur
- Mun Hua Tan, Han Ming Gan, Yin Peng Lee, Frederic Grandjean, Laurence Croft, Christopher Austin
- article
- Frontiers in Genetics, 2020, 11, pp.201. ⟨10.3389/fgene.2020.00201⟩
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- titre
- Unearthing the Plant Growth-Promoting Traits of Bacillus megaterium RmBm31, an Endophytic Bacterium Isolated From Root Nodules of Retama monosperma
- auteur
- Malika Affaf Dahmani, Antoine Desrut, Bouziane Moumen, Julien Verdon, Lamia Mermouri, Mourad Kacem, Pierre Coutos-Thévenot, Meriem Kaid-Harche, Thierry Bergès, Cécile Vriet
- article
- Frontiers in Plant Science, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.00124⟩
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- titre
- Horizontal transfer and gene loss shaped the evolution of alpha-amylases in bilaterians
- auteur
- Andrea Desiderato, Marcos Barbeitos, Clément Gilbert, Jean-Luc da Lage
- article
- G3, 2020, 10 (2), pp.709-719. ⟨10.1534/g3.119.400826⟩
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- titre
- Promiscuity and sex ratio in the terrestrial isopod Armadillidium vulgare and consequences on genetic diversity
- auteur
- Sylvine Durand, Christine Braquart-Varnier, Sophie Beltran-Bech
- article
- Behavioural Processes, 2020, 171, pp.104030. ⟨10.1016/j.beproc.2019.104030⟩
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- titre
- Habitat patches for newts in the face of climate change: local scale assessment combining niche modelling and graph theory
- auteur
- Clémentine Préau, Frédéric Grandjean, Yann Sellier, Miguel Gailledrat, Romain R. Bertrand, Francis Isselin-Nondedeu
- article
- Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.3570. ⟨10.1038/s41598-020-60479-4⟩
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- titre
- Improved lipid mixtures profiling by 1H NMR using reference lineshape adjustment and deconvolution techniques
- auteur
- Ghina Hajjar, Noelle Merchak, Charbel Daniel, Toufic Rizk, Serge Akoka, Joseph Bejjani
- article
- Talanta, 2020, 208, pp.120475. ⟨10.1016/j.talanta.2019.120475⟩
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-
- titre
- Niche modelling to guide conservation actions in France for the endangered crayfish Austropotamobius pallipes in relation to the invasive Pacifastacus leniusculus
- auteur
- Clémentine Préau, Iris Nadeau, Yann Sellier, Francis Isselin‐nondedeu, Romain R. Bertrand, Marc Collas, Cesar Capinha, Frederic Grandjean
- article
- Freshwater Biology, 2020, 65 (2), pp.304-315. ⟨10.1111/fwb.13422⟩
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-
- titre
- Modelling hydrolysis: Simultaneous versus sequential biodegradation of the hydrolysable fractions
- auteur
- Julie Jimenez, Cyrille Charnier, Mokhles Kouas, Eric Latrille, Michel Torrijos, Jérôme Harmand, Dominique Patureau, Mathieu Sperandio, Eberhard Morgenroth, Fabrice Béline, George Ekama, Peter Vanrolleghem, Ángel Robles, Aurora Seco, Damien Batstone, Jean-Philippe Steyer
- article
- Waste Management, 2020, 101, pp.150-160. ⟨10.1016/j.wasman.2019.10.004⟩
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-
- titre
- Isotopic evidence for alteration of nitrous oxide emissions and producing pathways' contribution under nitrifying conditions
- auteur
- Guillaume Humbert, Mathieu Sebilo, Justine Fiat, Longqi Lang, Ahlem Filali, Véronique Vaury, Mathieu Sperandio, Anniet M. Laverman
- article
- Biogeosciences, 2020, 17 (4), pp.979-993. ⟨10.5194/bg-17-979-2020⟩
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- titre
- Multi-scale spatial genetic structure of the vector-borne pathogen 'Candidatus phytoplasma prunorum' in orchards and in wild habitats
- auteur
- Véronique Marie-Jeanne, François Bonnot, Gaël Thébaud, Jean Peccoud, Gérard Labonne, Nicolas Sauvion
- article
- Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.5002. ⟨10.1038/s41598-020-61908-0⟩
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- titre
- Horizontal transfer and evolution of transposable elements in vertebrates
- auteur
- Hua-Hao Zhang, Jean Peccoud, Min-Rui-Xuan Xu, Xiao-Gu Zhang, Clement Gilbert
- article
- Nature Communications, 2020, 11, pp.1362. ⟨10.1038/s41467-020-15149-4⟩
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-
- titre
- The shutting down of the insulin pathway: a developmental window for Wolbachia load and feminization
- auteur
- Benjamin Herran, Sandrine Geniez, Carine Delaunay, Maryline Raimond, Jérôme Lesobre, Joanne Bertaux, Barton Slatko, Pierre Grève
- article
- Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.10551. ⟨10.1038/s41598-020-67428-1⟩
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-
- titre
- Growth of Arabidopsis thaliana in rhizobox culture system evaluated through the lens of root microbiome
- auteur
- Anne Mercier, Laure Mignerot, Nils Hennion, Kevin Gravouil, Benoît Porcheron, Mickaël Durand, Laurence Maurousset, Yann Héchard, Joanne Bertaux, Thierry Ferreira, Béatrice Lauga, Rémi Lemoine, Nathalie Pourtau
- article
- Plant and Soil, 2020, 455, pp.467-487. ⟨10.1007/s11104-020-04650-w⟩
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-
- titre
- Painted black: Iguana melanoderma (Reptilia, Squamata, Iguanidae) a new melanistic endemic species from Saba and Montserrat islands (Lesser Antilles)
- auteur
- Michel Breuil, David Schikorski, Barbara Vuillaume, Ulrike Krauss, Matthew Morton, Elizabeth Corry, Nicolas Bech, Mišel Jelić, Frédéric Grandjean
- article
- Zookeys, 2020, 926, pp.95-131. ⟨10.3897/zookeys.926.48679⟩
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- titre
- Wide spectrum and high frequency of genomic structural variation, including transposable elements, in large double-stranded DNA viruses
- auteur
- Vincent Loiseau, Elisabeth A. Herniou, Yannis Moreau, Nicolas Lévêque, Carine Meignin, Laurent Daeffler, Brian Federici, Richard Cordaux, Clément Gilbert
- article
- Virus Evolution, 2020, 6 (1), pp.vez060. ⟨10.1093/ve/vez060⟩
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-
2019
Article dans une revue
- titre
- Expanding Tara Oceans Protocols for Underway, Ecosystemic Sampling of the Ocean-Atmosphere Interface During Tara Pacific Expedition (2016–2018)
- auteur
- Gabriel Gorsky, Guillaume Bourdin, Fabien Lombard, Maria Luiza Pedrotti, Samuel Audrain, Nicolas Bin, Emmanuel Boss, Chris Bowler, Nicolas Cassar, Loic Caudan, Geneviève Chabot, Natalie Cohen, Daniel Cron, Colomban de Vargas, John Dolan, Eric Douville, Amanda Elineau, J. Michel Flores, Jean-François Ghiglione, Nils Haëntjens, Martin Hertau, Seth G. John, Rachel L. Kelly, Ilan Koren, Yajuan Lin, Dominique Marie, Clémentine Moulin, Yohann Moucherie, Stéphane Pesant, Marc Picheral, Julie Poulain, Mireille Pujo-Pay, Gilles Reverdin, Sarah Romac, Matthew B. Sullivan, Miri Trainic, Marc Tressol, Romain Troublé, Assaf Vardi, Christian R. Voolstra, Patrick Wincker, Sylvain Agostini, Bernard Banaigs, Emilie Boissin, Didier Forcioli, Paola Furla, Pierre Galand, Eric Gilson, Stéphanie Reynaud, Shinichi Sunagawa, Olivier P. Thomas, Rebecca Lisette Vega Thurber, Didier Zoccola, Serge Planes, Denis Allemand, Eric Karsenti
- article
- Frontiers in Marine Science, 2019, 6, pp.650. ⟨10.3389/fmars.2019.00750⟩
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-
- titre
- Joint effects of group sex-ratio and Wolbachia infection on female reproductive success in the terrestrial isopod Armadillidium vulgare
- auteur
- Margot Fortin, Joël Meunier, Tiffany Laverré, Catherine Souty-Grosset, Freddie-Jeanne Richard
- article
- BMC Evolutionary Biology, 2019, 19 (1), ⟨10.1186/s12862-019-1391-6⟩
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-
- titre
- Lignocellulose degradation in isopods: new insights into the adaptation to terrestrial life
- auteur
- Marius Bredon, Benjamin Herran, Baptiste Lheraud, Joanne Bertaux, Pierre Greve, Bouziane B. Moumen, Didier Bouchon
- article
- BMC Genomics, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s12864-019-5825-8⟩
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-
- titre
- The 2019 FASEB Science Research Conference on The Mobile DNA Conference: 25 Years of Discussion and Research, June 23–28, Palm Springs, California, USA
- auteur
- David W Ray, Nicole Paulat, Wenfeng An, Stéphane Boissinot, Richard Cordaux, Tiffany Kaul, Ben Freeman, Victoria Belancio
- article
- FASEB Journal, 2019, 33 (11), pp.11625-11628. ⟨10.1096/fj.201902390⟩
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-
- titre
- Survival capacity of the common woodlouse Armadillidium vulgare is improved with a second infection of Salmonella enterica
- auteur
- Cybèle Prigot-Maurice, Alexandra Cerqueira de Araujo, Sylvine Durand, Tiffany Laverré, Romain Pigeault, Julien Verdon, Philippe Bulet, Sophie Beltran-Bech, Christine Braquart-Varnier
- article
- Journal of Invertebrate Pathology, 2019, 168, pp.107278. ⟨10.1016/j.jip.2019.107278⟩
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-
- titre
- Fine-scale population structure analysis in Armadillidium vulgare (Isopoda: Oniscidea) reveals strong female philopatry
- auteur
- Sylvine Durand, Frederic Grandjean, Isabelle Giraud, Richard Cordaux, Sophie Beltran-Bech, Nicolas Bech
- article
- Acta Oecologica, 2019, 101, pp.103478. ⟨10.1016/j.actao.2019.103478⟩
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-
- titre
- Mass drives mating success in Armadillidium vulgare (Crustacea, Oniscidea)
- auteur
- François Lefebvre, Freddie-Jeanne Richard, Jérôme Moreau, Thierry Rigaud, Yves Caubet
- article
- Behavioural Processes, 2019, 168, pp.103944. ⟨10.1016/j.beproc.2019.103944⟩
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-
- titre
- The induced damage in the hepatopancreas of Orchestia species after exposure to a mixture of Cu/Zn—An ultrastructural study
- auteur
- Raja Jelassi, Hajer Khemaissia, Chedliya Ghemari, Maryline Raimond, Catherine Souty‐grosset, Karima Nasri‐ammar
- article
- Microscopy Research and Technique, 2019, 83 (2), pp.148-155. ⟨10.1002/jemt.23397⟩
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-
- titre
- Differing trophic niches of three French stygobionts and their implications for conservation of endemic stygofauna
- auteur
- Fabio Ercoli, François Lefebvre, Marjorie Delangle, Nil Godé, Michel Caillon, Roland Raimond, Catherine Souty‐grosset
- article
- Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 2019, 29 (12), pp.2193-2203. ⟨10.1002/aqc.3227⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Sex chromosomes control vertical transmission of feminizing Wolbachia symbionts in an isopod
- auteur
- Thomas Becking, Mohamed Amine Chebbi, Isabelle Giraud, Bouziane Moumen, Tiffany Laverré, Yves Caubet, Jean Peccoud, Clément Gilbert, Richard Cordaux
- article
- PLoS Biology, 2019, 17 (10), pp.e3000438. ⟨10.1371/journal.pbio.3000438⟩
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-
- titre
- Evaluation of trace element contamination using Armadillo officinalis Duméril, 1816 (Crustacea, Isopoda) as a tool: An ultrastructural study
- auteur
- Hajer Khemaissia, Raja Jelassi, Chedliya Ghemari, Maryline Raimond, Catherine Souty‐grosset, Karima Nasri‐ammar
- article
- Microscopy Research and Technique, 2019, ⟨10.1002/jemt.23371⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Effects of trace metal elements on ultrastructural features of hepatopancreas of Armadillidium granulatum Brandt, 1833 (Crustacea, Isopoda)
- auteur
- Hajer Khemaissia, Raja Jelassi, Chedliya Ghemari, Maryline Raimond, Catherine Souty‐grosset, Karima Nasri‐ammar
- article
- Microscopy Research and Technique, 2019, 82 (10), pp.1819-1831. ⟨10.1002/jemt.23349⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A new bunya-like virus associated with mass mortality of white-clawed crayfish in the wild
- auteur
- Frédéric Grandjean, C. Gilbert, F. Razafimafondy, M. Vucić, C. Delaunay, P. Gindre, J. Bouchard, M. Raimond, B. Moumen
- article
- Virology, 2019, 533, pp.115-124. ⟨10.1016/j.virol.2019.05.014⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mathematical modeling and analysis of dynamic effects of multiple time-varying delays on electrophysiological wave propagation in the heart
- auteur
- Aziz Belmiloudi, S. Corre
- article
- Nonlinear Analysis: Real World Applications, 2019, 47, pp.18-44. ⟨10.1016/j.nonrwa.2018.09.025⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- India in the Oil Palm Era: Describing India’s Dependence on Palm Oil, Recommendations for Sustainable Production, and Opportunities to Become an Influential Consumer
- auteur
- H. Sagar, Amani Mabano, Ramya Roopa, Mahmuda Sharmin, Freddie-Jeanne Richard, Julia Clause
- article
- Tropical Conservation Science, 2019, 12, pp.194008291983891. ⟨10.1177/1940082919838918⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A story of nasal horns: two new subspecies of Iguana Laurenti, 1768 (Squamata, Iguanidae) in Saint Lucia, St Vincent & the Grenadines, and Grenada (southern Lesser Antilles)
- auteur
- Michel Breuil, Barbara Vuillaume, David Schikorski, Ulrike Krauss, Matthew Morton, Pius Haynes, Jennifer Daltry, Elizabeth Corry, Glenroy Gaymes, Joanne Gaymes, Nicolas Bech, Mišel Jelić, Frédéric Grandjean
- article
- Zootaxa, 2019, 4608 (2), pp.201. ⟨10.11646/zootaxa.4608.2.1⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The Genome of Armadillidium vulgare (Crustacea, Isopoda) Provides Insights into Sex Chromosome Evolution in the Context of Cytoplasmic Sex Determination
- auteur
- Mohamed Amine Chebbi, Thomas Becking, Bouziane Moumen, Isabelle Giraud, Clément Gilbert, Jean Peccoud, Richard Cordaux
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2019, 36 (4), pp.727-741. ⟨10.1093/molbev/msz010⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- IGFBP-rP1, a strongly conserved member of the androgenic hormone signalling pathway in Isopoda
- auteur
- Benjamin Herran, Nicolas Cerveau, Camille Houdelet, Clémentine Bernier, Catherine Debenest, Carine Delaunay, Maryline Raimond, Joanne Bertaux, Pierre Greve
- article
- General and Comparative Endocrinology, 2019, 272, pp.9-19. ⟨10.1016/j.ygcen.2018.11.006⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Ecotoxicological effects of trace element contamination in talitrid amphipod Orchestia montagui Audouin, 1826
- auteur
- Raja Jelassi, Hajer Khemaissia, Chedliya Ghemari, Maryline Raimond, Catherine Souty-Grosset, Karima Nasri-Ammar
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2019, 26 (6), pp.5577-5587. ⟨10.1007/s11356-018-3974-y⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Detection and Control of Invasive Freshwater Crayfish: From Traditional to Innovative Methods
- auteur
- Chiara Manfrin, Catherine Souty-Grosset, Pedro Anastácio, Julian Reynolds, Piero Giulianini
- article
- Diversity, 2019, 11 (1), pp.5. ⟨10.3390/d11010005⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Global survey of mobile DNA horizontal transfer in arthropods reveals Lepidoptera as a prime hotspot
- auteur
- Daphné Reiss, Gladys Mialdea, Vincent Miele, Damien M. de Vienne, Jean Peccoud, Clément Gilbert, Laurent Duret, Sylvain Charlat
- article
- PLoS Genetics, 2019, 15 (2), pp.e1007965. ⟨10.1371/journal.pgen.1007965⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Predicting suitable habitats of four range margin amphibians under climate and land-use changes in southwestern France
- auteur
- Clémentine Préau, Francis Isselin-Nondedeu, Yann Sellier, Romain Bertrand, Frédéric Grandjean
- article
- Regional Environmental Change, 2019, 19, pp.27-38. ⟨10.1007/s10113-018-1381-z⟩
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Immune Priming and Trans-Generational Protection From Parasites
- auteur
- Yannick Moret, Christine Coustau, Christine Braquart-Varnier, Benjamin Gourbal
- article
- Encyclopedia of Animal Behavior, Elsevier, pp.764-774, 2019, ⟨10.1016/B978-0-12-809633-8.90726-X⟩
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-
Pré-publication, Document de travail
- titre
- The crustacean Armadillidium vulgare, a new promising model for the study of cellular senescence
- auteur
- Charlotte Depeux, Ascel Samba-Louaka, Thomas Becking, Christine Braquart-Varnier, Jérôme Moreau, Jean-François Lemaître, Tiffany Laverré, Hélène Paulhac, François-Xavier Dechaume-Moncharmont, Jean-Michel Gaillard, Sophie Beltran-Bech
- article
- 2019
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-
2018
Article dans une revue
- titre
- How do familiarity and relatedness influence mate choice in Armadillidium vulgare?
- auteur
- Margot Fortin, Camille Vitet, Catherine Souty-Grosset, Freddie-Jeanne Richard
- article
- PLoS ONE, 2018, 13 (12), pp.e0209893. ⟨10.1371/journal.pone.0209893⟩
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-
- titre
- Effect of agricultural practices on terrestrial isopods: a review
- auteur
- Catherine Souty-Grosset, Ariel Faberi
- article
- Zookeys, 2018, 801, pp.63-96. ⟨10.3897/zookeys.801.24680⟩
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-
- titre
- Genomics analysis of Aphanomyces spp. identifies a new class of oomycete effector associated with host adaptation
- auteur
- Elodie Gaulin, Michiel Pel, Laurent Camborde, Hélène San Clemente, Sarah Courbier, Marie-Alexane Dupouy, Julie Lengellé, Marine Veyssière, Aurélie Le Ru, Frédéric Grandjean, Richard Cordaux, Bouziane Moumen, Clément Gilbert, Liliana Cano, Jean-Marc Aury, Julie Guy, Patrick Wincker, Olivier Bouchez, Christophe C. Klopp, Bernard Dumas
- article
- BMC Biology, 2018, 16 (1), ⟨10.1186/s12915-018-0508-5⟩
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-
- titre
- Divergent evolution and clade-specific duplications of the Insulin-like Receptor in malacostracan crustaceans
- auteur
- Benjamin Herran, Joanne Bertaux, Pierre Greve
- article
- General and Comparative Endocrinology, 2018, 268, pp.34-39. ⟨10.1016/j.ygcen.2018.07.013⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- ORDER within the chaos: Insights into phylogenetic relationships within the Anomura (Crustacea: Decapoda) from mitochondrial sequences and gene order rearrangements
- auteur
- Mun Hua Tan, Han Ming Gan, Yin Peng Lee, Stuart Linton, Frédéric Grandjean, Marlise Ladvocat Bartholomei-Santos, Adam Miller, Christopher Austin
- article
- Molecular Phylogenetics and Evolution, 2018, 127, pp.320 - 331. ⟨10.1016/j.ympev.2018.05.015⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Gaia Data Release 2. Summary of the contents and survey properties
- auteur
- Gaia Collaboration, A. Brown, A. Vallenari, T. Prusti, J. de Bruijne, C. Babusiaux, C. Bailer-Jones, M. Biermann, D. Evans, L. Eyer, F. Jansen, C. Jordi, S. Klioner, U. Lammers, L. Lindegren, X. Luri, F. Mignard, C. Panem, D. Pourbaix, S. Randich, P. Sartoretti, H. Siddiqui, C. Soubiran, F. van Leeuwen, A. Walton, F. Arenou, U. Bastian, M. Cropper, R. Drimmel, D. Katz, M. Lattanzi, J. Bakker, C. Cacciari, J. Castañeda, L. Chaoul, N. Cheek, F. de Angeli, C. Fabricius, R. Guerra, B. Holl, E. Masana, R. Messineo, N. Mowlavi, K. Nienartowicz, P. Panuzzo, J. Portell, M. Riello, M. Seabroke, P. Tanga, F. Thevenin, G. Gracia-Abril, G. Comoretto, M. Garcia-Reinaldos, D. Teyssier, M. Altmann, R. Andrae, M. Audard, I. Bellas-Velidis, K. Benson, Jérôme Berthier, R. Blomme, P. Burgess, G. Busso, B. Carry, A. Cellino, G. Clementini, M. Clotet, O. Creevey, M. David, J. de Ridder, L. Delchambre, A. Dell’oro, C. Ducourant, J. Hernandez, M. Fouesneau, Y. Frémat, L. Galluccio, M. García-Torres, J. González-Núñez, J. González-Vidal, E. Gosset, P. Guy, J. Halbwachs, C. Hambly, D. Harrison, D. Hestroffer, T. Hodgkin, A. Hutton, Gérard Jasniewicz, A. Jean-Antoine-Piccolo, S. Jordan, J. Korn, A. Krone-Martins, C. Lanza, T. Lebzelter, W. Löffler, M. Manteiga, M. Marrese, J. Martín-Fleitas, A. Moitinho, A. Mor, K. Muinonen, J. Osinde, E. Pancino, T. Pauwels, J. Petit, A. Recio-Blanco, J. Richards, L. Rimoldini, C. Robin, M. Sarro, C. Siopis, M. Smith, A. Sozzetti, M. Süveges, J. Torra, W. van Reeven, U. Abbas, A. Abreu Aramburu, S. Accart, C. Aerts, G. Altavilla, M. Álvarez, R. Alvarez, J. Alves, R. Anderson, H. Andrei, E. Anglada Varela, E. Antiche, T. Antoja, B. Arcay, T. Astraatmadja, N. Bach, S. Baker, L. Balaguer-Nunez, P. Balm, C. Barache, C. Barata, D. Barbato, F. Barblan, S. Barklem, D. Barrado, M. Barros, M. Barstow, S. Bartholomé Muñoz, J. Bassilana, U. Becciani, M. Bellazzini, A. Berihuete, Stefano Bertone, L. Bianchi, O. Bienaymé, S. Blanco-Cuaresma, T. Boch, C. Boeche, A. Bombrun, R. Borrachero, D. Bossini, S. Bouquillon, G. Bourda, A. Bragaglia, L. Bramante, M. Breddels, A. Bressan, N. Brouillet, T. Brüsemeister, E. Brugaletta, B. Bucciarelli, A. Burlacu, D. Busonero, A. Butkevich, R. Buzzi, E. Caffau, R. Cancelliere, G. Cannizzaro, T. Cantat-Gaudin, R. Carballo, T. Carlucci, J. Carrasco, L. Casamiquela, M. Castellani, A. Castro-Ginard, P. Charlot, L. Chemin, A. Chiavassa, G. Cocozza, G. Costigan, S. Cowell, F. Crifo, M. Crosta, C. Crowley, J. Cuypers†, C. Dafonte, Y. Damerdji, A. Dapergolas, P. David, P. de Laverny, F. de Luise, R. de March, D. Martino, R. de Souza, A. de Torres, J. Debosscher, E. del Pozo, M. Delbò, A. Delgado, H. Delgado, P. Di Matteo, S. Diakite, C. Diener, E. Distefano, C. Dolding, P. Drazinos, J. Duran, B. Edvardsson, H. Enke, K. Eriksson, P. Esquej, G. Eynard Bontemps, C. Fabre, M. Fabrizio, S. Faigler, J. Falcão, M. Farràs Casas, L. Federici, G. Fedorets, P. Fernique, F. Figueras, F. Filippi, K. Findeisen, A. Fonti, E. Fraile, M. Fraser, B. Frézouls, M. Gai, S. Galleti, D. Garabato, F. García-Sedano, A. Garofalo, N. Garralda, A. Gavel, P. Gavras, J. Gerssen, R. Geyer, P. Giacobbe, G. Gilmore, S. Girona, G. Giuffrida, F. Glass, M. Gomes, M. Granvik, A. Gueguen, A. Guerrier, J. Guiraud, R. Gutiérrez-Sánchez, R. Haigron, D. Hatzidimitriou, M. Hauser, M. Haywood, U. Heiter, A. Helmi, J. Heu, T. Hilger, D. Hobbs, W. Hofmann, G. Holland, H. Huckle, A. Hypki, V. Icardi, K. Janssen, G. Jevardat de Fombelle, G. Jonker, L. Juhasz, F. Julbe, A. Karampelas, A. Kewley, J. Klar, A. Kochoska, R. Kohley, K. Kolenberg, M. Kontizas, E. Kontizas, S. Koposov, G. Kordopatis, Z. Kostrzewa-Rutkowska, P. Koubsky, S. Lambert, A. Lanza, Y. Lasne, J. Lavigne, Y. Le Fustec, C. Le Poncin-Lafitte, Y. Lebreton, S. Leccia, N. Leclerc, I. Lecoeur-Taibi, H. Lenhardt, F. Leroux, S. Liao, E. Licata, H. Lindstrøm, T. Lister, E. Livanou, A. Lobel, M. López, S. Managau, G. Mann, G. Mantelet, O. Marchal, J. Marchant, M. Marconi, S. Marinoni, G. Marschalkó, D. J. Marshall, M. Martino, G. Marton, N. Mary, D. Massari, G. Matijevič, T. Mazeh, J. Mcmillan, S. Messina, D. Michalik, R. Millar, D. Molina, R. Molinaro, L. Molnar, P. Montegriffo, R. Mor, T. Sagristà Sellés, R. Morbidelli, T. Morel, D. Morris, A. Mulone, T. Muraveva, I. Musella, G. Nelemans, L. Nicastro, L. Noval, W. O’mullane, C. Ordenovic, D. Ordóñez-Blanco, P. Osborne, C. Pagani, I. Pagano, F. Pailler, H. Palacin, L. Palaversa, A. Panahi, M. Pawlak, M. Piersimoni, F. Pineau, E. Plachy, G. Plum, E. Poggio, E. Poujoulet, A. Prša, L. Pulone, E. Racero, S. Ragaini, N. Rambaux, M. Ramos-Lerate, S. Regibo, C. Reyle, F. Riclet, V. Ripepi, A. Riva, A. Rivard, G. Rixon, T. Roegiers, M. Roelens, M. Romero-Gomez, N. Rowell, F. Royer, L. Ruiz-Dern, G. Sadowski, J. Sahlmann, J. Salgado, E. Salguero, N. Sanna, T. Santana-Ros, M. Sarasso, H. Savietto, M. Schultheis, E. Sciacca, M. Segol, C. Segovia, D. Segransan, C. Shih, L. Siltala, A. Silva, R. Smart, W. Smith, E. Solano, F. Solitro, R. Sordo, S. Soria Nieto, J. Souchay, A. Spagna, F. Spoto, U. Stampa, A. Steele, H. Steidelmüller, C. Stephenson, H. Stoev, F. Suess, J. Surdej, L. Szabados, E. Szegedi-Elek, D. Tapiador, F. Taris, G. Tauran, M. Taylor, R. Teixeira, D. Terrett, P. Teyssandier, W. Thuillot, A. Titarenko, F. Torra Clotet, C. Turon, A. Ulla, E. Utrilla, S. Uzzi, M. Vaillant, G. Valentini, V. Valette, A. van Elteren, E. van Hemelryck, M. van Leeuwen, M. Vaschetto, A. Vecchiato, J. Veljanoski, Y. Viala, D. Vicente, S. Vogt, C. von Essen, H. Voss, V. Votruba, S. Voutsinas, G. Walmsley, M. Weiler, O. Wertz, T. Wevers, Ł. Wyrzykowski, A. Yoldas, M. Žerjal, H. Ziaeepour, J. Zorec, S. Zschocke, S. Zucker, C. Zurbach, T. Zwitter
- article
- Astronomy and Astrophysics - A&A, 2018, 616, pp.id.A1. ⟨10.1051/0004-6361/201833051⟩
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-
- titre
- Identifying genomic hotspots of differentiation and candidate genes involved in the adaptive divergence of pea aphid host races
- auteur
- Pierre Nouhaud, Mathieu Gautier, Anaïs Gouin, Julie Jaquiéry, Jean Peccoud, Fabrice Legeai, Lucie Mieuzet, Carole Smadja, Claire Lemaitre, Renaud Vitalis, Jean-Christophe Simon
- article
- Molecular Ecology, 2018, 27 (16), pp.3287 - 3300. ⟨10.1111/mec.14799⟩
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-
- titre
- Hundreds of novel composite genes and chimeric genes with bacterial origins contributed to haloarchaeal evolution
- auteur
- Raphaël Méheust, Andrew K Watson, Francois-Joseph Lapointe, R. Thane Papke, Philippe Lopez, Eric Bapteste
- article
- Genome Biology, 2018, 19, pp.75. ⟨10.1186/s13059-018-1454-9⟩
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-
- titre
- Fast Evolution and Lineage-Specific Gene Family Expansions of Aphid Salivary Effectors Driven by Interactions with Host-Plants
- auteur
- Hélène Boulain, Fabrice Legeai, Endrick Guy, Stéphanie Morliere, Nadine Douglas, Jonghee Oh, Marimuthu Murugan, Michael Smith, Julie Jaquiéry, Jean Peccoud, Frank White, James Carolan, Jean-Christophe Simon, Akiko Sugio
- article
- Genome Biology and Evolution, 2018, 10 (6), pp.1554-1572. ⟨10.1093/gbe/evy097⟩
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-
- titre
- Investigating the Molecular Genetic Basis of Cytoplasmic Sex Determination Caused by Wolbachia Endosymbionts in Terrestrial Isopods
- auteur
- Myriam Badawi, Bouziane Moumen, Isabelle Giraud, Pierre Greve, Richard Cordaux
- article
- Genes, 2018, 9 (6), ⟨10.3390/genes9060290⟩
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-
- titre
- Freshwater acidification: an example of an endangered crayfish species sensitive to pH
- auteur
- David Beaune, Yann Sellier, Gilles Luquet, Frédéric Grandjean
- article
- Hydrobiologia, 2018, 813 (1), pp.41-50. ⟨10.1007/s10750-018-3504-4⟩
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-
- titre
- Cnidarian Primary Cell Culture as a Tool to Investigate the Effect of Thermal Stress at Cellular Level
- auteur
- P. Ventura, G. Toullec, C. Fricano, L. Chapron, V. Meunier, E. Röttinger, P. Furla, S. Barnay-Verdier
- article
- Marine Biotechnology, 2018, 20 (2), pp.144-154. ⟨10.1007/s10126-017-9791-3⟩
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-
- titre
- A Survey of Virus Recombination Uncovers Canonical Features of Artificial Chimeras Generated During Deep Sequencing Library Preparation
- auteur
- Jean Peccoud, Sebastian Lequime, Isabelle Moltini-Conclois, Isabelle Giraud, Louis Lambrechts, Clement Gilbert
- article
- G3, 2018, 8 (4), pp.1129-1138. ⟨10.1534/g3.117.300468⟩
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-
- titre
- Rapid evolution of aphid pests in agricultural environments
- auteur
- Jean-Christophe Simon, Jean Peccoud
- article
- Current Opinion in Insect Science, 2018, 26, pp.17 - 24. ⟨10.1016/j.cois.2017.12.009⟩
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-
- titre
- Inoculation of an ecosystem engineer (Earthworm: Lumbricus terrestris ) during experimental grassland restoration: Consequences for above and belowground soil compartments
- auteur
- Estelle Forey, Matthieu Chauvat, Sékou F.M. Coulibaly, Estelle Langlois, Sébastien Barot, Julia Clause
- article
- Applied Soil Ecology, 2018, 125, pp.148 - 155. ⟨10.1016/j.apsoil.2017.12.021⟩
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-
- titre
- Horizontal acquisition of transposable elements and viral sequences: patterns and consequences
- auteur
- Clément Gilbert, Cédric Feschotte
- article
- Current Opinion in Genetics and Development, 2018, 49, pp.15-24. ⟨10.1016/j.gde.2018.02.007⟩
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-
- titre
- Spatial and genetic distribution of a north American termite, Reticulitermes flavipes, across the landscape of Paris
- auteur
- Guillaume Baudouin, Nicolas Bech, Anne-Geneviève Bagnères, Franck Dedeine
- article
- Urban Ecosystems, 2018, ⟨10.1007/s11252-018-0747-9⟩
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-
- titre
- Males prefer virgin females, even if parasitized, in the terrestrial isopod Armadillidium vulgare
- auteur
- Margot Fortin, Catherine Debenest, Catherine Souty-Grosset, Freddie-Jeanne Richard
- article
- Ecology and Evolution, 2018, 8 (6), pp.3341 - 3353. ⟨10.1002/ece3.3858⟩
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-
- titre
- Genetic diversity of the invasive crayfish Procambarus clarkii in France
- auteur
- Mauricio Pereira Almerão, Carine Delaunay, Aurore Coignet, Douglas Fernando Peiró, François Pinet, Catherine Souty-Grosset
- article
- Limnologica, 2018, 69, pp.135 - 141. ⟨10.1016/j.limno.2018.01.002⟩
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-
- titre
- Producing offspring in Armadillidium vulgare : Effects of genetic diversity and inbreeding
- auteur
- Sylvine Durand, Vincent Loiseau, Cybèle Prigot, Christine Braquart-Varnier, Sophie Beltran-Bech
- article
- Evolution & Development, 2018, 20 (2), pp.65 - 77. ⟨10.1111/ede.12248⟩
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-
- titre
- Disentangling the Causes for Faster-X Evolution in Aphids
- auteur
- Julie Jaquiéry, Jean Peccoud, Tiphaine Ouisse, Fabrice Legeai, Nathalie Prunier-Leterme, Anais Gouin, Pierre Nouhaud, Jennifer Brisson, Ryan Bickel, Swapna Purandare, Julie Poulain, Christophe Battail, Claire Lemaitre, Lucie Mieuzet, Gaël Le Trionnaire, Jean-Christophe Simon, C. Rispe
- article
- Genome Biology and Evolution, 2018, 10 (2), pp.507-520. ⟨10.1093/gbe/evy015⟩
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-
- titre
- Analyzing Horizontal Transfer of Transposable Elements on a Large Scale: Challenges and Prospects
- auteur
- Jean Peccoud, Richard Cordaux, Clément Gilbert
- article
- BioEssays, 2018, 40 (2), ⟨10.1002/bies.201700177⟩
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-
- titre
- Characterization of the spoilage potential of pure and mixed cultures of bacterial species isolated from tropical yellowfin tuna ( Thunnus albacares )
- auteur
- Juliette Smith-Ravin, A. Silbande, J. Cornet, M. Cardinal, F. Chevalier, K. Rochefort, S. Adenet, F. Leroi
- article
- Journal of Applied Microbiology, 2018, 124 (2), pp.559 - 571. ⟨10.1111/jam.13663⟩
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-
- titre
- Female-biased sex ratios unrelated to Wolbachia infection in European species of the Jaera albifrons complex (marine isopods)
- auteur
- Ambre Ribardière, Julia Centanni, Arnaud Dano, Jérôme Coudret, Claire Daguin-Thiébaut, Céline Houbin, Elise Kerdoncuff, Ségolène Jambut, Richard Cordaux, Thomas Broquet
- article
- Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2018, 509, pp.91-98. ⟨10.1016/j.jembe.2018.09.002⟩
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-
- titre
- Feminizing Wolbachia influence microbiota composition in the terrestrial isopod Armadillidium vulgare
- auteur
- Jessica Dittmer, Didier Bouchon
- article
- Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.6998. ⟨10.1038/s41598-018-25450-4⟩
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-
- titre
- Lignocellulose degradation at the holobiont level: teamwork in a keystone soil invertebrate
- auteur
- Marius Bredon, Jessica Dittmer, Cyril Noel, Bouziane Moumen, Didier Bouchon
- article
- Microbiome, 2018, 6 (1), pp.162. ⟨10.1186/s40168-018-0536-y⟩
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-
- titre
- Molecular systematics reveals multiple lineages and cryptic speciation in the freshwater crayfish Parastacus brasiliensis (von Martens, 1869) (Crustacea : Decapoda : Parastacidae)
- auteur
- Ivana Miranda, Kelly Gomes, Felipe Ribeiro, Paula Araujo, Catherine Souty-Grosset, Christoph Schubart
- article
- Invertebrate Systematics, 2018, ⟨10.1071/IS18012⟩
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-
- titre
- Control of H 2 Dissociative Ionization in the Nonlinear Regime Using Vacuum Ultraviolet Free-Electron Laser Pulses
- auteur
- F. Holzmeier, R. Y. Bello, M. Hervé, A. Achner, T. M. Baumann, M. Meyer, P. Finetti, M. Di Fraia, D. Gauthier, E. Roussel, O. Plekan, R. Richter, K. C. Prince, C. Callegari, H. Bachau, A. Palacios, F. Martín, D. Dowek
- article
- Physical Review Letters, 2018, 121 (10), pp.103002. ⟨10.1103/PhysRevLett.121.103002⟩
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-
- titre
- The complete mitochondrial genome of Gammarus roeselii (Crustacea, Amphipoda): insights into mitogenome plasticity and evolution
- auteur
- Alexandre Cormier, Rémi Wattier, Maria Teixeira, Thierry Rigaud, Richard Cordaux
- article
- Hydrobiologia, 2018, 825, pp.197-210. ⟨10.1007/s10750-018-3578-z⟩
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-
- titre
- Heavy Metals Assessment and Their Effects on the Hepatopancreas in Orchestia montagui (Amphipoda, Talitridae)
- auteur
- Raja Jelassi, Ghemari Chedliya, Hajer Khemaissia, Maryline Raimond, Catherine Souty-Grosset, Karima Nasri-Ammar
- article
- Lecture Notes in Computer Science, 2018, ⟨10.1007/978-3-319-70548-4_112⟩
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-
- titre
- Pan-arthropod analysis reveals somatic piRNAs as an ancestral defence against transposable elements
- auteur
- Samuel Lewis, Kaycee A. Quarles, Yujing Yang, Mélanie Tanguy, Lise L. Frezal, Stephen A. Smith, Prashant P. Sharma, Richard Cordaux, Clément Gilbert, Isabelle Giraud, David H. Collins, Phillip D. Zamore, Eric A. Miska, Peter Sarkies, Francis M. Jiggins
- article
- Nature Ecology & Evolution, 2018, 2, pp.174-181. ⟨10.1038/s41559-017-0403-4⟩
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-
Communication dans un congrès
- titre
- Long ncRNAs and epigenetic regulations are attractive candidate elements for the orchestration of symbiotic gene expression in M. truncatula.
- auteur
- Yann Pecrix, S Evan Staton, Erika Sallet, Christine Lelandais Briere, Sandra Moreau, Sébastien Carrere, Thomas Blein, Marie-Françoise Jardinaud, David Latrasse, Hélène Bergès, Andréas Niebel, Julia Buitink, Moussa Benhamed, Martin Crespi, Jerome Gouzy, Pascal Gamas
- article
- International plant epigenetics symposium, ERC (European Research Council) and the RFI Objectif Végétal regional programme, Oct 2018, Angers, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Recovering the complexity in scientific knowledge: towards automatically reconstructing the maize floral transition gene regulatory network
- auteur
- Adrienne Ressayre, Natalia Conde E Silva, Catherine Damerval, Fabien Chardon, Yves Deveaux, Arnaud Desbiez-Piat, C. Dillmann, Elodie E. Marchadier, Dominique de Vienne, Robert Bossy, Estelle Chaix, Claire Nédellec
- article
- International Conférence on Ecological Science, Oct 2018, Paris, France
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-
2017
Article dans une revue
- titre
- When GIS zooms in: spatio-genetic maps of multipaternity in Armadillidium vulgare
- auteur
- Nicolas Bech, Charlotte Depeux, Sylvine Durand, Catherine Debenest, Alexandra Lafitte, Sophie Beltran-Bech
- article
- Genetica, 2017, 145 (6), pp.503 - 512. ⟨10.1007/s10709-017-9992-8⟩
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-
- titre
- High genetic variation of invasive signal crayfish in Europe reflects multiple introductions and secondary translocations
- auteur
- Adam Petrusek, Lenka Filipová, Eva Kozubíková-Balcarová, Frederic Grandjean
- article
- Freshwater Science, 2017, 36 (4), pp.838 - 850. ⟨10.1086/694866⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- An American termite in Paris: temporal colony dynamics
- auteur
- Guillaume Baudouin, Franck Dedeine, Nicolas Bech, Stéphanie Bankhead-Dronnet, Simon Dupont, Anne-Geneviève Bagnères
- article
- Genetica, 2017, 145 (6), pp.491 - 502. ⟨10.1007/s10709-017-9991-9⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The use of Chara spp. (Charales: Characeae) as a bioindicator of physico-chemical habitat suitability for an endangered crayfish Austropotamobius pallipes in lentic waters
- auteur
- David Beaune, Yann Sellier, Elisabeth Lambert, Frederic Grandjean
- article
- Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 2017, ⟨10.1002/aqc.2847⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Amphipoda and Isopoda diversity around Tunisian wetlands (North Africa) in relation to environmental conditions
- auteur
- Hajer Khemaissia, Raja Jelassi, Catherine Souty-Grosset, Karima Nasri-Ammar
- article
- African Journal of Ecology, 2017, ⟨10.1111/aje.12466⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Legionella pneumophila decreases velocity of Acanthamoeba castellanii
- auteur
- Luce Mengue, Freddie-Jeanne Richard, Yves Caubet, Steven Rolland, Yann Héchard, Ascel Samba-Louaka
- article
- Experimental Parasitology, 2017, ⟨10.1016/j.exppara.2017.07.013⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Phenotypic shift in Wolbachia virulence towards its native host across serial horizontal passages.
- auteur
- Winka Le Clec'H, Jessica Dittmer, Maryline Raimond, Didier Bouchon, Mathieu Sicard
- article
- Biology Letters, 2017, 284 (1859), ⟨10.1098/rspb.2017.1076⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Untangling Heteroplasmy, Structure, and Evolution of an Atypical Mitochondrial Genome by PacBio Sequencing.
- auteur
- Jean Peccoud, Mohamed Amine Chebbi, Alexandre Cormier, Bouziane Moumen, Clément Gilbert, Isabelle Marcadé, Christopher Chandler, Richard Cordaux
- article
- Genetics, 2017, 207 (1), pp.269-280. ⟨10.1534/genetics.117.203380⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Paternity success depends on male genetic characteristics in the terrestrial isopod Armadillidium vulgare
- auteur
- Sylvine Durand, Aurélie Cohas, Christine Braquart-Varnier, Sophie Beltran-Bech
- article
- Behavioral Ecology and Sociobiology, 2017, 71 (6), ⟨10.1007/s00265-017-2317-1⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Diversity and evolution of sex determination systems in terrestrial isopods.
- auteur
- Thomas Becking, Isabelle Giraud, Maryline Raimond, Bouziane Moumen, Christopher Chandler, Richard Cordaux, Clément Gilbert
- article
- Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.1084. ⟨10.1038/s41598-017-01195-4⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Massive horizontal transfer of transposable elements in insects.
- auteur
- Jean Peccoud, Vincent Loiseau, Richard Cordaux, Clément Gilbert
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2017, ⟨10.1073/pnas.1621178114⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Point of Care Cardiac Troponin Assay Analytical Performances for their Use in Clinical Routine.
- auteur
- Anne Dupuy, Solenne Baillet, Richard Dumont, Isabelle Giraud, Stéphanie Badiou, Anne-Sophie Bargnoux, Nils Kuster, François Roubille, Jean-Paul Cristol
- article
- Clinical Laboratory, 2017, pp.851-854. ⟨10.7754/Clin.Lab.2016.161008⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fate of Eight Different Polymers under Uncontrolled Composting Conditions: Relationships Between Deterioration, Biofilm Formation, and the Material Surface Properties.
- auteur
- Anne Mercier, Kevin Gravouil, Willy Aucher, Sandra Brosset-Vincent, Linette Kadri, Jenny Colas, Didier Bouchon, Thierry Ferreira
- article
- Environmental Science and Technology, 2017, 51 (4), pp.1988-1997. ⟨10.1021/acs.est.6b03530⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Status of Pacifastacus leniusculus and its role in recent crayfish plague outbreaks in France: improving distribution and crayfish plague infection patterns
- auteur
- Frédéric Grandjean, Jonathan Roques, Carine Delaunay, Adam Petrusek, Thomas Becking, Marc Collas
- article
- Aquatic Invasions, 2017, 12 (4), pp.541-549. ⟨10.3391/ai.2017.12.4.10⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mycobacterium llatzerense, a waterborne Mycobacterium, that resists phagocytosis by Acanthamoeba castellanii
- auteur
- Vincent Delafont, Ascel Samba-Louaka, Emmanuelle Cambau, Didier Bouchon, Laurent Moulin, Yann Héchard
- article
- Scientific Reports, 2017, 7, ⟨10.1038/srep46270⟩
- Accès au bibtex
-
Thèse
- titre
- Étude de la diversité neutre et adaptative chez l'anémone de mer symbiotique Anemonia viridis : apport de techniques de type Next-Generation Sequencing dans les questions de délimitation d’espèces et d’adaptation locale
- auteur
- Cédric Mallien
- article
- Ecologie, Environnement. COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019), 2017. Français. ⟨NNT : 2017AZUR4111⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2016
Article dans une revue
- titre
- Iron Availability Modulates the Persistence of Legionella pneumophila in Complex Biofilms.
- auteur
- Emilie Portier, Joanne Bertaux, Jérôme Labanowski, Yann Hechard
- article
- Microbes and environments / JSME, 2016, 31 (4), pp.387-394. ⟨10.1264/jsme2.ME16010⟩
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-
- titre
- Differential antioxidant response between two Symbiodinium species from contrasting environments
- auteur
- S. Roberty, P. Furla, J. -C. Plumier
- article
- Plant, Cell and Environment, 2016, 39 (12), pp.2713-2724. ⟨10.1111/pce.12825⟩
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-
- titre
- Multiple paternity in a wild population of Armadillidium vulgare : influence of infection with Wolbachia ?
- auteur
- V. Valette, S. Durand, N. Bech, F. Grandjean, S. Beltran-Bech
- article
- Journal of Evolutionary Biology, 2016, 30 (2), pp.235 - 243. ⟨10.1111/jeb.13009⟩
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-
- titre
- Resilience to ocean acidification: decreased carbonic anhydrase activity in sea anemones under high pCO(2) conditions
- auteur
- Patricia Ventura, Michael D. Jarrold, Pierre-Laurent Merle, Stephanie Barnay-Verdier, Thamilla Zamoum, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Piero Calosi, Paola Furla
- article
- Marine Ecology Progress Series, 2016, 559, pp.257-263. ⟨10.3354/meps11916⟩
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-
- titre
- Strong genetic structuring of the cockle Cerastoderma glaucum across Europe: new insights from an intronic marker and multivariate analysis
- auteur
- Ludmila Sromek, Didier Forcioli, Rafal Lasota, Paola Furla, Katarzyna Tarnowska-Marini, Maciej Wolowicz, Anne Chenuil
- article
- Journal of Molluscan Studies, 2016, 82 (4), pp.515--524. ⟨10.1093/mollus/eyw019⟩
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-
- titre
- The Terrestrial Isopod Microbiome: An All-in-One Toolbox for Animal–Microbe Interactions of Ecological Relevance
- auteur
- Didier Bouchon, Martin Zimmer, Jessica Dittmer
- article
- Frontiers in Microbiology, 2016, 7 (1472), 20 p. ⟨10.3389/fmicb.2016.01472⟩
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-
- titre
- Armadillidin H, a Glycine-Rich Peptide from the Terrestrial Crustacean Armadillidium vulgare, Displays an Unexpected Wide Antimicrobial Spectrum with Membranolytic Activity.
- auteur
- Julien Verdon, Pierre Coutos-Thévenot, Marie-Helene Rodier, Celine Landon, Segolene Depayras, Cyril Noel, Sylvain La Camera, Bouziane Moumen, Pierre Greve, Didier Bouchon, Jean-Marc Berjeaud, Christine Braquart-Varnier
- article
- Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.1484. ⟨10.3389/fmicb.2016.01484⟩
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-
- titre
- Environmental factors shaping cultured free-living amoebae and their associated bacterial community within drinking water network
- auteur
- Laurent Moulin, Vincent Delafont, Didier Bouchon, Yann Héchard
- article
- Water Research, 2016, 100, pp.382 - 392. ⟨10.1016/j.watres.2016.05.044⟩
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-
- titre
- The red swamp crayfish Procambarus clarkii in Europe: Impacts on aquatic ecosystems and human well-being
- auteur
- Catherine Souty-Grosset, Pedro Manuel Anastácio, Laura Aquiloni, Filipe Banha, Justine Choquer, Christoph Chucholl, Elena Tricarico
- article
- Limnologica - Ecology and Management of Inland Waters, 2016, 58, pp.78-93. ⟨10.1016/j.limno.2016.03.003⟩
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-
- titre
- Host origin and tissue microhabitat shaping the microbiota of the terrestrial isopod Armadillidium vulgare.
- auteur
- Jessica Dittmer, Jérôme Lesobre, Bouziane Moumen, Didier Bouchon
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2016, 92 (5), pp.1-15. ⟨10.1093/femsec/fiw063⟩
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-
- titre
- Isolation, characterization and PCR multiplexing of microsatellite loci for two sub-species of terrestrial isopod Porcellio dilatatus (Crustacea, Oniscidea).
- auteur
- Caroline Michaud, Cassandre Chupeau, Nicolas Bech, Magali Thierry, Mathieu Sicard, Pierre Greve, Sophie Beltran-Bech
- article
- Genetica, 2016, 144 (2), pp.223-228. ⟨10.1007/s10709-016-9892-3⟩
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-
- titre
- Efficacy of dental unit waterlines disinfectants on a polymicrobial biofilm.
- auteur
- Damien Costa, Marion Girardot, Joanne Bertaux, Julien Verdon, Christine Imbert
- article
- Water Research, 2016, 91, pp.38-44. ⟨10.1016/j.watres.2015.12.053⟩
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-
- titre
- Prevalence of the pathogen Aphanomyces astaci in freshwater crayfish populations in Croatia
- auteur
- I Maguire, M Jelić, G Klobučar, M Delpy, C Delaunay, F Grandjean
- article
- Diseases of Aquatic Organisms, 2016, 118 (1), pp.45-53. ⟨10.3354/dao02955⟩
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-
- titre
- Hierarchical organization of the cuticle of the subsocial desert isopod, Hemilepistus reaumurii.
- auteur
- Anas Ayari, Maryline Raimond, Catherine Souty-Grosset, Karima Nasri-Ammar
- article
- Journal of Structural Biology, 2016, 193 (2), pp.115-123. ⟨10.1016/j.jsb.2015.12.005⟩
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-
- titre
- Differential distribution of lipids in epidermis, gastrodermis and hosted Symbiodinium in the sea anemone Anemonia viridis
- auteur
- Johana Revel, Lionel Massi, Mohamed Mehiri, Marc Boutoute, Patrick Mayzaud, Laure Capron, Cecile Sabourault
- article
- Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Molecular and Integrative Physiology, 2016, 191, pp.140-151. ⟨10.1016/j.cbpa.2015.10.017⟩
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-
- titre
- Monitoring of white-clawed crayfish (Austropotamobius pallipes) population during a crayfish plague outbreak followed by rescue
- auteur
- M. Collas, T. Becking, M. Delpy, M. Pflieger, P. Bohn, J. Reynolds, F. Grandjean
- article
- Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 2016, 417, pp.1. ⟨10.1051/kmae/2015037⟩
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-
- titre
- Characterization of glutathione peroxidase diversity in the symbiotic sea anemone Anemonia viridis
- auteur
- Alexis Pey, Thamilla Zamoum, Richard Christen, Pierre-Laurent Merle, Paola Furla
- article
- Biochimie, 2016, 132, pp.94 - 101. ⟨10.1016/j.biochi.2016.10.016⟩
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-
- titre
- Benthic protists: the under-charted majority
- auteur
- Dominik Forster, Micah Dunthorn, Fréderic Mahé, John R. Dolan, Stéphane Audic, David Bass, Lucie Bittner, Christophe Boutte, Richard Christen, Jean-Michel Claverie, Johan Decelle, Bente Edvardsen, Elianne Egge, Wenche Eikrem, Angélique Gobet, Wiebe H.C.F. Kooistra, Ramiro Logares, Ramon Massana, Marina Montresor, Fabrice Not, Hiroyuki Ogata, Jan Pawlowski, Massimo C. Pernice, Sarah Romac, Kamran Shalchian-Tabrizi, Nathalie Simon, Thomas A. Richards, Sébastien Santini, Diana Sarno, Raffaele Siano, Daniel Vaulot, Patrick Wincker, Adriana Zingone, Colomban de Vargas, Thorsten Stoeck
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2016, 92 (8), pp.fiw120. ⟨10.1093/femsec/fiw120⟩
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-
- titre
- Continuous Influx of Genetic Material from Host to Virus Populations.
- auteur
- Clément Gilbert, Jean Peccoud, Aurélien Chateigner, Bouziane Moumen, Richard Cordaux, Elisabeth A Herniou
- article
- PLoS Genetics, 2016, 12 (2), pp.e1005838. ⟨10.1371/journal.pgen.1005838⟩
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- titre
- Birth of a W sex chromosome by horizontal transfer of Wolbachia bacterial symbiont genome
- auteur
- Sébastien Leclercq, Julien Thézé, Mohamed Amine Chebbi, Isabelle Giraud, Bouziane Moumen, Lise Ernenwein, Pierre Grève, Clément Gilbert, Richard Cordaux
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 113 (52), pp.15036-15041. ⟨10.1073/pnas.1608979113⟩
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-
- titre
- Dynamics of Bacterial Community Composition in the Malaria Mosquito's Epithelia
- auteur
- Majoline T. Tchioffo, Anne Boissiere, Luc Abate, Sandrine E. Nsango, Albert N. Bayibeki, Parfait H. Awono-Ambene, Richard Christen, Geoffrey Gimonneau, Isabelle Morlais
- article
- Frontiers in Microbiology, 2016, 6, pp.1500. ⟨10.3389/fmicb.2015.01500⟩
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-
- titre
- Phenotypic variation contrasts with genetic homogeneity across scattered sea snake colonies
- auteur
- Nicolas Bech, Thomas Foucart, Thomas Fauvel, Francois Brischoux, D. Bouchon, Xavier Bonnet
- article
- Journal of Biogeography, 2016, 43, pp.1576-1582. ⟨10.1111/jbi.12735⟩
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-
- titre
- Identification of Atg8 from Acanthamoeba castellanii by genetic complementation in Saccharomyces cerevisiae.
- auteur
- Matthieu Régnacq, Pierre Voisin, Yann Héchard, Thierry Bergès, Christine Braquart-Varnier, Ascel Samba-Louaka
- article
- Molecular and Biochemical Parasitology, 2016, 210 (1-2), pp.55-57. ⟨10.1016/j.molbiopara.2016.08.006⟩
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-
- titre
- Thermal and menthol stress induce different cellular events during sea anemone bleaching
- auteur
- Vincent Dani, Fabrice Priouzeau, Sophie Pagnotta, Diane Carette, Jean-Pierre Laugier, Cécile Sabourault
- article
- Symbiosis, 2016, 69 (3), pp.175 - 192. ⟨10.1007/s13199-016-0406-y⟩
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- General Ecological Aspects of Anthozoan-Symbiodinium Interactions in the Mediterranean Sea
- auteur
- Pilar Casado-Amezúa, Alejandro Terrón-Sigler, Jorge H. Pinzón, Paola Furla, Didier Forcioli, Denis Allemand, Marta Ribes, Rafel Coma
- article
- The Cnidaria, Past, Present and Future, Part V, Springer, pp.375-386, 2016, 978-3-319-31303-0. ⟨10.1007/978-3-319-31305-4_24⟩
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-
2015
Article dans une revue
- titre
- Supergroup C Wolbachia, mutualist symbionts of filarial nematodes, have a distinct genome structure.
- auteur
- Francesco Comandatore, Richard Cordaux, Claudio Bandi, Mark Blaxter, Alistair Darby, Benjamin L Makepeace, Matteo Montagna, Davide Sassera
- article
- Open Biology, 2015, 5 (12), ⟨10.1098/rsob.150099⟩
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-
- titre
- Effect of experimental exposure to differently virulent Aphanomyces astaci strains on the immune response of the noble crayfish Astacus astacus.
- auteur
- Thomas Becking, Agata Mrugała, Carine Delaunay, Jiří Svoboda, Maryline Raimond, Satu Viljamaa-Dirks, Adam Petrusek, Frédéric Grandjean, Christine Braquart-Varnier
- article
- Journal of Invertebrate Pathology, 2015, 132, pp.115-224. ⟨10.1016/j.jip.2015.08.007⟩
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-
- titre
- Large gene overlaps and tRNA processing in the compact mitochondrial genome of the crustacean Armadillidium vulgare.
- auteur
- Vincent Doublet, Elodie Ubrig, Abdelmalek Alioua, Didier Bouchon, Isabelle Marcadé, Laurence Maréchal-Drouard
- article
- RNA Biology, 2015, pp.1-10. ⟨10.1080/15476286.2015.1090078⟩
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-
- titre
- ERK1 and ERK2 present functional redundancy in tetrapods despite higher evolution rate of ERK1
- auteur
- Roser Busca, Richard Christen, Matthew Lovern, Alexander M. Clifford, Jia-Xing Yue, Greg G. Goss, Jacques Pouyssegur, Philippe Lenormand
- article
- BMC Evolutionary Biology, 2015, 15, pp.179. ⟨10.1186/s12862-015-0450-x⟩
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-
- titre
- Immune response and survival of Circulifer haematoceps to Spiroplasma citri infection requires expression of the gene hexamerin.
- auteur
- Rémi Eliautout, Marie-Pierre Dubrana, Carole Vincent-Monégat, Agnès Vallier, Christine Braquart-Varnier, Marylène Poirié, Colette Saillard, Abdelaziz Heddi, Nathalie Arricau-Bouvery
- article
- Developmental and Comparative Immunology, 2015, 54 (1), pp.7-19. ⟨10.1016/j.dci.2015.08.007⟩
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-
- titre
- Multiple Conserved Heteroplasmic Sites in tRNA Genes in the Mitochondrial Genomes of Terrestrial Isopods (Oniscidea).
- auteur
- Christopher H Chandler, Myriam Badawi, Bouziane Moumen, Pierre Grève, Richard Cordaux
- article
- G3, 2015, 5 (7), pp.1317-1322. ⟨10.1534/g3.115.018283⟩
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-
- titre
- Characterisation of 14 polymorphic microsatellite markers for the Transylvanian bush-cricket Pholidoptera transsylvanica (Orthoptera: Tettigoniidae)
- auteur
- Elena Iulia Iorgu, Ionuţ Ştefan Iorgu, Oana Paula Popa, Alexandra Florina Levărdă, Ana-Maria Krapal, Frédéric Grandjean, Luis Ovidiu Popa
- article
- Conservation Genetics Resources, 2015, 7 (2), pp.377-380. ⟨10.1007/s12686-014-0373-7⟩
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-
- titre
- Chloroplast and oxygen evolution changes in Symbiodinium sp as a response to latrunculin and butanedione monoxime treatments under various light conditions
- auteur
- Marco A. Villanueva, Stephanie Barnay-Verdier, Fabrice Priouzeau, Paola Furla
- article
- Photosynthesis Research, 2015, 124 (3), pp.305-313. ⟨10.1007/s11120-015-0142-9⟩
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-
- titre
- Wolbachia in Neotropical terrestrial isopods.
- auteur
- Bianca L Zimmermann, Didier Bouchon, Maurício P Almerão, Paula B Araujo
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2015, 91 (4), pp.1-10. ⟨10.1093/femsec/fiv025⟩
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-
- titre
- Distribution, introduction pathway, and invasion risk analysis of the North American crayfish (Decapoda: Cambaridae) in southeast Brazil
- auteur
- T. Loureiro,, P. Anastacio,, S. Bueno,, P.B. Araujo, C. Souty-Grosset, M.P. Almerao
- article
- Journal of Crustacean Biology, 2015, 35 (1), pp.88-96. ⟨10.1163/1937240X-00002307⟩
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-
- titre
- Shedding light on microbial dark matter: a TM6 bacterium as natural endosymbiont of a free-living amoeba.
- auteur
- Vincent Delafont, Ascel Samba-Louaka, Didier Bouchon, Laurent Moulin, Yann Héchard
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2015, 7 (6), pp.970-8. ⟨10.1111/1758-2229.12343⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The Mutualistic Side of Wolbachia–Isopod Interactions: Wolbachia Mediated Protection Against Pathogenic Intracellular Bacteria
- auteur
- Christine Braquart-Varnier, Mine Altinli, Romain Pigeault, Frédéric D. Chevalier, Pierre Grève, Didier Bouchon, Mathieu Sicard
- article
- Frontiers in Microbiology, 2015, 6, ⟨10.3389/fmicb.2015.01388⟩
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-
- titre
- Multiple drivers of decline in the global status of freshwater crayfish (Decapoda: Astacidea)
- auteur
- N. Richman,, M. Bohm, S. Adams,, F. Alvarez,, E. Bergey,, J. Bunn,, Q. Burnham,, J. Cordeiro,, J. Coughran,, K. Crandall,, K. Dawkins,, R. Distefano,, N. Doran,, L. Edsman, A. Eversole,, L. Fureder,, J. Furse,, F. Gherardi, P. Hamr,, D. Holdich,, P. Horwitz,, K. Johnston,, C. Jones,, J. Jones,, R. Jones,, T. Jones,, Tadashi Kawai, S. Lawler,, M. Lopez-Mejia,, R. Miller,, C. Pedraza-Lara,, J. Reynolds,, A. Richardson,, M. Schultz,, G. Schuster,, P. Sibley,, C. Souty-Grosset, C. Taylor,, R. Thoma,, J. Walls,, T. Walsh,, B. Collen,
- article
- Archives belges de dermatologie et de syphiligraphie, 2015, 370 (1662), pp.20140060. ⟨10.1098/rstb.2014.0060⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Surfactin from Bacillus subtilis displays an unexpected anti-Legionella activity.
- auteur
- Clémence Loiseau, Margot Schlusselhuber, Renaud Bigot, Joanne Bertaux, Jean-Marc Berjeaud, Julien Verdon
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, 2015, 99 (12), pp.5083-93. ⟨10.1007/s00253-014-6317-z⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The first record of translocated white-clawed crayfish from the Austropotamobius pallipes complex in Sardinia (Italy)
- auteur
- J. Amouret,, S. Bertocchi, S. Brusconi, M. Fondi, F. Gherardi, F. Grandjean, A. Chessa, E. Tricarico, C. Souty-Grosset
- article
- Journal of Limnology, 2015, 74 (3), pp.491-500. ⟨10.4081/jlimnol.2015.1143⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How Do Females’ Genetic Characteristics Influence Male Mate Preference in the Terrestrial Isopod Armadillidium vulgare?
- auteur
- Sylvine Durand, Fanny Beauché, Freddie-Jeanne Richard, S. Beltran-Bech
- article
- Ethology - International Journal of Behavioural Biology, 2015, 121 (11), pp.1122-1130. ⟨10.1111/eth.12429⟩
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-
- titre
- The complete mitogenome of the endangered white-clawed freshwater crayfish Austropotamobius pallipes (Lereboullet, 1858) (Crustacea: Decapoda: Astacidae).
- auteur
- Frederic Grandjean, Mun Hua Tan, Huan You Gan, Han Ming Gan, Christopher M Austin
- article
- Mitochondrial DNA Part A, 2015, pp.1-2. ⟨10.3109/19401736.2015.1018207⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Genomic context drives transcription of insertion sequences in the bacterial endosymbiont Wolbachia wVulC.
- auteur
- Nicolas Cerveau, Clément Gilbert, Chao Liu, Roger A Garrett, Pierre Grève, Didier Bouchon, Richard Cordaux
- article
- Gene, 2015, 564, pp.81-86. ⟨10.1016/j.gene.2015.03.044⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Genetic characterisation of new host-specialised biotypes and novel associations with bacterial symbionts in the pea aphid complex
- auteur
- Jean Peccoud, Frédérique Maheo, Manon de La Huerta, Cindy Laurence, Jean-Christophe Simon
- article
- Insect Conservation and Diversity, 2015, 8 (5), pp.484-492. ⟨10.1111/icad.12131⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- MALDI-MS and NanoSIMS imaging techniques to study cnidarian?dinoflagellate symbioses
- auteur
- C. Kopp, M. Wisztorski, J. Revel, M. Mehiri, V. Dani, L. Capron, D. Carette, I. Fournier, L. Massi, D. Mouajjah, S. Pagnotta, F. Priouzeau, M. Salzet, A. Meibom, C. Sabourault
- article
- Zoology, 2015, 118 (2), pp.125 - 131. ⟨10.1016/j.zool.2014.06.006⟩
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-
Poster de conférence
- titre
- Yet another Galaxy Genome viewer
- auteur
- Thomas Alain Darde, François Moreews, Yvan Le Bras, Cyril Monjeaud, Frédéric Chalmel
- article
- GCC, Jul 2015, Norwich, United Kingdom
- Accès au bibtex
-
2014
Article dans une revue
- titre
- Composition of Anopheles coluzzii and Anopheles gambiae microbiota from larval to adult stages
- auteur
- Geoffrey Gimonneau, Majoline T. Tchioffo, Luc Abate, Anne Boissiere, Parfait H. Awono-Ambene, Sandrine E. Nsango, Richard Christen, Isabelle Morlais
- article
- Infection, Genetics and Evolution, 2014, 28, pp.715-724. ⟨10.1016/j.meegid.2014.09.029⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Feminization of the Isopod Cylisticus convexus after Transinfection of the wVulC Wolbachia Strain of Armadillidium vulgare.
- auteur
- Myriam Badawi, Pierre Grève, Richard Cordaux
- article
- PLoS ONE, 2014, 10 (6), pp.e0128660. ⟨10.1371/journal.pone.0128660⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A call for benchmarking transposable element annotation methods.
- auteur
- Douglas R Hoen, Glenn Hickey, Guillaume Bourque, Josep Casacuberta, Richard Cordaux, Cédric Feschotte, Anna-Sophie Fiston-Lavier, Aurélie Hua-Van, Robert Hubley, Aurélie Kapusta, Emmanuelle Lerat, Florian Maumus, David D Pollock, Hadi Quesneville, Arian Smit, Travis J Wheeler, Thomas E Bureau, Mathieu Blanchette
- article
- Mobile DNA, 2014, 6, pp.13. ⟨10.1186/s13100-015-0044-6⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparative paleovirological analysis of crustaceans identifies multiple widespread viral groups.
- auteur
- Gabriel Metegnier, Thomas Becking, Mohamed Amine Chebbi, Isabelle Giraud, Bouziane Moumen, Sarah Schaack, Richard Cordaux, Clément Gilbert
- article
- Mobile DNA, 2014, 6 (179), pp.16. ⟨10.1186/s13100-015-0047-3⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Intra-cellular bacterial infections affect learning and memory capacities of an invertebrate.
- auteur
- Noémie Templé, Freddie-Jeanne Richard
- article
- Frontiers in Zoology, 2014, 12, pp.36. ⟨10.1186/s12983-015-0129-6⟩
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-
- titre
- NEIGHBOUR-IN: Image processing software for spatial analysis of animal grouping.
- auteur
- Yves Caubet, Freddie-Jeanne Richard
- article
- Zookeys, 2014, 515, pp.173-189. ⟨10.3897/zookeys.515.9390⟩
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-
- titre
- Metabolite profiling of pea roots in response to phosphate availability
- auteur
- Jérôme Laparre, Coline Balzergue, Soizic Rochange, Pascal Ludwiczak, Fabien Letisse, Jean Charles Portais, Guillaume Bécard, Virginie Puech Pagès
- article
- Plant Signaling and Behavior, 2014, 6 (6), pp.837-839. ⟨10.4161/psb.6.6.15168⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Salt stress mitigation by seed priming with UV-C in lettuce plants: Growth, antioxidant activity and phenolic compounds
- auteur
- Chayma Ouhibi, Houneida Attia, Fedia Rebah, Najoua Msilini, Mohamed Chebbi, Jawad Aarrouf, Laurent Urban, Mokhtar Lachaâl
- article
- Plant Physiology and Biochemistry, 2014, ⟨10.1016/j.plaphy.2014.07.019⟩
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-
- titre
- Endogenous hepadnaviruses, bornaviruses and circoviruses in snakes.
- auteur
- C Gilbert, J M Meik, D Dashevsky, D C Card, T A Castoe, S Schaack
- article
- Proceedings - Royal society. Biological sciences, 2014, 281 (1791), pp.20141122. ⟨10.1098/rspb.2014.1122⟩
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-
- titre
- Are Niemann-Pick type C proteins key players in cnidarian-dinoflagellate endosymbioses?
- auteur
- Vincent Dani, Philippe Ganot, Fabrice Priouzeau, Paola Furla, Cecile Sabourault
- article
- Molecular Ecology, 2014, 23 (18), pp.4527-4540. ⟨10.1111/mec.12876⟩
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-
- titre
- Ephemeroptera communities as bioindicators of the suitability of headwater streams for restocking with white-clawed crayfish, Austropotamobius pallipes
- auteur
- J. Jandry, M. Brulin, B. Parinet, F. Grandjean
- article
- Ecological Indicators, 2014, 46, pp.560-565. ⟨10.1016/j.ecolind.2014.07.005⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modulation of host immunity and reproduction by horizontally acquired Wolbachia.
- auteur
- Romain Pigeault, Christine Braquart-Varnier, Isabelle Marcadé, Gaëtan Mappa, Elmina Mottin, Mathieu Sicard
- article
- Journal of Insect Physiology, 2014, 70, 10.1016/j.jinsphys.2014.07.005. ⟨10.1016/j.jinsphys.2014.07.005⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Effects of genetic similarity on the life-history strategy of co-infecting trematodes: are parasites capable of intrahost kin recognition?
- auteur
- A Joannes, C Lagrue, R Poulin, S. Beltran-Bech
- article
- International Journal of Evolutionary Biology, 2014, 27 (8), pp.1623-1630. ⟨10.5061/dryad.50tp1⟩
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-
- titre
- Genetic connectivity of the grey partridge in central northern France in a highly man dominated landscape
- auteur
- Nicolas Bech, Stéphanie Manel, Elisabeth Bro, Claude Novoa, Benjamin-Marc Bijaoui-Georget, Sophie Beltran-Bech, Jérôme Boissier
- article
- Conservation Genetics, 2014, 15 (5), pp.1001-1011. ⟨10.1007/s10592-014-0594-z⟩
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-
- titre
- Population genomics supports baculoviruses as vectors of horizontal transfer of insect transposons.
- auteur
- Clément Gilbert, Aurélien Chateigner, Lise Ernenwein, Valérie Barbe, Annie Bézier, Elisabeth A Herniou, Richard Cordaux
- article
- Nature Communications, 2014, 5, pp.3348. ⟨10.1038/ncomms4348⟩
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-
- titre
- Impact of infection on mate choice
- auteur
- Sophie Beltran-Bech, Freddie-Jeanne Richard
- article
- Animal Behaviour, 2014, 90, pp.159-170. ⟨10.1016/j.anbehav.2014.01.026⟩
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-
- titre
- Development of a microsatellite primer set to investigate the genetic population structure of Armadillidium nasatum (Crustacea, Oniscidea).
- auteur
- Séverine Masson, Cédric Faivre, Isabelle Giraud, Catherine Souty-Grosset, Richard Cordaux, Carine Delaunay, Didier Bouchon, Nicolas Bech
- article
- Journal of Genetics, 2014, 93 (2), pp.545-549. ⟨10.1007/s12041-014-0400-1⟩
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-
- titre
- Wolbachia infect ovaries in the course of their maturation: last minute passengers and priority travellers?
- auteur
- Lise Genty, Didier Bouchon, Maryline Raimond, Joanne Bertaux
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (4), pp.e94577. ⟨10.1371/journal.pone.0094577⟩
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-
- titre
- Remarkable diversity of endogenous viruses in a crustacean genome.
- auteur
- Julien Thézé, Sébastien Leclercq, Bouziane Moumen, Richard Cordaux, Clément Gilbert
- article
- Genome Biology and Evolution, 2014, 6 (6), pp.2129-2140. ⟨10.1093/gbe/evu163⟩
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-
- titre
- A host as an ecosystem: Wolbachia coping with environmental constraints.
- auteur
- Mathieu Sicard, Jessica Dittmer, Pierre Grève, Didier Bouchon, Christine Braquart-Varnier
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 2014, pp.10.1111/1462-2920.12573. ⟨10.1111/1462-2920.12573⟩
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-
- titre
- Reduced n‑3 highly unsaturated fatty acids dietary content expected with global change reduces the metabolic capacity of the golden grey mullet
- auteur
- Marie Vagner, Jose-Luis Zambonino-Infante, David Mazurais, Nathalie Imbert‑auvray, Natascha Ouillon, Emmanuel Dubillot, Hervé Le Delliou, David Akbar, Christel Lefrançois
- article
- Marine Biology, 2014, 161 (11), pp.2547-2562. ⟨10.1007/s00227-014-2526-3⟩
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-
- titre
- Genetic control of contagious asexuality in the pea aphid
- auteur
- Julie Jaquiéry, Jean Peccoud, Tiphaine Ouisse, Fabrice Legeai, Nathalie Prunier-Leterme, Anaïs Gouin, Pierre Nouhaud, Jennifer A. Brisson, Ryan Bickel, Swapna Purandare, Julie Poulain, Christophe Battail, Claire Lemaitre, Lucie Mieuzet, Gaël Le Trionnaire, Jean-Christophe Simon, Claude Rispe
- article
- PLoS Genetics, 2014, 10 (12), pp.e1004838. ⟨10.1371/journal.pgen.1004838⟩
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-
- titre
- Host tissues as microhabitats for Wolbachia and quantitative insights into the bacterial community in terrestrial isopods
- auteur
- Jessica Dittmer, S. Beltran-Bech, J Lesobre, M Raimond, M Johnson, D Bouchon
- article
- Molecular Ecology Notes, 2014, 23 (10), pp.2619-2635. ⟨10.1111/mec.12760⟩
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-
- titre
- Putative toxins from the entomopathogenic bacterium Photorhabdus luminescens kill Armadillidium vulgare (Terrestrial isopod)
- auteur
- Mathieu Sicard, Maryline Raimond, Sophie Gaudriault, Anne Lanois, Sylvie Pages, Catherine Debenest, Christine Braquart-Varnier, Alain Givaudan
- article
- Biological Control, 2014, 69, pp.40-44. ⟨10.1016/j.biocontrol.2013.10.011⟩
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-
- titre
- Signs of Neutralization in a Redundant Gene Involved in Homologous Recombination in Wolbachia Endosymbionts
- auteur
- Myriam Badawi, Isabelle Giraud, Fabrice Vavre, Pierre Grève, Richard Cordaux
- article
- Genome Biology and Evolution, 2014, 10 (6), pp.2654-2664. ⟨10.1093/gbe/evu207⟩
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-
- titre
- Horizontal transfer of transposons between and within crustaceans and insects
- auteur
- M. Dupeyron, Sébastien Leclercq, Didier Bouchon, Nicolas Cerveau, Clément Gilbert
- article
- Mobile DNA, 2014, 5 (1), pp.4. ⟨10.1186/1759-8753-5-4⟩
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-
- titre
- Molecular detection and genotyping of Aphanomyces astaci directly from preserved crayfish samples uncovers the Norwegian crayfish plague disease history.
- auteur
- Trude Vrålstad, David A Strand, Frédéric Grandjean, Agnar Kvellestad, Tore Håstein, Ann Kristin Knutsen, Trond Taugbøl, Ida Skaar
- article
- Veterinary Microbiology, 2014, 173 (1-2), pp.66-75. ⟨10.1016/j.vetmic.2014.07.008⟩
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-
- titre
- Microsatellite markers for direct genotyping of the crayfish plague pathogen Aphanomyces astaci (Oomycetes) from infected host tissues.
- auteur
- Frédéric Grandjean, Trude Vrålstad, Javier Diéguez-Uribeondo, Mišel Jelić, Joa Mangombi, Carine Delaunay, Lenka Filipová, Svetlana Rezinciuc, Eva Kozubíková-Balcarová, Daniel Guyonnet, Satu Viljamaa-Dirks, Adam Petrusek
- article
- Veterinary Microbiology, 2014, 3-4, pp.317-324. ⟨10.1016/j.vetmic.2014.02.020⟩
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-
- titre
- The native South American crayfishes (Crustacea, Parastacidae): state of knowledge and conservation status
- auteur
- M. Almerão, E. Rudolph, C. Souty-Grosset, K. Crandall,, L. Buckup,, J. Amouret,, A. Verdi,, P. Araujo,
- article
- Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 2014, pp.n/a-n/a. ⟨10.1002/aqc.2488⟩
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-
- titre
- The crayfish plague pathogen can infect freshwater-inhabiting crabs
- auteur
- Jiří Svoboda, David A. Strand, Trude Vrålstad, F. Grandjean, Lennart Edsman, Pavel Kozák, Antonín Kouba, Rosa F. Fristad, Seval Bahadir Koca, A. Petrusek
- article
- Freshwater Biology, 2014, pp.12315. ⟨10.1111/fwb.12315⟩
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-
- titre
- Bidirectional cytoplasmic incompatibility caused by Wolbachia in the terrestrial isopod Porcellio dilatatus.
- auteur
- Mathieu Sicard, Didier Bouchon, Laura Ceyrac, Roland Raimond, Magali Thierry, Winka Le Clec'H, Isabelle Marcadé, Yves Caubet, Pierre Grève
- article
- Journal of Invertebrate Pathology, 2014, 121, pp.28-36. ⟨10.1016/j.jip.2014.06.007⟩
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-
Communication dans un congrès
- titre
- Amateur observations with one meter professional telescope at Pic du Midi
- auteur
- Marc Delcroix, François Colas, Jean-Luc Dauvergne, Jean Lecacheux, Frédéric Vachier, C. Pellier
- article
- European Planetary Science Congress 2014, Sep 2014, Cascais, Portugal
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-
- titre
- 2013 bright spot on Neptune
- auteur
- Marc Delcroix, François Colas, P. Gorczynski
- article
- European Planetary Science Congress 2014, Sep 2014, Cascais, Portugal
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- A Mathematical Model for Growing Metastases on Oncologists’s Service
- auteur
- Dominique Barbolosi, Assia Benabdallah, Sébastien Benzekry, Joseph Ciccolini, Christian Faivre, Florence Hubert, Federico Verga, Benoit You
- article
- Computational Surgery and Dual Training, Springer, pp.331 - 338, 2014, ⟨10.1007/978-1-4614-8648-0_21⟩
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-
2013
Article dans une revue
- titre
- Modulation of Malaria Infection in Anopheles gambiae Mosquitoes Exposed to Natural Midgut Bacteria
- auteur
- Majoline T. Tchioffo, Anne Boissiere, Thomas S. Churcher, Luc Abate, Geoffrey Gimonneau, Sandrine E. Nsango, Parfait H. Awono-Ambene, Richard Christen, Antoine Berry, Isabelle Morlais
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (12), pp.e81663. ⟨10.1371/journal.pone.0081663⟩
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-
- titre
- Anemonia viridis primary cell culture: a new tool for cnidarian studies
- auteur
- Stephanie Barnay-Verdier, Diane Dall'Osso, Nathalie Joli, Juliette Olivre, Fabrice Priouzeau, Thamilla Zamoum, Pierre-Laurent Merle, Paola Furla
- article
- Cytotechnology, 2013, 65 (5), pp.686
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-
- titre
- Establishment of primary cell culture from the temperate symbiotic cnidarian, Anemonia viridis
- auteur
- Stephanie Barnay-Verdier, Diane Dall'Osso, Nathalie Joli, Juliette Olivre, Fabrice Priouzeau, Thamilla Zamoum, Pierre-Laurent Merle, Paola Furla
- article
- Cytotechnology, 2013, 65 (5), pp.697-704. ⟨10.1007/s10616-013-9566-2⟩
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-
- titre
- Exploration of Deinococcus-Thermus molecular diversity by novel group-specific PCR primers
- auteur
- Nicolas Theodorakopoulos, Dipankar Bachar, Richard Christen, Karine Alain, Virginie Chapon
- article
- MicrobiologyOpen, 2013, 2 (5), pp.862-872. ⟨10.1002/mbo3.119⟩
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-
- titre
- Prevalence of the Crayfish Plague Pathogen Aphanomyces astaci in Populations of the Signal Crayfish Pacifastacus leniusculus in France: Evaluating the Threat to Native Crayfish
- auteur
- Lenka Filipová, Adam Petrusek, Klára Matasová, Carine Delaunay, Frédéric Grandjean
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (7), pp.e70157. ⟨10.1371/journal.pone.0070157⟩
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-
- titre
- Thermal threshold and sensitivity of the only symbiotic Mediterranean gorgonian Eunicella singularis by morphometric and genotypic analyses
- auteur
- Alexis Pey, Jerome Cataneo, Didier Forcioli, Pierre-Laurent Merle, Paola Furla
- article
- Comptes Rendus Biologies, 2013, 336 (7), pp.331-341. ⟨10.1016/j.crvi.2013.06.008⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The Response of the Mediterranean Gorgonian Eunicella singularis to Thermal Stress Is Independent of Its Nutritional Regime
- auteur
- Leila Ezzat, Pierre-Laurent Merle, Paola Furla, Alexandre Buttler, Christine Ferrier-Pages
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (5), pp.e64370. ⟨10.1371/journal.pone.0064370⟩
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-
- titre
- DsRed-mediated oligomerization stabilizes HMGB1 on chromatin in vivo and on DNA in vitro
- auteur
- Melanie Messmer, Christophe Klein, Rachel Boniface, Nina F. Gnaedig, Maxime Lecerf, Stephanie Barnay-Verdier, Vincent Marechal
- article
- Biochimie, 2013, 95 (4), pp.962-966. ⟨10.1016/j.biochi.2012.11.001⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Do parasites adopt different strategies in different intermediate hosts? Host size, not host species, influences Coitocaecum parvum (Trematoda) life history strategy, size and egg production.
- auteur
- R Ruiz Daniels, S. Beltran, R. Poulin, C. Lagrue
- article
- Parasitology, 2013, pp.275-283. ⟨10.1017/S0031182012001564⟩
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-
- titre
- Horizontal transfer and evolution of prokaryote transposable elements in eukaryotes.
- auteur
- Clément Gilbert, Richard Cordaux
- article
- Genome Biology and Evolution, 2013, 5 (5), pp.822-832. ⟨10.1093/gbe/evt057⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Isolation and characterization of microsatellite loci from Iguana delicatissima (Reptilia: Iguanidae), new perspectives for investigation of hybridization events with Iguana iguana
- auteur
- V. Valette, L. Filipova, B. Vuillaume, C. Cherbonnel, Ange Marie Risterucci, C. Delaunay, M. Breuil, F. Grandjean
- article
- Conservation Genetics Resources, 2013, 5 (1), pp.173-175. ⟨10.1007/s12686-012-9761-z⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Ecological Roles of Crayfish in Freshwater and Terrestrial Habitats
- auteur
- J. Reynolds, Catherine Souty-Grosset, A. Richardson
- article
- Freshwater Crayfish, 2013, 9 (2), pp.197-218
- Accès au bibtex
-
- titre
- Climate warming and the agonistic behaviour of invasive crayfishes in Europe
- auteur
- F. Gherardi, A. Coignet, C. Souty-Grosset, D. Spigoli, L. Aquiloni
- article
- Freshwater Biology, 2013, 58 (9), pp.1958-1967. ⟨10.1111/fwb.12183⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The complete mitogenome of the invasive spiny-cheek crayfish Orconectes limosus (Rafinesque, 1817) (Crustacea: Decapoda: Cambaridae)
- auteur
- Han Ming Gan, Huan You Gan, Yin Peng Lee, Frederic Grandjean, Christopher Austin
- article
- Mitochondrial DNA Part A, 2013, 24 (1), pp.6-7. ⟨10.3109/19401736.2015.1007326⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Microbacterium lemovicicum sp. nov., a bacterium isolated from a natural uranium-rich soil.
- auteur
- Laure Mondani, Laurie Piette, Richard Christen, Dipankar Bachar, C. Berthomieu, Virginie Chapon
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63, pp.2600-2606. ⟨10.1099/ijs.0.048454-0⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Oxidative stress in the root nodules of Phaseolus vulgaris is induced under conditions of phosphorus deficiency
- auteur
- Adnane Bargaz, Mustapha Faghire, Mohamed Farissi, Jean-Jacques Drevon, Cherki Ghoulam
- article
- Acta Physiologiae Plantarum, 2013, 35 (5), pp.1633 - 1644. ⟨10.1007/s11738-012-1206-5⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Updating the Vibrio clades defined by multilocus sequence phylogeny: proposal of eight new clades, and the description of Vibrio tritonius sp. nov.
- auteur
- Tomoo Sawabe, Yoshitoshi Ogura, Yuta Matsumura, Gao Feng, Akm Rohul Amin, Sayaka Mino, Satoshi Nakagawa, Toko Sawabe, Ramesh Kumar, Yohei Fukui, Masataka Satomi, Ryoji Matsushima, Fabiano L. Thompson, Bruno Gomez-Gil, Richard Christen, Fumito Maruyama, Ken Kurokawa, Tetsuya Hayashi
- article
- Frontiers in Microbiology, 2013, 4, pp.414. ⟨10.3389/fmicb.2013.00414⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Isolation and Characterization of Microsatellite Loci for the Isopod Crustacean Armadillidium vulgare and Transferability in Terrestrial Isopods.
- auteur
- Isabelle Giraud, Victorien Valette, Nicolas Bech, Frédéric Grandjean, Richard Cordaux
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (10), pp.e76639. ⟨10.1371/journal.pone.0076639⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Functional endogenous viral elements in the genome of the parasitoid wasp Cotesia congregata: insights into the evolutionary dynamics of bracoviruses
- auteur
- Annie Bézier, Faustine Louis, Séverine Jancek, Georges Périquet, Julien Thézé, Gabor Gyapay, Karine Musset, Jérôme Lesobre, P. Lenoble, Catherine Dupuy, Dawn Gundersen-Rindal, Elisabeth A. Herniou, Jean-Michel Drezen
- article
- Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences (1934–1990), 2013, 368 (1626), pp.20130047. ⟨10.1098/rstb.2013.0047⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Transcriptome de novo assembly from next-generation sequencing and comparative analyses in the hexaploid salt marsh species Spartina maritima and Spartina alterniflora (Poaceae)
- auteur
- Julie Ferreira de Carvalho, Julie Poulain, Corinne da Silva, Patrick Wincker, Sophie Michon-Coudouel, Alexandra Dheilly, Delphine Naquin, Julien Boutte, Armel Salmon, Malika L. Aïnouche
- article
- Heredity, 2013, 110 (2), pp.181-193. ⟨10.1038/hdy.2012.76⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species
- auteur
- Keith Bradnam, Joseph Fass, Anton Alexandrov, Paul Baranay, Michael Bechner, Inanç Birol, Sébastien Boisvert, Jarrod Chapman, Guillaume Chapuis, Rayan Chikhi, Hamidreza Chitsaz, Wen-Chi Chou, Jacques Corbeil, Cristian del Fabbro, T Roderick Docking, Richard Durbin, Dent Earl, Scott Emrich, Pavel Fedotov, Nuno Fonseca, Ganeshkumar Ganapathy, Richard Gibbs, Sante Gnerre, Élénie Godzaridis, Steve Goldstein, Matthias Haimel, Giles Hall, David Haussler, Joseph Hiatt, Isaac Ho, Jason Howard, Martin Hunt, Shaun Jackman, David Jaffe, Erich Jarvis, Huaiyang Jiang, Sergey Kazakov, Paul Kersey, Jacob Kitzman, James Knight, Sergey Koren, Tak-Wah Lam, Dominique Lavenier, François Laviolette, Yingrui Li, Zhenyu Li, Binghang Liu, Yue Liu, Ruibang Luo, Iain Maccallum, Matthew Macmanes, Nicolas Maillet, Sergey Melnikov, Delphine Naquin, Zemin Ning, Thomas Otto, Benedict Paten, Octávio Paulo, Adam Phillippy, Francisco Pina-Martins, Michael Place, Dariusz Przybylski, Xiang Qin, Carson Qu, Filipe Ribeiro, Stephen Richards, Daniel Rokhsar, J Graham Ruby, Simone Scalabrin, Michael Schatz, David Schwartz, Alexey Sergushichev, Ted Sharpe, Timothy Shaw, Jay Shendure, Yujian Shi, Jared Simpson, Henry Song, Fedor Tsarev, Francesco Vezzi, Riccardo Vicedomini, Bruno Vieira, Jun Wang, Kim Worley, Shuangye Yin, Siu-Ming Yiu, Jianying Yuan, Guojie Zhang, Hao Zhang, Shiguo Zhou, Ian Korf
- article
- GigaScience, 2013, 2 (1), pp.10. ⟨10.1186/2047-217X-2-10⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cannibalism and Predation as Paths for Horizontal Passage of Wolbachia between Terrestrial Isopods
- auteur
- Winka Le Clec'H, Frédéric Chevalier, Lise Genty, Joanne Bertaux, Didier Bouchon, Mathieu Sicard
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (4), pp.e60232. ⟨10.1371/journal.pone.0060232⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Best Timing of Mate Search in Armadillidium vulgare (Isopoda, Oniscidea)
- auteur
- Fanny Beauche, Freddie-Jeanne Richard
- article
- PLoS ONE, 2013, pp.e57737. ⟨10.1371/journal.pone.0057737⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Copper tolerance and genetic diversity of Porcellionides sexfasciatus (ISOPODA) in a highly contaminated mine habitat
- auteur
- D. Costa, Didier Bouchon, Nico M van Straalen, José Paulo Sousa, Rui Ribeiro
- article
- Environmental toxicology and chemistry / SETAC, 2013, 32 (4), pp.884-888. ⟨10.1002/etc.2120⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Genotypic variation of nodules' enzymatic activities in symbiotic nitrogen fixation among common bean (Phaseolus vulgaris L.) genotypes grown under salinity constraint
- auteur
- Mustapha Faghire, Farissi Mohamed, Khadijattou Taoufiq, Rachid Fghire, Adnane Bargaz, Btissam Mandri, Khalid Oufdou, Laurie Amenc, Jean-Jacques Drevon, Cherki Ghoulam
- article
- Symbiosis, 2013, 60 (3), pp.115 - 122. ⟨10.1007/s13199-013-0247-x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Differential expression of trehalose 6-P phosphatase and ascorbate peroxidase transcripts in nodule cortex of Phaseolus vulgaris and regulation of nodule O-2 permeability
- auteur
- Adnane Bargaz, Mohamed Lazali, Laurie Amenc, Josiane Abadie, Cherki Ghoulam, Mohamed Farissi, Mustapha Faghire, Jean-Jacques Drevon
- article
- Planta, 2013, 238 (1), pp.107 - 119. ⟨10.1007/s00425-013-1877-1⟩
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-
Communication dans un congrès
- titre
- Towards a Life Sciences Virtual Research Environment
- auteur
- Yvan Le Bras, Aurélien Roult, Cyril Monjoeaud, Bahin Mathieu, Olivier Quenez, Heriveau Claudia, Anthony Bretaudeau, Olivier Sallou, Olivier Collin
- article
- JOBIM 2013 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2013, Toulouse, France
- Accès au bibtex
-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Interactions et rétroactions : rôle de leur écologie et de leur évolution dans le fonctionnement des écosystèmes.
- auteur
- J. Roy, D. Bouchon, D. Corenblit, Thierry Dutoit, F. Lallier, N. Niquil, F. Vavre
- article
- Prospectives de l’Institut Ecologie et Environnement du CNRS, 2013
- Accès au bibtex
-
Autre publication scientifique
- titre
- LC3B Labeling on Terrestrial Isopod Adipocytes
- auteur
- Christine Braquart-Varnier, Maryline Raimond, Mathieu Sicard
- article
- 2013
- Accès au bibtex
-
2012
Article dans une revue
- titre
- Targeted genome enrichment for efficient purification of endosymbiont DNA from host DNA.
- auteur
- Sandrine Geniez, Jeremy M Foster, Sanjay Kumar, Bouziane Moumen, Emily Leproust, Owen Hardy, Moraima Guadalupe, Stephen J Thomas, Braden Boone, Cynthia Hendrickson, Didier Bouchon, Pierre Grève, Barton E Slatko
- article
- Symbiosis, 2012, 58 (1-3), pp.201-207. ⟨10.1007/s13199-012-0215-x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Significant and persistent impact of timber harvesting on soil microbial communities in Northern coniferous forests
- auteur
- Martin Hartmann, Charles G. Howes, David Vaninsberghe, Hang Yu, Dipankar Bachar, Richard Christen, Rolf Henrik Nilsson, Steven J. Hallam, William W. Mohn
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2012, 6 (12), pp.2199-2218. ⟨10.1038/ismej.2012.84⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Symbiodinium isolation by NaOH treatment
- auteur
- Thamilla Zamoum, Paola Furla
- article
- Journal of Experimental Biology, 2012, 215 (22), pp.3875-3880. ⟨10.1242/jeb.074955⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Patho-Genes.org: a website dedicated to gene sequences of potential bioterror bacteria and PCR primers used to amplify them
- auteur
- Julien Gardes, Dipankar Bachar, Olivier Croce, Richard Christen
- article
- Microbial Biotechnology, 2012, 5 (5, SI), pp.594-598. ⟨10.1111/j.1751-7915.2012.00353.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- In Silico Analyses of Primers Used to Detect the Pathogenicity Genes of Vibrio cholerae
- auteur
- Julien Gardes, Olivier Croce, Richard Christen
- article
- Microbes and environments / JSME, 2012, 27 (3), pp.250-256. ⟨10.1264/jsme2.ME11317⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- High virulence of Wolbachia after host switching: when autophagy hurts.
- auteur
- Winka Le Clec'H, Christine Braquart-Varnier, Maryline Raimond, Jean-Baptiste Ferdy, Didier Bouchon, Mathieu Sicard
- article
- PLoS Pathogens, 2012, 8 (8), pp.e1002844. ⟨10.1371/journal.ppat.1002844⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Seqcrawler: biological data indexing and browsing platform.
- auteur
- Olivier Sallou, Anthony Bretaudeau, Aurelien Roult
- article
- BMC Bioinformatics, 2012, 13 (1), pp.175. ⟨10.1186/1471-2105-13-175⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bird mortality related to collisions with ski-lift cables: do we estimate just the tip of the iceberg?
- auteur
- Nicolas Bech, Sophie Beltran, Jérôme Boissier, Jean-François Allienne, J. Resseguier, Claude Novoa
- article
- Animal Biodiversity and Conservation, 2012, 35 (1), pp.95-98
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Influence of Changing Plant Food Sources on the Gut Microbiota of Saltmarsh Detritivores
- auteur
- Jessica Dittmer, Jérôme Lesobre, Roland Raimond, Didier Bouchon, Martin Zimmer
- article
- Microbial ecology, 2012, 64, pp.814 - 825. ⟨10.1007/s00248-012-0056-4⟩
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-
- titre
- Midgut Microbiota of the Malaria Mosquito Vector Anopheles gambiae and Interactions with Plasmodium falciparum Infection
- auteur
- Anne Boissiere, Majoline T. Tchioffo, Dipankar Bachar, Luc Abate, Alexandra Marie, Sandrine E. Nsango, Hamid R. Shahbazkia, Parfait H. Awono-Ambene, Elena A. Levashina, Richard Christen, Isabelle Morlais
- article
- PLoS Pathogens, 2012, 8 (5), pp.e1002742. ⟨10.1371/journal.ppat.1002742⟩
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-
- titre
- The transcriptomic response to thermal stress is immediate, transient and potentiated by ultraviolet radiation in the sea anemone Anemonia viridis
- auteur
- A. Moya, P. Ganot, P. Furla, C. Sabourault
- article
- Molecular Ecology, 2012, 21 (5), pp.1158-1174. ⟨10.1111/j.1365-294X.2012.05458.x⟩
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-
- titre
- Widespread atypical mitochondrial DNA structure in isopods (Crustacea, Peracarida) related to a constitutive heteroplasmy in terrestrial species.
- auteur
- Vincent Doublet, Roland Raimond, Frédéric Grandjean, Alexandra Lafitte, Catherine Souty-Grosset, Isabelle Marcadé
- article
- Genome, 2012, 55 (3), pp.234-44. ⟨10.1139/g2012-008⟩
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-
- titre
- Effects of parasitic sex-ratio distorters on host genetic structure in the Armadillidium vulgare-Wolbachia association
- auteur
- S. Verne, M. Johnson, D. Bouchon, F. Grandjean
- article
- Journal of Evolutionary Biology, 2012, 25 (2), pp.264-76. ⟨10.1111/j.1420-9101.2011.02413.x⟩
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-
- titre
- Searching for Smallest Grammars on Large Sequences and Application to DNA
- auteur
- Rafael Carrascosa, François Coste, Matthias Gallé, Gabriel Infante-Lopez
- article
- Journal of Discrete Algorithms, 2012, Special issue on Stringology, Bioinformatics and Algorithms, 11, pp.62-72. ⟨10.1016/j.jda.2011.04.006⟩
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-
- titre
- The relationship between Ephemeroptera and presence of the white-clawed crayfish (Austropotamobius pallipes). Case study in the Poitou-Charentes region (France)
- auteur
- M.C. Trouilhe, G. Freyssinel, J. Jandry, M. Brulin, B. Parinet, C. Souty-Grosset, F. Grandjean
- article
- Fundamental and Applied Limnology, 2012, 179 (4), pp.293-303. ⟨10.1127/1863-9135/2012/0028⟩
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-
- titre
- Feminizing Wolbachia: a transcriptomics approach with insights on the immune response genes in Armadillidium vulgare
- auteur
- Frédéric Chevalier, Juline Herbinière-Gaboreau, Delphine Charif, Guillaume Mitta, Frédérick F. Gavory, Patrick Wincker, Pierre Grève, Christine Braquart-Varnier, Didier Bouchon
- article
- BMC Microbiology, 2012, 12 (suppl), pp.S1. ⟨10.1186/1471-2180-12-S1-S1⟩
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-
- titre
- Molecular biomass and MetaTaxogenomic assessment of soil microbial communities as influenced by soil DNA extraction procedure
- auteur
- Sebastien Terrat, Richard Christen, Samuel S. Dequiedt, Mélanie M. Lelievre, Virginie Nowak, Tiffanie Regnier, Dipankar Bachar, Pierre Plassart, Patrick Wincker, Claudy C. Jolivet, Antonio Bispo, Philippe P. Lemanceau, Pierre-Alain Maron, Christophe Mougel, Lionel Ranjard
- article
- Microbial Biotechnology, 2012, 5 (1), pp.135-141. ⟨10.1111/j.1751-7915.2011.00307.x⟩
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-
- titre
- MRI image artifact ontology: A Proposed Method for Improved Recognition.
- auteur
- Jeremy Lasbleiz, John Morelli, Nicolas Schnel, Anita Burgun, Régis Duvauferrier, Hervé Saint-Jalmes
- article
- Studies in Health Technology and Informatics, 2012, 180, pp.103-7. ⟨10.3233/978-1-61499-101-4-103⟩
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-
- titre
- Effects of immunostimulation on social behavior, chemical communication and genome-wide gene expression in honey bee workers (Apis mellifera)
- auteur
- Freddie-Jeanne Richard, Holly Holt, Christina M Grozinger
- article
- BMC Genomics, 2012, 13 (1), pp.558. ⟨10.1186/1471-2164-13-558⟩
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-
- titre
- DETECTION OF WOLBACHIA (ALPHAPROTEOBACTERIA: RICKETTSIALES) IN THREE SPECIES OF TERRESTRIAL ISOPODS (CRUSTACEA: ISOPODA: ONISCIDEA) IN BRAZIL
- auteur
- B.L. Zimmermann, M.P. Almerao, D. Bouchon, P.B. Araujo
- article
- Brazilian Journal of Microbiology, 2012, 43 (2), pp.711-715. ⟨10.1590/S1517-83822012000200036⟩
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-
- titre
- Analysis of gene expression from the Wolbachia genome of a filarial nematode supports both metabolic and defensive roles within the symbiosis
- auteur
- A.C. Darby, S.D. Amstrong, G.S. Bah, G. Kaur, M.A. Hughes, S.M. Kay, P. Koldkjaer, L. Rainbow, A.D. Radford, M.L. Blaxter, V.N. Tanya, A.J. Trees, R. Cordaux, J.M. Wastling, B.L. Makepeace
- article
- Genome Research, 2012, 22 (12), pp.2467-2477. ⟨10.1101/gr.138420.112⟩
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-
- titre
- Estimating population size of the red swamp crayfish (Procambarus clarkii) in fish-ponds (Brenne, Central France)
- auteur
- A. Coignet, F. Pinet, Catherine Souty-Grosset
- article
- Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 2012, 406, pp.2-2. ⟨10.1051/kmae/2012019⟩
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-
- titre
- PHYMYCO-DB: A Curated Database for Analyses of Fungal Diversity and Evolution
- auteur
- Stéphane Mahé, Marie Duhamel, Thomas Le Calvez, Laëtitia Guillot, Ludmila Sarbu, Anthony Bretaudeau, Olivier Collin, Alexis Dufresne, E. Toby Kiers, Philippe Vandenkoornhuyse
- article
- PLoS ONE, 2012, 7 (9), pp.e43117. ⟨10.1371/journal.pone.0043117⟩
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-
- titre
- Fluctuating asymmetry analysis on Porcellio scaber (Crustacea, Isopoda) populations living under metals-contaminated woody habitats
- auteur
- J.P. Godet, S. Demuynck, C. Waterlot, S. Lemiere, Catherine Souty-Grosset, F. Douay, A. Lepretre, C. Pruvot
- article
- Ecological Indicators, 2012, 23, pp.130-139. ⟨10.1016/j.ecolind.2012.03.018⟩
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-
- titre
- Endogenous viruses: insights into viral evolution and impact on host biology
- auteur
- C. Feschotte, C. Gilbert
- article
- Nature Reviews Genetics, 2012, 13 (4), pp.283-296. ⟨10.1038/nrg3199⟩
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-
- titre
- Widespread Wolbachia infection in terrestrial isopods and other crustaceans.
- auteur
- Richard Cordaux, Samuel Pichon, Houda Ben Afia Hatira, Vincent Doublet, Pierre Grève, Isabelle Marcadé, Christine Braquart-Varnier, Catherine Souty-Grosset, Faouzia Charfi-Cheikhrouha, Didier Bouchon
- article
- Zookeys, 2012, 176, pp.123-31. ⟨10.3897/zookeys.176.2284⟩
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-
- titre
- A phosphoenol pyruvate phosphatase transcript is induced in the root nodule cortex of Phaseolus vulgaris under conditions of phosphorus deficiency
- auteur
- Adnane Bargaz, Cherki Ghoulam, Laurie Amenc, Mohamed Lazali, M. Faghire, Josiane Abadie, Jean-Jacques Drevon
- article
- Journal of Experimental Botany, 2012, 63 (13), pp.4723 - 4730. ⟨10.1093/jxb/ers151⟩
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-
- titre
- Accelerated evolution of sex chromosomes in aphids, an X0 system.
- auteur
- Julie Jaquiéry, Solenn Stoeckel, Claude Rispe, Lucie Mieuzet, Fabrice Legeai, Jean-Christophe Simon
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2012, 29 (2), epub ahead of print. ⟨10.1093/molbev/msr252⟩
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-
- titre
- Cargo capacity of phages and plasmids and other factors influencing horizontal transfers of prokaryote transposable elements
- auteur
- Sébastien Leclercq, Clément Gilbert, Richard Cordaux
- article
- Mobile Genetic Elements, 2012, 2 (2), pp.115-118. ⟨10.4161/mge.20352⟩
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-
- titre
- A preliminary study of terrestrial is opod diversit y in coastal wetlands of Tunisia
- auteur
- H. Khemaissia, M. Touihri, R. Jelassi, C. Souty-Grosset, K. Nasri-Ammar
- article
- Vie et Milieu / Life & Environment, 2012, 62 (4), pp.203-211
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-
- titre
- Selection-Driven Extinction Dynamics for Group II Introns in Enterobacteriales
- auteur
- Sébastien Leclercq, Richard Cordaux
- article
- PLoS ONE, 2012, 7 (12), pp.e52268
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-
Communication dans un congrès
- titre
- Hadoopizer : a cloud environment for bio-informatics data analysis
- auteur
- Anthony Bretaudeau, Olivier Sallou, Olivier Collin
- article
- journées scientifiques mésocentres et France Grilles 2012, Oct 2012, Paris, France
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-
- titre
- Local Substitutability for Sequence Generalization
- auteur
- François Coste, Gaelle Garet, Jacques Nicolas
- article
- ICGI 2012, University of Maryland, Sep 2012, Washington, United States. pp.97-111
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-
- titre
- Modeling cell signaling pathways with discrete dynamical systems : Application to the Transforming Growth Factor β (TGFβ) dependent Epithelial-Mesenchymal Transition
- auteur
- Geoffroy Andrieux, Michel Le Borgne, Nathalie Theret
- article
- ISMB 2012, Jul 2012, Long Beach, United States
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-
- titre
- Using Mutual Information and Answer Set Programming to refine PWM based transcription regulation network
- auteur
- Andres Aravena, Carito Guziolowski, Anne Siegel, Alejandro Maass
- article
- Jobim 2012, Jul 2012, Rennes, France. pp.171
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-
- titre
- Modeling cell signaling pathways with discrete dynamical systems : Application to Transforming Growth Factor β (TGFβ) signaling
- auteur
- Geoffroy Andrieux, Michel Le Borgne, Nathalie Theret
- article
- Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Jul 2012, Rennes, France
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-
- titre
- Evolution and control of host-microbe symbiosis in arthropods: an RNAseq-based transcriptomic analysis
- auteur
- Yves Moné, F. Chevalier, M.C. Carpentier, N. Kremer, Patrick Mavingui, V. Raquin, Abdelaziz Heddi, Carole Vincent-Monégat, Christine Braquart-Varnier, P. Greve, D. Bouchon, F. Vavre
- article
- 7. International Wolbachia conference, Jun 2012, St Pierre d'Oléron, France
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-
- titre
- Systems biology approaches at cellular level in the model organism Ectocarpus siliculosus to better understand brown algal physiology
- auteur
- Thierry Tonon, Patricia Bonin, Sylvain Prigent, Z. Shao, Agnès Groisillier, Sylvie Rousvoal, Sophie Goulitquer, Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Catherine Boyen, Anne Siegel
- article
- Esil 2012: algal post-genomics, Apr 2012, Roscoff, France
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Chapelle-lez-Herlaimont: inteligencia territorial, cohesión social y bien¬estar (Bélgica)
- auteur
- Jean-Jacques Girardot, Laurence Meire, Eric Bernard
- article
- Intelligentia Territorial : teoría, métodos e iniciativas en Europa y América Latina, 250-259p, 2012, 978-987-595-158-7
- Accès au bibtex
-
- titre
- Design of PCR primers for the detection of waterborne bacteria
- auteur
- Julien Gardes, Richard Christen
- article
- DETECTION OF PATHOGENS IN WATER USING MICRO AND NANO-TECHNOLOGY, IWA PUBLISHING, pp.237-254, 2012, 978-1-78040-108-9
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-
Poster de conférence
- titre
- Dr Motifs: a web resource for pattern matching and discovery
- auteur
- Anthony Bretaudeau, Olivier Collin
- article
- JOBIM 2012, Jul 2012, Rennes, France
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-
Thèse
- titre
- Régulation de la symbiose endomycorhizienne par le phosphate
- auteur
- Coline Balzergue
- article
- Biologie végétale. Université Paul Sabatier - Toulouse III, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
2011
Article dans une revue
- titre
- Toward systems biology in brown algae to explore acclimation and adaptation to the shore environment.
- auteur
- Thierry Tonon, Damien Eveillard, Sylvain Prigent, Jérémie Bourdon, Philippe Potin, Catherine Boyen, Anne Siegel
- article
- OMICS, 2011, 15 (12), pp.883-892. ⟨10.1089/omi.2011.0089⟩
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-
- titre
- Do phages efficiently shuttle transposable elements among prokaryotes?
- auteur
- Sébastien Leclercq, Richard Cordaux
- article
- Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2011, 65 (11), pp.3327-3331. ⟨10.1111/j.1558-5646.2011.01395.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The Smallest Grammar Problem as Constituents Choice and Minimal Grammar Parsing
- auteur
- Rafael Carrascosa, François Coste, Matthias Gallé, Gabriel Infante-Lopez
- article
- Algorithms, 2011, 4, pp.262-284. ⟨10.3390/a4040262⟩
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-
- titre
- BioMart Central Portal: an open database network for the biological community
- auteur
- Jonathan M. Guberman, J. Ai, O. Arnaiz, Baran Joachim, Andrew Blake, Richard Baldock, Claude Chelala, David Croft, Anthony Cros, Rosalind J. Cutts, A. Di Génova, Simon Forbes, T. Fujisawa, E. Gadaleta, M. Goodstein D., Gunes Gundem, Bernard Haggarty, Syed Haider, Matthew D. Hall, Todd Harris, Robin Haw, S. Hu, Simon Hubbard, Jack Hsu, Vivek Iyer, Philip Jones, Toshiaki Katayama, R. Kinsella, Lei Kong, Daniel Lawson, Yong Liang, Núria López-Bigas, J. Luo, Michael Lush, Jeremy Mason, François Moreews, Nelson Ndegwa, Darren Oakley, Christian Perez-Llamas, Michael Primig, Elena Rivkin, S. Rosanoff, Rebecca Shepherd, Reinhard Simon, B. Skarnes, Damian Smedley, Linda Sperling, William Spooner, Peter Stevenson, Kevin Stone, J. Teague, Jun Wang, Jianxin Wang, Brett Whitty, T. Wong D., Marie Wong-Erasmus, L. Yao, Ken Youens-Clark, Christina Yung, Junjun Zhang, Arek Kasprzyk
- article
- Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2011, pp.bar041. ⟨10.1093/database/bar041⟩
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-
- titre
- Assemblathon 1: A competitive assessment of de novo short read assembly methods
- auteur
- Dent A. Earl, Keith Bradnam, John St. John, Aaron Darling, Dawei Lin, Joseph Faas, Hung On Ken Yu, Buffalo Vince, Daniel R. Zerbino, Mark Diekhans, Ngan Nguyen, Pramila Nuwantha, Ariyaratne Wing-Kin Sung, Zemin Ning, Matthias Haimel, Jared T. Simpson, Nuno A. Fronseca, Inanç Birol, T. Roderick Docking, Isaac Y. Ho, Daniel S Rokhsar, Rayan Chikhi, Dominique Lavenier, Guillaume Chapuis, Delphine Naquin, Nicolas Maillet, Michael C. Schatz, David R. Kelly, Adam M. Phillippy, Sergey Koren, Shiaw-Pyng Yang, Wei Wu, Wen-Chi Chou, Anuj Srivastava, Timothy I. Shaw, J. Graham Ruby, Peter Skewes-Cox, Miguel Betegon, Michelle T. Dimon, Victor Solovyev, Petr Kosarev, Denis Vorobyev, Ricardo Ramirez-Gonzalez, Richard Leggett, Dan Maclean, Fangfang Xia, Ruibang Luo, Zhenyu Li, Yinlong Xie, Binghang Liu, Sante Gnerre, Iain Maccallum, Dariusz Przybylski, Filipe J. Ribeiro, Shuangye Yin, Ted Sharpe, Giles Hall, Paul J. Kersey, Richard Durbin, Shaun D. Jackman, Jarrod A. Chapman, Xiaoqiu Huang, Joseph L. Derisi, Mario Caccamo, Yingrui Li, David B. Jaffe, Richard M. Green, David Haussler, Ian Korf, Benedict Paten
- article
- Genome Research, 2011, ⟨10.1101/gr.126599.111⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Integrating quantitative knowledge into a qualitative gene regulatory network.
- auteur
- Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Anne Siegel
- article
- PLoS Computational Biology, 2011, 7 (9), pp.e1002157. ⟨10.1371/journal.pcbi.1002157⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Effects of instrumental insemination and insemination quantity on Dufour's gland chemical profiles and vitellogenin expression in honey bee queens (Apis mellifera).
- auteur
- Freddie-Jeanne Richard, Coby Schal, David R Tarpy, Christina M Grozinger
- article
- Journal of Chemical Ecology, 2011, 37 (9), pp.1027-36. ⟨10.1007/s10886-011-9999-z⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Un déluge de données
- auteur
- Christophe Blanchet, Olivier Collin
- article
- Biofutur, 2011
- Accès au bibtex
-
- titre
- The impact of endosymbionts on the evolution of host sex-determination mechanisms.
- auteur
- Richard Cordaux, Didier Bouchon, Pierre Grève
- article
- Trends in Genetics, 2011, 27 (8), pp.332-341. ⟨10.1016/j.tig.2011.05.002⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Etude quantitative dálgorithmes de stéréovision pour les systèmes embarqués d'aide à la conduite
- auteur
- Mehdi Darouich, Stéphane Guyetant, Dominique Lavenier
- article
- Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série TSI : Technique et Science Informatiques, 2011, 30 (5), pp.539-569
- Accès au bibtex
-
- titre
- Characterization of bacterial symbioses in Myrtea sp. (Bivalvia: Lucinidae) and Thyasira sp. (Bivalvia Thyasiridae) from a cold seep in the Eastern Mediterranean.
- auteur
- Terry Terry.Brissac@upmc.Fr Brissac, F. Rodrigues Clara, Olivier Gros, Sébastien Duperron
- article
- Marine Ecology, 2011, 32 (2), pp.198-210. ⟨10.1111/j.1439-0485.2010.00413.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region
- auteur
- Frédéric Lecerc, Anthony Bretaudeau, Olivier Sallou, Colette Désert, Yuna Blum, Sandrine Lagarrigue, Olivier Demeure
- article
- Nucleic Acids Research, 2011, 39 (Suppl 2), open access. ⟨10.1093/nar/gkr361⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Algorithm engineering for optimal alignment of protein structure distance matrices
- auteur
- Inken Wohlers, Rumen Andonov, Gunnar W. Klau
- article
- Optimization Letters, 2011, ⟨10.1007/s11590-011-0313-3⟩
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-
- titre
- The spin glass delafossite CuFe 0.5 V 0.5 O 2 : a dipolar glass?
- auteur
- Kiran Singh, Antoine Maignan, Charles Simon, Vincent Hardy, Elise Pachoud, Christine Martin
- article
- Journal of Physics: Condensed Matter, 2011, 23 (12), pp.126005. ⟨10.1088/0953-8984/23/12/126005⟩
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-
- titre
- Variation of parasite load and immune parameters in two species of New Zealand shore crabs
- auteur
- Jessica Dittmer, Anson V Koehler, Freddie-Jeanne Richard, Robert Poulin, Mathieu Sicard
- article
- Parasitology Research, 2011, 109 (3), pp.759 - 767. ⟨10.1007/s00436-011-2319-2⟩
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-
- titre
- Vertebrate host protective immunity drives genetic diversity and antigenic polymorphism in Schistosoma mansoni.
- auteur
- S. Beltran, Benjamin Gourbal, Jérôme Boissier, David Duval, S. Kieffer-Jaquinod, R. J. Pierce, Christoph Grunau, A. Théron, G. Mitta
- article
- Journal of Evolutionary Biology, 2011, 24 (3), pp.554-72. ⟨10.1111/j.1420-9101.2010.02190.x⟩
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-
- titre
- QTL analysis of seed germination and pre-emergence growth at extreme temperatures in Medicago truncatula.
- auteur
- Paula Menna Barreto Dias, Sophie Brunel-Muguet, Caroline Dürr, Thierry Huguet, Didier Demilly, Marie-Hélène Wagner, Béatrice Teulat
- article
- TAG Theoretical and Applied Genetics, 2011, 122 (2), pp.429-44. ⟨10.1007/s00122-010-1458-7⟩
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-
- titre
- Fractal tiles associated with shift radix systems
- auteur
- Valerie Berthe, Anne Siegel, Wolfgang Steiner, Paul Surer, Jörg Thuswaldner
- article
- Advances in Mathematics, 2011, 226 (1), pp.139-175. ⟨10.1016/j.aim.2010.06.010⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Maximum Contact Map Overlap Revisited
- auteur
- Rumen Andonov, Noël Malod-Dognin, Nicola Yanev
- article
- Journal of Computational Biology, 2011, 18 (1), pp.1-15. ⟨10.1089/cmb.2009.0196⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Current conservation strategies for European crayfish
- auteur
- P. Kozak, L. Füreder, J. Reynolds, C. Souty-Grosset, A. Kouba
- article
- Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 2011, 401, pp.1-8. ⟨10.1051/kmae/2011018⟩
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-
- titre
- Haplotype variation in the spiny-cheek crayfish Orconectes limosus: colonization of Europe and genetic diversity of native stocks
- auteur
- L. Filipova, D. A. Lieb, F. Grandjean, A. Petrusek
- article
- Journal of the North American Benthological Society, 2011, 30 (4), pp.871-881
- Accès au bibtex
-
- titre
- An Expressed Sequence Tag collection from the male antennae of the Noctuid moth Spodoptera littoralis: a resource for olfactory and pheromone detection research.
- auteur
- Fabrice Legeai, Sébastien Malpel, Nicolas Montagné, Christelle Monsempes, François Cousserans, Christine Merlin, Marie-Christine François, Martine Maïbèche-Coisné, Frédérick F. Gavory, Julie Poulain, Emmanuelle Jacquin-Joly
- article
- BMC Genomics, 2011, 12 (86), pp.86. ⟨10.1186/1471-2164-12-86⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Immune Cellular Effectors of Terrestrial Isopod Armadillidium vulgare: Meeting with Their Invaders, Wolbachia
- auteur
- F. Chevalier, J. Herbiniere-Gaboreau, J. Bertaux, M. Raimond, F. Morel, D. Bouchon, P. Greve, C. Braquart-Varnier
- article
- PLoS ONE, 2011, 6 (4), pp.e18531. ⟨10.1371/journal.pone.0018531⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Quantitative trait loci associated with drought tolerance in the model legume Medicago truncatula
- auteur
- Mounawer M. Badri, Fabien F. Chardon, Thierry T. Huguet, Mohamed Elarbi M. E. Aouani
- article
- Euphytica, 2011, 181 (3), pp.415 - 428. ⟨10.1007/s10681-011-0473-3⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Growth and metal accumulation in Porcellio scaber exposed to poplar litter from Cd-, Pb-, and Zn-contaminated sites.
- auteur
- Jean-Philippe Godet, Sylvain Demuynck, Christophe Waterlot, Sébastien Lemière, Catherine Souty-Grosset, Renaud Scheifler, Francis Douay, Alain Leprêtre, Christelle Pruvot
- article
- Ecotoxicology and Environmental Safety, 2011, 74 (3), pp.451-458. ⟨10.1016/j.ecoenv.2010.09.007⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Use of Ephemeroptera as bioindicators of the occurrence of white-clawed crayfish (Austropotamobius pallipes)
- auteur
- F. Grandjean, J. Jandry, E. Bardon, A. Coignet, M.-C. Trouilhé, B. Parinet, C. Souty-Grosset, M. Brulin
- article
- Hydrobiologia, 2011, 671, pp.253-258. ⟨10.1007/s10750-011-0717-1⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A novel substitution matrix fitted to the compositional bias in Mollicutes improves the prediction of homologous relationships
- auteur
- Claire Lemaitre, Aurélien Barré, Christine Citti, Florence Tardy, François Thiaucourt, Pascal Sirand-Pugnet, Patricia Thébault
- article
- BMC Bioinformatics, 2011, 12 (1), pp.457. ⟨10.1186/1471-2105-12-457⟩
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- titre
- QTLs mapping of morphological traits related to salt tolerance in Medicago truncatula
- auteur
- Soumaya S. Arraouadi, Fabien F. Chardon, Thierry T. Huguet, Mohamed Elarbi M. E. Aouani, Mounawer M. Badri
- article
- Acta Physiologiae Plantarum, 2011, 33 (3), pp.917-926. ⟨10.1007/s11738-010-0621-8⟩
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- titre
- SigReannot-mart: a query environment for expression microarray probe re-annotations.
- auteur
- François Moreews, Gaelle Rauffet, Patrice Dehais, Christophe C. Klopp
- article
- Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2011, 2011, pp.bar025. ⟨10.1093/database/bar025⟩
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- titre
- Directed Binary Hierarchies and Directed Ultrametrics
- auteur
- Israël-César C. Lerman, Pascale Kuntz
- article
- Journal of Classification, 2011, 28 (3), pp.272-296. ⟨10.1007/s00357-011-9091-y⟩
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-
- titre
- Close 3D proximity of evolutionary breakpoints argues for the notion of spatial synteny
- auteur
- Amélie Véron, Claire Lemaitre, Christian Gautier, Vincent Lacroix, Marie-France Sagot
- article
- BMC Genomics, 2011, 12 (1), pp.303. ⟨10.1186/1471-2164-12-303⟩
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- titre
- Designing Logical Rules to Model the Response of Biomolecular Networks with Complex Interactions: An Application to Cancer Modeling.
- auteur
- Carito Guziolowski, Sylvain Blachon, Tatiana Baumuratova, Gautier Stoll, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel
- article
- IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2011, 8 (5), pp.1223-1234. ⟨10.1109/TCBB.2010.71⟩
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- titre
- Identification of exotic North American crayfish in Europe by DNA barcoding
- auteur
- L. Filipova, F. Grandjean, C. Chucholl, D.M. Soes, A. Petrusek
- article
- Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 2011, 401, 11p14. ⟨10.1051/kmae/2011025⟩
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-
- titre
- Local protein threading by Mixed Integer Programming
- auteur
- Guillaume Collet, Rumen Andonov, Jean-François Gibrat, Nicola Yanev
- article
- Discrete Applied Mathematics, 2011, 159 (16), pp.1707-1716. ⟨10.1016/j.dam.2010.05.024⟩
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- titre
- Disentangling the impact of demographic factors on population differentiation of an endangered freshwater crayfish (Austropotamobius pallipes) using population density and microsatellite data
- auteur
- N. Gouin, C. Souty-Grosset, J. Borquez, A. Bertin, F. Grandjean
- article
- Freshwater Biology, 2011, 56, pp.2105-2118. ⟨10.1111/j.1365-2427.2011.02629.x⟩
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- titre
- Short- and long-term evolutionary dynamics of bacterial insertion sequences: insights from Wolbachia endosymbionts
- auteur
- Nicolas Cerveau, Sébastien Leclercq, Didier Bouchon, Richard Cordaux
- article
- Genome Biology and Evolution, 2011, 3, pp.1175-1186. ⟨10.1093/gbe/evr096⟩
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- titre
- Simple Shared Motifs (SSM) in conserved region of promoters: a new approach to identify co-regulation patterns.
- auteur
- Jérémy Gruel, Michel Leborgne, Nolwenn Le Meur, Nathalie Théret
- article
- BMC Bioinformatics, 2011, 12, pp.365. ⟨10.1186/1471-2105-12-365⟩
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- titre
- A species-specific microsatellite marker to discriminate European Atlantic salmon, brown trout, and their hybrids
- auteur
- Charles Perrier, Frederic Grandjean, Jérôme Le Gentil, Corinne Cherbonnel, Guillaume Evanno
- article
- Conservation Genetics Resources, 2011, 3 (1), pp.131-133. ⟨10.1007/s12686-010-9307-1⟩
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- titre
- Remarkable abundance and evolution of mobile group II introns in Wolbachia bacterial endosymbionts.
- auteur
- Sébastien Leclercq, Isabelle Giraud, Richard Cordaux
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2011, 28 (1), pp.685-697. ⟨10.1093/molbev/msq238⟩
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- titre
- Armadillidium virgo n. sp. from caves in southeastern Sicily:Is it a parthenogenetic species? (Crustacea, Isopoda, Oniscidea)
- auteur
- D. Caruso, D. Bouchon
- article
- Italian Journal of Zoology, 2011, 78 (1), pp.96-100
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- titre
- Genetically regulated metabolic networks: Gale-Nikaido modules and differential inequalities
- auteur
- Ovidiu Radulescu, Anne Siegel, Elisabeth Pecou, Clément Chatelain, Sandrine Lagarrigue
- article
- Transactions on Computational Systems Biology, 2011, Transactions on Computational Systems Biology XIII, 6575 (Lecture Notes in Computer Science 6575), pp.110-130. ⟨10.1007/978-3-642-19748-2_6⟩
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Communication dans un congrès
- titre
- A symmetry-driven BP algorithm for the Discretizable Molecular Distance Geometry Problem
- auteur
- Antonio Mucherino, Carlile Lavor, Leo Liberti
- article
- IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, Nov 2011, Atlanta, United States
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- titre
- A new method for modeling reactions and regulations to analyze high-throughout data
- auteur
- Pierre Blavy, Florence Gondret, Sven Thiele, Carito Guziolowski, Sandrine Lagarrigue, Jaap J. van Milgen, François Moreews, Anne Siegel
- article
- 4. International Symposium on Animal Functional Genomics, Sorcha De Gras; Sorcha De Gras, Oct 2011, Dublin, Ireland
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- titre
- Utilisation d'une Grille de Calcul (GRISBI) pour le Traitement de Données NGS (New Generation Sequencing)
- auteur
- Florence Maurier, Alexis Groppi, Aurélien Barré, Delphine Naquin, Aurélien Roult, Clément Gauthey, Christophe Blanchet, Tiphaine Martin
- article
- Rencontres Scientifiques France Grilles 2011, Sep 2011, Lyon, France
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- titre
- Importance de l'impulsion de pouvoirs locaux dans la dynamique partenariale transversale. Le Plan de Cohésion Sociale et la méthode ouverte de coordination
- auteur
- Laurence Meire
- article
- International Conference "Sustainable economics within the new culture of development". ENTI. September 12th-14th 2011, Sep 2011, Liège, Belgique
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- titre
- Parallel and memory-efficient reads indexing for genome assembly
- auteur
- Rayan Chikhi, Guillaume Chapuis, Dominique Lavenier
- article
- Parallel Bio-Computing 2011, Sep 2011, torun, Poland
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- titre
- Localized genome assembly from reads to scaffolds: practical traversal of the paired string graph
- auteur
- Rayan Chikhi, Dominique Lavenier
- article
- WABI 2011, Sep 2011, Sarrebruck, Germany. ⟨10.1007/978-3-642-23038-7_4⟩
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- titre
- Using Dominances for Solving the Protein Family Identification Problem
- auteur
- Noël Malod-Dognin, Mathilde Le Boudic-Jamin, Pritish Kamath, Rumen Andonov
- article
- 11th Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2011), Max-Planck-Institute für Informatics, Sep 2011, Saarbrücken, Germany. pp.201-212, ⟨10.1007/978-3-642-23038-7_18⟩
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- titre
- Finding Long and Multiple Repeats with Edit Distance
- auteur
- Maria Federico, Pierre Peterlongo, Nadia Pisanti, Marie-France Sagot
- article
- The Prague Stringology Conference 2011, Aug 2011, Prague, Czech Republic
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- titre
- biomanycores.org: a repository of interoperable open-source code for many-core bioinformatics
- auteur
- Jean-Frédéric Berthelot, Charles Deltel, Mathieu Giraud, Stéphane Janot, Laetitia Jourdan, Dominique Lavenier, Helene Touzet, Jean-Stéphane Varré
- article
- JOBIM 2011, Jul 2011, Paris, France
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- titre
- OBIWEE : an open source bioinformatics cloud environment
- auteur
- François Moreews, Jonathan Piat, Olivier Sallou
- article
- BOSC 2011 - 12th Annual Bioinformatics Open Source Conference, Jul 2011, Vienne, Austria
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- titre
- SLICEE: A Service oriented middleware for intensive scientific computation
- auteur
- Jonathan Piat, François Moreews, Olivier Collin, Dominique Lavenier, Alexandre Cornu
- article
- SERVICES 2011, Jul 2011, WASHINGTON DC, United States
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- titre
- RENABI GRISBI Infrastructure Distribuée pour la Bioinformatique
- auteur
- Christophe Blanchet, Clément Gauthey, Christophe C. Caron, Olivier Collin, Stephane Delmotte, Tiphaine Martin, Aurelien Roult, Franck Samson, Bruno Spataro
- article
- JOBIM 2011 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématique, Jun 2011, Paris, France
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- titre
- Utilisation d'une Grille de Calcul (GRISBI) pour le Traitement de Données NGS
- auteur
- Florence Maurier, Alexis Groppi, Aurélien Barré, Delphine Naquin, Aurelien Roult, Clement Gauthier, Christophe Blanchet, Tiphaine Martin
- article
- JOBIM 2011, Jun 2011, Paris, France
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- titre
- Sparsifying Distance Matrices for Protein-Protein Structure Alignments
- auteur
- Antonio Mucherino, Inken Wohlers, Gunnar W. Klau, Rumen Andonov
- article
- CTW2011, Jun 2011, Rome, Italy
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- titre
- Présentation des Centres Bioinformatiques Régionaux : RENABI-GO
- auteur
- Tiphaine Martin, Christophe C. Caron, Olivier Collin
- article
- Journées GRISBI 2011 : scientifiques et technologique, Christophe Blanchet and Christophe Caron and Olivier Collin and Stéphane Delmotte and Clément Gauthey and Tiphaine Martin and Franck Samson and Bruno Spataro, May 2011, Lyon, France
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- titre
- AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region
- auteur
- Frédéric Lecerf, Anthony Bretaudeau, Olivier Sallou, Colette Désert, Anne Blum, Sandrine Lagarrigue, Olivier O. Demeure
- article
- 15th QTLMAS, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Génétique Animale (0598)., May 2011, Rennes, France
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- titre
- GPU Accelerted QTLMap
- auteur
- Guillaume Chapuis, Olivier Filangi, Pascale Le Roy, Jean-Michel Elsen, Dominique Lavenier
- article
- The 15th QTL-MAS workshop, May 2011, -, France
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- titre
- Development of a new magnetocaloric material used in a magnetic refrigeration device
- auteur
- Frédéric Guilloud, Ulrich Legait, Afef Kedous-Lebouc, Vincent Hardy
- article
- First Euro Mediterranean Meeting on Functionalized Materials EMM-FM, Mar 2011, Sousse, Tunisia
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-
- titre
- Froid magnétique
- auteur
- Vincent Hardy, B. Chevalier, Daniel Fruchart, Afef Kedous-Lebouc, Cyrille Train
- article
- Colloque PIE CNRS, Mar 2011, Montpellier, France
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- titre
- Two types of transcriptional repression in living cells of [i]Bacillus subtilis[/i] characterized by number and brightness analysis
- auteur
- Matthew L. Ferguson, Dominique Le Coq, Matthieu Jules, Bryan Chun, Stephane Aymerich, Ovidiu Radulescu, Nathalie Declerck, Catherine A. Royer
- article
- 55. Annual Meeting of the Biophysical-Society, Mar 2011, Baltimore, Maryland, United States. ⟨10.1016/j.bpj.2010.12.1179⟩
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- titre
- Identification rapide de familles protéiques par dominance
- auteur
- Mathilde Le Boudic-Jamin, Noël Malod-Dognin, Alexandre Cornu, Jacques Nicolas, Rumen Andonov
- article
- 12th Annual Congress of the French National Society of Operations Research and Decision Science (ROADEF), École Nationale Supérieure des Mines de Saint-Étienne, Mar 2011, Saint-Étienne, France. pp.791-792
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- titre
- HLS Tools for FPGA : faster development with better performances
- auteur
- Alexandre Cornu, Steven Derrien, Dominique Lavenier
- article
- Proceeding of the 7th International Symposium on Applied Reconfigurable Computing, Feb 2011, Belfast, United Kingdom. pp.67-78
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- titre
- Biomanycores, open-source parallel code for many-core bioinformatics
- auteur
- Mathieu Giraud, Stéphane Janot, Jean-Frédéric Berthelot, Charles Deltel, Laetitia Jourdan, Dominique Lavenier, Helene Touzet, Jean-Stéphane Varré
- article
- Bioinformatics Open Source Conference (BOSC 2011), 2011, Vienne, Austria
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- GPU accelerated RNA folding algorithm
- auteur
- Dominique Lavenier, Guillaume Rizk, Sanjay Rajopadhye
- article
- Wen-mei W. Hwu. GPU Computing Gems, ELSEVIER, pp.560, 2011, ⟨10.1016/B978-0-12-384988-5.00014-0⟩
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-
- titre
- Probabilistic Approaches for Investigating Biological Networks
- auteur
- Jérémie Bourdon, Damien Eveillard
- article
- Mourad Elloumi, Albert Y. Zomaya. Algorithms in Computational Molecular Biology: Techniques, Approaches and Applications, Wiley, pp.1066, 2011
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-
- titre
- Evolutionary Dynamics and Genomic Impact of Prokaryote Transposable Elements
- auteur
- N. Cerveau, S. Leclercq, D. Bouchon, R. Cordaux
- article
- Pierre Pontarotti. Evolutionary Biology: Concepts, Biodiversity, Macroevolution and Genome Evolution, Springer Verlag, pp.291-312, 2011, 978-3-642-20762-4. ⟨10.1007/978-3-642-20763-1_17⟩
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-
Mémoire d'étudiant
- titre
- Apprentissage de grammaires algébriques par alignement multiple de séquences protéiques
- auteur
- Gaelle Garet
- article
- Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. 2011
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-
Autre publication scientifique
- titre
- How to accelerate genomic sequence alignment 4X using half an FPGA
- auteur
- Alexandre Cornu, Steven Derrien, Dominique Lavenier
- article
- 2011
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-
Poster de conférence
- titre
- AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region
- auteur
- Frédéric Lecerf, Anthony Bretaudeau, Olivier Sallou, Colette Désert, Yuna Blum, Sandrine Lagarrigue, Olivier O. Demeure
- article
- 12. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2011, Paris, France. 2011, JOBIM 2011
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-
Rapport
- titre
- kisSplice, détection d'évènements d'épissages alternatifs dans les données RNA-seq
- auteur
- Gustavo Akio Tominaga Sacomoto, J. Kielbassa, Pavlos Antoniou, Rayan Chikhi, Raluca Uricaru, Marie-France Sagot, Pierre Peterlongo, Vincent Lacroix
- article
- [Research Report] RR-7852, INRIA. 2011, pp.12
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-
- titre
- Recherche et annotation des structures de CRISPR dans l'ensemble des génomes procaryotes
- auteur
- Christophe Vroland, Catherine Belleannée, Jacques Nicolas
- article
- [Rapport de recherche] PI-1986, 2011, pp.24
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-
- titre
- Mapsembler, targeted assembly of larges genomes on a desktop computer
- auteur
- Pierre Peterlongo, Rayan Chikhi
- article
- [Research Report] RR-7565, INRIA. 2011, pp.17
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-
Thèse
- titre
- Dynamique évolutive des éléments transposables de type séquence d'insertion dans les génomes des bactéries endosymbiotiques Wolbachia
- auteur
- Nicolas Cerveau
- article
- Biodiversité et Ecologie. Université de Poitiers, 2011. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- La symbiose à Wolbachia ( -protéobactérie) : impacts sur le système immunitaire et l'immunocompétence de son hôte Armadillidium vulgare (crustacé isopode)
- auteur
- Frédéric Chevalier
- article
- Biodiversité et Ecologie. Université de Poitiers, 2011. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Searching for Compact Hierarchical Structures in DNA by means of the Smallest Grammar Problem
- auteur
- Matthias Gallé
- article
- Modeling and Simulation. Université Rennes 1, 2011. English. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Parallelization on graphic hardware : contributions to RNA folding and sequence alignment
- auteur
- Guillaume Rizk
- article
- Computer Science [cs]. Université Rennes 1, 2011. English. ⟨NNT : 2011REN1S021⟩
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-
2010
Article dans une revue
- titre
- GermOnline 4.0 is a genomics gateway for germline development, meiosis and the mitotic cell cycle
- auteur
- Aurélie Lardenois, Alexandre Gattiker, Olivier Collin, Frédéric Chalmel, Michael Primig
- article
- Database -Weston-, 2010, pp.baq030. ⟨10.1093/database/baq030⟩
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-
- titre
- Statistical Properties of Factor Oracles
- auteur
- Jérémie Bourdon, Irena Rusu
- article
- Journal of Discrete Algorithms, 2010, LNCS, 9 (2011), pp.59-66. ⟨10.1007/978-3-642-02441-2⟩
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- titre
- GASSST: Global Alignment Short Sequence Search Tool
- auteur
- Guillaume Rizk, Dominique Lavenier
- article
- Bioinformatics, 2010, 26 (20), pp 2534-2540
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- titre
- Cassis: detection of genomic rearrangement breakpoints.
- auteur
- Christian Baudet, Claire Lemaitre, Zanoni Dias, Christian Gautier, Eric Tannier, Marie-France Sagot
- article
- Bioinformatics, 2010, 26 (15), pp.1897-8. ⟨10.1093/bioinformatics/btq301⟩
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-
- titre
- Bioinformatic prediction, deep sequencing of microRNAs and expression analysis during phenotypic plasticity in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum.
- auteur
- Fabrice Legeai, Guillaume Rizk, Thomas Walsh, Owain Edwards, Karl Gordon, Dominique Lavenier, Nathalie Leterme, Agnès Méreau, Jacques Nicolas, Denis Tagu, Stéphanie Jaubert-Possamai
- article
- BMC Genomics, 2010, 11 (1), pp.281. ⟨10.1186/1471-2164-11-281⟩
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-
- titre
- Analysis of virion structural components reveals vestiges of the ancestral ichnovirus genome.
- auteur
- Anne-Nathalie Volkoff, Véronique Jouan, Serge Urbach, Sylvie Samain, Max Bergoin, Patrick Wincker, Edith Demettre, François Cousserans, Bertille Provost, Fasseli Coulibaly, Fabrice Legeai, Catherine Béliveau, Michel Cusson, Gabor Gyapay, Jean-Michel Drezen
- article
- PLoS Pathogens, 2010, 6 (5), pp.e1000923. ⟨10.1371/journal.ppat.1000923⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Extensive synteny conservation of holocentric chromosomes in Lepidoptera despite high rates of local genome rearrangements.
- auteur
- E. d'Alençon, H. Sezutsu, Fabrice Legeai, E. Permal, S. Bernard-Samain, S. Gimenez, C. Gagneur, F. Cousserans, M. Shimomura, A. Brun-Barale, T. Flutre, A. Couloux, P. East, K. Gordon, K. Mita, H. Quesneville, P. Fournier, R. Feyereisen
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2010, 107 (17), pp.7680-5. ⟨10.1073/pnas.0910413107⟩
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-
- titre
- A parallel scheme for comparing transcription factor binding sites matrices
- auteur
- Solenne Carat, Rémi Houlgatte, Jérémie Bourdon
- article
- Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2010, 8 (3), pp.18
- Accès au bibtex
-
- titre
- Décoder le vivant
- auteur
- Jacques Nicolas
- article
- Interstices, 2010
- Accès au bibtex
-
- titre
- Model of cap-dependent translation initiation in sea urchin: a step towards the eukaryotic translation regulation network.
- auteur
- Robert Bellé, Sylvain Prigent, Anne Siegel, Patrick Cormier
- article
- Molecular Reproduction and Development, 2010, 77 (3), pp.257-64. ⟨10.1002/mrd.21142⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Comparative analysis of the Acyrthosiphon pisum genome and expressed sequence tag-based gene sets from other aphid species.
- auteur
- Morgane Ollivier, Fabrice Legeai, Claude Rispe
- article
- Insect Molecular Biology, 2010, 19 Suppl 2 (s2), pp.33-45. ⟨10.1111/j.1365-2583.2009.00976.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Asymptotology of Chemical Reaction Networks
- auteur
- Alexander N. Gorban, Ovidiu Radulescu, Andrei Zinovyev
- article
- Chemical Engineering Science, 2010, 65 (7), pp.2310-2324. ⟨10.1016/j.ces.2009.09.005⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Sex and stripping: The key to the intimate relationship between Wolbachia and host?
- auteur
- L. Negri, M. Pellecchia, P. Greve, Daniele Daffonchio, C. Bandi, A. Alma
- article
- Communicative and Integrative Biology, 2010, 3 (2), pp.110-115
- Accès au bibtex
-
- titre
- Rational numbers with purely periodic $\beta$-expansion
- auteur
- Boris Adamczewski, Christiane Frougny, Anne Siegel, Wolfgang Steiner
- article
- Bulletin of the London Mathematical Society, 2010, 42 (3), pp.538-552. ⟨10.1112/blms/bdq019⟩
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-
- titre
- Cryptic diversity within the invasive virile crayfish Orconectes virilis (Hagen, 1870) species complex: new lineages recorded in both native and introduced ranges
- auteur
- L. Filipova, D. Holdich, J. Lesobre, F. Grandjean, A. Petrusek
- article
- Biological Invasions, 2010, 12, pp.983-989. ⟨10.1007/s10530-009-9526-0⟩
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-
- titre
- ModuleOrganizer: detecting modules in families of transposable elements.
- auteur
- Sebastien Tempel, Christine Rousseau, Fariza Tahi, Jacques Nicolas
- article
- BMC Bioinformatics, 2010, 11, pp.474. ⟨10.1186/1471-2105-11-474⟩
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-
- titre
- Female-extended control over their reproductive investment: the role of early mating interactions on oocyte maturation in the terrestrial crustacean Armadillidium vulgare (Latreille, 1804)
- auteur
- Fabrice Lefebvre, Y. Caubet
- article
- Invertebrate Reproduction and Development, 2010, 54 (4), pp.177-186
- Accès au bibtex
-
- titre
- Land-use in headwaters and distribution of the native white-clawed crayfish Austropotamobius pallipes (Lereboullet) in a stream from the Poitou-Charentes region
- auteur
- C. Souty-Grosset, V Hardy, R. Raimond, L. Ollivier
- article
- Freshwater Crayfish, 2010, 17, pp.129-134
- Accès au bibtex
-
- titre
- Terrestrial Isopods Diversity Related to Irrigation and Agricultural Practices in Norht-East of Tunisia
- auteur
- M. Fraj, F.C. Cheikhrouha, C. Souty-Grosset
- article
- Anadolu Tarim Bilim, 2010, 25(S-3), pp.217-223
- Accès au bibtex
-
- titre
- Effects of queen mandibular pheromone on nestmate recognition in worker honeybees, Apis mellifera
- auteur
- Y.L. Fan, F.-J. Richard, N. Rouf, C. M. Grozinger
- article
- Animal Behaviour, 2010, 79 (3), pp.649-656. ⟨10.1016/j.anbehav.2009.12.013⟩
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-
- titre
- Que sait-on du déterminisme de la qualité des huiles du tournesol face aux nouvelles attentes ?
- auteur
- Monique Berger, Alicia Ayerdi-Gotor, Ahmad Sarrafi, Pierre Maury, Jean Daydé, Anne Calmon
- article
- Oléagineux, Corps Gras, Lipides, 2010, 17 (3), pp.171-184
- Accès au bibtex
-
- titre
- Genetic variability of Austropotamobius italicus in the Marches region: implications for conservation
- auteur
- R. Cataudella, M. Paolucci, C. Delaunay, A. Ropiquet, A. Hassanin, M. Balsamo, F. Grandjean
- article
- Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 2010, 20 (3), pp.261-268. ⟨10.1002/aqc.1099⟩
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-
- titre
- Computational methods for the analysis of primate mobile elements.
- auteur
- Richard Cordaux, Shurjo K Sen, Miriam K Konkel, Mark A Batzer
- article
- Methods in Molecular Biology, 2010, 628, pp.137-151. ⟨10.1007/978-1-60327-367-1_8⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Impact of Soil Quality On The Distribution of Terrestrial Isopods in some Tunisian Wetlands
- auteur
- H. Khemaissia, C. Souty-Grosset, K. Nasri-Ammar
- article
- Anadolu Tarim Bilim, 2010, 25(S-2), pp.131-136
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-
- titre
- DNA Slippage Occurs at Microsatellite Loci without Minimal Threshold Length in Humans: A Comparative Genomic Approach
- auteur
- Sébastien Leclercq, Eric Rivals, Philippe Jarne
- article
- Genome Biology and Evolution, 2010, 2, pp.325-335. ⟨10.1093/gbe/evq023⟩
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-
- titre
- Localizing potentially active post-transcriptional regulations in the Ewing's sarcoma gene regulatory network.
- auteur
- Tatiana Baumuratova, Didier Surdez, Bernard Delyon, Gautier Stoll, Olivier Delattre, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel
- article
- BMC Systems Biology, 2010, 4 (1), pp.146. ⟨10.1186/1752-0509-4-146⟩
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-
- titre
- Variations of immune parameters in terrestrial isopods: a matter of gender, aging and Wolbachia
- auteur
- M. Sicard, F. Chevalier, M. de Vlechouver, D. Bouchon, P. Greve, C. Braquart-Varnier
- article
- Die Naturwissenschaften, 2010, 97 (9), pp.819-826
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-
- titre
- AphidBase: a centralized bioinformatic resource for annotation of the pea aphid genome.
- auteur
- Fabrice Legeai, Shuji Shigenobu, Jean-Pierre Gauthier, John Colbourne, Claude Rispe, Olivier Collin, Stephen Richards, A.C.C. Wilson, Terence Murphy, Denis Tagu
- article
- Insect Molecular Biology, 2010, 19 (s2), pp.5-12. ⟨10.1111/j.1365-2583.2009.00930.x⟩
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-
- titre
- Solving Maximum Clique Problem for Protein Structure Similarity
- auteur
- Noël Malod-Dognin, Rumen Andonov, Nicola Yanev
- article
- Serdica Journal of Computing, 2010, 4 (1), pp.93--100
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-
- titre
- Insertion Sequence Inversions Mediated by Ectopic Recombination between Terminal Inverted Repeats
- auteur
- A. Ling, R. Cordaux
- article
- PLoS ONE, 2010, 5 (12), pp.e15654. ⟨10.1371/journal.pone.0015654⟩
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-
Communication dans un congrès
- titre
- Observa, an observatory for social innovation in Chapelle-lez-Herlaimont.
- auteur
- Laurence Meire, Eric Bernard
- article
- 9th International Conference of Territorial Intelligence of ENTI "Ecological and Social Innovation", Nov 2010, Strasbourg, France
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-
- titre
- Oscile
- auteur
- Cathy Charlier, Jérôme Montfort, Olivier Chabrol, François Moreews, M. Salhab, Laurent Richard-Parpaillon, Rozenn Dalbies-Tran, Christelle Hennequet-Antier, Franck Chesnel, Svetlana Uzbekova, Pierre Pontarotti, Julien Bobe
- article
- VIIIe Colloque Agenae / Genanimal, Nov 2010, Bordeaux, France
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-
- titre
- Using Semantic Web Technologies for Clinical Trial Recruitment
- auteur
- Paolo Besana, Marc Cuggia, Oussama Zekri, Annabel Bourdé, Anita Burgun
- article
- 9th International Semantic Web Conference, ISWC 2010, Nov 2010, Shangai, China. pp.34-49, ⟨10.1007/978-3-642-17749-1_3⟩
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-
- titre
- Identifying SNPs without a reference genome by comparing raw reads
- auteur
- Pierre Peterlongo, Nicolas Schnel, Nadia Pisanti, Marie-France Sagot, Vincent Lacroix
- article
- String Processing and Information Retrieval, Oct 2010, Los Cabos, Mexico. pp.147-158, ⟨10.1007/978-3-642-16321-0_14⟩
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-
- titre
- Remarkable abundance and evolution of mobile group II introns in Wolbachia bacterial endosymbionts: evolutionary dynamics and genomic impact
- auteur
- Sébastien Leclercq, Richard Cordaux
- article
- 14. Evolutionary Biology Meeting at Marseilles, Association pour l'Etude de l'Evolution Biologique., Sep 2010, Marseilles, France
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-
- titre
- Modelling Biological Sequences by Grammatical Inference
- auteur
- François Coste
- article
- ICGI 2010 Tutorial Day, José M. Sempere and Pedro Garcias, Sep 2010, Valencia, Spain
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-
- titre
- BioDesc : gestion d'un entrepôt multiformat de descriptions de ressources bioinformatiques
- auteur
- Philippe Picouet, Z. Doughi, Loraine Brillet, Erwan Corre, Christophe Caron, Olivier Collin, François Moreews, Xavier Bailly
- article
- JOBIM, Sep 2010, Montpellier, France
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-
- titre
- ReNaBi-GRISBI: grande infrastructure pour la bioinformatique
- auteur
- Christophe Blanchet, Clément Gauthey, Olivier Collin, Tiphaine Martin, Nouredine Melab, Frederic Plewniak, Franck Samson, Bruno Spataro, Christophe Caron
- article
- JOBIM 2010 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Sep 2010, Montpellier, France
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-
- titre
- Complex update strategies for Probabilistic Boolean Networks
- auteur
- Théo Merle, Jérémie Bourdon
- article
- 7th Workshop on Computational Systems Biology, Jun 2010, Luxembourg, France. pp.4
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-
- titre
- Prediction and analyzes of non coding RNA sequences in the pea aphid genome
- auteur
- Fabrice Legeai, Guillaume Rizk, T. Walsh, Owain Edwards, Jacques Nicolas, Denis Tagu, Stéphanie Jaubert-Possamai
- article
- Arthropods Genomics, Jun 2010, Kansas City, United States
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-
- titre
- A New Tree Distance Metric for Structural Comparison of Sequences
- auteur
- Matthias Gallé
- article
- Dagstuhl Seminar: Structure Discovery in Biology: Motifs, Networks & Phylogenies, Jun 2010, Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum fuer Informatik, Germany
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-
- titre
- Choosing Word Occurrences for the Smallest Grammar Problem
- auteur
- Rafael Carrascosa, François Coste, Matthias Gallé, G. Infante-Lopez
- article
- LATA, May 2010, Trier, Germany
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-
- titre
- An optimized filter for finding multiple repeats in DNA sequences
- auteur
- Maria Federico, Pierre Peterlongo, Nadia Pisanti
- article
- 2010 ACS/IEEE International Conference on Computer Systems and Applications, May 2010, HAMMAMET, Tunisia
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-
- titre
- SHREC'10 Track: Protein Models
- auteur
- Lazaros Mavridis, Vishwesh Venkatraman, David Ritchie, Naoto Morikawa, Rumen Andonov, Alexandre Cornu, Noël Malod-Dognin, Jacques Nicolas, Maja Temerinac-Ott, Marco Reisert, Hans Burkhardt, Apostolos Axenopoulos, Petros Daras
- article
- Eurographics Workshop on 3D Object Retrieval - 3DOR 2010, May 2010, Norrköping, Sweden
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-
- titre
- Maximum Cliques in Protein Structure Comparison
- auteur
- Noël Malod-Dognin, Rumen Andonov, Nicola Yanev
- article
- SEA 2010 9th International Symposium on Experimental Algorithms, May 2010, Naples, Italy. pp.106-117, ⟨10.1007/978-3-642-13193-6_10⟩
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-
- titre
- Repair and Prediction (under Inconsistency) in Large Biological Networks with Answer Set Programming
- auteur
- Martin Gebser, Carito Guziolowski, Mihail Ivanchev, Torsten Schaub, Anne Siegel, Philippe Veber, Sven Thiele
- article
- Principles of Knowledge Representation and Reasoning, 2010, Toronto, Canada
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-
- titre
- MolliGen 3.0, evolution of a database dedicated to the comparative genomics of mollicutes
- auteur
- Aurélien Barré, Claire Lemaitre, Patricia Thebault, Antoine de Daruvar, Alain Blanchard, Pascal Sirand-Pugnet
- article
- Congress of the International Organization for Mycoplasmology ; 2010/07/11-16 ; Chianciano Terme (ITA). IOM congress 2010., 2010, Italy
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Seed-Based Parallel Protein SequenceComparison Combining Multithreading, GPU, and FPGA technologies
- auteur
- Dominique Lavenier, van Hoa Nguyen
- article
- Bioinformatics: High Performance Parallel Computer Architectures, Taylor & Francis Group / CRC Press, pp.181-202, 2010
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-
- titre
- Parallel Genomic Sequence Comparison
- auteur
- Dominique Lavenier
- article
- Parallel and Distributed Computing, INTECH, pp.273-290, 2010
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-
- titre
- Filters and seeds approaches for fast homology searches in large datasets
- auteur
- Nadia Pisanti, Mathieu Giraud, Pierre Peterlongo
- article
- Algorithms in computational molecular biology, 2010, ⟨10.1002/9780470892107.ch15⟩
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-
- titre
- Infraorder astacidea Latreille, 1802 P.O. : The freshwater crayfish
- auteur
- F. Gherardi, C. Souty-Grosset, G. Vogt, J. Dieguez-Uribeondo, K. A. Crandall
- article
- The Crustacea Part A+B, Decapoda, BRILL, pp.269-423, 2010
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-
- titre
- Substitutions, Rauzy fractals and tilings
- auteur
- Valerie Berthe, Anne Siegel, Jorg Thuswaldner
- article
- Cambridge University Press. Combinatorics, Automata and Number Theory, 135, Cambridge University Press, 2010, Encyclopedia of Mathematics and its Applications, 9780521515979
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-
- titre
- A generic stoichiometric model to analyse the metabolic flexibility of the mammary gland in lactating dairy cows
- auteur
- Sophie Lemosquet, Oumarou Abdou-Arbi, Anne Siegel, Jocelyne Guinard-Flament, Jaap J. van Milgen, Jérémie Bourdon
- article
- D. Sauvant, J. Van Milgen, P. Faverdin and N. Friggens. Modelling nutrient digestion and utilization in farm animals, Wageningen Academic Publishers, 2010, 978-90-8686-156-9
- Accès au bibtex
-
Poster de conférence
- titre
- A tale of genome, annotations, metabolism and phylogenomics: the pea aphid genome resources
- auteur
- Fabrice Legeai, Stefano Colella, Jaime Huerta-Cepas, Jean-Pierre Gauthier, Augusto Vellozo, Patrice Baa-Puyoulet, Marie-France Sagot, Toni Gabaldon, Olivier Collin, Hubert Charles, Denis Tagu
- article
- 10. Cold Spring Harbor Laboratory / Wellcome Trust conference on Genome Informatics, Sep 2010, Hinxton, United Kingdom. 1 p., 2010
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-
Rapport
- titre
- Comparing Protein 3D Structures Using A_purva
- auteur
- Noël Malod-Dognin, Nicola Yanev, Rumen Andonov
- article
- [Research Report] RR-7464, INRIA. 2010, pp.9
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-
- titre
- Compression de séquences d'A.D.N. à base de grammaires minimales
- auteur
- Perrin Matthieu
- article
- [Stage] 2010, pp.14
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation du Signal TGF-b : De lObtention des données à la Simulation
- auteur
- Geoffroy Andrieux, Nolwenn Le Meur, Michel Le Borgne, Nathalie Théret
- article
- [Stage] 2010
- Accès au bibtex
-
- titre
- Prédiction des Motifs de Phycobilines-lyases chez les cyanobactéries
- auteur
- Sevellec Maelle
- article
- [Stage] 2010, pp.71
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-
- titre
- Analyse comparative d'indices d'implication discriminants fond´es sur une échelle de probabilité
- auteur
- Israël-César C. Lerman, Sylvie Guillaume
- article
- [Rapport de recherche] RR-7187, INRIA. 2010, pp.88
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-
Thèse
- titre
- Alignements locaux pour la reconnaissance de repliements des protéines par programmation linéaire en nombres entiers
- auteur
- Guillaume Collet
- article
- Modélisation et simulation. Université Rennes 1, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Structure et Evolution du Génome Mitochondrial des Oniscidea (Crustacea, Isopoda)
- auteur
- V. Doublet
- article
- Ecologie, Environnement. Université de Poitiers, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Identification des éléments clefs du métabolisme des lipides et de leurs régulateurs
- auteur
- Pierre Blavy
- article
- Interactions entre organismes. Université Rennes 1, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Protein Structure Comparison: From Contact Map Overlap Maximisation to Distance-based Alignment Search Tool
- auteur
- Noël Malod-Dognin
- article
- Modeling and Simulation. Université Rennes 1, 2010. English. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Analysis of Large-Scale Biological Networks with Constraint-Based Approaches over Static Models
- auteur
- Carito Guziolowski
- article
- Other [cs.OH]. Université Rennes 1, 2010. English. ⟨NNT : ⟩
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-
2009
Article dans une revue
- titre
- Décoder le vivant
- auteur
- Jacques Nicolas
- article
- DocSciences, 2009, Le numérique et les sciences du vivant, 8, pp.26-33
- Accès au bibtex
-
- titre
- Paired-end read length lower bounds for genome re-sequencing
- auteur
- Rayan Chikhi, Dominique Lavenier
- article
- BMC Bioinformatics, 2009, ⟨10.1186/1471-2105-10-S13-O2⟩
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-
- titre
- PLAST: parallel local alignment search tool for database comparison
- auteur
- van Hoa Nguyen, Dominique Lavenier
- article
- BMC Bioinformatics, 2009, 10, pp.24
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A minimal model for hepatic fatty acid balance during fasting: Application to PPAR alpha-deficient mice
- auteur
- Pierre Blavy, Florence Gondret, Hervé Guillou, Sandrine Lagarrigue, P.G.P. Martin, Jaap J. van Milgen, Ovidiu Radulescu, A. Siegel
- article
- Journal of Theoretical Biology, 2009, 261 (2), pp.266. ⟨10.1016/j.jtbi.2009.07.025⟩
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-
- titre
- Generation and analysis of a 29,745 unique Expressed Sequence Tags from the Pacific oyster (Crassostrea gigas) assembled into a publicly accessible database: the GigasDatabase
- auteur
- Elodie Fleury, Arnaud Huvet, Christophe Lelong, Julien de Lorgeril, Viviane Boulo, Yannick Gueguen, Evelyne Bachère, Arnaud Tanguy, Dario Moraga, Caroline Fabioux, Penelope Lindeque, Jenny Shaw, Richard Reinhardt, Patrick Prunet, Grace Davey, Sylvie Lapegue, Christopher Sauvage, Charlotte Corporeau, Jeanne Moal, Frédérick F. Gavory, Patrick Wincker, François Moreews, Christophe C. Klopp, Michel Mathieu, Pierre Boudry, Pascal Favrel
- article
- BMC Genomics, 2009, 10 (341), pp.341. ⟨10.1186/1471-2164-10-341⟩
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-
- titre
- sigReannot: an oligo-set re-annotation pipeline based on similarities with the Ensembl transcripts and Unigene clusters.
- auteur
- Casel Pierrot, François Moreews, Christophe C. Klopp
- article
- BMC Proceedings, 2009, 3 (4), pp.1-5. ⟨10.1186/1753-6561-3-S4-S3⟩
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-
- titre
- GPU-based Parallel SVM Algorithm
- auteur
- Thanh Nghi Do, Van-Hoa Nguyen, François Poulet
- article
- Journal of Frontiers of Computer Science and Technology, 2009, 3 (4), pp.368-377
- Accès au bibtex
-
- titre
- Temporal constraints of a gene regulatory network: refining a qualitative simulation
- auteur
- Jamil Ahmad, Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Jonathan Fromentin, Olivier Roux, Christine Sinoquet
- article
- BioSystems, 2009, pp.10.1016/j.biosystems.2009.05.002. ⟨10.1016/j.biosystems.2009.05.002⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- In-place update of suffix array while recoding words
- auteur
- Matthias Gallé, Pierre Peterlongo, François Coste
- article
- International Journal of Foundations of Computer Science, 2009, 20 (6), pp.1025-1045. ⟨10.1142/S0129054109007029⟩
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-
- titre
- Fine-scale genetic structure of Atlantic salmon (Salmo salar) using microsatellite markers: effects of restocking and natural recolonization
- auteur
- F. Grandjean, S. Verne, C. Cherbonnel, A. Richard
- article
- Freshwater Biology, 2009, 54, pp.417-433. ⟨10.1111/j.1365-2427.2008.02116.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Canalization of gene expression and domain shifts in the Drosophila blastoderm by dynamical attractors
- auteur
- Manu Manu, Svetlana Surkova, Alexander V. Spirov, Vitaly Gursky, Hilde Janssens, Ah-Ram Kim, Ovidiu Radulescu, Carlos E. Vanario-Alonso, D.H. Sharp, Maria Samsonova, John Reinitz
- article
- PLoS Computational Biology, 2009, 5, pp.3
- Accès au bibtex
-
- titre
- MIMAS 3.0 is a Multiomics Information Management and Annotation System.
- auteur
- Alexandre Gattiker, Leandro Hermida, Robin Liechti, Ioannis Xenarios, Olivier Collin, Jacques Rougemont, Michael Primig
- article
- BMC Bioinformatics, 2009, 10, pp.151. ⟨10.1186/1471-2105-10-151⟩
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-
- titre
- Canalization of gene expression in the Drosophila blastoderm by gap genes cross regulation
- auteur
- Manu Manu, Svetlana Surkova, Alexander V. Spirov, Vitaly Gursky, Hilde Janssens, Ah-Ram Kim, Carlos E. Vanario-Alonso, Ovidiu Radulescu, David H. Sharp, Maria Samsonova, John Reinitz
- article
- PLoS Biology, 2009, 7, pp.3
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-
- titre
- The "soil microbial loop" is not always needed to explain protozoan stimulation of plants
- auteur
- F. Ekelund, S. Saj, M. Vestergard, J. Bertaux, J. Mikola
- article
- Soil Biology and Biochemistry, 2009, 41 (11), pp.2336-2342. ⟨10.1016/j.soilbio.2009.08.019⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Steinernema boemarei n. sp. (Nematoda: Steinernematidae), a new entomopathogenic nematode from southern France
- auteur
- M.-M. Lee, M. Sicard, S. P. Stock
- article
- Systematic Parasitology, 2009, 72, pp.127-141. ⟨10.1007/s11230-008-9166-2⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Hybrid Algorithm for the Unbounded Knapsack Problem
- auteur
- Vincent Poirriez, Nicola Yanev, Rumen Andonov
- article
- Discrete Optimization, 2009, 6, pp.110-124. ⟨10.1016/j.disopt.2008.09.004⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Size Regulation in the Segmentation of Drosophila: Interacting Interfaces between Localized Domains of Gene Expression Ensure Robust Spatial Patterning
- auteur
- S.A. Vakulenko, Manu Manu, John Reinitz, Ovidiu Radulescu
- article
- Physical Review Letters, 2009, 103, pp.168102
- Accès au bibtex
-
- titre
- flowCore: a Bioconductor package for high throughput flow cytometry.
- auteur
- Florian Hahne, Nolwenn Le Meur, Ryan R Brinkman, Byron Ellis, Perry Haaland, Deepayan Sarkar, Josef Spidlen, Errol Strain, Robert Gentleman
- article
- BMC Bioinformatics, 2009, 10, pp.106. ⟨10.1186/1471-2105-10-106⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Queen reproductive state modulates pheromone production and queen-worker interactions in honeybees
- auteur
- S.D. Kocher, F.J. Richard, D.R. Tarpy, C.M. Grozinger
- article
- Behavioral Ecology and Sociobiology, 2009, pp.1-8. ⟨10.1093/beheco/arp090⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- CRISPI: a CRISPR Interactive database
- auteur
- Christine Rousseau, Mathieu Gonnet, Marc Le Romancer, Jacques Nicolas
- article
- Bioinformatics, 2009, 25 (24), pp.3317-3318. ⟨10.1093/bioinformatics/btp586⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Knowledge based identification of essential signaling from genome-scale siRNA experiments.
- auteur
- Armand Bankhead, Iliana Sach, Chester Ni, Nolwenn Lemeur, Mark Kruger, Marc Ferrer, Robert Gentleman, Carol Rohl
- article
- BMC Systems Biology, 2009, 3 (1), pp.80. ⟨10.1186/1752-0509-3-80⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- BioQuali Cytoscape plugin: analysing the global consistency of regulatory networks
- auteur
- Carito Guziolowski, Annabel Bourdé, François Moreews, Anne Siegel
- article
- BMC Genomics, 2009, 26 (10), pp.244. ⟨10.1186/1471-2164-10-244⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Increase in magnetoresistivity in Ba2CoS3via Zn2+/Co2+ substitution
- auteur
- Mark Harrison, Vincent Hardy, Antoine Maignan, M. Grazia Francesconi
- article
- Chemical Communications, 2009, 16, pp.2214. ⟨10.1039/b817363j⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Analyse logique, combinatoire et statistique de la construction d'une hiérarchie implicative ; niveaux et noeuds significatifs
- auteur
- Israël-César Lerman
- article
- Mathématiques et Sciences Humaines, 2009
- Accès au bibtex
-
- titre
- Conservation of the Type IV Secretion System throughout Wolbachia evolution
- auteur
- S. Pichon, D. Bouchon, R. Cordaux, Lin Chen, R. A. Garrett, P. Greve
- article
- Biochemical and Biophysical Research Communications, 2009, 4, pp.557-562. ⟨10.1016/j.bbrc.2009.05.118⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Lossless filter for multiple repeats with bounded edit distance
- auteur
- Pierre Peterlongo, Gustavo Akio Tominaga Sacomoto, Alair Pereira Do Lago, Nadia Pisanti, Marie-France Sagot
- article
- Algorithms for Molecular Biology, 2009, 4 (1), pp.3. ⟨10.1186/1748-7188-4-3⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The plant pathogenic fungus Gaeumannomyces graminis var. tritici improves bacterial growth and triggers early gene regulations in the biocontrol strain Pseudomonas fluorescens Pf29Arp
- auteur
- Matthieu Barret, P. Frey-Klett, M. Boutin, Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt, Frédérique Martin, Laëtitia Guillot, Alain Sarniguet
- article
- New Phytologist, 2009, 181 (2), pp.435-447. ⟨10.1111/j.1469-8137.2008.02675.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Gene conversion maintains nonfunctional transposable elements in an obligate mutualistic endosymbiont
- auteur
- R. Cordaux
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2009, 26 (8), pp.1679-1682. ⟨10.1093/molbev/msp093⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The impact of retrotransposons on human genome evolution.
- auteur
- R. Cordaux, M.A. Batzer
- article
- Nature Reviews Genetics, 2009, 10, pp.691-703
- Accès au bibtex
-
- titre
- In silico investigation of ADAM12 effect on TGF-beta receptors trafficking.
- auteur
- Jérémy Gruel, Michel Leborgne, Nolwenn Lemeur, Nathalie Théret
- article
- BMC Research Notes, 2009, 2 (1), pp.193. ⟨10.1186/1756-0500-2-193⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Présentation de "Numeration: Mathematics and Computer Science" (CIRM, 2009)
- auteur
- Anne Siegel, Boris Adamczewski, Wolfgang Steiner
- article
- Actes des rencontres du CIRM, 2009, 1 (1), pp.1-2
- Accès au bibtex
-
- titre
- Symbiotic Virus at the Evolutionary Intersection of Three Types of Large DNA Viruses; Iridoviruses, Ascoviruses, and Ichnoviruses
- auteur
- Yves Bigot, Sylvaine Renault, Jacques Nicolas, Corinne Moundras, Marie-Véronique Demattei, Sylvie Samain, Dennis K. Bideshi, Brian A. Federici
- article
- PLoS ONE, 2009, 4 (7), pp.e6397. ⟨10.1371/journal.pone.0006397⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Partial Resistance of Medicago truncatula to Aphanomyces euteiches Is Associated with Protection of the Root Stele and Is Controlled by a Major QTL Rich in Proteasome-Related Genes
- auteur
- Naceur Djebali, Alain Jauneau, Carine Ameline, Fabien Chardon, Valérie Jaulneau, Catherine Mathé, Arnaud Bottin, Marc Cazaux, Marie-Laure Pilet-Nayel, Alain Baranger, Mohamed Elarbi Aouani, Marie-Thérèse Esquerré-Tugayé, Bernard Dumas, Thierry Huguet, Christophe Jacquet
- article
- Molecular Plant-Microbe Interactions, 2009, 22 (9), pp.1043-1055. ⟨10.1094/MPMI-22-9-1043⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Life history comparison of two terrestrial isopods in relation to habitat specialization
- auteur
- A. Ferreira Quadros, Y. Caubet, P. B. Araujo
- article
- Acta Oecologica, 2009, 35 (2), pp.243-249. ⟨10.1016/j.actao.2008.10.007⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Molecular Phylogeny of Wolbachia Strains in Arthropod Hosts Based on groE-Homologous Gene Sequences
- auteur
- I. Wiwatanaratanabutr, P. Kittayapong, Y. Caubet, D. Bouchon
- article
- Zoological science, 2009, 26, pp.171-177
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-
- titre
- Soil amoebae rapidly change bacterial community composition in the rhizosphere of Arabidopsis thaliana
- auteur
- K. Rosenberg, J. Bertaux, K. Krome, A. Hartmann, S. Scheu, M. Bonkowski
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2009, 3 (6), pp.675-684. ⟨10.1038/ismej.2009.11⟩
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-
- titre
- Manifold aspects of specificity in a nematode-bacterium mutualism
- auteur
- E. Chapuis, V. Emelianoff, V. Paulmier, N. Le Brun, Sylvie Pages, M. Sicard, F.-B. Ferdy
- article
- Journal of Evolutionary Biology, 2009, 22 (10), pp.1-14. ⟨10.1111/j.1420-9101.2009.01829.x⟩
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-
- titre
- Hybrid stochastic simplifications for multiscale gene networks
- auteur
- Alina Crudu, Arnaud Debussche, Ovidiu Radulescu
- article
- BMC Systems Biology, 2009, 3 (1), pp.89. ⟨10.1186/1752-0509-3-89⟩
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-
- titre
- Transcriptomic and proteomic analyses of seasonal photoperiodism in the pea aphid.
- auteur
- Gaël Le Trionnaire, F. Francis, S. Jaubert-Possamai, J. Bonhomme, E. de Pauw, J.-P. Gauthier, E. Haubruge, Fabrice Legeai, N. Prunier-Leterme, Jean-Christophe Simon, T. Sandré, Denis Tagu
- article
- BMC Genomics, 2009, 10, pp.456. ⟨10.1186/1471-2164-10-456⟩
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-
- titre
- Hybienic behavior, liquid-foraging, and trophallaxis in the leafcutting ants, Acromyrmex subterraneus and Acromyrmex
- auteur
- F.-J. Richard, C. Errard
- article
- Journal of Insect Science, 2009, 9 (63), pp.1-9. ⟨10.1673/031.009.6301⟩
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-
Communication dans un congrès
- titre
- From AphidBase and Lepido-DB to an Information System for Insect Plant pest genomics studies.
- auteur
- Fabrice Legeai, Jean-Pierre Gauthier, François Cousserans, Emmanuelle d'Alençon, Olivier Collin, Jacques Nicolas, Philippe Fournier, Denis Tagu
- article
- 1st Workshop on Information System for Insect Pest, Nov 2009, Rennes, France
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-
- titre
- Asymptotology of Chemical Reaction Networks
- auteur
- Alexander N. Gorban, Ovidiu Radulescu, Andrei Zinovyev
- article
- International Symposium on Mathematics in Chemical Kinetics and Engineering (MACKIE-2009), Nov 2009, Ghent, Belgium
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-
- titre
- High throughput flow cytometry analysis with Bioconductor
- auteur
- Nolwenn Le Meur, Florian Hahne, Deepayan Sarkar, Byron Ellis, Josef Spidlen, Ryan R Brinkman, Robert Gentleman
- article
- Advanced Flow Cytometry Analysis 2009, Nov 2009, Marseille, France
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-
- titre
- New experiment of Catalyse research-action method in Chapelle-lez-Herlaimont
- auteur
- Laurence Meire
- article
- 8th International Conference of Territorial Intelligence "Territorial intelligence and culture of development", Nov 2009, Salerno, Italy
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-
- titre
- La calculette métabolique": une approche de modélisation biochimique pour explorer les contraintes au sein du métabolisme des mammifères
- auteur
- Oumarou Abdou-Arbi, Jérémie Bourdon, Anne Siegel, Jaap J. van Milgen, Sophie Lemosquet
- article
- 3. Journées d’Animation Scientifique du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage, Oct 2009, Tours, France
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-
- titre
- Multiclock discrete models of biological systems
- auteur
- Nolwenn Le Meur, Michel Le Borgne, Jérémy Gruel, Nathalie Théret
- article
- European Conference on Complex Systems 2009 (ECCS), Sep 2009, Warwick, United Kingdom
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-
- titre
- c-GAMMA: Comparative Genome Analysis of Molecular Markers
- auteur
- Pierre Peterlongo, Jacques Nicolas, Dominique Lavenier, Raoul Vorc'H, Joël Querellou
- article
- Pattern Recognition in Bioinformatics, Sep 2009, Sheffield, United Kingdom. pp.255-269, ⟨10.1007/978-3-642-04031-3_23⟩
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-
- titre
- From pure discrete spectrum conditions to topological properties of self-affine tiles
- auteur
- Anne Siegel
- article
- Aperiodic Order, Sep 2009, Leceister, United Kingdom
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-
- titre
- Lepido-DB, a new bioinformatic resource for the annotation and cross-comparisons of lepidopteran genomes.
- auteur
- Fabrice Legeai, Emmanuelle d'Alençon, François Cousserans, Hideki Sezutsu, Emmanuelle Permal, Karl Gordon, Hadi Quesneville, René Feyereisen, Philippe Fournier
- article
- The Eighth International Workshop on MOLECULAR BIOLOGY AND GENETICS OF THE LEPIDOPTERA, Aug 2009, Kolimpari, Greece
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-
- titre
- A statistical method for PWM clustering
- auteur
- Solenne Carat, Rémi Houlgatte, Jérémie Bourdon
- article
- Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Jul 2009, Moscou, Russia. pp.59-60
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-
- titre
- High throughput flow cytometry analysis with Bioconductor.
- auteur
- Nolwenn Le Meur, Florian Hahne, Deepayan Sarkar, Byron Ellis, Josef Spidlen, Ryan R Brinkman, Robert Gentleman
- article
- useR! 2009, Jul 2009, Rennes, France
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-
- titre
- A framework for building reliable distributed bioinformatics service repositories
- auteur
- François Moreews
- article
- ICWS 2009 International Conference on Web Services, Jul 2009, Los Angeles, United States. ⟨10.1109/ICWS.2009.143⟩
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-
- titre
- Identification and characterization of novel anti-infectious peptides from the male genital tract.
- auteur
- Frédéric Bourgeon, Jacques Nicolas, Nathalie Melaine, Charles Pineau
- article
- 34th Federation of European Biochemical Societies (FEBS) Congress, Jul 2009, Prague, Czech Republic
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-
- titre
- Rational numbers with purely periodic beta-expansions
- auteur
- Anne Siegel
- article
- Fractals and Tilings, Jul 2009, Strobl, Austria
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- titre
- QBIOS: driving toward a trusted distributed bioinformatics service infrastructure
- auteur
- François Moreews
- article
- ISMB 2009 - International Conference On Intelligent Systems for Molecular Biology, Jun 2009, Stockholm, Sweden
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-
- titre
- Multiclock discrete approach to model the influence of EGF and TGFß pathways on cell proliferation
- auteur
- Nolwenn Le Meur, Michel Le Borgne, Jérémy Gruel, Nathalie Theret
- article
- JOBIM 2009 satellite meeting : Dynamical modelling and simulation of biological networks, Jun 2009, Nantes, France
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- titre
- Multiclock discrete models of the eukaryotic cell cycle.
- auteur
- Nolwenn Le Meur, Jérémy Gruel, Michel Le Borgne, Nathalie Théret
- article
- Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques., Jun 2009, Nantes, France
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-
- titre
- Protein Threading
- auteur
- Guillaume Collet, Rumen Andonov, Nicola Yanev, Jean-François Gibrat
- article
- 8th Cologne-Twente Workshop on Graphs and Combinatorial Optimization, Jun 2009, Paris, France
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-
- titre
- Implementing Protein Seed-Based Comparison Algorithm on the SGI RASC-100 Platform
- auteur
- van Hoa Nguyen, Alexandre Cornu, Dominique Lavenier
- article
- Reconfigurable Architectures Workshop - IPDPS, May 2009, Rome, Italy
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-
- titre
- GPU accelerated Rna folding algorithm
- auteur
- Guillaume Rizk, Dominique Lavenier
- article
- 9th International Conference on Computational Science, May 2009, Baton Rouge, United States. pp.1031
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-
- titre
- Method for Relating Inter-patient Gene Copy Numbers Variations with Gene Expression via Gene Influence Networks
- auteur
- Sylvain Blachon, Gautier Stoll, Carito Guziolowski, Andrei Zinovyev, Emmanuel Barillot, Anne Siegel, Ovidiu Radulescu
- article
- AIAI 2009 Workshop -- Workshop on Biomedical Informatics and Intelligent Approaches in the Support of Genomic Medicine (BMIINT), Apr 2009, Thessalonik, Greece. pp.72-87
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-
- titre
- Modeling the influence of EGF and TGF-b pathways in tumor progression of hepatocellular carcinoma.
- auteur
- Nolwenn Le Meur, Jérémy Gruel, Michel Le Borgne, Nathalie Théret
- article
- Asian Pacific Association for Study of the Liver, Feb 2009, Hong-Kong, Hong Kong SAR China. pp.64, FP107
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-
- titre
- SVM incrémental et parallèle sur GPU
- auteur
- François Poulet, Thanh Nghi Do, van Hoa Nguyen
- article
- 9èmes Journées Francophones "Extraction et Gestion des Connaissances", Jan 2009, Strasbourg, France. pp.103-114
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-
- titre
- Potential implication of host/symbiont recognition mechanisms during coral bleaching
- auteur
- Jeremie Vidal-Dupiol, Guillaume Mitta, Emmanuel Roger, Denis Allemand, Christine Ferrier-Pagès, P Furla, R. Grover, P.L. Merle, Éric Tambutté, Sylvie Tambutté, Didier Zoccola, Ophélie Ladrière, M. Poulicek, L. Fouré, Mehdi Adjeroud
- article
- Advancing the Science of Limnology and Oceanography ASLO Meeting, Jan 2009, Nice, France. pp.278
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-
- titre
- Graph and hierarchical-based approaches for structuring association rule sets
- auteur
- Pascale Kuntz, Israël-César C. Lerman
- article
- Graph theoretical methods for clustering at International Federation of Classification Societies (IFCS), 2009, Dresde, Germany
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Die europäischen Flusskrebsarten-characterisierung and generelles verbreitungsmuster
- auteur
- M. Pöckl, C. Souty-Grosset
- article
- Flusskrebse : Biologie-Ökologie-Gefährdung, L. Fuereder, pp.14-22, 2009
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-
Ouvrages
- titre
- Topological properties of Rauzy fractals
- auteur
- Anne Siegel, Jorg Thuswaldner
- article
- Société Mathématiques de France, 118, pp.144, 2009, Mémoires de la SMF
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-
Poster de conférence
- titre
- Evolutionary dynamics of a group II mobile intron in the endosymbiotic bacteria Wolbachia
- auteur
- Sébastien Leclercq, Richard Cordaux
- article
- 16. Congrès National des Éléments Transposables (CNET 2009), Jul 2009, Le Mans, France. 2009
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-
Rapport
- titre
- Maximum Cliques in Protein Structure Comparison
- auteur
- Noël Malod-Dognin, Rumen Andonov, Nicola Yanev
- article
- [Research Report] RR-7053, INRIA. 2009, pp.19
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-
- titre
- Création d'une bibliothèque de coeurs structuraux pour le protein threading. Utilisation des familles structurales.
- auteur
- Tristan Bitard Feildel
- article
- [Stage] 2009
- Accès au bibtex
-
- titre
- Pondération d'automates modélisant des familles de protéines et significativité des scores
- auteur
- Vincent Picard
- article
- [Stage] 2009
- Accès au bibtex
-
- titre
- Analyse comparative d'indices d'implication discriminants fondés sur une échelle de probabilité.
- auteur
- Israël-César C. Lerman, Sylvie Guillaume
- article
- [Rapport de recherche] PI 1942, 2009, pp.72
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-
- titre
- Solving loosely coupled constraints
- auteur
- Michel Le Borgne
- article
- [Research Report] RR-6958, INRIA. 2009, pp.19
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-
- titre
- Local Protein Threading by Mixed Integer Programming
- auteur
- Guillaume Collet, Rumen Andonov, Nicola Yanev, Jean-François Gibrat
- article
- [Research Report] RR-7122, INRIA. 2009, pp.17
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Flexible Alignments for Protein Threading
- auteur
- Guillaume Collet, Rumen Andonov, Nicola Yanev, Jean-François Gibrat
- article
- [Research Report] RR-6808, INRIA. 2009
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-
- titre
- Directed binary hierarchies and directed ultrametrics
- auteur
- Israël-César Lerman, Pascale Kuntz
- article
- [Research Report] PI 1922, 2009, pp.21
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Directed binary hierarchies and directed ultrametrics
- auteur
- Israël-César Lerman, Pascale Kuntz
- article
- [Research Report] RR-6815, INRIA. 2009, pp.27
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-
- titre
- Identification in silico d'un nouveau gène de la famille des TNF (tumor necrosis factor)
- auteur
- Fanny Colombel
- article
- [Stage] 2009
- Accès au bibtex
-
- titre
- Solving Maximum Clique Problem for Protein Structure Similarity
- auteur
- Noël Malod-Dognin, Rumen Andonov, Nicola Yanev
- article
- [Research Report] RR-6818, INRIA. 2009, pp.12
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-
Thèse
- titre
- Système de sécrétion de type IV et protéines à domaines ankyrines dans les interactions Wolbachia-arthropodes
- auteur
- S. Pichon
- article
- Ecologie, Environnement. Université de Poitiers, 2009. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Etude de l'interaction de Medicago truncatula avec Fusarium oxysporum et du rôle de l'acide salicylique dans les interactions de la plante avec différents agents pathogènes et symbiotiques
- auteur
- Montserrat Ramirez-Suero
- article
- Biologie végétale. Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT, 2009. Français. ⟨NNT : 2009INPT015A⟩
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-
- titre
- Traitement parallèle des comparaisons intensives de séquences génomiques
- auteur
- van Hoa Nguyen
- article
- Informatique [cs]. Université Rennes 1, 2009. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
Pré-publication, Document de travail
- titre
- Qualitative modelling and analysis of gene regulatory networks: application to the adaptation of Escherichia coli bacterium to carbon availability
- auteur
- Jamil Ahmad, Jérémie Bourdon, Damien Eveillard, Jonathan Fromentin, Olivier Roux, Christine Sinoquet
- article
- 2009
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-
2008
Article dans une revue
- titre
- Combining flash memory and FPGAs to efficiently implement a massively parallel algorithm for content-based image retrieval
- auteur
- Chikhi Rayan, Steven Derrien, Noumsi Auguste, Patrice Quinton
- article
- International Journal of Electronics, 2008, 95 (7), pp.621-635(15)
- Accès au bibtex
-
- titre
- Lossless filter for multiple repetitions with Hamming distance
- auteur
- Pierre Peterlongo, Nadia Pisanti, Frédéric Boyer, Alair Pereira Do Lago, Marie-France Sagot
- article
- Journal of Discrete Algorithms, 2008, 6 (3), pp.497-509. ⟨10.1016/j.jda.2007.03.003⟩
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-
- titre
- Indexing gapped-factors using a tree
- auteur
- Pierre Peterlongo, Julien Allali, Marie-France Sagot
- article
- International Journal of Foundations of Computer Science, 2008, 19 (1), pp.71-87. ⟨10.1142/S0129054108005541⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Intense transpositional activity of insertion sequences in an ancient obligate endosymbiont
- auteur
- R. Cordaux, S. Pichon, A. Ling, P. Perez, C. Delaunay, F. Vavre, D. Bouchon, P. Greve
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2008, 25 (9), pp.1889-1896. ⟨10.1093/molbev/msn134⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Conserving indigenous crayfish: stock assessment and habitat requirements in the threatened Austropotamobius italicus
- auteur
- S. Brusconi, S. Bertocchi, B. Renai, M. Scalici, C. Souty-Grosset, F. Gherardi
- article
- Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 2008, 18 (7), pp.1227-1239. ⟨10.1002/aqc.935⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal neighborhood indexing for protein similarity search
- auteur
- Pierre Peterlongo, Laurent Noé, Dominique Lavenier, van Hoa Nguyen, Gregory Kucherov, Mathieu Giraud
- article
- BMC Bioinformatics, 2008, 9 (534), ⟨10.1186/1471-2105-9-534⟩
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-
- titre
- BioMAJ: a flexible framework for databanks synchronization and processing
- auteur
- Olivier Filangi, Yoann Beausse, Anthony Assi, Ludovic Legrand, Jean-Marc Larré, Véronique Martin, Olivier Collin, Christophe Caron, Hugues Leroy, David Allouche
- article
- Bioinformatics, 2008, 24 (16), pp.1823-1825. ⟨10.1093/bioinformatics/btn325⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Thirty Million Year-Old Inherited Heteroplasmy
- auteur
- V. Doublet, C. Souty-Grosset, D. Bouchon, R. Cordaux, I. Marcade
- article
- PLoS ONE, 2008, 3 (8), pp.e2938
- Accès au bibtex
-
- titre
- The human genome in the LINE of fire
- auteur
- R. Cordaux
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2008, 105, pp.19033-19034
- Accès au bibtex
-
- titre
- Impact of heat wave on brooks harbouring the white-clawed crayfish (Austropotamobius pallipes) in western France (Deux-Sèvres)
- auteur
- B. Renai, M.C. Trouilhe, B. Bourdon, E. Bachelier, B. Parinet, F. Grandjean, C. Souty-Grosset
- article
- Freshwater Crayfish, 2008, 16, pp.57-69
- Accès au bibtex
-
- titre
- Genetic variability of the threatened crayfish Austropotamobius italicus in Tuscany (Italy): implications for its management
- auteur
- S. Bertocchi, S. Brusconi, F. Gherardi, F. Grandjean, C. Souty-Grosset
- article
- Fundamental and Applied Limnology, 2008, 173, pp.153-164
- Accès au bibtex
-
- titre
- From Molecules to Organisms: Towards Multiscale Integrated Models of Biological Systems
- auteur
- Christophe Lavelle, Hugues Berry, Guillaume Beslon, Francisco Ginelli, Jean-Louis Giavitto, Zoï Kapoula, André Le Bivic, Nadine Peyriéras, Ovidiu Radulescu, Adrien Six, Véronique Thomas-Vaslin, Paul Bourgine
- article
- Theoretical Biology Insights, 2008, 1, pp.13-22
- Accès au bibtex
-
- titre
- Does Wolbachia influence survival in starved Armadillidium vulgare?
- auteur
- M. Lachat, Y. Caubet, D. Bouchon
- article
- Proceedings of the International Symposium of Terrestrial Isopod Biology, 2008, pp.125-130
- Accès au bibtex
-
- titre
- Viral cystatin evolution and three-dimensional structure modelling: a case of directional selection acting on a viral protein involved in a host-parasitoid interaction
- auteur
- S. Serbielle, S. Chowdhury, S. Pichon, S. Dupas, J. Lesobre, E. O. Purisima, J.-M. Drezen, E. Huguet
- article
- BMC Biology, 2008, 6 (1), pp.38
- Accès au bibtex
-
- titre
- Wolbachia Mediate Variation of Host Immunocompetence
- auteur
- C. Braquart-Varnier, M. Lachat, J. Herbiniere, M. Johnson, Y. Caubet, D. Bouchon, M. Sicard
- article
- PLoS ONE, 2008, 3 (9), pp.e3286
- Accès au bibtex
-
- titre
- Comparaison de deux critères en classification ascendante hiérarchique sous contrainte de contiguïté, Application en imagerie numérique
- auteur
- Israël-César Lerman, Kaddour Bachar
- article
- Journal de la Société Française de Statistique, 2008, 149 (2), pp.45-74
- Accès au bibtex
-
- titre
- Wolbachia in terrestrial isopods in Tunisia
- auteur
- H. Ben Afia Hatira, F. Charfi-Cheikhrouha, D. Bouchon
- article
- Proceedings of the International Symposium of Terrestrial Isopod Biology, 2008, pp.116-123
- Accès au bibtex
-
- titre
- A dynamic programming based reduction procedure for the multidimensional 0-1 knapsack problem
- auteur
- Stefan Balev, Nicola Yanev, Arnaud Fréville, Rumen Andonov
- article
- European Journal of Operational Research, 2008, 186 (1), pp.63-76. ⟨10.1016/j.ejor.2006.02.058⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- RDISK : une architecture reconfigurable pour l'exploration des banques génomiques
- auteur
- Dominique Lavenier
- article
- Techniques de l'Ingénieur, 2008, November (IN89)
- Accès au bibtex
-
- titre
- Reorganization and monophyly of the genus Rickettsiella: All in good time - Authors' reply
- auteur
- R. Cordaux, D. Bouchon
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 2008, 74 (16), pp.5264
- Accès au bibtex
-
- titre
- The diversity of reproductive parasites among arthropods: Wolbachia do not walk alone
- auteur
- O. Duron, D. Bouchon, S. Boutin, L. Bellamy, L. Zhou, J. Engelstadter, G. D. Hurst
- article
- BMC Biology, 2008, pp.6-27. ⟨10.1186/1741-7007-6-27⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Diversity of terrestrial isopods and habitats in Poitou-Charentes (western France)
- auteur
- C. Souty-Grosset, S. Corre, G. Freyssinel, V. Aubert, V. Donque, R. Raimond
- article
- Proceedings of the International Symposium of Terrestrial Isopod Biology (ISTIB07), 2008, pp.21-37
- Accès au bibtex
-
- titre
- Protein profiling of hemocytes from the terrestrial crustacean Armadillidium vulgare
- auteur
- J. Herbiniere, P. Greve, J.-M. Strub, D. Thierse, Frelon Raimond M., A. V. Dorsselaer, G. Martin, C. Braquart-Varnier
- article
- Developmental and Comparative Immunology, 2008, 32, pp.875-882. ⟨10.1016/j.dci.2008.01.007⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Plants may alter competition by modifying nutrient bioavailability in rhizosphere: a modeling approach
- auteur
- Xavier Raynaud, Benoit Jaillard, Paul W. Leadley
- article
- The American Naturalist, 2008, 171 (1), pp.44-58. ⟨10.1086/523951⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A physical map of the heterozygous grapevine 'Cabernet Sauvignon' allows mapping candidate genes for disease resistance
- auteur
- Marco Moroldo, Sophie Paillard, Raffaella Marconi, Fabrice Legeai, Aurélie Canaguier, Corinne Cruaud, Véronique de Berardinis, Cécile Guichard, Véronique Brunaud, Isabelle Le Clainche, Simone Scalabrin, Raffaele Testolini, Gabriele Di Gaspero, Michele Morgante, Anne-Françoise Adam-Blondon
- article
- BMC Plant Biology, 2008, 8 (66), pp.1-14. ⟨10.1186/1471-2229-8-66⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Breeding system, pollinator choice and variation in pollen quality in British herbaceous plants
- auteur
- M. E. Hanley, M. Franco, S. Pichon, B. Darvill, D. Goulson
- article
- Functional Ecology, 2008, 22, pp.592-598. ⟨10.1111/j.1365-2435.2008.01415.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Isolation and identification of entomopathogenic nematodes and their symbiotic bacteria from Hérault and Gard (Southern France)
- auteur
- V. Emelianoff, N. Le Brun, Sylvie Pages, P. Stock, P. Tailliez, C. Moulia, M. Sicard
- article
- Journal of Invertebrate Pathology, 2008, 98 (2), pp.211-217. ⟨10.1016/j.jip.2008.01.006⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Pathogenic effect of entomopathogenic nematode-bacterium complexes on terrestrial isopods
- auteur
- M. Sicard, M. Raimond, O. Prats, A. Lafitte, C. Braquart-Varnier
- article
- Journal of Invertebrate Pathology, 2008, 99, pp.20-27. ⟨10.1016/j.jip.2008.02.001⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Zinc distribution and speciation in roots of various genotypes of tobacco exposed to Zn
- auteur
- Anne Straczek, Geraldine Sarret, Alain Manceau, Philippe Hinsinger, Nicolas Geoffroy, Benoit Jaillard
- article
- Environmental and Experimental Botany, 2008, 63, pp.80-90
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Robust simplifications of multiscale biochemical networks
- auteur
- Ovidiu Radulescu, Alexander N. Gorban, Andrei Zinovyev, Alain Lilienbaum
- article
- BMC Systems Biology, 2008, 2:86
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modeling synthetic lethality
- auteur
- Nolwenn Le Meur, Robert Gentleman
- article
- Genome Biology, 2008, 9 (9), pp.R135. ⟨10.1186/gb-2008-9-9-r135⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modulation of social interactions by immune stimulation in honey bee, Apis mellifera, workers
- auteur
- F.-J. Richard, A. Aubert, Cm Grozinger
- article
- BMC Biology, 2008, 6, pp.50. ⟨10.1186/1741-7007-6-50⟩
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-
- titre
- Low migration decreases interference competition among parasites and increases virulence
- auteur
- F. Vigneux, F. Bashey, M. Sicard, C.M. Lively
- article
- Journal of Evolutionary Biology, 2008, 21 (5), pp.1245-1251. ⟨10.1111/j.1420-9101.2008.01576.x⟩
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-
- titre
- Geographical variability of aggregation in terrestrial isopods: What is the actual significance of such behaviour?
- auteur
- Y. Caubet, G. O'Farrell, Fabrice Lefebvre
- article
- Proceedings of the International Symposium of Terrestrial Isopod Biology, 2008, pp.137-148
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-
- titre
- Coding Region Prediction Based on a Universal DNA Sequence Representation Method
- auteur
- Dominique Lavenier, Xianyang Jiang, Stephen Yau
- article
- Journal of Computational Biology, 2008, 15 (10), pp.1237-1256. ⟨10.1089/cmb.2008.0041⟩
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-
- titre
- Inferring the role of transcription factors in regulatory networks
- auteur
- Philippe Veber, Carito Guziolowski, Michel Le Borgne, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel
- article
- BMC Bioinformatics, 2008, 9, ⟨10.1186/1471-2105-9-228⟩
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-
- titre
- Dynamic and static limitation in multiscale reaction networks, revisited
- auteur
- Alexander N. Gorban, Ovidiu Radulescu
- article
- Chemical Engineering Science, 2008, Advances in Chemical Engineering, 34, pp.103-173
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-
- titre
- Lagrangian approaches for a class of matching problems in computational biology
- auteur
- Nicola Yanev, Rumen Andonov, Philippe Veber, Stefan Balev
- article
- Computers & Mathematics with Applications, 2008, 55 (Issue 5 (March 2008)), pp.1054-1067. ⟨10.1016/j.camwa.2006.12.103⟩
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-
- titre
- Homology modelling of protein-protein complexes: a simple method and its possibilities and limitations
- auteur
- Guillaume Launay, Thomas Simonson
- article
- BMC Bioinformatics, 2008, 9, pp.427
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-
- titre
- Boundary of central tiles associated with Pisot beta-numeration and purely periodic expansions
- auteur
- Shigeki Akiyama, Guy Barat, Valerie Berthe, Anne Siegel
- article
- Monatshefte für Mathematik, 2008, 155 (3-4), pp.377-419. ⟨10.1007/s00605-008-0009-7⟩
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-
- titre
- Low genetic variability of the white-clawed crayfish in the Iberian Peninsula : its origin and management implications
- auteur
- J. Dieguez-Uribeondo, F. Royo, C. Souty-Grosset, A. Ropiquet, F. Grandjean
- article
- Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 2008, 18, pp.19-31. ⟨10.1002/aqc.811⟩
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-
- titre
- Characterization and transcriptional analysis of two gene clusters for type IV secretion machinery in Wolbachia of Armadillidium vulgare
- auteur
- C. Felix, S. Pichon, C. Braquart-Varnier, H. Braig, Lin Chen, R. A. Garrett, G. Martin, P. Greve
- article
- Research in Microbiology, 2008, 159 (6), pp.481-485. ⟨10.1016/j.resmic.2008.05.007⟩
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-
- titre
- ISWpi1 from Wolbachia pipientis defines a novel group of insertion sequences within the IS5 family
- auteur
- R. Cordaux
- article
- Gene, 2008, 409, pp.20-27. ⟨10.1016/j.gene.2007.10.035⟩
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-
Communication dans un congrès
- titre
- Efficient Parallelization of a Protein Sequence Comparison Algorithm on Manycore Architecture
- auteur
- Xioachun Ye, van Hoa Nguyen, Dominique Lavenier, Dongrui Fan
- article
- Ninth International Conference on Parallel and Distributed Computing, Applications and Technologies, Dec 2008, France. online proceedings: http://www.cs.otago.ac.nz/pdcat08/
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-
- titre
- In silico investigation of ADAM12 effect on TGF-beta receptors trafficking
- auteur
- Jérémy Gruel, Nolwenn Le Meur, Michel Le Borgne, Nathalie Théret
- article
- IPG 2008, Nov 2008, Lyon, France
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-
- titre
- Transfert d'une observation exploratoire à partir du guide européen : l'expérimentation de Chapelle-lez-Herlaimont
- auteur
- Laurence Meire, Carine de Noose, Jean-Marie Delvoye
- article
- In International Conference of Territorial Intelligence, Besançon 2008., Oct 2008, Besançon, France. pp.10
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-
- titre
- Speed up SVM Algorithms for Massive Classification Tasks
- auteur
- Thanh Nghi Do, van Hoa Nguyen, François Poulet
- article
- Advanced Data Mining and Applications - 4th International Conference, ADMA'08, Oct 2008, Chengdu, China. pp.147-157
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-
- titre
- CURATING A LARGE-SCALE REGULATORY NETWORK BY EVALUATING ITS CONSISTENCY WITH EXPRESSION DATASETS
- auteur
- Carito Guziolowski, Jérémy Gruel, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel
- article
- CIBB 2008: COMPUTATIONAL INTELLIGENCE METHODS FOR BIOINFORMATICS AND BIOSTATISTICS, Oct 2008, Salerno, Italy. pp.144-155
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-
- titre
- Parallelizing the ACGT OncoSimulator
- auteur
- Dominique Lavenier, Julien Jacques
- article
- 3rd International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology, Sep 2008, Istanbul, Turkey. online proceedings: http://www.3rd-iarwiso.iccs.ntua.gr/
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-
- titre
- GPU Accelerated RNA-RNA Interaction Algorithm
- auteur
- Guillaume Rizk, Dominique Lavenier
- article
- EMBnet, Sep 2008, Martina Franca, Italy
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-
- titre
- An Efficient Lagrangian Relaxation for the Contact Map Overlap Problem
- auteur
- Rumen Andonov, Nicola Yanev, Noël Malod-Dognin
- article
- WABI 2008 (8th Workshop on Algorithms in Bioinformatics), Universität Karlsruhe, Sep 2008, Karlsruhe, Germany. pp.162-173, ⟨10.1007/978-3-540-87361-7_14⟩
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-
- titre
- A Fast Parallel SVM Algorithm for Massive Classification Tasks
- auteur
- Thanh Nghi Do, van Hoa Nguyen, François Poulet
- article
- Modelling, Computation and Optimization, 2nd International Conference, MCO 2008, Sep 2008, Metz, France. pp.419-428
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-
- titre
- In-place Update of Suffix Array while Recoding Words
- auteur
- Matthias Gallé, Pierre Peterlongo, François Coste
- article
- Prague Stringology Conference 2008, Sep 2008, Prague, Czech Republic. pp.54--67
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-
- titre
- Timescales and instabilities of shear thinning solutions of wormlike micelles
- auteur
- Ovidiu Radulescu, Sandra Lerouge, Benoit Lasne
- article
- 15th International Congress on Rheology 2008, Aug 2008, Monterey, United States. pp.CF36
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-
- titre
- GEO EXPORTER : a tools to automate publishing of microarray data to Gene Expression Omnibus
- auteur
- François Moreews
- article
- ISMB 2008, The International Society for Computational Biology, Jul 2008, Toronto, Canada
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-
- titre
- Speeding up Subset Seed Algorithm for Intensive Protein Sequence Comparison
- auteur
- van Hoa Nguyen, Dominique Lavenier
- article
- 6th IEEE International Conference on research, innovation & vision for the future, Jul 2008, Ho Chi Minh Ville, Vietnam
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-
- titre
- Apollo: a tool for the manual annotation of the pea aphid genome
- auteur
- Fabrice Legeai, Jean-Pierre Gauthier, Denis Tagu
- article
- Pea Aphid Genome Annotation Workshop, Jul 2008, Princeton, United States
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-
- titre
- BioWorkFlow: Web Services toolkit and workflow applications evaluation to deploy a confidence network
- auteur
- Marc Wessner, Martin Senger, Franck Samson, Philippe Picouet, François Moreews, Hervé Ménager, Véronique Martin, Sébastien Letort, Catherine Letondal, Mark Hoebeke, Jerome Gouzy, Jean-François Gibrat, Erwan Corre, Olivier Collin, Sébastien Carrere, Christophe Caron, Pierre Tufféry, Bertrand Néron
- article
- Jobim (Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques), Jun 2008, Lille, France
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-
- titre
- Comparaison intensive des séquences protéiques : indexation des banques et usage des instructions SIMD des microprocesseurs
- auteur
- van Hoa Nguyen, Dominique Lavenier
- article
- Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM, Jun 2008, Lille, France
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-
- titre
- A minimal and dynamic model for fatty acid metabolism in mouse liver
- auteur
- Pierre Blavy, Florence Gondret, Hervé Guillou, Sandrine Lagarrigue, Pascal G.P. Martin, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel, Jaap J. van Milgen
- article
- Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jun 2008, Lille (FR), France
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-
- titre
- Directed binary hierarchies and directed ultrametrics
- auteur
- Pascale Kuntz, Israël-César Lerman
- article
- First joint meeting of the French and Italian Classification Societies, Jun 2008, Caserte, Italy. pp.337-340
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-
- titre
- Ordered Index Seed Algorithm for Intensive DNA Sequence Comparison
- auteur
- Dominique Lavenier
- article
- HiCOMB 2008 : Seventh IEEE International Workshop on High Performance Computational Biology, Apr 2008, Miami, United States. online proceeding : http://www.hicomb.org/HiCOMB2008/
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-
- titre
- Analyse de la Vraisemblance des Liens Relationnels
- auteur
- Israël-César Lerman
- article
- 3èmes Journées Thématiques Apprentissage Artificiel et Fouille des Données, Younès Benani, Apr 2008, Paris, France
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-
- titre
- Modèle de PLNE pour la recherche de cliques de poids maximal
- auteur
- Noël Malod-Dognin, Rumen Andonov, Nicola Yanev, Jean-François Gibrat
- article
- ROADEF 2008, Institut Supérieur d'Informatique, de Modélisation et de leurs Applications, Feb 2008, Clermont-Ferrand, France
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-
- titre
- Parallélisation de la recherche de similarités entre séquences protéiques sur GPU
- auteur
- van Hoa Nguyen, Dominique Lavenier
- article
- RenPar'18 : Rencontres francophones du Parallélisme, Feb 2008, Fribourg, Suisse
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-
- titre
- Contribution To The Annotations Of The Chicken 20K Oligo Microarray Of ARK-Genomics
- auteur
- Christophe C. Klopp, François Moreews, Marc Aubry, Sandrine Lagarrigue
- article
- International Plant & Animal Genomes XVI Conference, Jan 2008, San Diego, United States
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-
- titre
- Transcriptome Profiling Of Feeding-To-Fasting Transition In Chicken Liver Using A Chicken 20K Oligo Microarray
- auteur
- Colette Désert, Pierre Blavy, François Moreews, Michel Jacques M.J. Duclos, Pascale Le Roy, Madeleine Douaire, Christian Diot
- article
- International Plant & Animal Genomes XVI Conference, Jan 2008, San Diego, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Contribution to the annotation of the chicken 20K oligo microarray of ARK-genomics
- auteur
- C. Klopp, François Moreews, Marc Aubry, Sandrine Lagarrigue
- article
- Plant & Animal Genomes, XVI Conference, Jan 2008, San Diego (US), United States
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-
- titre
- Topological properties of central tiles and boundary graphs
- auteur
- Anne Siegel
- article
- Number Theory and Ergodic Theory, 2008, Kanazawa, Japan
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Evolutionary emergence of genes through retrotransposition
- auteur
- R. Cordaux, M.A. Batzer
- article
- Encyclopedia of Life Sciences: Handbook of Human Molecular Evolution, D.N. Cooper & H. Kehrer-Sawatzki Eds., pp.1-8, 2008, ⟨10.1002/9780470015902.a0020783⟩
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-
- titre
- Feminizing / Wolbachia/ and the evolution of sex determination in isopods
- auteur
- D. Bouchon, R. Cordaux, P. Greve
- article
- K. Bourtzis and T. Miller. Insect Symbiosis, Taylor and Francis Group LLC, pp.273-294, 2008
- Accès au bibtex
-
HDR
- titre
- Analyse de systèmes dynamiques par discrétisation. Exemples d'applications en théorie des nombres et en biologie moléculaire
- auteur
- Anne Siegel
- article
- Mathématiques [math]. Université Rennes 1, 2008
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Syntaxe, raisonnement et génomes
- auteur
- Jacques Nicolas
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. Université Rennes 1, 2008
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Autre publication scientifique
- titre
- Architecture flexible pour la stéréovision embarquée
- auteur
- Mehdi Darouich, Stephane Guyetant, Dominique Lavenier
- article
- 2008
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-
Ouvrages
- titre
- Grammatical Inference: Algorithms and Applications 9th International Colloquium, ICGI 2008 Saint-Malo, France, September 22-24, 2008 Proceedings
- auteur
- François Coste, Laurent Miclet, Alexander Clark
- article
- Alexander Clark and François Coste and Laurent Miclet. Springer, 5278, pp.305, 2008, Lecture Notes in Artificial Intelligence, R. Goebel and J. Siekmann and W. Wahlster, 978-3-540-88008-0. ⟨10.1007/978-3-540-88009-7⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Special Issue: Journées Montoises d'informatique théorique (Rennes, 2006)
- auteur
- Didier Caucal, Anne Siegel
- article
- Caucal, Didier and Siegel, Anne. RAIRO - Theoretical Informatics and Applications, EDP Sciences, RAIRO - Theoretical Informatics and Applications 42(3), pp.240, 2008
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-
Rapport
- titre
- bioperl : Bibliothèque perl pour la modélisation et le traitement de données issues de la biologie
- auteur
- Fabrice Legeai
- article
- [Technical Report] 2008
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fine-grained parallelization of similarity search between protein sequences
- auteur
- van Hoa Nguyen, Dominique Lavenier
- article
- [Research Report] RR-6513, INRIA. 2008, pp.40
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling local repeats on genomic sequences
- auteur
- Jacques Nicolas, Christine Rousseau, Anne Siegel, Pierre Peterlongo, François Coste, Patrick Durand, Sébastien Tempel, Anne-Sophie Valin, Frédéric Mahé
- article
- [Research Report] RR-6802, INRIA. 2008, pp.43
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Parallel Reconfigurable Operator for Genomic Sequence Comparison: Architecture and Performance Analyses
- auteur
- Alexandre Cornu, Francois Dussaugey, Dominique Lavenier
- article
- [Research Report] RR-6776, INRIA. 2008
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Alignements multiples locaux et partiels de séquences protéiques à partir de paires de fragments alignables
- auteur
- Olivier Baldellon
- article
- [Stage] 2008, pp.17
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-
Thèse
- titre
- Apprentissage d'automates modélisant des familles de séquences protéiques
- auteur
- Goulven Kerbellec
- article
- Interface homme-machine [cs.HC]. Université Rennes 1, 2008. Français. ⟨NNT : ⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2007
Article dans une revue
- titre
- Molecular and Functional Characterization of a Na+-K+ Transporter from the Trk Family in the Ectomycorrhizal Fungus Hebeloma cylindrosporum.
- auteur
- Claire Corratgé, Sabine Zimmermann, Raphaël Lambilliotte, Claude Plassard, Roland Marmeisse, Jean-Baptiste Thibaud, Benoît Lacombe, Hervé Sentenac
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2007, 282 (36), pp.26057-26066. ⟨10.1074/jbc.M611613200⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Characterization of the Interaction Between the Bacterial Wilt Pathogen Ralstonia solanacearum and the Model Legume Plant Medicago truncatula
- auteur
- Fabienne Vailleau, Elodie Sartorel, Marie-Françoise Jardinaud, Fabien Chardon, Stéphane Genin, Thierry Huguet, Laurent Gentzbittel, Michel Petitprez
- article
- Molecular Plant-Microbe Interactions, 2007, vol. 20 n° 2., pp.159-167
- Accès au bibtex
-
- titre
- Dynamical robustness of biological networks with hierarchical distribution of time scales
- auteur
- Alexander N. Gorban, Ovidiu Radulescu
- article
- IET Systems Biology, 2007
- Accès au bibtex
-
- titre
- Model-based Identification of Helitrons Results in a New Classification of Their Families in Arabidopsis thaliana
- auteur
- Sébastien Tempel, Jacques Nicolas, Abdelhak El Amrani, Ivan Couée
- article
- Gene, 2007, 403 (1-2), ⟨10.1016/j.gene.2007.06.030⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An automatic calibration approach for left ventricular volume assessment
- auteur
- P. Beatrice, V. Regis, D. Philippe, P. Remy, P. Francoise, F. Gerard
- article
- Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, 2007, 2007, pp.4460--4463
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Reconfigurable Index FLASH Memory tailored to Seed-Based Genomic Sequence Comparison Algorithms
- auteur
- Dominique Lavenier, Gilles Georges, Xinchun Liu
- article
- The Journal of VLSI Signal, 2007, 48 (3), pp.255-269. ⟨10.1007/s11265-007-0073-6⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Purely Periodic beta-Expansions in the Pisot Non-unit Case
- auteur
- Valerie Berthe, Anne Siegel
- article
- Journal of Number Theory, 2007, 127 (2), pp.153-172. ⟨10.1016/j.jnt.2007.07.005⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Assessing the quality of dissolved organic matter in forest soils using ultraviolet absorption spectrophotometry
- auteur
- Jérôme Jaffrain, F. Gérard, Michel Meyer, J. Ranger
- article
- Soil Science Society of America Journal, 2007, 71 (6), pp.1851-1858. ⟨10.2136/sssaj2006.0202⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Large Gene Family Expansion and Variable Selective Pressures for Cathepsin B in Aphids
- auteur
- Claude Rispe, Mayako Kutsukabe, Vincent Doublet, Sylvie Hudaverdian, Fabrice Legeai, Jean-Christophe Simon, Denis Tagu, Takema Fukatsu
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2007, 25 (Oct 13), pp.5-17. ⟨10.1093/molbev/msm222⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Théorèmes limites pour des processus de Markov à sauts. Synthèse des résultats et applications en biologie moleculaire
- auteur
- Ovidiu Radulescu, Aurélie Muller, Alina Crudu
- article
- Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série TSI : Technique et Science Informatiques, 2007, 26 (3-4), pp.443-469. ⟨10.3166/tsi.26.443-469⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Intracellular bacteria in mushrooms, the hidden face of mycology
- auteur
- J. Bertaux, J. Garbaye Klett, P. Frey
- article
- Biofutur, 2007, 283, pp.35-38
- Accès au bibtex
-
- titre
- Path-equivalent developments in acyclic weighted automata
- auteur
- Mathieu Giraud, Philippe Veber, Dominique Lavenier
- article
- International Journal of Foundations of Computer Science, 2007, 18 (4), pp.799-812. ⟨10.1142/S012905410700498X⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Doc'UMVF: Two search tools to provide quality-controlled teaching resources in French to students and teachers
- auteur
- Marc Cuggia, Stéfan Darmoni, Nicolas Garcelon, Lina Soualmia, Annabel Bourdé
- article
- International Journal of Medical Informatics, 2007, 6 (5), pp.357-362. ⟨10.1016/j.ijmedinf.2007.01.001⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mapping sequences by parts
- auteur
- Gilles Didier, Carito Guziolowski
- article
- Algorithms for Molecular Biology, 2007, 2, pp.11. ⟨10.1186/1748-7188-2-11⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Checking Consistency Between Expression Data and Large Scale Regulatory Networks: A Case Study
- auteur
- Carito Guziolowski, Philippe Veber, Michel Le Borgne, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel
- article
- Journal of Biological Physics and Chemistry, 2007, 7, pp.37-43
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An Internet supported workflow for the publication process in UMVF (French Virtual Medical University)
- auteur
- Jean-Marie Renard, Annabel Bourdé, Marc Cuggia, Nicolas Garcelon, Nathalie Souf, Stéfan Darmoni, Régis Beuscart, Jean-Marc Brunetaud
- article
- International Journal of Medical Informatics, 2007, 76 (5), pp.363-368
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimiser un plan d'expérience à partir de modèles qualitatifs?
- auteur
- Anne Siegel, Carito Guziolowski, Philippe Veber, Ovidiu Radulescu, Michel Le Borgne
- article
- Biofutur, 2007, 275, pp.27-31
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How does a symbiotic fungus modulate expression of its host-plant nitrite reductase?
- auteur
- Julie Bailly, Jean-Claude Debaud, Marie-Christine Verner, Claude Plassard, Michel Chalot, Roland Marmeisse, Laurence Fraissinet-Tachet
- article
- New Phytologist, 2007, 175 (1), pp.155-165. ⟨10.1111/j.1469-8137.2007.02066.x⟩
- Accès au bibtex
-
Communication dans un congrès
- titre
- GridR: An R-based grid-enabled tool for data analysis in ACGT clinico-genomics trials
- auteur
- Dennis Wegener, Thierry Sengstag, Stelios Sfakianakis, Stefan Rüping, Anthony Assi
- article
- 3rd IEEE International Conference on e-Science and Grid Computing, Dec 2007, Bangalore, India
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Représentation par jeux du chaos de séquences d'ADN
- auteur
- Thibaut Henin
- article
- Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, Sep 2007, Chessy, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Protein similarity search with subset seeds on a dedicated reconfigurable hardware
- auteur
- Pierre Peterlongo, Laurent Noé, Dominique Lavenier, Gilles Georges, Julien Jacques, Gregory Kucherov, Mathieu Giraud
- article
- Parallel Bio-Computing, Sep 2007, Gdansk,, Poland
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sur les différentes expressions formelles d'une hiérarchie binaire symétrique ou implicative
- auteur
- Israël-César Lerman
- article
- XIV Rencontres de la Société Francophone de Classification, École Nationale des Télécommunications de Paris, Sep 2007, Paris, France. pp.139-142
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mise à jour incrémentale de tableau des suffxes en cours de recodage
- auteur
- François Coste, Pierre Peterlongo, Matthias Gallé
- article
- Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, Sep 2007, Chessy, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Qualitative response of interaction networks: application to the validation of biological models
- auteur
- Anne Siegel, Carito Guziolowski, Philippe Veber, Ovidiu Radulescu, Michel Le Borgne
- article
- 6th International Congress on Industrial and Applied Mathematics. ICIAM 07, Jul 2007, Zurich, Switzerland
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparaison de deux critères de la CAH sous contrainte de contiguïté spatiale
- auteur
- Kaddour Bachar, Israël-César Lerman
- article
- 39-èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2007, Angers, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Topological properties of central tiles for substitutions
- auteur
- Anne Siegel, Jorg Thuswaldner
- article
- Journées de Numération, Apr 2007, Graz, Austria
- Accès au bibtex
-
- titre
- Détection de domaines dans des séquences génomiques : un problème de couverture optimale
- auteur
- Philippe Veber, Sébastien Tempel, Rumen Andonov, Dominique Lavenier, Jacques Nicolas
- article
- FRANCORO V/ROADEF 2007, Feb 2007, Grenoble, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Problème d'optimisation de recherche de cliques pour caractériser des familles de protéines
- auteur
- François Coste, Goulven Kerbellec
- article
- ROADEF 2007, Universités de Grenoble, Feb 2007, Grenoble, France. pp.157--158
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Recent advances in solving the protein threading problem
- auteur
- Rumen Andonov, Guillaume Collet, Jean-François Gibrat, Antoine Marin, Vincent Poirriez, Nicola Yanev
- article
- Talbi, El-Ghazali and Zomaya, Albert Y. Grid Computing for Bioinformatics and Computational Biology, Wiley, pp.325-356, 2007, 978-0-471-78409-8
- Accès au bibtex
-
- titre
- A New Probabilistic Measure of Interestingness for Association Rules, Based on the Likelihood of the Link
- auteur
- Israël-César Lerman, Jérôme Azé
- article
- Guillet, F. and Hamilton, H. Quality Measures in Data Mining. Studies in Computational Intelligence, Springer, pp.207-236, 2007
- Accès au bibtex
-
- titre
- Representation of Concept Description by Multivalued Taxonomic Preordonance Variables
- auteur
- Israël-César Lerman, Philippe Peter
- article
- Brito, P. and Bertrand, P. and Cucumel, G. and de Carvalho, F. Selected Contributions in Data Analysis and Classification, Springer, pp.271-284, 2007, Studies in Classification, Data Analysis, and Knowledge organization
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-
Autre publication scientifique
- titre
- BioMAJ : A workflow engine dedicated to biological bank management
- auteur
- David Allouche, Anthony Assi, Yoann Beausse, Christophe Caron, Olivier Filangi, Jean-Marc Larré, Hugues Leroy, Véronique Martin
- article
- 2007
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-
- titre
- POGG: Integrating qualitative and quantitative data of macromolecular networks. A probabilistic toolbox
- auteur
- Etienne Giraudet, Eric Docet, Jérémie Bourdon
- article
- 2007
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-
Rapport
- titre
- Parsing avec erreurs par un protomate
- auteur
- Jessie Mahé
- article
- [Stage] 2007, pp.45
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-
- titre
- Towards Structural Classification of Proteins based on Contact Map Overlap
- auteur
- Rumen Andonov, Nicola Yanev, Noël Malod-Dognin
- article
- [Research Report] RR-6370, INRIA. 2007, pp.20
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-
- titre
- Decision Diagrams for Qualitative Biological Models
- auteur
- Michel Le Borgne, Philippe Veber
- article
- [Research Report] RR-6182, INRIA. 2007, pp.17
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-
- titre
- Checking Consistency Between Expression Data and Large Scale Regulatory Networks: A Case Study
- auteur
- Carito Guziolowski, Philippe Veber, Michel Le Borgne, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel
- article
- [Research Report] RR-6190, INRIA. 2007, pp.14
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-
- titre
- Recent Advances in Solving the Protein Threading Problem
- auteur
- Rumen Andonov, Guillaume Collet, Jean-François Gibrat, Antoine Marin, Vincent Poirriez, Nicola Yanev
- article
- [Research Report] RR-6253, INRIA. 2007, pp.41
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-
- titre
- Towards Structural Classification of Proteins based on Contact Map Overlap
- auteur
- Rumen Andonov, Nicola Yanev, Noël Malod-Dognin
- article
- [Research Report] PI 1872, 2007, pp.22
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-
- titre
- A Novel Algorithm for Finding Maximum Common Ordered Subgraph
- auteur
- Nicola Yanev, Rumen Andonov
- article
- [Research Report] RR-6287, INRIA. 2007, pp.18
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-
- titre
- Boundary of central tiles associated with Pisot beta-numeration and purely periodic expansions
- auteur
- Shigeki Akiyama, Guy Barat, Valerie Berthe, Anne Siegel
- article
- [Research Report] 2007
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-
- titre
- In-place updating suffix arrays for grammatical inference
- auteur
- Matthias Gallé
- article
- [Internship report] 2007
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-
- titre
- Recherche de modules dans le réseau MAPK
- auteur
- Laurent Chamoin
- article
- [Internship report] 2007
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-
- titre
- Recent Advances in Solving the Protein Threading Problem
- auteur
- Rumen Andonov, Guillaume Collet, Jean-François Gibrat, Antoine Marin, Vincent Poirriez, Nicola Yanev
- article
- [Research Report] PI 1856, 2007, pp.38
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-
- titre
- Inferring the role of transcription factors in regulatory networks
- auteur
- Philippe Veber, Carito Guziolowski, Michel Le Borgne, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel
- article
- [Research Report] 2007
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-
- titre
- Logol : Modelling evolving sequence families through a dedicated constrained string language
- auteur
- Catherine Belleannée, Jacques Nicolas
- article
- [Research Report] RR-6350, INRIA. 2007, pp.19
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-
Thèse
- titre
- Modélisation grande échelle de réseaux biologiques : vérification par contraintes booléennes de la cohérence des données
- auteur
- Philippe Veber
- article
- Génie logiciel [cs.SE]. Université Rennes 1, 2007. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Dynamique des hélitrons dans le genome d'Arabidopsis thaliana : développement de nouvelles stratégies d'analyse des éléments transposables
- auteur
- Sébastien Tempel
- article
- Biochimie [q-bio.BM]. Université Rennes 1, 2007. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
2006
Article dans une revue
- titre
- Browsing repeats in genomes : Pygram and an application to non-coding region analysis.
- auteur
- Patrick Durand, Frédéric Mahé, Anne-Sophie Valin, Jacques Nicolas
- article
- BMC Bioinformatics, 2006, 7, pp.477. ⟨10.1186/1471-2105-7-477⟩
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-
- titre
- Symbiologik : jouez avec les gènes
- auteur
- Nicolas Deroche, Mathieu Giraud
- article
- Interstices, 2006
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-
- titre
- Rhizosphere: A new frontier for soil biogeochemistry
- auteur
- Philippe Hinsinger, Claude Plassard, Benoît Jaillard
- article
- Journal of Geochemical Exploration, 2006, 88 (1-3), pp.210-213. ⟨10.1016/j.gexplo.2005.08.041⟩
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-
- titre
- Fractal representation of the attractive lamination of an automorphism of the free group
- auteur
- Pierre Arnoux, Valerie Berthe, Arnaud Hilion, Anne Siegel
- article
- Annales de l'Institut Fourier, 2006, 56 (7), pp.2161-2212. ⟨10.5802/aif.2237⟩
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-
- titre
- Qualitative analysis of the relation between DNA microarray data and behavioral models of regulation networks
- auteur
- Anne Siegel, Ovidiu Radulescu, Michel Le Borgne, Philippe Veber, Julien Ouy, Sandrine Lagarrigue
- article
- BioSystems, 2006, 84, pp.153-174
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-
- titre
- Soil arsenic availability and the transfer of soil arsenic to crops in suburban areas in Fujian Province, southeast China
- auteur
- Rui-Qing Huang, Shu-Fang Gao, Wei-Ling Wang, Siobhan Staunton, Guo Wang
- article
- Science of the Total Environment, 2006, 368 (2-3), pp.531-541. ⟨10.1016/j.scitotenv.2006.03.013⟩
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-
- titre
- Influence of salinity and abscisic acid on the O-2 uptake by N-2-fixing nodules of common bean
- auteur
- M. Jebara, S. Harzalli-Jebara, M-Helene Payré, M.E. Aouani, Jean-Jacques Drevon
- article
- Biologia Plantarum, 2006, 50 (4), pp.717-721. ⟨10.1007/s10535-006-0114-1⟩
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-
- titre
- Coefficient numérique général de discrimination de classes d'objets par des variables de types quelconques. Application à des données génotypiques
- auteur
- Israël-César Lerman
- article
- Revue de Statistique Appliquée, 2006, Revue de Statistique Appliquée, 54 (2), pp.33-63
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-
- titre
- Topology and static response of interaction networks in molecular biology
- auteur
- Ovidiu Radulescu, Sandrine Lagarrigue, Anne Siegel, Philippe Veber, Michel Le Borgne
- article
- Journal of the Royal Society Interface, 2006, 3 (6), pp.185 - 196. ⟨10.1098/rsif.2005.0092⟩
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-
- titre
- GenoLink: a graph-based querying and browsing system for investigating the function of genes and proteins
- auteur
- Patrick Durand, Laurent Labarre, Alain Meil, Jean-Louis Divo1, Yves Vandenbrouck, Alain Viari, Jérôme Wojcik
- article
- BMC Bioinformatics, 2006, 7 (1), pp.21. ⟨10.1186/1471-2105-7-21⟩
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-
- titre
- Nitrogen from senescing lower leaves of common bean is re-translocated to nodules and might be involved in a N-feedback regulation of nitrogen fixation
- auteur
- Stephanie A. Fischinger, Jean-Jacques Drevon, Norbert Claassen, Joachim Schulze
- article
- Journal of Plant Physiology, 2006, 163 (10), pp.987-995. ⟨10.1016/j.jplph.2006.03.017⟩
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-
- titre
- Verification and intercomparison of reactive transport codes to describe root-uptake
- auteur
- Bernd Nowack, K. U. Mayer, S. E. Oswald, W. van Beinum, C. A. J. Appelo, Didier Jacques, Piet Seuntjens, Frédéric Gérard, Benoît Jaillard, Andrea Schnepf, T. Roose
- article
- Plant and Soil, 2006, 285 (1-2), pp.305-321. ⟨10.1007/s11104-006-9017-3⟩
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-
- titre
- Genotypic variation of N-2-fixing common bean (Phaseolus vulgaris L.) in response to iron deficiency
- auteur
- Abdelmajid Krouma, Jean-Jacques Drevon, Chedly Abdelly
- article
- Journal of Plant Physiology, 2006, 163 (11), pp.1094-1100. ⟨10.1016/j.jplph.2005.08.013⟩
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-
- titre
- Domain organization within repeated DNA sequences: application to the study of a family of transposable elements.
- auteur
- Sébastien Tempel, Mathieu Giraud, Dominique Lavenier, Israël-César C. Lerman, Anne-Sophie Valin, Ivan Couée, Abdelhak El Amrani, Jacques Nicolas
- article
- Bioinformatics, 2006, 22(16), pp.1948-1954
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-
- titre
- Fate of prions in soil: Adsorption and extraction by electroelution of recombinant ovine prion protein from montmorillonite and natural soils
- auteur
- Peggy Rigou, Human Rezaei, Jeanne Grosclaude, Siobhan Staunton, Herve Quiquampoix
- article
- Environmental Science and Technology, 2006, 40 (5), pp.1497-1503. ⟨10.1021/es0516965⟩
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-
- titre
- Découverte et analyse de signatures à grande échelle dans les protéines amyloïdes.
- auteur
- Sandrine Pawlicki, Anne-Sophie Valin, Mathieu Giraud, Gilles Georges, Christian Delamarche, Grégory Ranchy
- article
- Regard sur la biochimie, 2006, pp.1-12
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-
- titre
- Rhizosphere - perspectives and challenges - a tribute to Lorenz Hiltner 12-17 September 2004 - Munich, Germany
- auteur
- Philippe Hinsinger, Petra Marschner
- article
- Plant and Soil, 2006, 283 (1-2), pp.VII-VIII. ⟨10.1007/s11104-006-0057-5⟩
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-
- titre
- Evolution of water-extractable copper in soil with time as a function of organic matter amendments and aeration
- auteur
- Guo Wang, Siobhan Staunton
- article
- European Journal of Soil Science, 2006, 57 (3), pp.372-380. ⟨10.1111/j.1365-2389.2005.00748.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- JUICE: a data management system that facilitates the analysis of large volumes of information in an EST project workflow
- auteur
- Mariano Latorre, Herman Silva, Juan Saba, Carito Guziolowski, Paula Vizoso, Veronica Martinez, Jonathan Maldonado, Andrea Morales, Rodrigo Caroca, Veronica Cambiazo, Reinaldo Campos-Vargas, Mauricio Gonzalez, Ariel Orellana, Julio Retamales, Lee a Meisel
- article
- BMC Bioinformatics, 2006, 7, pp.513. ⟨10.1186/1471-2105-7-513⟩
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-
- titre
- Accurate prediction of BRCA1 and BRCA2 heterozygous genotype using expression profiling after induced DNA damage.
- auteur
- Zsofia Kote-Jarai, Lucy Matthews, Ana Osorio, Susan Shanley, Ian Giddings, François Moreews, Imogen Locke, Gareth Evans, Diana Eccles
- article
- Clinical Cancer Research, 2006, Clin Cancer Res. 2006 Jul 1;12(13):3896-901
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-
Communication dans un congrès
- titre
- Seed-based Genomic Sequence Comparison using a FPGA/FLASH Accelerator
- auteur
- Dominique Lavenier, Liu Xinchun, Gilles Georges
- article
- International IEEE Conference on Field Programmable Technology, Dec 2006, Thailand. http://fpt.selfip.org/fpt06/program.php
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-
- titre
- Déterminants des stocks de carbone des sols des petites Antilles. Alternatives de séquestration du carbone et spatialisation des stocks actuels et simulés
- auteur
- Eric Blanchart, Martial Bernoux, Dominique D. Arrouays, Sébastien Lehmann, Yves-Marie Cabidoche
- article
- Séminaire GESSOL, Nov 2006, Paris, France
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-
- titre
- Soil clay concentrates prion protein and prion infectivity
- auteur
- Peggy Rigou, Sylvie Noinville, Yann Quenet, Human Rezaei, Siobhan Staunton, Herve Quiquampoix, Pierre Sarradin, Celine Barc, Frédéric F. Lantier, Patricia Berthon, Serge Bernard, Jeanne Grosclaude
- article
- Prion 2006, Oct 2006, Turin, Italy
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-
- titre
- Remix : une architecture pour la recherche dans les masses de données indexées
- auteur
- Gilles Georges, Steven Derrien, Stéphane Rubini, Frédéric Raimbault, Laurent Amsaleg, Dominique Lavenier
- article
- Symposium en archichecture de machines (Sympa) 2006, Oct 2006, Perpignan, France. pp.142-153
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-
- titre
- Finiteness properties for Pisot $S$-adic tilings
- auteur
- Pierre Arnoux, Valerie Berthe, Anne Siegel
- article
- Journées Montoises d'Informatique Théorique, Aug 2006, RENNES, France
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-
- titre
- A flexible model for protein fold recognition
- auteur
- Guillaume Collet, Nicola Yanev, Antoine Marin, Rumen Andonov, Jean-François Gibrat
- article
- Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2006, Bordeaux, France
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-
- titre
- Learning Automata on Protein Sequences
- auteur
- François Coste, Goulven Kerbellec
- article
- JOBIM, Jul 2006, Bordeaux, France. pp.199--210
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-
- titre
- Recherche dans les banques d'ADN par indexation parallèle
- auteur
- van Hoa Nguyen, Dominique Lavenier
- article
- RVIF, Feb 2006, HCM, Vietnam
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Implémentation d'un algorithme d'alignement semi-global utilisant des paramètres non locaux pour la reconnaissance de repliement
- auteur
- Guillaume Collet, Antoine Marin, Nicola Yanev, Rumen Andonov, Jean-François Gibrat
- article
- ROADEF, Feb 2006, Lilles, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fine-Grained Parallelism for Genomic Computation
- auteur
- Dominique Lavenier
- article
- Conference on Parallel Processing for Scientific Computing, Feb 2006, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Path-Equivalent Removal of Epsilon-Transitions
- auteur
- Dominique Lavenier, Philippe Veber, Mathieu Giraud
- article
- 2006, pp.23--33, ⟨10.1007/11812128_4⟩
- Accès au bibtex
-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- High-performance alignment methods for protein threading
- auteur
- Rumen Andonov, Stefan Balev, Nicola Yanev
- article
- Albert Zomaya. Parallel computing for bioinformatics and computational biology, Wiley, pp.427-457, 2006
- Accès au bibtex
-
Poster de conférence
- titre
- Fine root density, branching pattern and mycorrhizal diversity across Pinus pinaster stands in south west France: methodology and first results
- auteur
- Claude Plassard, Céline Meredieu, Mark Ronald M. R. Bakker, Frederic F. Danjon, Pierre Trichet, Jacques Guinberteau, Laurent Augusto, Etienne Saur, Odile Domergue, Antoine Galiana, Yves Prin, Mourad Ali, Denis Loustau
- article
- COST 38 Meeting, Roots, mycorrhizas and their external mycelia in carbon dynamics in forest soil, Sep 2006, Rovaniemi, Finland. n.p., 2006
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Rapport
- titre
- Lagrangian Approaches for a class of Matching Problems in Computational Biology
- auteur
- Nicola Yanev, Rumen Andonov, Philippe Veber, Stefan Balev
- article
- [Research Report] RR-5973, INRIA. 2006
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analyse logique, combinatoire et statistique de la construction d'une hiérarchie binaire implicative ; niveaux et noeuds significatifs
- auteur
- Israël-César Lerman
- article
- [Research Report] PI 1827, 2006, pp.45
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Représentation par Jeux du Chaos de séquences d'ADN
- auteur
- Thibaut Henin
- article
- [Stage] 2006
- Accès au bibtex
-
- titre
- Lagrangian Approaches for a class of Matching Problems in Computational Biology
- auteur
- Nicola Yanev, Rumen Andonov, Philippe Veber, Stefan Balev
- article
- [Research Report] PI 1814, 2006, pp.18
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2005
Article dans une revue
- titre
- Progressing the state-of-the-art in grammatical inference by competition
- auteur
- Starkie Bradford, François Coste, Menno van Zaanen
- article
- AI Communications, 2005, 18 (2), pp.93-115
- Accès au bibtex
-
- titre
- Accélérer l'exploration et l'analyse des textes des génomes
- auteur
- Dominique Lavenier
- article
- Interstices, 2005
- Accès au bibtex
-
- titre
- Diversity of ectomycorrhizal fungi naturally established on containerised Pinus seedlings in nursery conditions
- auteur
- Khalid El Karkouri, Francis Martin, J.P. Emmanuel Douzery, Daniel Mousain
- article
- Microbiological Research, 2005, 160 (1), pp.47-52. ⟨10.1016/j.micres.2004.09.008⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- P-deficiency increases the O-2 uptake per N-2 reduced in alfalfa
- auteur
- Joachim Schulze, Jean-Jacques Drevon
- article
- Journal of Experimental Botany, 2005, 56 (417), pp.1779-1784. ⟨10.1093/jxb/eri166⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Complex Qualitative Models in Biology: a new approach
- auteur
- Philippe Veber, Michel Le Borgne, Anne Siegel, Sandrine Lagarrigue, Ovidiu Radulescu
- article
- Complexus, 2005, 2, pp.140-151
- Accès au bibtex
-
- titre
- Variability in symbiotic nitrogen fixation among white landraces of common bean from the Iberian peninsula
- auteur
- A. Paula Rodiño, Marta Santalla, Antonio M. de Ron, Jean-Jacques Drevon
- article
- Symbiosis, 2005, 40 (2), pp.69-78
- Accès au bibtex
-
- titre
- Rhizosphere geometry and heterogeneity arising from root-mediated physical and chemical processes
- auteur
- Philippe Hinsinger, George R. Gobran, Peter J. Gregory, Walter W. Wenzel
- article
- New Phytologist, 2005, 168 (2), pp.293-303. ⟨10.1111/j.1469-8137.2005.01512.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fate of prions in soil: Trapped conformation of full-length ovine prion protein induced by adsorption on clays
- auteur
- M. Revault, Herve Quiquampoix, M.H. Baron, S. Noinville
- article
- Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2005, 1724 (3), pp.367-374. ⟨10.1016/j.bbagen.2005.05.005⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evolution of Sr distribution coefficient as a function of time, incubation conditions and measurement technique
- auteur
- Guo Wang, Siobhan Staunton
- article
- Journal of Environmental Radioactivity, 2005, 81 (2-3), pp.173-185. ⟨10.1016/j.jenvrad.2004.01.034⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The dog and rat olfactory receptor repertoires
- auteur
- Pascale Quignon, Mathieu Giraud, Maud Rimbault, Patricia Lavigne, Sandrine Tacher, Emmanuelle Morin, Elodie Retout, Anne-Sophie Valin, Kerstin Lindblad-Toh, Jacques Nicolas, Francis Galibert
- article
- Genome Biology, 2005, 6 (10), pp.R83. ⟨10.1186/gb-2005-6-10-r83⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A new mechanism of action for skin whitening agents: binding to the peroxisome proliferator-activated receptor
- auteur
- J. W. Wiechers, A. V. Rawlings, C. Garcia, C. Chesné, P. Balaguer, J. C. Nicolas, S. Corre, M.-D. Galibert
- article
- International Journal of Cosmetic Science, 2005, 27 (2), pp.123--132. ⟨10.1111/j.1467-2494.2004.00256.x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fate of prions in soil: Adsorption kinetics of recombinant unglycosylated ovine prion protein onto mica in laminar flow conditions and subsequent desorption
- auteur
- Elena N. Vasina, Philippe Dejardin, Human Rezaei, Jeanne Grosclaude, Herve Quiquampoix
- article
- Biomacromolecules, 2005, 6 (6), pp.3425-3432. ⟨10.1021/bm050492d⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Nodule conductance varied among common bean (Phaseolus vulgaris) genotypes under phosphorus deficiency
- auteur
- Moez Jebara, Mohamed Elarbi Aouani, M-Helene Payré, Jean-Jacques Drevon
- article
- Journal of Plant Physiology, 2005, 162 (3), pp.309-315. ⟨10.1016/j.jplph.2004.06.015⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Proton release by roots of Medicago murex and Medicago sativa growing in acidic conditions, and implications for rhizosphere pH changes and nodulation at low pH
- auteur
- Yu-Hsuan Cheng, J.G. Howieson, G.W. O'Hara, E.L.J. Watkin, Gerard Souche, Benoît Jaillard, Philippe Hinsinger
- article
- Soil Biology and Biochemistry, 2005, 36 (8), pp.1357-1365. ⟨10.1016/j.soilbio.2004.04.017⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Suffix-Tree Analyser (STAN): looking for nucleotidic and peptidic patterns in genomes
- auteur
- Jacques Nicolas, Patrick Durand, Grégory Ranchy, Sébastien Tempel, Anne-Sophie Valin
- article
- Bioinformatics, 2005, 21(24), pp.4408-4410
- Accès au bibtex
-
- titre
- Nitrogen fixation and growth of annual Medicago-Sinorhizobium associations at low temperature
- auteur
- Christophe Robin, K. Sultan-Tubeileh, M. Obaton, Armand Guckert
- article
- European Journal of Agronomy, 2005, 22, pp.267-275
- Accès au bibtex
-
Communication dans un congrès
- titre
- Typologie fonctionnelle des matières organiques solubles dans les sols
- auteur
- Yves Dudal, Ghislain Sevenier, Emilie Guillon, L. Dupont, J.L. Boudenne, B. Coulomb, Lucile Jocteur-Monrozier, Herve Quiquampoix
- article
- 1. Colloque de restitution scientifique, Dec 2005, Toulouse, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Recherches de motifs et de similarités en bioinformatique : modélisations, solutions logicielles et matérielles
- auteur
- Mathieu Giraud, Laurent Noé, Gregory Kucherov, Dominique Lavenier
- article
- MajecSTIC 2005 : Manifestation des Jeunes Chercheurs francophones dans les domaines des STIC, IRISA – IETR – LTSI, Nov 2005, Rennes/France, pp.18--37
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Organisation modulaire des séquences d'ADN répétées: application à l'étude des hélitrons non-autonomes dans le génome d'Arabidopsis thaliana
- auteur
- Sébastien Tempel, Mathieu Giraud, Israël-César C. Lerman, Ivan Couée, Abdelhak El Amrani, Jacques Nicolas
- article
- XIIIe colloque Eléments Transposables, 2005, Orsay, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Similar Fragments Merging Approach to Learn Automata on Proteins
- auteur
- François Coste, Goulven Kerbellec
- article
- Machine Learning: ECML 2005, 16th European Conference on Machine Learning, 2005, Porto, Portugal. pp.522-529, ⟨10.1007/11564096_50⟩
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-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Enzymatic hydrolysis of organic phosphorus
- auteur
- Herve Quiquampoix, Daniel Mousain
- article
- Organic Phosphorus in the Environment, CAB International, 2005, 0-85199-822-4
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bioinformatics Applications
- auteur
- Dominique Lavenier, Mathieu Giraud
- article
- Gokhale, Maya B., Graham, Paul S. Reconfigurable Computing. Accelerating Computation with Field-Programmable Gate Arrays, Springer, 2005, Foundation of computing, 0-387-26105-2
- Accès au bibtex
-
- titre
- Le sol : ressource en nutriments et biodisponibilité
- auteur
- Philippe Hinsinger, Andre Schneider, J.E. Dufey
- article
- Sols et environnement, Dunod, 2005, 978-2-1000-5520-3
- Accès au bibtex
-
Autre publication scientifique
- titre
- Pyramid diagram: visualizing the organization of repetitive sequences in genomes.
- auteur
- Patrick Durand, Frédéric Mahé, Anne-Sophie Valin, Jacques Nicolas
- article
- 2005
- Accès au bibtex
-
Proceedings/Recueil des communications
- titre
- Plant Nutrition for Food Security, Human Health and Environmental Protection
- auteur
- Philippe Hinsinger
- article
- 15. International Plant Nutrition Colloquium, Sep 2005, Pekin, China. Tsinghua University Press, 1207 p., 2005
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-
Rapport
- titre
- Motif Discovery on Promotor Sequences
- auteur
- Maximilian Häussler, Jacques Nicolas
- article
- [Research Report] RR-5714, INRIA. 2005, pp.136
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-
- titre
- A Similar Fragments Merging Approach to Learn Automata on Proteins
- auteur
- François Coste, Goulven Kerbellec
- article
- [Research Report] RR-5672, INRIA. 2005, pp.17
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-
- titre
- A Similar Fragments Merging Approach to Learn Automata on Proteins
- auteur
- François Coste, Goulven Kerbellec
- article
- [Research Report] PI 1735, 2005
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-
Thèse
- titre
- Découverte de motifs relationnels en bioinformatique: application à la prédiction de ponts disulfures
- auteur
- Ingrid Jacquemin
- article
- Biochimie [q-bio.BM]. Université Rennes 1, 2005. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
- titre
- Inférence grammaticale sur des alphabets ordonnés : application à la découverte de motifs dans des familles de protéines
- auteur
- Aurélien Leroux
- article
- Biochimie [q-bio.BM]. Université Rennes 1, 2005. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
Pré-publication, Document de travail
- titre
- Inventaire des crustacés de la Réserve Naturelle de Chérine (PNR Brenne, Indre)
- auteur
- F. S. E. Lefebvre
- article
- 2005
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-
2004
Article dans une revue
- titre
- The dynamics of protons, aluminium, and calcium in the rhizosphere of maize cultivated in tropicals acid soils: experimental study and modelling
- auteur
- H. Calba, - Firdaus, P. Cazevieilles, C. The, Roland Poss, Benoît Jaillard
- article
- Plant and Soil, 2004, 260 (1), pp.33-46
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-
- titre
- Diversity of ectomycorrhizal symbionts in a disturbed Pinus halepensis plantation in the Mediterranean region
- auteur
- K. El Karkouri, F. Martin, Daniel Mousain
- article
- Annals of Forest Science, 2004, 61, pp.705-710
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-
- titre
- Characterisation of kaolinitic clays from the Ivory Coast: identification of structural Fe
- auteur
- Joseph Sei, A. Abba Toure, J. Olivier-Fourcade, Herve Quiquampoix, Siobhan Staunton, J.C. Jumas, M. Womes
- article
- Hyperfine Interactions, 2004, 155 (1-4), pp.51-64
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-
- titre
- Dynamics of ectomycorrhizal mycelial growth and P transfer to the host plant in response to low and high soil P availability
- auteur
- Margarita Torres Aquino, Claude Plassard
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2004, 48 (2), pp.149-156. ⟨10.1016/j.femsec.2004.01.008⟩
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-
- titre
- Quantification of ectomycorrhizal fungal effects on the bioavailability and mobilization of soil P in the rhizosphere of Pinus pinaster
- auteur
- Valter Casarin, Claude Plassard, Philippe Hinsinger, Jean Claude Arvieu
- article
- New Phytologist, 2004, 163 (1), pp.177-185. ⟨10.1111/j.1469-8137.2004.01093.x⟩
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-
- titre
- Zinc mobilisation from a contamined soil by three genotypes of tobacco as affected by soil and rhizosphere pH
- auteur
- N. Loosemore, Anne Straczek, Philippe Hinsinger, Benoît Jaillard
- article
- Plant and Soil, 2004, 260 (1), pp.19-32
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-
- titre
- Structural effects of drying and rehydration for enzymes in soils: a kinetics-FTIR analysis of alpha-chymotrypsin adsorbed on montmorillonite
- auteur
- S. Noinville, M. Revault, Herve Quiquampoix, M. H. Baron
- article
- Journal of Colloid and Interface Science, 2004, 273 (2), pp.414-425. ⟨10.1016/j.jcis.2004.01.067⟩
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-
- titre
- Sensitivity analysis of the distribution coefficient, Kd, of nickel with changing soil chemical properties
- auteur
- Siobhan Staunton
- article
- Geoderma, 2004, 122 (2-4), pp.281-290. ⟨10.1016/j.geoderma.2004.01.014⟩
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-
- titre
- Épidémiologie de la tremblante et de l'Encéphalopathie Spongiforme Bovine en France
- auteur
- Christian Ducrot, Jacques Cabaret, Suzanne Touzeau, David Abrial, Christine Jacob, Herve Quiquampoix, Jeanne Grosclaude
- article
- Productions Animales, 2004, 17, pp.67-76
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-
- titre
- Widespread vertical transmission and associated host sex-ratio distortion within the eukaryotic phylum Microspora
- auteur
- R.S. Terry, J.E. Smith, R.G. Sharpe, T. Rigaud, D.T.J. Littlewood, J.E. Ironside, D. Rollinson, D. Bouchon, C. Macneil, J.T.A. Dick, A.M. Dunn
- article
- Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2004, 271, pp.1783-1789
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-
- titre
- Characterisation of kaolinitic clays from the Ivory Coast (West Africa)
- auteur
- Joseph Sei, A. Abba Toure, J. Olivier-Fourcade, Herve Quiquampoix, Siobhan Staunton, J.C. Jumas, M. Womes
- article
- Applied Clay Science, 2004, 27 (3-4), pp.235-239. ⟨10.1016/j.clay.2004.06.004⟩
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-
- titre
- Large-scale identification of genes in the fungus Hebeloma cylindrosporum paves the way to molecular analyses of ectomycorrhizal symbiosis
- auteur
- R. Lambilliote, R. Cooke, Dylan Samson, Cécile Fizames, Frédéric Gaymard, Claude Plassard, M.V. Tatry, C. Berger, M. Laudié, F. Legeai, Michel Delseny, S. Zimmermann, Herve Sentenac
- article
- New Phytologist, 2004, 164 (3), pp.505-513. ⟨10.1111/j.1469-8137.2004.01185.x⟩
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-
- titre
- Biodegradability of wheat gluten based bioplastics
- auteur
- Sandra Domenek, P. Feuilloley, J. Gratraud, M.H. Morel, Stéphane Guilbert
- article
- Chemosphere, 2004, 54 (4), pp.551-559. ⟨10.1016/S0045-6535(03)00760-4⟩
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-
- titre
- GenoFrag: software to design primers optimized for whole genome scanning by long-range PCR amplification.
- auteur
- Nouri Ben Zakour, Michel Gautier, Rumen Andonov, Dominique Lavenier, Marie-Françoise Cochet, Philippe Veber, Alexei Sorokine, Yves Le Loir
- article
- Nucleic Acids Research, 2004, 32 (1), pp.17-24. ⟨10.1093/nar/gkg928⟩
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-
Communication dans un congrès
- titre
- Changes in drainage of nutrients after afforestation with eucalypts in a Congolese savanna
- auteur
- Philippe Deleporte, Jean-Paul Laclau, Jacques J. Ranger, J-D. Nzila, Julien Guy Kazotti, Yann Nouvellon, Jean-Claude Ruffin Mazoumbou
- article
- International IUFRO Conference of the WP2.08.03 on Silviculture and Improvement of Eucalypts. Eucalyptus in a changing world, Oct 2004, Aveiro, Portugal
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-
- titre
- Mutually Compatible and Incompatible Merges for the Search of the Smallest Consistent DFA
- auteur
- François Coste, John Abela, Sandro Spina
- article
- ICGI 2004: Grammatical Inference: Algorithms and Applications, 2004, Athens, Greece. pp.28-39, ⟨10.1007/978-3-540-30195-0_4⟩
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-
- titre
- Introducing Domain and Typing Bias in Automata Inference
- auteur
- François Coste, Daniel Fredouille, Christopher Kermorvant, Colin de La Higuera
- article
- ICGI 2004: Grammatical Inference: Algorithms and Applications, 2004, Athens, Greece. pp.115-126, ⟨10.1007/978-3-540-30195-0_11⟩
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-
Poster de conférence
- titre
- Dynamics of slash decomposition from a Eucalyptus clone in Congolese sandy soils
- auteur
- Julien Guy Kazotti, Philippe Deleporte, Jacques J. Ranger, Jean-Paul Laclau
- article
- International IUFRO Conference of the WP2.08.03 on Silviculture and Improvement of Eucalypts. Eucalyptus in a changing world, Oct 2004, Aveiro, Portugal. 2004
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-
- titre
- Control of the nitrogen mineralising activity of micro-organisms by vegetation is a key-parameter to be taken into account by managers whatever the ecosystem function considered
- auteur
- Jacques J. Ranger, J-D. Nzila, Bernhard Zeller, Jean-Paul Laclau, Jean-Pierre Bouillet, Philippe Deleporte, Judicaël Moukoumi, J-H. Jussy, J-N. Marien
- article
- 146. International symposium : Forests soils under global and local changes : from research to practice, Sep 2004, 2004
- Accès au bibtex
-
- titre
- Validation of coupled speciation-transport models to describe root-uptake
- auteur
- B. Nowack, D. Jacques, S. Oswald, T. Roose, A. Schnepf, P. Seuntjens, W. Van-Beinum, Frédéric Gérard, U. Mayer, G. Kirk, H. Nietfeld, Benoît Jaillard
- article
- Rhizosphère 1, Sep 2004, Munich, Allemagne. 2004
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-
Rapport
- titre
- Apprentissage d'automates par fusions de paires de fragments significativement similaires et premières expérimentations sur les protéines MIP
- auteur
- François Coste, Goulven Kerbellec, Boris Idmont, Daniel Fredouille, Christian Delamarche
- article
- [Rapport de recherche] RR-5176, INRIA. 2004
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-
Pré-publication, Document de travail
- titre
- Purely periodic beta-expansions in the Pisot non-unit case
- auteur
- Valerie Berthe, Anne Siegel
- article
- 2004
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-
2003
Article dans une revue
- titre
- Integration of data and methods for genome analysis.
- auteur
- Patrick Durand, Claudine Médigue, Anne Morgat, Yves Vandenbrouck, Alain Viari, François Rechenmann
- article
- Current Opinion in Drug Discovery and Development, 2003, 6 (3), pp.346-52
- Accès au bibtex
-
- titre
- Relative contributions of soil chemistry, plant physiology and rhizosphere induced changes in speciation on Ni accumulation in plant shoots
- auteur
- F. Pinel, E. Leclerc-Cessac, Siobhan Staunton
- article
- Plant and Soil, 2003, 255, pp.619-629
- Accès au bibtex
-
- titre
- Copper bioavailability and extractability as related to chemical properties of contaminated soils from a vine-growing area
- auteur
- V. Chaignon, I. Sanchez-Neira, Patrick Herrmann, Benoît Jaillard, Philippe Hinsinger
- article
- Environmental Pollution, 2003, 123, pp.229-238
- Accès au bibtex
-
- titre
- Root uptake and translocation of radiocaesium from agricultural soils by various plant species
- auteur
- Siobhan Staunton, Philippe Hinsinger, Anne Guivarch, F. Brechignac
- article
- Plant and Soil, 2003, 254, pp.443-455. ⟨10.1023/A:1025584016465⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Origins of root-mediated pH changes in the rhizosphere and their responses to environmental constraints: a review
- auteur
- Philippe Hinsinger, Claude Plassard, C. Tang, Benoît Jaillard
- article
- Plant and Soil, 2003, 248, pp.43-59
- Accès au bibtex
-
- titre
- Production et fixation d'azote chez des luzernes annuelles en région méditerranéenne lors de la période froide
- auteur
- Armand Guckert, K. Sultan-Tubeileh, G. Gintzburger, M. Obaton, Christophe Robin
- article
- Fourrages, 2003, 173, pp.37-47
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Communication dans un congrès
- titre
- Unambiguous Automata Inference by Means of State-Merging Methods
- auteur
- François Coste, Daniel Fredouille
- article
- Machine Learning: ECML 2003, 14th European Conference on Machine Learning, 2003, Cavtat-Dubrovnik, Croatia. pp.60-71, ⟨10.1007/978-3-540-39857-8_8⟩
- Accès au bibtex
-
Poster de conférence
- titre
- Influence du mucilage de maïs sur la structure et les activités de communautés microbiennes fonctionnelles telluriques d’intérêt agronomique
- auteur
- E. Mounier, J. Abadie, I. Gruet, Fabrice Martin-Laurent, Gerard Souche, Séverine Piutti, Dominique Chèneby, H. Quiquampoix, Sophie Slezack-Deschaumes, Christophe Nguyen, Christophe Robin, Benoit Jaillard, Emile Benizri, Laurent Philippot
- article
- 5èmes journées d'Ecologie Fonctionnelle, Mar 2003, Nancy, France. 2003
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Rapport
- titre
- Combinatorial approaches for segmentingbacterium genomes
- auteur
- Rumen Andonov, Nicola Yanev, Dominique Lavenier, Philippe Veber
- article
- [Research Report] RR-4853, INRIA. 2003
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- What is the Search Space for the Inference of Non Deterministic, Unambiguous and Deterministic Automata ?
- auteur
- François Coste, Daniel Fredouille
- article
- [Research Report] RR-4907, INRIA. 2003
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2002
Communication dans un congrès
- titre
- Nitrogen fixation of annual Medicago-Rhizobium associations during cool season in Mediterranean dry areas
- auteur
- Kholoud Sultan, Gustave Gintzburger, Michel Obaton, Christophe Robin, Hayat Touchane, Armand Guckert
- article
- 19th General Meeting of the European Grassland Federation. "Grassland Science in Europe. Multi-function grasslands", May 2002, La Rochelle, France. pp.736-737
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Le projet GénoGRID : une grille expérimentale pour la génomique
- auteur
- Dominique Lavenier, Hugues Leroy, Michel Hurfin, Rumen Andonov, L. Mouchard, F. Guinand
- article
- Journées Ouvertes Biologie Informatique et Mathématiques, 2002, Saint Malo, France. pp.27-32
- Accès au bibtex
-
- titre
- Couplage par composants logiciels de codes d'hydrogéologie
- auteur
- Jocelyne Erhel, Philippe Ackerer, Jean-Raynald de Dreuzy, Michel Kern, Hugues Leroy, Christian Pérez
- article
- École GRID 2002, 2002, Aussois, France
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Measurements of H+ fluxes and concentrations in the rhizosphere
- auteur
- Benoît Jaillard, Claude Plassard, Philippe Hinsinger
- article
- Handbook of Soil Acidity, CBL, 2002, 0-824470-8903
- Accès au bibtex
-
Rapport
- titre
- The Protein Threading Problem is in P?
- auteur
- Nicola Yanev, Rumen Andonov
- article
- [Research Report] RR-4577, INRIA. 2002
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ROOM : reconfigurable object-oriented machines for specific applications
- auteur
- Frédéric Raimbault, Dominique Lavenier
- article
- [Research Report] RR-4588, INRIA. 2002
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Purely Periodic beta-Expansions in the Pisot Non-unit Case
- auteur
- Valerie Berthe, Anne Siegel
- article
- [Research Report] RR-4619, INRIA. 2002
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2000
Article dans une revue
- titre
- Impact of grazing and tillage on water erosion in North-eastern Syria
- auteur
- H. Shinjo, H. Fujita, G. Gintzburger, T. Kosaki
- article
- Soil Science and Plant Nutrition, 2000, 46 (1), pp.151-162
- Accès au bibtex
-
- titre
- Le sol vivant, un territoire qui reste à découvrir
- auteur
- Jean Claude Cleyet Marel, Philippe Hinsinger
- article
- Oléagineux, Corps Gras, Lipides, 2000, 7 (6), pp.490-493
- Accès au bibtex
-
Chapitre d'ouvrage
- titre
- Modélisation du prélèvement minéral par les plantes fondée sur le fonctionnement bio-physico-chimique de la rhizosphère
- auteur
- Benoît Jaillard, A. Schneider, Alain Mollier, Sylvain Pellerin
- article
- Fonctionnement des peuplements végétaux sous contraintes environnementales, INRA Editions, 2000, 2-7380-0911-5
- Accès au bibtex
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Poster de conférence
- titre
- Responses of annual medics to low temperature in Syria : growth and N2 fixation
- auteur
- Kholoud Sultan-Tubeileh, Christophe Robin, Michel Obaton, Gustave Gintzburger, Hayat Touchane, Armand Guckert
- article
- Christen O., Ordon F. (Eds). Third International Crop Science Congress, Aug 2000, Hambourg, Germany. Book of Abstracts, pp.40
- Accès au texte intégral et bibtex
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1997
Article dans une revue
- titre
- Union of all the Minimum Cycle Bases of a Graph
- auteur
- Philippe Vismara
- article
- The Electronic Journal of Combinatorics, 1997, 4 (1), ⟨10.37236/1294⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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1989
Communication dans un congrès
- titre
- Libération de H+ par les plantes et acidification des sols
- auteur
- Benoît Jaillard, M. Meslem, Claude Plassard, H. Calba
- article
- Fixation symbiotique de l'azoteet developpement durable dans le Bassin Méditeranéen, Oct 1989, Carthage, Tunisie
- Accès au bibtex
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